RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567479.1

KIFC3-231, Transcript of kinesin family member C3, human

TSL 4

Gene KIFC3, Length 534 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
KIFC3-231	ENST00000567479	FOXD4	Q12950	439 aa	Predicted RBP	8.36	□□□□□ -1.07
KIFC3-231	ENST00000567479	GNA13	Q14344	377 aa		8.36	□□□□□ -1.07
KIFC3-231	ENST00000567479	SYT14P1	Q58G82	188 aa		8.36	□□□□□ -1.07
KIFC3-231	ENST00000567479	BEX5	Q5H9J7	111 aa		8.36	□□□□□ -1.07
KIFC3-231	ENST00000567479	COX20	Q5RI15	118 aa		8.36	□□□□□ -1.07
KIFC3-231	ENST00000567479	AGBL2	Q5U5Z8	902 aa		8.36	□□□□□ -1.07
KIFC3-231	ENST00000567479	TFAP2E	Q6VUC0	442 aa		8.36	□□□□□ -1.07
KIFC3-231	ENST00000567479	GRINA	Q7Z429	371 aa		8.36	□□□□□ -1.07
KIFC3-231	ENST00000567479	CXorf67	Q86X51	503 aa	Predicted RBP	8.36	□□□□□ -1.07
KIFC3-231	ENST00000567479	WFDC8	Q8IUA0	241 aa		8.36	□□□□□ -1.07
KIFC3-231	ENST00000567479	CMIP	Q8IY22	773 aa		8.36	□□□□□ -1.07
KIFC3-231	ENST00000567479	FAM71C	Q8NEG0	241 aa		8.36	□□□□□ -1.07
KIFC3-231	ENST00000567479	PNPT1	Q8TCS8	783 aa	Known RBP	8.36	□□□□□ -1.07
KIFC3-231	ENST00000567479	SLC25A43	Q8WUT9	341 aa	Predicted RBP	8.36	□□□□□ -1.07
KIFC3-231	ENST00000567479	HS3ST6	Q96QI5	342 aa		8.36	□□□□□ -1.07
KIFC3-231	ENST00000567479	OR52B2	Q96RD2	323 aa		8.36	□□□□□ -1.07
KIFC3-231	ENST00000567479	PIP5K1A	Q99755	562 aa		8.36	□□□□□ -1.07
KIFC3-231	ENST00000567479	PSD2	Q9BQI7	771 aa		8.36	□□□□□ -1.07
KIFC3-231	ENST00000567479	CCDC106	Q9BWC9	280 aa		8.36	□□□□□ -1.07
KIFC3-231	ENST00000567479	SLC38A1	Q9H2H9	487 aa		8.36	□□□□□ -1.07
KIFC3-231	ENST00000567479	RMND5A	Q9H871	391 aa		8.36	□□□□□ -1.07
KIFC3-231	ENST00000567479	UBTD1	Q9HAC8	227 aa		8.36	□□□□□ -1.07
KIFC3-231	ENST00000567479	BCO1	Q9HAY6	547 aa		8.36	□□□□□ -1.07
KIFC3-231	ENST00000567479	EXOSC3	Q9NQT5	275 aa	Known RBP	8.36	□□□□□ -1.07
KIFC3-231	ENST00000567479	CTPS2	Q9NRF8	586 aa		8.36	□□□□□ -1.07
KIFC3-231	ENST00000567479	SDR39U1	Q9NRG7	319 aa	Predicted RBP	8.36	□□□□□ -1.07
KIFC3-231	ENST00000567479	ZIM2	Q9NZV7	527 aa		8.36	□□□□□ -1.07
KIFC3-231	ENST00000567479	PRRC2A	P48634	2157 aa	Known RBP	8.36	□□□□□ -1.07
KIFC3-231	ENST00000567479	F8	P00451	2351 aa		8.36	□□□□□ -1.07
KIFC3-231	ENST00000567479	CELSR1	Q9NYQ6	3014 aa		8.36	□□□□□ -1.07
KIFC3-231	ENST00000567479	TEP1	Q99973	2627 aa	Known RBP	8.35	□□□□□ -1.07
KIFC3-231	ENST00000567479	MBD3L2B	A0A1B0GVZ6	204 aa	Predicted RBP	8.35	□□□□□ -1.07
KIFC3-231	ENST00000567479	ZNF724	A8MTY0	619 aa		8.35	□□□□□ -1.07
KIFC3-231	ENST00000567479	SMAD9	O15198	467 aa	Known RBP	8.35	□□□□□ -1.07
KIFC3-231	ENST00000567479	ARHGEF9	O43307	516 aa		8.35	□□□□□ -1.07
KIFC3-231	ENST00000567479	SMPD2	O60906	423 aa		8.35	□□□□□ -1.07
KIFC3-231	ENST00000567479	BCAS1	O75363	584 aa	Predicted RBP	8.35	□□□□□ -1.07
KIFC3-231	ENST00000567479	GCM2	O75603	506 aa	Predicted RBP	8.35	□□□□□ -1.07
KIFC3-231	ENST00000567479	DBI	P07108	87 aa	Known RBP	8.35	□□□□□ -1.07
KIFC3-231	ENST00000567479	CHRM4	P08173	479 aa		8.35	□□□□□ -1.07
KIFC3-231	ENST00000567479	ZCCHC18	P0CG32	403 aa		8.35	□□□□□ -1.07
KIFC3-231	ENST00000567479	FOSL1	P15407	271 aa		8.35	□□□□□ -1.07
KIFC3-231	ENST00000567479	IL32	P24001	234 aa		8.35	□□□□□ -1.07
KIFC3-231	ENST00000567479	LOX	P28300	417 aa	Predicted RBP	8.35	□□□□□ -1.07
KIFC3-231	ENST00000567479	CRAT	P43155	626 aa		8.35	□□□□□ -1.07
KIFC3-231	ENST00000567479	MAGEA8	P43361	318 aa		8.35	□□□□□ -1.07
KIFC3-231	ENST00000567479	HTR3A	P46098	478 aa		8.35	□□□□□ -1.07
KIFC3-231	ENST00000567479	CLK1	P49759	484 aa	Known RBP	8.35	□□□□□ -1.07
KIFC3-231	ENST00000567479	POLR2J	P52435	117 aa	Known RBP	8.35	□□□□□ -1.07
KIFC3-231	ENST00000567479	NR1H2	P55055	460 aa		8.35	□□□□□ -1.07
KIFC3-231	ENST00000567479	ITGAD	Q13349	1161 aa		8.35	□□□□□ -1.07
KIFC3-231	ENST00000567479	P2RY6	Q15077	328 aa		8.35	□□□□□ -1.07
KIFC3-231	ENST00000567479	SFRP5	Q5T4F7	317 aa		8.35	□□□□□ -1.07
KIFC3-231	ENST00000567479	SHE	Q5VZ18	495 aa		8.35	□□□□□ -1.07
KIFC3-231	ENST00000567479	ALKBH2	Q6NS38	261 aa		8.35	□□□□□ -1.07
KIFC3-231	ENST00000567479	EPGN	Q6UW88	154 aa		8.35	□□□□□ -1.07
KIFC3-231	ENST00000567479	MAVS	Q7Z434	540 aa		8.35	□□□□□ -1.07
KIFC3-231	ENST00000567479	MTDH	Q86UE4	582 aa	Known RBP	8.35	□□□□□ -1.07
KIFC3-231	ENST00000567479	ADGRG3	Q86Y34	549 aa		8.35	□□□□□ -1.07
KIFC3-231	ENST00000567479	P3H2	Q8IVL5	708 aa		8.35	□□□□□ -1.07
KIFC3-231	ENST00000567479	PEX5L	Q8IYB4	626 aa		8.35	□□□□□ -1.07
KIFC3-231	ENST00000567479	GABRG1	Q8N1C3	465 aa		8.35	□□□□□ -1.07
KIFC3-231	ENST00000567479	MIER2	Q8N344	545 aa		8.35	□□□□□ -1.07
KIFC3-231	ENST00000567479	WDR60	Q8WVS4	1066 aa		8.35	□□□□□ -1.07
KIFC3-231	ENST00000567479	HSD17B8	Q92506	261 aa		8.35	□□□□□ -1.07
KIFC3-231	ENST00000567479	CNOT9	Q92600	299 aa	Known RBP	8.35	□□□□□ -1.07
KIFC3-231	ENST00000567479	KISS1R	Q969F8	398 aa	Predicted RBP	8.35	□□□□□ -1.07
KIFC3-231	ENST00000567479	S100PBP	Q96BU1	408 aa		8.35	□□□□□ -1.07
KIFC3-231	ENST00000567479	ZNF775	Q96BV0	537 aa	Predicted RBP	8.35	□□□□□ -1.07
KIFC3-231	ENST00000567479	ZHX1-C8orf76	Q96EF9	292 aa		8.35	□□□□□ -1.07
KIFC3-231	ENST00000567479	PLPPR2	Q96GM1	343 aa		8.35	□□□□□ -1.07
KIFC3-231	ENST00000567479	ITCH	Q96J02	903 aa		8.35	□□□□□ -1.07
KIFC3-231	ENST00000567479	USB1	Q9BQ65	265 aa	Known RBP	8.35	□□□□□ -1.07
KIFC3-231	ENST00000567479	CALML5	Q9NZT1	146 aa		8.35	□□□□□ -1.07
KIFC3-231	ENST00000567479	CHRNA9	Q9UGM1	479 aa		8.35	□□□□□ -1.07
KIFC3-231	ENST00000567479	ING1	Q9UK53	422 aa	Predicted RBP	8.35	□□□□□ -1.07
KIFC3-231	ENST00000567479	HDGFL3	Q9Y3E1	203 aa		8.35	□□□□□ -1.07
KIFC3-231	ENST00000567479	USH1C	Q9Y6N9	552 aa		8.35	□□□□□ -1.07
KIFC3-231	ENST00000567479	NUP214	P35658	2090 aa	Predicted RBP	8.34	□□□□□ -1.07
KIFC3-231	ENST00000567479	TMED7-TICAM2	A0A0A6YYA0	188 aa		8.34	□□□□□ -1.07
KIFC3-231	ENST00000567479	FAM234B	A2RU67	622 aa		8.34	□□□□□ -1.07
KIFC3-231	ENST00000567479	CFAP73	A6NFT4	308 aa		8.34	□□□□□ -1.07
KIFC3-231	ENST00000567479	ZNF814	B7Z6K7	855 aa		8.34	□□□□□ -1.07
KIFC3-231	ENST00000567479	AP3D1	O14617	1153 aa		8.34	□□□□□ -1.07
KIFC3-231	ENST00000567479	ADAM11	O75078	769 aa		8.34	□□□□□ -1.07
KIFC3-231	ENST00000567479	TGDS	O95455	350 aa		8.34	□□□□□ -1.07
KIFC3-231	ENST00000567479	PMS2P2	O95744	297 aa		8.34	□□□□□ -1.07
KIFC3-231	ENST00000567479	FES	P07332	822 aa		8.34	□□□□□ -1.07
KIFC3-231	ENST00000567479	TFPT	P0C1Z6	253 aa		8.34	□□□□□ -1.07
KIFC3-231	ENST00000567479	ETFA	P13804	333 aa		8.34	□□□□□ -1.07
KIFC3-231	ENST00000567479	UQCRB	P14927	111 aa		8.34	□□□□□ -1.07
KIFC3-231	ENST00000567479	CCNA2	P20248	432 aa		8.34	□□□□□ -1.07
KIFC3-231	ENST00000567479	OR3A2	P47893	321 aa		8.34	□□□□□ -1.07
KIFC3-231	ENST00000567479	MAP2K6	P52564	334 aa		8.34	□□□□□ -1.07
KIFC3-231	ENST00000567479	PDK3	Q15120	406 aa		8.34	□□□□□ -1.07
KIFC3-231	ENST00000567479	TSC22D1	Q15714	1073 aa		8.34	□□□□□ -1.07
KIFC3-231	ENST00000567479	C6orf10	Q5SRN2	563 aa		8.34	□□□□□ -1.07
KIFC3-231	ENST00000567479	DNAJC14	Q6Y2X3	702 aa	Predicted RBP	8.34	□□□□□ -1.07
KIFC3-231	ENST00000567479	C20orf204	Q6ZNR8	217 aa		8.34	□□□□□ -1.07
KIFC3-231	ENST00000567479		Q6ZT83	130 aa		8.34	□□□□□ -1.07

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