RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000561438.5

TMOD3-211, Transcript of tropomodulin 3, humanhuman

TSL 5

Gene TMOD3, Length 1,139 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD3-211ENST00000561438 FAM166BA8MTA8 275 aa7.51□□□□□ -1.21
TMOD3-211ENST00000561438 H0YC42 278 aa7.51□□□□□ -1.21
TMOD3-211ENST00000561438 GSTA4O15217 222 aa7.51□□□□□ -1.21
TMOD3-211ENST00000561438 PEX1O43933 1283 aa7.51□□□□□ -1.21
TMOD3-211ENST00000561438 CDC40O60508 579 aaKnown RBP eCLIP7.51□□□□□ -1.21
TMOD3-211ENST00000561438 CSTAP01040 98 aa7.51□□□□□ -1.21
TMOD3-211ENST00000561438 IGHA1P01876 353 aa7.51□□□□□ -1.21
TMOD3-211ENST00000561438 UBL4AP11441 157 aa7.51□□□□□ -1.21
TMOD3-211ENST00000561438 IL7RP16871 459 aa7.51□□□□□ -1.21
TMOD3-211ENST00000561438 ATP6V1C1P21283 382 aa7.51□□□□□ -1.21
TMOD3-211ENST00000561438 RYKP34925 604 aa7.51□□□□□ -1.21
TMOD3-211ENST00000561438 MAGEA5P43359 124 aa7.51□□□□□ -1.21
TMOD3-211ENST00000561438 TPD52P55327 224 aaPredicted RBP7.51□□□□□ -1.21
TMOD3-211ENST00000561438 CLDN15P56746 228 aa7.51□□□□□ -1.21
TMOD3-211ENST00000561438 ARG2P78540 354 aa7.51□□□□□ -1.21
TMOD3-211ENST00000561438 ELF3P78545 371 aaPredicted RBP7.51□□□□□ -1.21
TMOD3-211ENST00000561438 HPCAP84074 193 aa7.51□□□□□ -1.21
TMOD3-211ENST00000561438 RHDQ02161 417 aa7.51□□□□□ -1.21
TMOD3-211ENST00000561438 EPS8Q12929 822 aa7.51□□□□□ -1.21
TMOD3-211ENST00000561438 FOXF1Q12946 379 aa7.51□□□□□ -1.21
TMOD3-211ENST00000561438 SEC23BQ15437 767 aa7.51□□□□□ -1.21
TMOD3-211ENST00000561438 TMEM44Q2T9K0 475 aa7.51□□□□□ -1.21
TMOD3-211ENST00000561438 PLPPR5Q32ZL2 321 aa7.51□□□□□ -1.21
TMOD3-211ENST00000561438 NKAPLQ5M9Q1 402 aa7.51□□□□□ -1.21
TMOD3-211ENST00000561438 C1orf146Q5VVC0 180 aa7.51□□□□□ -1.21
TMOD3-211ENST00000561438 C1QL3Q5VWW1 255 aa7.51□□□□□ -1.21
TMOD3-211ENST00000561438 SLC25A25Q6KCM7 469 aa7.51□□□□□ -1.21
TMOD3-211ENST00000561438 C22orf34Q6ZV56 151 aa7.51□□□□□ -1.21
TMOD3-211ENST00000561438 PATL1Q86TB9 770 aaKnown RBP7.51□□□□□ -1.21
TMOD3-211ENST00000561438 P3H2Q8IVL5 708 aa7.51□□□□□ -1.21
TMOD3-211ENST00000561438 PEX5LQ8IYB4 626 aa7.51□□□□□ -1.21
TMOD3-211ENST00000561438 HS3ST5Q8IZT8 346 aa7.51□□□□□ -1.21
TMOD3-211ENST00000561438 TMEM251Q8N6I4 163 aa7.51□□□□□ -1.21
TMOD3-211ENST00000561438 ZFP62Q8NB50 900 aaPredicted RBP7.51□□□□□ -1.21
TMOD3-211ENST00000561438 PAPD5Q8NDF8 572 aaKnown RBP7.51□□□□□ -1.21
TMOD3-211ENST00000561438 DNAJA3Q96EY1 480 aa7.51□□□□□ -1.21
TMOD3-211ENST00000561438 TMEM41AQ96HV5 264 aa7.51□□□□□ -1.21
TMOD3-211ENST00000561438 PYURFQ96I23 114 aa7.51□□□□□ -1.21
TMOD3-211ENST00000561438 SECISBP2Q96T21 854 aaKnown RBP7.51□□□□□ -1.21
TMOD3-211ENST00000561438 DOHHQ9BU89 302 aa7.51□□□□□ -1.21
TMOD3-211ENST00000561438 METTL7AQ9H8H3 244 aa7.51□□□□□ -1.21
TMOD3-211ENST00000561438 SACM1LQ9NTJ5 587 aa7.51□□□□□ -1.21
TMOD3-211ENST00000561438 THUMPD1Q9NXG2 353 aaKnown RBP7.51□□□□□ -1.21
TMOD3-211ENST00000561438 KLRF1Q9NZS2 232 aa7.51□□□□□ -1.21
TMOD3-211ENST00000561438 NKX1-2Q9UD57 310 aaPredicted RBP7.51□□□□□ -1.21
TMOD3-211ENST00000561438 ACAD8Q9UKU7 415 aa7.51□□□□□ -1.21
TMOD3-211ENST00000561438 C15orf41Q9Y2V0 281 aa7.51□□□□□ -1.21
TMOD3-211ENST00000561438 SH3GLB1Q9Y371 365 aa7.51□□□□□ -1.21
TMOD3-211ENST00000561438 ZNF451Q9Y4E5 1061 aa7.51□□□□□ -1.21
TMOD3-211ENST00000561438 PCDHGB3Q9Y5G1 929 aa7.51□□□□□ -1.21
TMOD3-211ENST00000561438 MAGED1Q9Y5V3 778 aaPredicted RBP7.51□□□□□ -1.21
TMOD3-211ENST00000561438 INTS1Q8N201 2190 aaKnown RBP7.51□□□□□ -1.21
TMOD3-211ENST00000561438 HRNRQ86YZ3 2850 aaPredicted RBP7.51□□□□□ -1.21
TMOD3-211ENST00000561438 SPTA1P02549 2419 aa7.51□□□□□ -1.21
TMOD3-211ENST00000561438 HIVEP3Q5T1R4 2406 aa7.51□□□□□ -1.21
TMOD3-211ENST00000561438 ALPK2Q86TB3 2170 aa7.5□□□□□ -1.21
TMOD3-211ENST00000561438 NCOA6Q14686 2063 aaPredicted RBP7.5□□□□□ -1.21
TMOD3-211ENST00000561438 DHRS12A0PJE2 317 aa7.5□□□□□ -1.21
TMOD3-211ENST00000561438 ANKRD34BA5PLL1 514 aa7.5□□□□□ -1.21
TMOD3-211ENST00000561438 AQP12BA6NM10 295 aa7.5□□□□□ -1.21
TMOD3-211ENST00000561438 CPSF4LA6NMK7 179 aaKnown RBP7.5□□□□□ -1.21
TMOD3-211ENST00000561438 ETV2O00321 342 aaPredicted RBP7.5□□□□□ -1.21
TMOD3-211ENST00000561438 SYT5O00445 386 aa7.5□□□□□ -1.21
TMOD3-211ENST00000561438 SCDO00767 359 aa7.5□□□□□ -1.21
TMOD3-211ENST00000561438 ZNF264O43296 627 aa7.5□□□□□ -1.21
TMOD3-211ENST00000561438 HCRTR2O43614 444 aa7.5□□□□□ -1.21
TMOD3-211ENST00000561438 PIP5K1CO60331 668 aa7.5□□□□□ -1.21
TMOD3-211ENST00000561438 TIPRLO75663 272 aa7.5□□□□□ -1.21
TMOD3-211ENST00000561438 CYP7B1O75881 506 aa7.5□□□□□ -1.21
TMOD3-211ENST00000561438 PRKCAP17252 672 aa7.5□□□□□ -1.21
TMOD3-211ENST00000561438 CNR1P21554 472 aa7.5□□□□□ -1.21
TMOD3-211ENST00000561438 LIMS1P48059 325 aa7.5□□□□□ -1.21
TMOD3-211ENST00000561438 TMED10P49755 219 aaKnown RBP7.5□□□□□ -1.21
TMOD3-211ENST00000561438 RASSF2P50749 326 aa7.5□□□□□ -1.21
TMOD3-211ENST00000561438 ANXA11P50995 505 aaKnown RBP7.5□□□□□ -1.21
TMOD3-211ENST00000561438 HSF1Q00613 529 aa7.5□□□□□ -1.21
TMOD3-211ENST00000561438 EGR4Q05215 589 aa7.5□□□□□ -1.21
TMOD3-211ENST00000561438 PIN1Q13526 163 aaPredicted RBP7.5□□□□□ -1.21
TMOD3-211ENST00000561438 GANABQ14697 944 aaKnown RBP7.5□□□□□ -1.21
TMOD3-211ENST00000561438 QPRTQ15274 297 aa7.5□□□□□ -1.21
TMOD3-211ENST00000561438 C3AR1Q16581 482 aa7.5□□□□□ -1.21
TMOD3-211ENST00000561438 LIN52Q52LA3 116 aa7.5□□□□□ -1.21
TMOD3-211ENST00000561438 EIPR1Q53HC9 387 aa7.5□□□□□ -1.21
TMOD3-211ENST00000561438 CMPK2Q5EBM0 449 aa7.5□□□□□ -1.21
TMOD3-211ENST00000561438 TIGD3Q6B0B8 471 aa7.5□□□□□ -1.21
TMOD3-211ENST00000561438 ASB18Q6ZVZ8 466 aa7.5□□□□□ -1.21
TMOD3-211ENST00000561438 SPATA24Q86W54 205 aa7.5□□□□□ -1.21
TMOD3-211ENST00000561438 PLCZ1Q86YW0 608 aa7.5□□□□□ -1.21
TMOD3-211ENST00000561438 EPHX4Q8IUS5 362 aa7.5□□□□□ -1.21
TMOD3-211ENST00000561438 NKAIN4Q8IVV8 208 aa7.5□□□□□ -1.21
TMOD3-211ENST00000561438 SLC30A8Q8IWU4 369 aa7.5□□□□□ -1.21
TMOD3-211ENST00000561438 AQP12AQ8IXF9 295 aa7.5□□□□□ -1.21
TMOD3-211ENST00000561438 GPALPP1Q8IXQ4 340 aa7.5□□□□□ -1.21
TMOD3-211ENST00000561438 ZNF527Q8NB42 609 aa7.5□□□□□ -1.21
TMOD3-211ENST00000561438 C3orf49Q96BT1 292 aa7.5□□□□□ -1.21
TMOD3-211ENST00000561438 C1GALT1C1Q96EU7 318 aa7.5□□□□□ -1.21
TMOD3-211ENST00000561438 SLC47A1Q96FL8 570 aa7.5□□□□□ -1.21
TMOD3-211ENST00000561438 DUS3LQ96G46 650 aaKnown RBP7.5□□□□□ -1.21
TMOD3-211ENST00000561438 VPS50Q96JG6 964 aa7.5□□□□□ -1.21
TMOD3-211ENST00000561438 SGCZQ96LD1 299 aa7.5□□□□□ -1.21
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 64 ms