RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000548849.5

CS-214, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 3

Gene CS, Length 1,028 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-214ENST00000548849 AGR3Q8TD06 166 aa14.98□□□□□ -0.01
CS-214ENST00000548849 SFXN5Q8TD22 340 aa14.98□□□□□ -0.01
CS-214ENST00000548849 ST8SIA1Q92185 356 aa14.98□□□□□ -0.01
CS-214ENST00000548849 PRPF18Q99633 342 aaKnown RBP14.98□□□□□ -0.01
CS-214ENST00000548849 RHOXF2Q9BQY4 288 aa14.98□□□□□ -0.01
CS-214ENST00000548849 C1orf50Q9BV19 199 aa14.98□□□□□ -0.01
CS-214ENST00000548849 BEX2Q9BXY8 128 aa14.98□□□□□ -0.01
CS-214ENST00000548849 LAT2Q9GZY6 243 aa14.98□□□□□ -0.01
CS-214ENST00000548849 NOSIPQ9Y314 301 aaKnown RBP14.98□□□□□ -0.01
CS-214ENST00000548849 NUP214P35658 2090 aaPredicted RBP14.97□□□□□ -0.01
CS-214ENST00000548849 A0A096LNT2 108 aa14.97□□□□□ -0.01
CS-214ENST00000548849 GOLGA8QA0A0J9YX86 632 aa14.97□□□□□ -0.01
CS-214ENST00000548849 A0A1W2PR80 420 aa14.97□□□□□ -0.01
CS-214ENST00000548849 GOLGA8OA6NCC3 632 aa14.97□□□□□ -0.01
CS-214ENST00000548849 GOLGA8NF8WBI6 632 aa14.97□□□□□ -0.01
CS-214ENST00000548849 LYPLA1O75608 230 aaPredicted RBP14.97□□□□□ -0.01
CS-214ENST00000548849 SLU7O95391 586 aaKnown RBP14.97□□□□□ -0.01
CS-214ENST00000548849 TFPIP10646 304 aa14.97□□□□□ -0.01
CS-214ENST00000548849 MATN1P21941 496 aa14.97□□□□□ -0.01
CS-214ENST00000548849 PTAFRP25105 342 aa14.97□□□□□ -0.01
CS-214ENST00000548849 SOAT1P35610 550 aa14.97□□□□□ -0.01
CS-214ENST00000548849 LOXL1Q08397 574 aaPredicted RBP14.97□□□□□ -0.01
CS-214ENST00000548849 SPOCK1Q08629 439 aa14.97□□□□□ -0.01
CS-214ENST00000548849 UGT3A2Q3SY77 523 aa14.97□□□□□ -0.01
CS-214ENST00000548849 ATP6AP1LQ52LC2 224 aa14.97□□□□□ -0.01
CS-214ENST00000548849 SYT14P1Q58G82 188 aa14.97□□□□□ -0.01
CS-214ENST00000548849 BHLHB9Q6PI77 547 aa14.97□□□□□ -0.01
CS-214ENST00000548849 MTDHQ86UE4 582 aaKnown RBP14.97□□□□□ -0.01
CS-214ENST00000548849 GSPT2Q8IYD1 628 aaKnown RBP14.97□□□□□ -0.01
CS-214ENST00000548849 KRTCAP2Q8N6L1 136 aa14.97□□□□□ -0.01
CS-214ENST00000548849 ZNF525Q8N782 197 aa14.97□□□□□ -0.01
CS-214ENST00000548849 UBLCP1Q8WVY7 318 aaPredicted RBP14.97□□□□□ -0.01
CS-214ENST00000548849 TMEM234Q8WY98 164 aa14.97□□□□□ -0.01
CS-214ENST00000548849 COQ8BQ96D53 544 aa14.97□□□□□ -0.01
CS-214ENST00000548849 EMC3Q9P0I2 261 aa14.97□□□□□ -0.01
CS-214ENST00000548849 ELOA3DA6NLF2 546 aaPredicted RBP14.96□□□□□ -0.01
CS-214ENST00000548849 DUXAA6NLW8 204 aa14.96□□□□□ -0.01
CS-214ENST00000548849 M0R1B8 84 aa14.96□□□□□ -0.01
CS-214ENST00000548849 CSTAP01040 98 aa14.96□□□□□ -0.01
CS-214ENST00000548849 UBTFL6P0CB48 400 aaPredicted RBP14.96□□□□□ -0.01
CS-214ENST00000548849 DHRS4L1P0CG22 281 aa14.96□□□□□ -0.01
CS-214ENST00000548849 SLC25A16P16260 332 aa14.96□□□□□ -0.01
CS-214ENST00000548849 PGCP20142 388 aa14.96□□□□□ -0.01
CS-214ENST00000548849 CD40P25942 277 aa14.96□□□□□ -0.01
CS-214ENST00000548849 RPS26P62854 115 aaKnown RBP14.96□□□□□ -0.01
CS-214ENST00000548849 SKP2Q13309 424 aa14.96□□□□□ -0.01
CS-214ENST00000548849 ELOA3BQ3SY89 546 aa14.96□□□□□ -0.01
CS-214ENST00000548849 IL23RQ5VWK5 629 aa14.96□□□□□ -0.01
CS-214ENST00000548849 ABLIM2Q6H8Q1 611 aa14.96□□□□□ -0.01
CS-214ENST00000548849 ELOA3Q8NG57 546 aa14.96□□□□□ -0.01
CS-214ENST00000548849 APH1AQ96BI3 265 aa14.96□□□□□ -0.01
CS-214ENST00000548849 ZHX1-C8orf76Q96EF9 292 aa14.96□□□□□ -0.01
CS-214ENST00000548849 DNAJA3Q96EY1 480 aa14.96□□□□□ -0.01
CS-214ENST00000548849 DUSP26Q9BV47 211 aa14.96□□□□□ -0.01
CS-214ENST00000548849 NMUR2Q9GZQ4 415 aa14.96□□□□□ -0.01
CS-214ENST00000548849 MANSC1Q9H8J5 431 aa14.96□□□□□ -0.01
CS-214ENST00000548849 EML4Q9HC35 981 aaKnown RBP14.96□□□□□ -0.01
CS-214ENST00000548849 ACER3Q9NUN7 267 aa14.96□□□□□ -0.01
CS-214ENST00000548849 KCNE5Q9UJ90 142 aa14.96□□□□□ -0.01
CS-214ENST00000548849 MKLN1Q9UL63 735 aa14.96□□□□□ -0.01
CS-214ENST00000548849 SLC25A15Q9Y619 301 aa14.96□□□□□ -0.01
CS-214ENST00000548849 IGKV3D-15A0A087WSY6 115 aa14.95□□□□□ -0.02
CS-214ENST00000548849 NPHS1O60500 1241 aa14.95□□□□□ -0.02
CS-214ENST00000548849 FCMRO60667 390 aa14.95□□□□□ -0.02
CS-214ENST00000548849 DNAJA2O60884 412 aa14.95□□□□□ -0.02
CS-214ENST00000548849 STX11O75558 287 aa14.95□□□□□ -0.02
CS-214ENST00000548849 UGT2B17O75795 530 aa14.95□□□□□ -0.02
CS-214ENST00000548849 AK1P00568 194 aa14.95□□□□□ -0.02
CS-214ENST00000548849 ALDH3A1P30838 453 aa14.95□□□□□ -0.02
CS-214ENST00000548849 CASP9P55211 416 aa14.95□□□□□ -0.02
CS-214ENST00000548849 HBA1P69905 142 aa14.95□□□□□ -0.02
CS-214ENST00000548849 VLDLRP98155 873 aa14.95□□□□□ -0.02
CS-214ENST00000548849 PDK3Q15120 406 aa14.95□□□□□ -0.02
CS-214ENST00000548849 ZNF141Q15928 474 aa14.95□□□□□ -0.02
CS-214ENST00000548849 C6orf136Q5SQH8 315 aa14.95□□□□□ -0.02
CS-214ENST00000548849 B3GLCTQ6Y288 498 aa14.95□□□□□ -0.02
CS-214ENST00000548849 EIF3MQ7L2H7 374 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
CS-214ENST00000548849 OLIG3Q7RTU3 272 aa14.95□□□□□ -0.02
CS-214ENST00000548849 C6orf120Q7Z4R8 191 aa14.95□□□□□ -0.02
CS-214ENST00000548849 FNDC5Q8NAU1 212 aa14.95□□□□□ -0.02
CS-214ENST00000548849 ZNF563Q8TA94 476 aa14.95□□□□□ -0.02
CS-214ENST00000548849 EPS8L3Q8TE67 593 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
CS-214ENST00000548849 SLC25A43Q8WUT9 341 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
CS-214ENST00000548849 FAM168AQ92567 244 aa14.95□□□□□ -0.02
CS-214ENST00000548849 C1QTNF6Q9BXI9 259 aa14.95□□□□□ -0.02
CS-214ENST00000548849 BHLHE41Q9C0J9 482 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
CS-214ENST00000548849 ASB6Q9NWX5 421 aa14.95□□□□□ -0.02
CS-214ENST00000548849 SPIN1Q9Y657 262 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
CS-214ENST00000548849 ATP23Q9Y6H3 246 aa14.95□□□□□ -0.02
CS-214ENST00000548849 CENPVL1A0A0U1RR11 272 aa14.94□□□□□ -0.02
CS-214ENST00000548849 MRPL33O75394 65 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
CS-214ENST00000548849 PRPS1L1P21108 318 aa14.94□□□□□ -0.02
CS-214ENST00000548849 APOBEC1P41238 236 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
CS-214ENST00000548849 PGS1Q32NB8 556 aa14.94□□□□□ -0.02
CS-214ENST00000548849 ARHGAP11BQ3KRB8 267 aa14.94□□□□□ -0.02
CS-214ENST00000548849 XKR7Q5GH72 579 aa14.94□□□□□ -0.02
CS-214ENST00000548849 CYB5R2Q6BCY4 276 aa14.94□□□□□ -0.02
CS-214ENST00000548849 C16orf62Q7Z3J2 963 aa14.94□□□□□ -0.02
CS-214ENST00000548849 CLEC4FQ8N1N0 589 aa14.94□□□□□ -0.02
CS-214ENST00000548849 SLC35G5Q96KT7 338 aa14.94□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.5 ms