RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000540109.5

PTPRD-214, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type D, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene PTPRD, Length 6,210 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRD-214ENST00000540109 RAB7BQ96AH8 199 aa5.67□□□□□ -1.5
PTPRD-214ENST00000540109 SCMH1Q96GD3 660 aa5.67□□□□□ -1.5
PTPRD-214ENST00000540109 HS6ST2Q96MM7 605 aa5.67□□□□□ -1.5
PTPRD-214ENST00000540109 DOHHQ9BU89 302 aa5.67□□□□□ -1.5
PTPRD-214ENST00000540109 TTTY10Q9BZA0 68 aa5.67□□□□□ -1.5
PTPRD-214ENST00000540109 RBM38Q9H0Z9 239 aaKnown RBP5.67□□□□□ -1.5
PTPRD-214ENST00000540109 SMDT1Q9H4I9 107 aa5.67□□□□□ -1.5
PTPRD-214ENST00000540109 ELL3Q9HB65 397 aaPredicted RBP5.67□□□□□ -1.5
PTPRD-214ENST00000540109 SDHAF3Q9NRP4 125 aa5.67□□□□□ -1.5
PTPRD-214ENST00000540109 ACOXLQ9NUZ1 547 aa5.67□□□□□ -1.5
PTPRD-214ENST00000540109 PARPBPQ9NWS1 579 aa5.67□□□□□ -1.5
PTPRD-214ENST00000540109 HCSTQ9UBK5 93 aa5.67□□□□□ -1.5
PTPRD-214ENST00000540109 ZNF629Q9UEG4 869 aaPredicted RBP5.67□□□□□ -1.5
PTPRD-214ENST00000540109 MBD1Q9UIS9 605 aaPredicted RBP5.67□□□□□ -1.5
PTPRD-214ENST00000540109 PTGDR2Q9Y5Y4 395 aa5.67□□□□□ -1.5
PTPRD-214ENST00000540109 PUS1Q9Y606 427 aaKnown RBP eCLIP5.67□□□□□ -1.5
PTPRD-214ENST00000540109 OBSL1O75147 1896 aa5.67□□□□□ -1.5
PTPRD-214ENST00000540109 FAM230AA0A1W2PPH8 454 aa5.67□□□□□ -1.5
PTPRD-214ENST00000540109 LNP1A1A4G5 178 aa5.67□□□□□ -1.5
PTPRD-214ENST00000540109 SOX15O60248 233 aa5.67□□□□□ -1.5
PTPRD-214ENST00000540109 PGAM2P15259 253 aa5.67□□□□□ -1.5
PTPRD-214ENST00000540109 MC3RP41968 323 aa5.67□□□□□ -1.5
PTPRD-214ENST00000540109 SPINT3P49223 89 aa5.67□□□□□ -1.5
PTPRD-214ENST00000540109 WNT4P56705 351 aa5.67□□□□□ -1.5
PTPRD-214ENST00000540109 ADARB1P78563 741 aaKnown RBP5.67□□□□□ -1.5
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PTPRD-214ENST00000540109 GPR176Q14439 515 aa5.67□□□□□ -1.5
PTPRD-214ENST00000540109 ZNF77Q15935 545 aa5.67□□□□□ -1.5
PTPRD-214ENST00000540109 PLPP4Q5VZY2 271 aa5.67□□□□□ -1.5
PTPRD-214ENST00000540109 DNM1P34Q6PK57 102 aa5.67□□□□□ -1.5
PTPRD-214ENST00000540109 UBAC2Q8NBM4 344 aa5.67□□□□□ -1.5
PTPRD-214ENST00000540109 FRZBQ92765 325 aa5.67□□□□□ -1.5
PTPRD-214ENST00000540109 RGMAQ96B86 450 aa5.67□□□□□ -1.5
PTPRD-214ENST00000540109 CDCA3Q99618 268 aaPredicted RBP5.67□□□□□ -1.5
PTPRD-214ENST00000540109 ELOVL1Q9BW60 279 aa5.67□□□□□ -1.5
PTPRD-214ENST00000540109 ATG5Q9H1Y0 275 aa5.67□□□□□ -1.5
PTPRD-214ENST00000540109 NOSIPQ9Y314 301 aaKnown RBP5.67□□□□□ -1.5
PTPRD-214ENST00000540109 ANAPC1Q9H1A4 1944 aa5.67□□□□□ -1.5
PTPRD-214ENST00000540109 TMEM235A6NFC5 223 aa5.67□□□□□ -1.5
PTPRD-214ENST00000540109 RHOP08100 348 aa5.67□□□□□ -1.5
PTPRD-214ENST00000540109 ATP1B2P14415 290 aaPredicted RBP5.67□□□□□ -1.5
PTPRD-214ENST00000540109 PTAFRP25105 342 aa5.67□□□□□ -1.5
PTPRD-214ENST00000540109 AKR1C3P42330 323 aa5.67□□□□□ -1.5
PTPRD-214ENST00000540109 OR3A2P47893 321 aa5.67□□□□□ -1.5
PTPRD-214ENST00000540109 C21orf58P58505 322 aa5.67□□□□□ -1.5
PTPRD-214ENST00000540109 VASNQ6EMK4 673 aa5.67□□□□□ -1.5
PTPRD-214ENST00000540109 APCDD1Q8J025 514 aa5.67□□□□□ -1.5
PTPRD-214ENST00000540109 L3MBTL4Q8NA19 623 aa5.67□□□□□ -1.5
PTPRD-214ENST00000540109 ZBED6CLQ96FA7 236 aaPredicted RBP5.67□□□□□ -1.5
PTPRD-214ENST00000540109 PKP4Q99569 1192 aa5.67□□□□□ -1.5
PTPRD-214ENST00000540109 NPAS1Q99742 590 aa5.67□□□□□ -1.5
PTPRD-214ENST00000540109 RSRP1Q9BUV0 290 aa5.67□□□□□ -1.5
PTPRD-214ENST00000540109 C1QTNF6Q9BXI9 259 aa5.67□□□□□ -1.5
PTPRD-214ENST00000540109 GABARAPL1Q9H0R8 117 aa5.67□□□□□ -1.5
PTPRD-214ENST00000540109 NMNAT1Q9HAN9 279 aaPredicted RBP5.67□□□□□ -1.5
PTPRD-214ENST00000540109 SPANXA1Q9NS26 97 aa5.67□□□□□ -1.5
PTPRD-214ENST00000540109 IKZF2Q9UKS7 526 aa5.67□□□□□ -1.5
PTPRD-214ENST00000540109 URGCP-MRPS24S4R325 110 aa5.67□□□□□ -1.5
PTPRD-214ENST00000540109 TTC24A2A3L6 582 aaPredicted RBP5.67□□□□□ -1.5
PTPRD-214ENST00000540109 MANBAO00462 879 aa5.67□□□□□ -1.5
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PTPRD-214ENST00000540109 ATG13O75143 517 aa5.67□□□□□ -1.5
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PTPRD-214ENST00000540109 DEFB103AP81534 67 aa5.67□□□□□ -1.5
PTPRD-214ENST00000540109 CDK3Q00526 305 aa5.67□□□□□ -1.5
PTPRD-214ENST00000540109 IFITM2Q01629 132 aa5.67□□□□□ -1.5
PTPRD-214ENST00000540109 GNMTQ14749 295 aa5.67□□□□□ -1.5
PTPRD-214ENST00000540109 COX19Q49B96 90 aa5.67□□□□□ -1.5
PTPRD-214ENST00000540109 OR4C5Q8NGB2 326 aa5.67□□□□□ -1.5
PTPRD-214ENST00000540109 EDAQ92838 391 aa5.67□□□□□ -1.5
PTPRD-214ENST00000540109 ACTRT3Q9BYD9 372 aa5.67□□□□□ -1.5
PTPRD-214ENST00000540109 DUSP21Q9H596 190 aa5.67□□□□□ -1.5
PTPRD-214ENST00000540109 FAM212BQ9NTI7 297 aaPredicted RBP5.67□□□□□ -1.5
PTPRD-214ENST00000540109 FBXO10Q9UK96 956 aa5.67□□□□□ -1.5
PTPRD-214ENST00000540109 STRAPQ9Y3F4 350 aaKnown RBP5.67□□□□□ -1.5
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PTPRD-214ENST00000540109 J3QLW9 94 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRD-214ENST00000540109 AK1P00568 194 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRD-214ENST00000540109 SFTPBP07988 381 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRD-214ENST00000540109 ZNF19P17023 458 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRD-214ENST00000540109 PSMB1P20618 241 aaKnown RBP5.66□□□□□ -1.5
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PTPRD-214ENST00000540109 CD70P32970 193 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRD-214ENST00000540109 CCR6P51684 374 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRD-214ENST00000540109 VAMP3Q15836 100 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRD-214ENST00000540109 ZNF805Q5CZA5 627 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRD-214ENST00000540109 B3GLCTQ6Y288 498 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRD-214ENST00000540109 NUP54Q7Z3B4 507 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRD-214ENST00000540109 CDH26Q8IXH8 852 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRD-214ENST00000540109 TSTD1Q8NFU3 115 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRD-214ENST00000540109 OR4E2Q8NGC2 313 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRD-214ENST00000540109 OR10D4PQ8NGN7 298 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRD-214ENST00000540109 DCUN1D4Q92564 292 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRD-214ENST00000540109 DNAJA3Q96EY1 480 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRD-214ENST00000540109 CCNL2Q96S94 520 aaPredicted RBP5.66□□□□□ -1.5
PTPRD-214ENST00000540109 ZNF587Q96SQ5 575 aaPredicted RBP5.66□□□□□ -1.5
PTPRD-214ENST00000540109 MICU1Q9BPX6 476 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRD-214ENST00000540109 WRAP53Q9BUR4 548 aaKnown RBP5.66□□□□□ -1.5
PTPRD-214ENST00000540109 TM6SF2Q9BZW4 377 aa5.66□□□□□ -1.5
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