RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000572369.5

SMG6-211, Transcript of SMG6, nonsense mediated mRNA decay factor, humanhuman

TSL 3

Gene SMG6, Length 689 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMG6-211ENST00000572369 PGM3O95394 542 aa6.99□□□□□ -1.29
SMG6-211ENST00000572369 TGM6O95932 706 aa6.99□□□□□ -1.29
SMG6-211ENST00000572369 ARAFP10398 606 aa6.99□□□□□ -1.29
SMG6-211ENST00000572369 HOXB9P17482 250 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
SMG6-211ENST00000572369 GPX2P18283 190 aa6.99□□□□□ -1.29
SMG6-211ENST00000572369 KLK2P20151 261 aa6.99□□□□□ -1.29
SMG6-211ENST00000572369 CCNA2P20248 432 aa6.99□□□□□ -1.29
SMG6-211ENST00000572369 ADSLP30566 484 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
SMG6-211ENST00000572369 UQCRC1P31930 480 aa6.99□□□□□ -1.29
SMG6-211ENST00000572369 LSP1P33241 339 aa6.99□□□□□ -1.29
SMG6-211ENST00000572369 APOBEC1P41238 236 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
SMG6-211ENST00000572369 CPA2P48052 419 aa6.99□□□□□ -1.29
SMG6-211ENST00000572369 IDH2P48735 452 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
SMG6-211ENST00000572369 ZNF136P52737 540 aa6.99□□□□□ -1.29
SMG6-211ENST00000572369 CTBP2P56545 445 aa6.99□□□□□ -1.29
SMG6-211ENST00000572369 CARD18P57730 90 aa6.99□□□□□ -1.29
SMG6-211ENST00000572369 SESN3P58005 492 aa6.99□□□□□ -1.29
SMG6-211ENST00000572369 MTPNP58546 118 aa6.99□□□□□ -1.29
SMG6-211ENST00000572369 SIRPAP78324 504 aa6.99□□□□□ -1.29
SMG6-211ENST00000572369 CDK6Q00534 326 aa6.99□□□□□ -1.29
SMG6-211ENST00000572369 SELENBP1Q13228 472 aa6.99□□□□□ -1.29
SMG6-211ENST00000572369 CAPRIN1Q14444 709 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
SMG6-211ENST00000572369 ZSWIM7Q19AV6 140 aa6.99□□□□□ -1.29
SMG6-211ENST00000572369 TMEM44Q2T9K0 475 aa6.99□□□□□ -1.29
SMG6-211ENST00000572369 TRMT5Q32P41 509 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
SMG6-211ENST00000572369 TMEM176BQ3YBM2 270 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
SMG6-211ENST00000572369 RUNDC3AQ59EK9 446 aa6.99□□□□□ -1.29
SMG6-211ENST00000572369 PRAMEF8Q5VWM4 474 aa6.99□□□□□ -1.29
SMG6-211ENST00000572369 PRAMEF7Q5VXH5 474 aa6.99□□□□□ -1.29
SMG6-211ENST00000572369 REP15Q6BDI9 236 aa6.99□□□□□ -1.29
SMG6-211ENST00000572369 C3orf33Q6P1S2 294 aa6.99□□□□□ -1.29
SMG6-211ENST00000572369 DLEU7Q6UYE1 221 aa6.99□□□□□ -1.29
SMG6-211ENST00000572369 ZNF550Q7Z398 422 aa6.99□□□□□ -1.29
SMG6-211ENST00000572369 LUZP2Q86TE4 346 aa6.99□□□□□ -1.29
SMG6-211ENST00000572369 GGNQ86UU5 652 aa6.99□□□□□ -1.29
SMG6-211ENST00000572369 RETREG3Q86VR2 466 aa6.99□□□□□ -1.29
SMG6-211ENST00000572369 SNX32Q86XE0 403 aa6.99□□□□□ -1.29
SMG6-211ENST00000572369 LIX1LQ8IVB5 337 aa6.99□□□□□ -1.29
SMG6-211ENST00000572369 MSRB3Q8IXL7 192 aa6.99□□□□□ -1.29
SMG6-211ENST00000572369 CADM2Q8N3J6 435 aa6.99□□□□□ -1.29
SMG6-211ENST00000572369 METTL25Q8N6Q8 603 aa6.99□□□□□ -1.29
SMG6-211ENST00000572369 NAXEQ8NCW5 288 aa6.99□□□□□ -1.29
SMG6-211ENST00000572369 HIPK4Q8NE63 616 aa6.99□□□□□ -1.29
SMG6-211ENST00000572369 OR2V1Q8NHB1 315 aa6.99□□□□□ -1.29
SMG6-211ENST00000572369 FNDC9Q8TBE3 224 aa6.99□□□□□ -1.29
SMG6-211ENST00000572369 POC1BQ8TC44 478 aa6.99□□□□□ -1.29
SMG6-211ENST00000572369 SLC26A7Q8TE54 656 aa6.99□□□□□ -1.29
SMG6-211ENST00000572369 FIG4Q92562 907 aa6.99□□□□□ -1.29
SMG6-211ENST00000572369 OSTF1Q92882 214 aa6.99□□□□□ -1.29
SMG6-211ENST00000572369 ANKRD27Q96NW4 1050 aa6.99□□□□□ -1.29
SMG6-211ENST00000572369 OR5B2Q96R09 309 aa6.99□□□□□ -1.29
SMG6-211ENST00000572369 SH3GL1Q99961 368 aa6.99□□□□□ -1.29
SMG6-211ENST00000572369 ECSITQ9BQ95 431 aa6.99□□□□□ -1.29
SMG6-211ENST00000572369 SFXN3Q9BWM7 321 aa6.99□□□□□ -1.29
SMG6-211ENST00000572369 SPATA9Q9BWV2 254 aa6.99□□□□□ -1.29
SMG6-211ENST00000572369 PIF1Q9H611 641 aa6.99□□□□□ -1.29
SMG6-211ENST00000572369 EXOSC3Q9NQT5 275 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
SMG6-211ENST00000572369 ACER3Q9NUN7 267 aa6.99□□□□□ -1.29
SMG6-211ENST00000572369 RLIMQ9NVW2 624 aa6.99□□□□□ -1.29
SMG6-211ENST00000572369 GID8Q9NWU2 228 aa6.99□□□□□ -1.29
SMG6-211ENST00000572369 ARMCX1Q9P291 453 aa6.99□□□□□ -1.29
SMG6-211ENST00000572369 CLCF1Q9UBD9 225 aa6.99□□□□□ -1.29
SMG6-211ENST00000572369 RPS6KB2Q9UBS0 482 aa6.99□□□□□ -1.29
SMG6-211ENST00000572369 ZNF443Q9Y2A4 671 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
SMG6-211ENST00000572369 ZNF175Q9Y473 711 aa6.99□□□□□ -1.29
SMG6-211ENST00000572369 NOTCH1P46531 2555 aa6.99□□□□□ -1.29
SMG6-211ENST00000572369 CACNA1CQ13936 2221 aa6.99□□□□□ -1.29
SMG6-211ENST00000572369 MED12LQ86YW9 2145 aa6.98□□□□□ -1.29
SMG6-211ENST00000572369 TRBV5-3A0A0A0MS03 114 aa6.98□□□□□ -1.29
SMG6-211ENST00000572369 A0A1W2PNR3 127 aa6.98□□□□□ -1.29
SMG6-211ENST00000572369 CDHR4A6H8M9 788 aa6.98□□□□□ -1.29
SMG6-211ENST00000572369 PRORSD1PA6NEY8 169 aa6.98□□□□□ -1.29
SMG6-211ENST00000572369 FBP2O00757 339 aa6.98□□□□□ -1.29
SMG6-211ENST00000572369 AP3D1O14617 1153 aa6.98□□□□□ -1.29
SMG6-211ENST00000572369 SLC22A2O15244 555 aa6.98□□□□□ -1.29
SMG6-211ENST00000572369 BCAS1O75363 584 aaPredicted RBP6.98□□□□□ -1.29
SMG6-211ENST00000572369 SERPINB7O75635 380 aa6.98□□□□□ -1.29
SMG6-211ENST00000572369 NPPAP01160 153 aa6.98□□□□□ -1.29
SMG6-211ENST00000572369 THBS1P07996 1170 aa6.98□□□□□ -1.29
SMG6-211ENST00000572369 PABPC4LP0CB38 370 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
SMG6-211ENST00000572369 GKN3PP0CG01 181 aa6.98□□□□□ -1.29
SMG6-211ENST00000572369 BMP2P12643 396 aa6.98□□□□□ -1.29
SMG6-211ENST00000572369 ETS2P15036 469 aa6.98□□□□□ -1.29
SMG6-211ENST00000572369 IL11P20809 199 aa6.98□□□□□ -1.29
SMG6-211ENST00000572369 RPS4Y1P22090 263 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
SMG6-211ENST00000572369 CXCR1P25024 350 aa6.98□□□□□ -1.29
SMG6-211ENST00000572369 PSMA4P25789 261 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
SMG6-211ENST00000572369 AQP1P29972 269 aa6.98□□□□□ -1.29
SMG6-211ENST00000572369 SSTR2P30874 369 aa6.98□□□□□ -1.29
SMG6-211ENST00000572369 HTR3AP46098 478 aa6.98□□□□□ -1.29
SMG6-211ENST00000572369 ASCL1P50553 236 aa6.98□□□□□ -1.29
SMG6-211ENST00000572369 NCALDP61601 193 aa6.98□□□□□ -1.29
SMG6-211ENST00000572369 EEF1A1P68104 462 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
SMG6-211ENST00000572369 RBBP4Q09028 425 aa6.98□□□□□ -1.29
SMG6-211ENST00000572369 FOXF2Q12947 444 aa6.98□□□□□ -1.29
SMG6-211ENST00000572369 MAPK11Q15759 364 aa6.98□□□□□ -1.29
SMG6-211ENST00000572369 SLC25A53Q5H9E4 307 aa6.98□□□□□ -1.29
SMG6-211ENST00000572369 EEF1A1P5Q5VTE0 462 aa6.98□□□□□ -1.29
SMG6-211ENST00000572369 AP1ARQ63HQ0 302 aa6.98□□□□□ -1.29
SMG6-211ENST00000572369 GTF2IRD2BQ6EKJ0 949 aa6.98□□□□□ -1.29
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