RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560934.1

LINS1-210, Transcript of lines homolog 1, human

TSL 4

Gene LINS1, Length 562 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LINS1-210	ENST00000560934	WDR74	Q6RFH5	385 aa	Predicted RBP	4.09	□□□□□ -1.75
LINS1-210	ENST00000560934	ASB18	Q6ZVZ8	466 aa		4.09	□□□□□ -1.75
LINS1-210	ENST00000560934	TUBA1A	Q71U36	451 aa		4.09	□□□□□ -1.75
LINS1-210	ENST00000560934	DGLUCY	Q7Z3D6	616 aa		4.09	□□□□□ -1.75
LINS1-210	ENST00000560934	SPATA21	Q7Z572	469 aa		4.09	□□□□□ -1.75
LINS1-210	ENST00000560934	VN1R4	Q7Z5H5	301 aa		4.09	□□□□□ -1.75
LINS1-210	ENST00000560934	KMT5C	Q86Y97	462 aa		4.09	□□□□□ -1.75
LINS1-210	ENST00000560934	SUPV3L1	Q8IYB8	786 aa	Known RBP eCLIP	4.09	□□□□□ -1.75
LINS1-210	ENST00000560934	PM20D2	Q8IYS1	436 aa		4.09	□□□□□ -1.75
LINS1-210	ENST00000560934	SLC5A8	Q8N695	610 aa		4.09	□□□□□ -1.75
LINS1-210	ENST00000560934	AMER3	Q8N944	861 aa		4.09	□□□□□ -1.75
LINS1-210	ENST00000560934	MFSD9	Q8NBP5	474 aa		4.09	□□□□□ -1.75
LINS1-210	ENST00000560934	OR6C4	Q8NGE1	309 aa		4.09	□□□□□ -1.75
LINS1-210	ENST00000560934	C10orf82	Q8WW14	230 aa		4.09	□□□□□ -1.75
LINS1-210	ENST00000560934	NAT6	Q93015	286 aa		4.09	□□□□□ -1.75
LINS1-210	ENST00000560934	TM4SF19	Q96DZ7	209 aa		4.09	□□□□□ -1.75
LINS1-210	ENST00000560934	F2RL3	Q96RI0	385 aa		4.09	□□□□□ -1.75
LINS1-210	ENST00000560934	TUBA1C	Q9BQE3	449 aa		4.09	□□□□□ -1.75
LINS1-210	ENST00000560934	EFCAB11	Q9BUY7	163 aa		4.09	□□□□□ -1.75
LINS1-210	ENST00000560934	ACPT	Q9BZG2	426 aa		4.09	□□□□□ -1.75
LINS1-210	ENST00000560934	AICDA	Q9GZX7	198 aa		4.09	□□□□□ -1.75
LINS1-210	ENST00000560934	RHBG	Q9H310	441 aa		4.09	□□□□□ -1.75
LINS1-210	ENST00000560934	ELOVL6	Q9H5J4	265 aa		4.09	□□□□□ -1.75
LINS1-210	ENST00000560934	MEAF6	Q9HAF1	191 aa		4.09	□□□□□ -1.75
LINS1-210	ENST00000560934	STARD5	Q9NSY2	213 aa		4.09	□□□□□ -1.75
LINS1-210	ENST00000560934	POU2F3	Q9UKI9	436 aa		4.09	□□□□□ -1.75
LINS1-210	ENST00000560934	SNX6	Q9UNH7	406 aa		4.09	□□□□□ -1.75
LINS1-210	ENST00000560934	EXO1	Q9UQ84	846 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
LINS1-210	ENST00000560934	STK38L	Q9Y2H1	464 aa		4.09	□□□□□ -1.75
LINS1-210	ENST00000560934	KLK4	Q9Y5K2	254 aa		4.09	□□□□□ -1.75
LINS1-210	ENST00000560934	SNX8	Q9Y5X2	465 aa		4.09	□□□□□ -1.75
LINS1-210	ENST00000560934	MUC3A	Q02505	3323 aa		4.09	□□□□□ -1.76
LINS1-210	ENST00000560934	PCNX2	A6NKB5	2137 aa		4.09	□□□□□ -1.76
LINS1-210	ENST00000560934		A0A0G2JN53	185 aa		4.08	□□□□□ -1.76
LINS1-210	ENST00000560934	IGHV5-10-1	A0A0J9YXX1	117 aa		4.08	□□□□□ -1.76
LINS1-210	ENST00000560934	TLCD2	A6NGC4	264 aa		4.08	□□□□□ -1.76
LINS1-210	ENST00000560934	ANKDD1B	A6NHY2	528 aa		4.08	□□□□□ -1.76
LINS1-210	ENST00000560934	TRPC5OS	A6NMA1	111 aa		4.08	□□□□□ -1.76
LINS1-210	ENST00000560934	FOXE1	O00358	373 aa	Predicted RBP	4.08	□□□□□ -1.76
LINS1-210	ENST00000560934	SAP18	O00422	153 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
LINS1-210	ENST00000560934	RTCA	O00442	366 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
LINS1-210	ENST00000560934	NDUFAB1	O14561	156 aa		4.08	□□□□□ -1.76
LINS1-210	ENST00000560934	P2RX6	O15547	441 aa		4.08	□□□□□ -1.76
LINS1-210	ENST00000560934	ZNHIT1	O43257	154 aa		4.08	□□□□□ -1.76
LINS1-210	ENST00000560934	DUX1	O43812	170 aa		4.08	□□□□□ -1.76
LINS1-210	ENST00000560934	SRPX2	O60687	465 aa	Predicted RBP	4.08	□□□□□ -1.76
LINS1-210	ENST00000560934	SEC22B	O75396	215 aa		4.08	□□□□□ -1.76
LINS1-210	ENST00000560934	SERPINA6	P08185	405 aa		4.08	□□□□□ -1.76
LINS1-210	ENST00000560934	SNRNP70	P08621	437 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
LINS1-210	ENST00000560934	SMIM10L1	P0DMW3	83 aa		4.08	□□□□□ -1.76
LINS1-210	ENST00000560934	FOLR1	P15328	257 aa		4.08	□□□□□ -1.76
LINS1-210	ENST00000560934	LBP	P18428	481 aa		4.08	□□□□□ -1.76
LINS1-210	ENST00000560934	NELFE	P18615	380 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
LINS1-210	ENST00000560934	CCKBR	P32239	447 aa		4.08	□□□□□ -1.76
LINS1-210	ENST00000560934	AHR	P35869	848 aa		4.08	□□□□□ -1.76
LINS1-210	ENST00000560934	ACADVL	P49748	655 aa		4.08	□□□□□ -1.76
LINS1-210	ENST00000560934	DIO3	P55073	304 aa		4.08	□□□□□ -1.76
LINS1-210	ENST00000560934	CLDN6	P56747	220 aa		4.08	□□□□□ -1.76
LINS1-210	ENST00000560934	VSX2	P58304	361 aa	Predicted RBP	4.08	□□□□□ -1.76
LINS1-210	ENST00000560934	EMX2	Q04743	252 aa		4.08	□□□□□ -1.76
LINS1-210	ENST00000560934	RUNX1T1	Q06455	604 aa		4.08	□□□□□ -1.76
LINS1-210	ENST00000560934	ZFP36L1	Q07352	338 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
LINS1-210	ENST00000560934	BPTF	Q12830	3046 aa		4.08	□□□□□ -1.76
LINS1-210	ENST00000560934	IFT88	Q13099	833 aa		4.08	□□□□□ -1.76
LINS1-210	ENST00000560934	DEFB110	Q30KQ9	67 aa		4.08	□□□□□ -1.76
LINS1-210	ENST00000560934	OTOGL	Q3ZCN5	2332 aa		4.08	□□□□□ -1.76
LINS1-210	ENST00000560934	XKR7	Q5GH72	579 aa		4.08	□□□□□ -1.76
LINS1-210	ENST00000560934	C6orf136	Q5SQH8	315 aa		4.08	□□□□□ -1.76
LINS1-210	ENST00000560934	IL23R	Q5VWK5	629 aa		4.08	□□□□□ -1.76
LINS1-210	ENST00000560934	OR7E24	Q6IFN5	339 aa		4.08	□□□□□ -1.76
LINS1-210	ENST00000560934	RNF165	Q6ZSG1	346 aa		4.08	□□□□□ -1.76
LINS1-210	ENST00000560934	ARHGAP22	Q7Z5H3	698 aa		4.08	□□□□□ -1.76
LINS1-210	ENST00000560934	ASPG	Q86U10	573 aa		4.08	□□□□□ -1.76
LINS1-210	ENST00000560934	EPHX4	Q8IUS5	362 aa		4.08	□□□□□ -1.76
LINS1-210	ENST00000560934	NAXD	Q8IW45	347 aa		4.08	□□□□□ -1.76
LINS1-210	ENST00000560934	GCSAM	Q8N6F7	178 aa		4.08	□□□□□ -1.76
LINS1-210	ENST00000560934	C1orf52	Q8N6N3	182 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
LINS1-210	ENST00000560934	GBP7	Q8N8V2	638 aa	Predicted RBP	4.08	□□□□□ -1.76
LINS1-210	ENST00000560934	CCDC197	Q8NCU1	140 aa		4.08	□□□□□ -1.76
LINS1-210	ENST00000560934	DEFB124	Q8NES8	71 aa		4.08	□□□□□ -1.76
LINS1-210	ENST00000560934	OR4D9	Q8NGE8	314 aa		4.08	□□□□□ -1.76
LINS1-210	ENST00000560934	SLC13A3	Q8WWT9	602 aa		4.08	□□□□□ -1.76
LINS1-210	ENST00000560934	UCN3	Q969E3	161 aa		4.08	□□□□□ -1.76
LINS1-210	ENST00000560934	UBE2E3	Q969T4	207 aa		4.08	□□□□□ -1.76
LINS1-210	ENST00000560934	TUBGCP3	Q96CW5	907 aa		4.08	□□□□□ -1.76
LINS1-210	ENST00000560934	MS4A6E	Q96DS6	147 aa		4.08	□□□□□ -1.76
LINS1-210	ENST00000560934	C19orf60	Q96EN9	201 aa		4.08	□□□□□ -1.76
LINS1-210	ENST00000560934	C11orf24	Q96F05	449 aa	Predicted RBP	4.08	□□□□□ -1.76
LINS1-210	ENST00000560934	SMIM10	Q96HG1	83 aa		4.08	□□□□□ -1.76
LINS1-210	ENST00000560934	RILP	Q96NA2	401 aa		4.08	□□□□□ -1.76
LINS1-210	ENST00000560934	SIKE1	Q9BRV8	207 aa		4.08	□□□□□ -1.76
LINS1-210	ENST00000560934	CCDC28B	Q9BUN5	200 aa		4.08	□□□□□ -1.76
LINS1-210	ENST00000560934	MS4A8	Q9BY19	250 aa		4.08	□□□□□ -1.76
LINS1-210	ENST00000560934	MRPL1	Q9BYD6	325 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
LINS1-210	ENST00000560934	CHRNA10	Q9GZZ6	450 aa		4.08	□□□□□ -1.76
LINS1-210	ENST00000560934	NSRP1	Q9H0G5	558 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
LINS1-210	ENST00000560934	SEMA6A	Q9H2E6	1030 aa		4.08	□□□□□ -1.76
LINS1-210	ENST00000560934	SYNDIG1	Q9H7V2	258 aa		4.08	□□□□□ -1.76
LINS1-210	ENST00000560934	LRTM1	Q9HBL6	345 aa		4.08	□□□□□ -1.76
LINS1-210	ENST00000560934	LHX9	Q9NQ69	397 aa		4.08	□□□□□ -1.76

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