RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000583289.5

PTPRM-215, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, human

TSL 5

Gene PTPRM, Length 792 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PTPRM-215	ENST00000583289	TSPAN31	Q12999	210 aa		4.19	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	AQP6	Q13520	282 aa		4.19	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	IRF4	Q15306	451 aa		4.19	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	MED22	Q15528	200 aa		4.19	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	TRAM1	Q15629	374 aa		4.19	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	RAB30	Q15771	203 aa		4.19	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	RPE65	Q16518	533 aa		4.19	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	SYT16	Q17RD7	645 aa		4.19	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	GPAT3	Q53EU6	434 aa		4.19	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	CCDC157	Q569K6	752 aa		4.19	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	TCEAL5	Q5H9L2	206 aa		4.19	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	EOGT	Q5NDL2	527 aa		4.19	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	TPRG1L	Q5T0D9	272 aa		4.19	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	MFSD4B	Q5TF39	518 aa		4.19	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	ARHGAP40	Q5TG30	622 aa		4.19	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	AGAP7P	Q5VUJ5	663 aa		4.19	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	ADNP2	Q6IQ32	1131 aa		4.19	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	ANKRD54	Q6NXT1	300 aa		4.19	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	PGBD2	Q6P3X8	592 aa		4.19	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	TNFAIP8L2	Q6P589	184 aa	Predicted RBP	4.19	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	PODNL1	Q6PEZ8	512 aa		4.19	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	METAP1D	Q6UB28	335 aa	Predicted RBP	4.19	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	SLC36A4	Q6YBV0	504 aa		4.19	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	ZNF852	Q6ZMS4	543 aa		4.19	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	DEF8	Q6ZN54	512 aa		4.19	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	RASSF6	Q6ZTQ3	369 aa		4.19	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	C16orf62	Q7Z3J2	963 aa		4.19	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	GALNT10	Q86SR1	603 aa		4.19	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	ASPG	Q86U10	573 aa		4.19	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	RANBP3L	Q86VV4	465 aa	Predicted RBP	4.19	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	CCDC71	Q8IV32	467 aa	Predicted RBP	4.19	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	ADGRF3	Q8IZF5	1079 aa		4.19	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	SLC34A3	Q8N130	599 aa		4.19	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	NANOGP1	Q8N7R0	232 aa		4.19	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	ZBTB8B	Q8NAP8	495 aa	Predicted RBP	4.19	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	OR5AK3P	Q8NH89	298 aa		4.19	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	WDR36	Q8NI36	951 aa	Known RBP	4.19	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	PIGX	Q8TBF5	258 aa		4.19	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	SLC7A13	Q8TCU3	470 aa		4.19	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	OIT3	Q8WWZ8	545 aa		4.19	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	ACOT11	Q8WXI4	607 aa	Predicted RBP	4.19	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	RERG	Q96A58	199 aa	Predicted RBP	4.19	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	TMCO6	Q96DC7	493 aa		4.19	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	MRPL38	Q96DV4	380 aa	Known RBP	4.19	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	RSPRY1	Q96DX4	576 aa		4.19	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	ELP4	Q96EB1	424 aa		4.19	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	MRPL48	Q96GC5	212 aa	Known RBP	4.19	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	MSANTD3	Q96H12	275 aa		4.19	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	HS6ST2	Q96MM7	605 aa		4.19	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	NECTIN4	Q96NY8	510 aa		4.19	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	IL17F	Q96PD4	163 aa		4.19	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	STAC	Q99469	402 aa		4.19	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	NIPSNAP1	Q9BPW8	284 aa		4.19	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	C17orf62	Q9BQA9	187 aa		4.19	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	FUZ	Q9BT04	418 aa		4.19	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	ABCG4	Q9H172	646 aa		4.19	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	OR51I1	Q9H343	314 aa		4.19	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	SRMS	Q9H3Y6	488 aa		4.19	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	GLIPR2	Q9H4G4	154 aa		4.19	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	C8orf33	Q9H7E9	229 aa	Predicted RBP	4.19	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	MOV10	Q9HCE1	1003 aa	Known RBP	4.19	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	FGF20	Q9NP95	211 aa	Predicted RBP	4.19	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	SIRT3	Q9NTG7	399 aa	Predicted RBP	4.19	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	C14orf105	Q9NVL8	296 aa		4.19	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	GPR83	Q9NYM4	423 aa		4.19	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	NPAP1	Q9NZP6	1156 aa		4.19	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	SELENON	Q9NZV5	590 aa		4.19	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	PNMA8B	Q9ULN7	279 aa	Predicted RBP	4.19	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	BAIAP2	Q9UQB8	552 aa		4.19	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	TRAPPC4	Q9Y296	219 aa		4.19	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	TMEM5	Q9Y2B1	443 aa		4.19	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	PLEKHM1	Q9Y4G2	1056 aa		4.19	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	PDE4DIP	Q5VU43	2346 aa		4.19	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	KIF26A	Q9ULI4	1882 aa	Predicted RBP	4.19	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	NIN	Q8N4C6	2090 aa		4.18	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	ARPC4-TTLL3	A0A0A6YYG9	625 aa		4.18	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	KIR2DS5	A0A0G2JLQ3	304 aa		4.18	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289		A0A0G2JNG1	304 aa		4.18	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	TRBV4-1	A0A0J9YWV2	114 aa		4.18	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	LOC100506127	A0A0U1RQW1	187 aa		4.18	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	HSFX4	A0A1B0GTS1	333 aa	Predicted RBP	4.18	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	IQCM	A0A1B0GVH7	501 aa		4.18	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	HSFX3	A0A1B0GWH4	333 aa	Predicted RBP	4.18	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	FEZF1	A0PJY2	475 aa		4.18	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	SYNDIG1L	A6NDD5	238 aa		4.18	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	ANTXRL	A6NF34	631 aa		4.18	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	C2orf74	A8MZ97	194 aa		4.18	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	ZNF670-ZNF695	F2Z2N8	137 aa		4.18	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289		H3BUI4	141 aa		4.18	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289		H7C1Q1	480 aa		4.18	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	KIR2DS3	K7RE56	304 aa		4.18	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	RTCA	O00442	366 aa	Known RBP	4.18	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	FFAR1	O14842	300 aa		4.18	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	SLC30A4	O14863	429 aa		4.18	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	HAT1	O14929	419 aa		4.18	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	KCNAB3	O43448	404 aa		4.18	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	TLX2	O43763	284 aa	Predicted RBP	4.18	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	KIAA0513	O60268	411 aa		4.18	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	LCMT2	O60294	686 aa	Known RBP	4.18	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	PLOD3	O60568	738 aa		4.18	□□□□□ -1.74

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