RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000532538.1

BRPF3-210, Transcript of bromodomain and PHD finger containing 3, humanhuman

TSL 4

Gene BRPF3, Length 567 nt, Biotype retained intron.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRPF3-210ENST00000532538 TMEM108Q6UXF1 575 aa13.43□□□□□ -0.26
BRPF3-210ENST00000532538 TMPPEQ6ZT21 453 aa13.43□□□□□ -0.26
BRPF3-210ENST00000532538 EIF3MQ7L2H7 374 aaKnown RBP13.43□□□□□ -0.26
BRPF3-210ENST00000532538 C6orf120Q7Z4R8 191 aa13.43□□□□□ -0.26
BRPF3-210ENST00000532538 P2RY8Q86VZ1 359 aa13.43□□□□□ -0.26
BRPF3-210ENST00000532538 CLEC4FQ8N1N0 589 aa13.43□□□□□ -0.26
BRPF3-210ENST00000532538 OR4A15Q8NGL6 344 aa13.43□□□□□ -0.26
BRPF3-210ENST00000532538 ST8SIA1Q92185 356 aa13.43□□□□□ -0.26
BRPF3-210ENST00000532538 APH1AQ96BI3 265 aa13.43□□□□□ -0.26
BRPF3-210ENST00000532538 RADILQ96JH8 1075 aa13.43□□□□□ -0.26
BRPF3-210ENST00000532538 MGAT4BQ9UQ53 548 aa13.43□□□□□ -0.26
BRPF3-210ENST00000532538 B3GALT5Q9Y2C3 310 aa13.43□□□□□ -0.26
BRPF3-210ENST00000532538 SONP18583 2426 aaKnown RBP13.43□□□□□ -0.26
BRPF3-210ENST00000532538 RNF103-CHMP3A0A140T963 221 aa13.42□□□□□ -0.26
BRPF3-210ENST00000532538 FAM234BA2RU67 622 aa13.42□□□□□ -0.26
BRPF3-210ENST00000532538 ZNF724A8MTY0 619 aa13.42□□□□□ -0.26
BRPF3-210ENST00000532538 SHISA9B4DS77 424 aa13.42□□□□□ -0.26
BRPF3-210ENST00000532538 CPSF4O95639 269 aaKnown RBP13.42□□□□□ -0.26
BRPF3-210ENST00000532538 CD8AP01732 235 aa13.42□□□□□ -0.26
BRPF3-210ENST00000532538 HBA1P69905 142 aa13.42□□□□□ -0.26
BRPF3-210ENST00000532538 IFFO1Q0D2I5 559 aa13.42□□□□□ -0.26
BRPF3-210ENST00000532538 MAD2L1Q13257 205 aaPredicted RBP13.42□□□□□ -0.26
BRPF3-210ENST00000532538 UGT3A2Q3SY77 523 aa13.42□□□□□ -0.26
BRPF3-210ENST00000532538 SYT14P1Q58G82 188 aa13.42□□□□□ -0.26
BRPF3-210ENST00000532538 SLC25A53Q5H9E4 307 aa13.42□□□□□ -0.26
BRPF3-210ENST00000532538 OLIG3Q7RTU3 272 aa13.42□□□□□ -0.26
BRPF3-210ENST00000532538 HIPK1Q86Z02 1210 aa13.42□□□□□ -0.26
BRPF3-210ENST00000532538 SLC25A43Q8WUT9 341 aaPredicted RBP13.42□□□□□ -0.26
BRPF3-210ENST00000532538 COQ8BQ96D53 544 aa13.42□□□□□ -0.26
BRPF3-210ENST00000532538 PPP1R36Q96LQ0 422 aa13.42□□□□□ -0.26
BRPF3-210ENST00000532538 C3orf30Q96M34 536 aa13.42□□□□□ -0.26
BRPF3-210ENST00000532538 C1QTNF6Q9BXI9 259 aa13.42□□□□□ -0.26
BRPF3-210ENST00000532538 NMUR2Q9GZQ4 415 aa13.42□□□□□ -0.26
BRPF3-210ENST00000532538 SLC17A7Q9P2U7 560 aa13.42□□□□□ -0.26
BRPF3-210ENST00000532538 UPB1Q9UBR1 384 aa13.42□□□□□ -0.26
BRPF3-210ENST00000532538 ATP23Q9Y6H3 246 aa13.42□□□□□ -0.26
BRPF3-210ENST00000532538 OR5H1A6NKK0 313 aa13.41□□□□□ -0.26
BRPF3-210ENST00000532538 NPIPB9F8W1W9 429 aa13.41□□□□□ -0.26
BRPF3-210ENST00000532538 FCMRO60667 390 aa13.41□□□□□ -0.26
BRPF3-210ENST00000532538 MRPL33O75394 65 aaKnown RBP13.41□□□□□ -0.26
BRPF3-210ENST00000532538 DHRS4L1P0CG22 281 aa13.41□□□□□ -0.26
BRPF3-210ENST00000532538 G6PDP11413 515 aa13.41□□□□□ -0.26
BRPF3-210ENST00000532538 EDNRAP25101 427 aa13.41□□□□□ -0.26
BRPF3-210ENST00000532538 OR2B6P58173 313 aa13.41□□□□□ -0.26
BRPF3-210ENST00000532538 HPCAP84074 193 aa13.41□□□□□ -0.26
BRPF3-210ENST00000532538 SKP2Q13309 424 aa13.41□□□□□ -0.26
BRPF3-210ENST00000532538 FBXW9Q5XUX1 488 aa13.41□□□□□ -0.26
BRPF3-210ENST00000532538 OR4F3Q6IEY1 312 aa13.41□□□□□ -0.26
BRPF3-210ENST00000532538 MTDHQ86UE4 582 aaKnown RBP13.41□□□□□ -0.26
BRPF3-210ENST00000532538 CLECL1Q8IZS7 167 aa13.41□□□□□ -0.26
BRPF3-210ENST00000532538 ZNF433Q8N7K0 673 aaPredicted RBP13.41□□□□□ -0.26
BRPF3-210ENST00000532538 PSMA8Q8TAA3 256 aa13.41□□□□□ -0.26
BRPF3-210ENST00000532538 XAGE5Q8WWM1 108 aa13.41□□□□□ -0.26
BRPF3-210ENST00000532538 TMEM158Q8WZ71 300 aa13.41□□□□□ -0.26
BRPF3-210ENST00000532538 HTRA1Q92743 480 aa13.41□□□□□ -0.26
BRPF3-210ENST00000532538 ZNF524Q96C55 264 aa13.41□□□□□ -0.26
BRPF3-210ENST00000532538 KCNK17Q96T54 332 aa13.41□□□□□ -0.26
BRPF3-210ENST00000532538 OR51I1Q9H343 314 aa13.41□□□□□ -0.26
BRPF3-210ENST00000532538 CBLN4Q9NTU7 201 aa13.41□□□□□ -0.26
BRPF3-210ENST00000532538 ASB6Q9NWX5 421 aa13.41□□□□□ -0.26
BRPF3-210ENST00000532538 NPAP1Q9NZP6 1156 aa13.41□□□□□ -0.26
BRPF3-210ENST00000532538 ZDHHC2Q9UIJ5 367 aa13.41□□□□□ -0.26
BRPF3-210ENST00000532538 ING1Q9UK53 422 aaPredicted RBP13.41□□□□□ -0.26
BRPF3-210ENST00000532538 WDR45Q9Y484 360 aa13.41□□□□□ -0.26
BRPF3-210ENST00000532538 IGHV4-30-2A0A087WSY4 118 aa13.4□□□□□ -0.26
BRPF3-210ENST00000532538 GPR171O14626 319 aa13.4□□□□□ -0.26
BRPF3-210ENST00000532538 ANKRD28O15084 1053 aa13.4□□□□□ -0.26
BRPF3-210ENST00000532538 GPRIN2O60269 458 aa13.4□□□□□ -0.26
BRPF3-210ENST00000532538 OR12D1P0DN82 309 aa13.4□□□□□ -0.26
BRPF3-210ENST00000532538 BMP4P12644 408 aa13.4□□□□□ -0.26
BRPF3-210ENST00000532538 PTAFRP25105 342 aa13.4□□□□□ -0.26
BRPF3-210ENST00000532538 TTKP33981 857 aa13.4□□□□□ -0.26
BRPF3-210ENST00000532538 CHI3L1P36222 383 aaPredicted RBP13.4□□□□□ -0.26
BRPF3-210ENST00000532538 APOBEC1P41238 236 aaKnown RBP13.4□□□□□ -0.26
BRPF3-210ENST00000532538 MAGEA8P43361 318 aa13.4□□□□□ -0.26
BRPF3-210ENST00000532538 DSCR9P59020 149 aa13.4□□□□□ -0.26
BRPF3-210ENST00000532538 ZNF141Q15928 474 aa13.4□□□□□ -0.26
BRPF3-210ENST00000532538 ARHGAP11BQ3KRB8 267 aa13.4□□□□□ -0.26
BRPF3-210ENST00000532538 GPAT3Q53EU6 434 aa13.4□□□□□ -0.26
BRPF3-210ENST00000532538 XKR7Q5GH72 579 aa13.4□□□□□ -0.26
BRPF3-210ENST00000532538 C9orf135Q5VTT2 229 aa13.4□□□□□ -0.26
BRPF3-210ENST00000532538 TNFAIP8L2Q6P589 184 aaPredicted RBP13.4□□□□□ -0.26
BRPF3-210ENST00000532538 DNAJC14Q6Y2X3 702 aaPredicted RBP13.4□□□□□ -0.26
BRPF3-210ENST00000532538 DTX2Q86UW9 622 aa13.4□□□□□ -0.26
BRPF3-210ENST00000532538 MUC15Q8N387 334 aa13.4□□□□□ -0.26
BRPF3-210ENST00000532538 PIGXQ8TBF5 258 aa13.4□□□□□ -0.26
BRPF3-210ENST00000532538 TCP10LQ8TDR4 215 aa13.4□□□□□ -0.26
BRPF3-210ENST00000532538 DHRS9Q9BPW9 319 aa13.4□□□□□ -0.26
BRPF3-210ENST00000532538 DPY30Q9C005 99 aa13.4□□□□□ -0.26
BRPF3-210ENST00000532538 CTPS2Q9NRF8 586 aa13.4□□□□□ -0.26
BRPF3-210ENST00000532538 ACER3Q9NUN7 267 aa13.4□□□□□ -0.26
BRPF3-210ENST00000532538 NOP53Q9NZM5 478 aaKnown RBP13.4□□□□□ -0.26
BRPF3-210ENST00000532538 CHRNA9Q9UGM1 479 aa13.4□□□□□ -0.26
BRPF3-210ENST00000532538 SLC35A3Q9Y2D2 325 aa13.4□□□□□ -0.26
BRPF3-210ENST00000532538 ZANQ9Y493 2812 aa13.39□□□□□ -0.27
BRPF3-210ENST00000532538 ESPNB1AK53 854 aa13.39□□□□□ -0.27
BRPF3-210ENST00000532538 E7EQL1 145 aa13.39□□□□□ -0.27
BRPF3-210ENST00000532538 UGT2B17O75795 530 aa13.39□□□□□ -0.27
BRPF3-210ENST00000532538 AGR2O95994 175 aa13.39□□□□□ -0.27
BRPF3-210ENST00000532538 COX5AP20674 150 aa13.39□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.8 ms