RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000534198.1

RBM4B-208, Transcript of RNA binding motif protein 4B, human

TSL 3

Gene RBM4B, Length 431 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBM4B-208	ENST00000534198	IGFBP1	P08833	259 aa	Predicted RBP	7.58	□□□□□ -1.2
RBM4B-208	ENST00000534198	SNRPA	P09012	282 aa	Known RBP	7.58	□□□□□ -1.2
RBM4B-208	ENST00000534198	HPGD	P15428	266 aa		7.58	□□□□□ -1.2
RBM4B-208	ENST00000534198	TAC1	P20366	129 aa		7.58	□□□□□ -1.2
RBM4B-208	ENST00000534198	EFNA1	P20827	205 aa	Predicted RBP	7.58	□□□□□ -1.2
RBM4B-208	ENST00000534198	PHB	P35232	272 aa		7.58	□□□□□ -1.2
RBM4B-208	ENST00000534198	COMP	P49747	757 aa	Predicted RBP	7.58	□□□□□ -1.2
RBM4B-208	ENST00000534198	DIO1	P49895	249 aa		7.58	□□□□□ -1.2
RBM4B-208	ENST00000534198	GYS2	P54840	703 aa		7.58	□□□□□ -1.2
RBM4B-208	ENST00000534198	SESN3	P58005	492 aa		7.58	□□□□□ -1.2
RBM4B-208	ENST00000534198	PHC1	P78364	1004 aa		7.58	□□□□□ -1.2
RBM4B-208	ENST00000534198	POU6F2	P78424	691 aa	Predicted RBP	7.58	□□□□□ -1.2
RBM4B-208	ENST00000534198	H3F3A	P84243	136 aa		7.58	□□□□□ -1.2
RBM4B-208	ENST00000534198	CHRNB3	Q05901	458 aa		7.58	□□□□□ -1.2
RBM4B-208	ENST00000534198	SELENBP1	Q13228	472 aa		7.58	□□□□□ -1.2
RBM4B-208	ENST00000534198	MLC1	Q15049	377 aa		7.58	□□□□□ -1.2
RBM4B-208	ENST00000534198	TIGD2	Q4W5G0	525 aa		7.58	□□□□□ -1.2
RBM4B-208	ENST00000534198	RFTN2	Q52LD8	501 aa	Predicted RBP	7.58	□□□□□ -1.2
RBM4B-208	ENST00000534198	AP1AR	Q63HQ0	302 aa		7.58	□□□□□ -1.2
RBM4B-208	ENST00000534198	KLHL17	Q6TDP4	642 aa		7.58	□□□□□ -1.2
RBM4B-208	ENST00000534198	GSPT2	Q8IYD1	628 aa	Known RBP	7.58	□□□□□ -1.2
RBM4B-208	ENST00000534198	COX18	Q8N8Q8	333 aa		7.58	□□□□□ -1.2
RBM4B-208	ENST00000534198	ANKS4B	Q8N8V4	417 aa		7.58	□□□□□ -1.2
RBM4B-208	ENST00000534198	OR52E4	Q8NGH9	312 aa		7.58	□□□□□ -1.2
RBM4B-208	ENST00000534198	OR2T11	Q8NH01	316 aa		7.58	□□□□□ -1.2
RBM4B-208	ENST00000534198	ARL8A	Q96BM9	186 aa		7.58	□□□□□ -1.2
RBM4B-208	ENST00000534198	TLCD1	Q96CP7	247 aa		7.58	□□□□□ -1.2
RBM4B-208	ENST00000534198	BOD1	Q96IK1	185 aa		7.58	□□□□□ -1.2
RBM4B-208	ENST00000534198	METTL2A	Q96IZ6	378 aa	Known RBP	7.58	□□□□□ -1.2
RBM4B-208	ENST00000534198	OR5B2	Q96R09	309 aa		7.58	□□□□□ -1.2
RBM4B-208	ENST00000534198	BPESC1	Q9GZL8	116 aa		7.58	□□□□□ -1.2
RBM4B-208	ENST00000534198	HOXD1	Q9GZZ0	328 aa		7.58	□□□□□ -1.2
RBM4B-208	ENST00000534198	CDC42EP4	Q9H3Q1	356 aa	Known RBP	7.58	□□□□□ -1.2
RBM4B-208	ENST00000534198	TUBB1	Q9H4B7	451 aa		7.58	□□□□□ -1.2
RBM4B-208	ENST00000534198	MID1IP1	Q9NPA3	183 aa		7.58	□□□□□ -1.2
RBM4B-208	ENST00000534198	GPATCH2	Q9NW75	528 aa		7.58	□□□□□ -1.2
RBM4B-208	ENST00000534198	TAS2R16	Q9NYV7	291 aa		7.58	□□□□□ -1.2
RBM4B-208	ENST00000534198	MALT1	Q9UDY8	824 aa		7.58	□□□□□ -1.2
RBM4B-208	ENST00000534198	EMCN	Q9ULC0	261 aa		7.58	□□□□□ -1.2
RBM4B-208	ENST00000534198	DTNA	Q9Y4J8	743 aa		7.58	□□□□□ -1.2
RBM4B-208	ENST00000534198	PTGDR2	Q9Y5Y4	395 aa		7.58	□□□□□ -1.2
RBM4B-208	ENST00000534198	ATP23	Q9Y6H3	246 aa		7.58	□□□□□ -1.2
RBM4B-208	ENST00000534198	PMF1-BGLAP	U3KQ54	211 aa		7.58	□□□□□ -1.2
RBM4B-208	ENST00000534198	TENM1	Q9UKZ4	2725 aa		7.58	□□□□□ -1.2
RBM4B-208	ENST00000534198	CENPVL1	A0A0U1RR11	272 aa		7.57	□□□□□ -1.2
RBM4B-208	ENST00000534198	ERICH4	A6NGS2	130 aa		7.57	□□□□□ -1.2
RBM4B-208	ENST00000534198	ATP6V1G2-DDX39B	F2Z307	99 aa		7.57	□□□□□ -1.2
RBM4B-208	ENST00000534198	POC1B-GALNT4	F8VUJ3	575 aa		7.57	□□□□□ -1.2
RBM4B-208	ENST00000534198	AKAP10	O43572	662 aa		7.57	□□□□□ -1.2
RBM4B-208	ENST00000534198	KIAA0513	O60268	411 aa		7.57	□□□□□ -1.2
RBM4B-208	ENST00000534198	EIF4E2	O60573	245 aa	Known RBP	7.57	□□□□□ -1.2
RBM4B-208	ENST00000534198	BCAS1	O75363	584 aa	Predicted RBP	7.57	□□□□□ -1.2
RBM4B-208	ENST00000534198	SEC22B	O75396	215 aa		7.57	□□□□□ -1.2
RBM4B-208	ENST00000534198	STAMBP	O95630	424 aa		7.57	□□□□□ -1.2
RBM4B-208	ENST00000534198	TACSTD2	P09758	323 aa		7.57	□□□□□ -1.2
RBM4B-208	ENST00000534198	SDC1	P18827	310 aa		7.57	□□□□□ -1.2
RBM4B-208	ENST00000534198	GIF	P27352	417 aa		7.57	□□□□□ -1.2
RBM4B-208	ENST00000534198	SLC7A1	P30825	629 aa		7.57	□□□□□ -1.2
RBM4B-208	ENST00000534198	MDH1	P40925	334 aa	Known RBP	7.57	□□□□□ -1.2
RBM4B-208	ENST00000534198	SLC16A1	P53985	500 aa		7.57	□□□□□ -1.2
RBM4B-208	ENST00000534198	SKP2	Q13309	424 aa		7.57	□□□□□ -1.2
RBM4B-208	ENST00000534198	LASP1	Q14847	261 aa	Known RBP	7.57	□□□□□ -1.2
RBM4B-208	ENST00000534198	OR7E24	Q6IFN5	339 aa		7.57	□□□□□ -1.2
RBM4B-208	ENST00000534198	CDC73	Q6P1J9	531 aa		7.57	□□□□□ -1.2
RBM4B-208	ENST00000534198	C12orf54	Q6X4T0	127 aa		7.57	□□□□□ -1.2
RBM4B-208	ENST00000534198	SLC22A9	Q8IVM8	553 aa		7.57	□□□□□ -1.2
RBM4B-208	ENST00000534198	CCDC103	Q8IW40	242 aa		7.57	□□□□□ -1.2
RBM4B-208	ENST00000534198	SEMA6D	Q8NFY4	1073 aa		7.57	□□□□□ -1.2
RBM4B-208	ENST00000534198	PSMA8	Q8TAA3	256 aa		7.57	□□□□□ -1.2
RBM4B-208	ENST00000534198	IFT81	Q8WYA0	676 aa		7.57	□□□□□ -1.2
RBM4B-208	ENST00000534198	APH1A	Q96BI3	265 aa		7.57	□□□□□ -1.2
RBM4B-208	ENST00000534198	C3orf49	Q96BT1	292 aa		7.57	□□□□□ -1.2
RBM4B-208	ENST00000534198	FBXO17	Q96EF6	278 aa		7.57	□□□□□ -1.2
RBM4B-208	ENST00000534198	ARL5B	Q96KC2	179 aa		7.57	□□□□□ -1.2
RBM4B-208	ENST00000534198	SDF2	Q99470	211 aa		7.57	□□□□□ -1.2
RBM4B-208	ENST00000534198	PIMREG	Q9BSJ6	248 aa		7.57	□□□□□ -1.2
RBM4B-208	ENST00000534198	THUMPD3	Q9BV44	507 aa	Known RBP	7.57	□□□□□ -1.2
RBM4B-208	ENST00000534198	ROPN1B	Q9BZX4	212 aa	Predicted RBP	7.57	□□□□□ -1.2
RBM4B-208	ENST00000534198	BHLHE41	Q9C0J9	482 aa	Predicted RBP	7.57	□□□□□ -1.2
RBM4B-208	ENST00000534198	LAT2	Q9GZY6	243 aa		7.57	□□□□□ -1.2
RBM4B-208	ENST00000534198	ROPN1	Q9HAT0	212 aa	Predicted RBP	7.57	□□□□□ -1.2
RBM4B-208	ENST00000534198	SLC17A5	Q9NRA2	495 aa		7.57	□□□□□ -1.2
RBM4B-208	ENST00000534198	ASB6	Q9NWX5	421 aa		7.57	□□□□□ -1.2
RBM4B-208	ENST00000534198	SH3BP4	Q9P0V3	963 aa		7.57	□□□□□ -1.2
RBM4B-208	ENST00000534198	TMEFF2	Q9UIK5	374 aa	Predicted RBP	7.57	□□□□□ -1.2
RBM4B-208	ENST00000534198	MOK	Q9UQ07	419 aa		7.57	□□□□□ -1.2
RBM4B-208	ENST00000534198	STK38L	Q9Y2H1	464 aa		7.57	□□□□□ -1.2
RBM4B-208	ENST00000534198	NOSIP	Q9Y314	301 aa	Known RBP	7.57	□□□□□ -1.2
RBM4B-208	ENST00000534198	TRAF6	Q9Y4K3	522 aa		7.57	□□□□□ -1.2
RBM4B-208	ENST00000534198	TRRAP	Q9Y4A5	3859 aa		7.56	□□□□□ -1.2
RBM4B-208	ENST00000534198	TMEM129	A0AVI4	362 aa		7.56	□□□□□ -1.2
RBM4B-208	ENST00000534198	TMEM89	A2RUT3	159 aa		7.56	□□□□□ -1.2
RBM4B-208	ENST00000534198	SERINC4	A6NH21	518 aa		7.56	□□□□□ -1.2
RBM4B-208	ENST00000534198	CCT8L1P	A6NM43	557 aa		7.56	□□□□□ -1.2
RBM4B-208	ENST00000534198	GTPBP1	O00178	669 aa	Known RBP	7.56	□□□□□ -1.2
RBM4B-208	ENST00000534198	ZNF264	O43296	627 aa		7.56	□□□□□ -1.2
RBM4B-208	ENST00000534198	FCMR	O60667	390 aa		7.56	□□□□□ -1.2
RBM4B-208	ENST00000534198	NUDT14	O95848	222 aa		7.56	□□□□□ -1.2
RBM4B-208	ENST00000534198	MYZAP	P0CAP1	466 aa		7.56	□□□□□ -1.2
RBM4B-208	ENST00000534198	BMP4	P12644	408 aa		7.56	□□□□□ -1.2

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