RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000531908.5

RPS13-208, Transcript of ribosomal protein S13, human

TSL 2

Gene RPS13, Length 746 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RPS13-208	ENST00000531908	CHRNG	P07510	517 aa		4.26	□□□□□ -1.73
RPS13-208	ENST00000531908	FGF4	P08620	206 aa		4.26	□□□□□ -1.73
RPS13-208	ENST00000531908	KRT16	P08779	473 aa		4.26	□□□□□ -1.73
RPS13-208	ENST00000531908	ALPI	P09923	528 aa		4.26	□□□□□ -1.73
RPS13-208	ENST00000531908	TPBGL	P0DKB5	382 aa		4.26	□□□□□ -1.73
RPS13-208	ENST00000531908	NQO1	P15559	274 aa	Known RBP	4.26	□□□□□ -1.73
RPS13-208	ENST00000531908	CD1D	P15813	335 aa		4.26	□□□□□ -1.73
RPS13-208	ENST00000531908	AOC1	P19801	751 aa		4.26	□□□□□ -1.73
RPS13-208	ENST00000531908	PTPN4	P29074	926 aa		4.26	□□□□□ -1.73
RPS13-208	ENST00000531908	RBMS1	P29558	406 aa	Known RBP	4.26	□□□□□ -1.73
RPS13-208	ENST00000531908	SERPINB5	P36952	375 aa		4.26	□□□□□ -1.73
RPS13-208	ENST00000531908	PTGER3	P43115	390 aa		4.26	□□□□□ -1.73
RPS13-208	ENST00000531908	TTPA	P49638	278 aa		4.26	□□□□□ -1.73
RPS13-208	ENST00000531908	RPL14	P50914	215 aa	Known RBP	4.26	□□□□□ -1.73
RPS13-208	ENST00000531908	KPNA2	P52292	529 aa	Known RBP	4.26	□□□□□ -1.73
RPS13-208	ENST00000531908	KCNJ2	P63252	427 aa		4.26	□□□□□ -1.73
RPS13-208	ENST00000531908	ELF3	P78545	371 aa	Predicted RBP	4.26	□□□□□ -1.73
RPS13-208	ENST00000531908	ASPH	Q12797	758 aa		4.26	□□□□□ -1.73
RPS13-208	ENST00000531908	RCN2	Q14257	317 aa		4.26	□□□□□ -1.73
RPS13-208	ENST00000531908	FUT11	Q495W5	492 aa		4.26	□□□□□ -1.73
RPS13-208	ENST00000531908	ATP1A1-AS1	Q5TC04	95 aa		4.26	□□□□□ -1.73
RPS13-208	ENST00000531908	FAM46C	Q5VWP2	391 aa		4.26	□□□□□ -1.73
RPS13-208	ENST00000531908	LYPLAL1	Q5VWZ2	237 aa		4.26	□□□□□ -1.73
RPS13-208	ENST00000531908	C11orf88	Q6PI97	169 aa		4.26	□□□□□ -1.73
RPS13-208	ENST00000531908	AFTPH	Q6ULP2	937 aa		4.26	□□□□□ -1.73
RPS13-208	ENST00000531908	TMEM184A	Q6ZMB5	413 aa		4.26	□□□□□ -1.73
RPS13-208	ENST00000531908	FRRS1	Q6ZNA5	592 aa		4.26	□□□□□ -1.73
RPS13-208	ENST00000531908	SLC22A9	Q8IVM8	553 aa		4.26	□□□□□ -1.73
RPS13-208	ENST00000531908	METTL4	Q8N3J2	472 aa		4.26	□□□□□ -1.73
RPS13-208	ENST00000531908	ZNF781	Q8N8C0	355 aa		4.26	□□□□□ -1.73
RPS13-208	ENST00000531908	OR2A12	Q8NGT7	310 aa		4.26	□□□□□ -1.73
RPS13-208	ENST00000531908	RHEBL1	Q8TAI7	183 aa		4.26	□□□□□ -1.73
RPS13-208	ENST00000531908	ITFG1	Q8TB96	612 aa		4.26	□□□□□ -1.73
RPS13-208	ENST00000531908	DTX3L	Q8TDB6	740 aa		4.26	□□□□□ -1.73
RPS13-208	ENST00000531908	L3HYPDH	Q96EM0	354 aa		4.26	□□□□□ -1.73
RPS13-208	ENST00000531908	C2orf48	Q96LS8	159 aa		4.26	□□□□□ -1.73
RPS13-208	ENST00000531908	RILP	Q96NA2	401 aa		4.26	□□□□□ -1.73
RPS13-208	ENST00000531908	MCCC1	Q96RQ3	725 aa	Predicted RBP	4.26	□□□□□ -1.73
RPS13-208	ENST00000531908	EBF4	Q9BQW3	602 aa		4.26	□□□□□ -1.73
RPS13-208	ENST00000531908	TBC1D10A	Q9BXI6	508 aa		4.26	□□□□□ -1.73
RPS13-208	ENST00000531908	TM6SF2	Q9BZW4	377 aa		4.26	□□□□□ -1.73
RPS13-208	ENST00000531908	NMUR2	Q9GZQ4	415 aa		4.26	□□□□□ -1.73
RPS13-208	ENST00000531908	WWP1	Q9H0M0	922 aa		4.26	□□□□□ -1.73
RPS13-208	ENST00000531908	FAM96A	Q9H5X1	160 aa		4.26	□□□□□ -1.73
RPS13-208	ENST00000531908	COG4	Q9H9E3	785 aa		4.26	□□□□□ -1.73
RPS13-208	ENST00000531908	LMAN1L	Q9HAT1	526 aa		4.26	□□□□□ -1.73
RPS13-208	ENST00000531908	NDE1	Q9NXR1	346 aa		4.26	□□□□□ -1.73
RPS13-208	ENST00000531908	TAS2R13	Q9NYV9	303 aa		4.26	□□□□□ -1.73
RPS13-208	ENST00000531908	TAS2R1	Q9NYW7	299 aa		4.26	□□□□□ -1.73
RPS13-208	ENST00000531908	GALP	Q9UBC7	116 aa		4.26	□□□□□ -1.73
RPS13-208	ENST00000531908	PILRB	Q9UKJ0	227 aa		4.26	□□□□□ -1.73
RPS13-208	ENST00000531908	ERVW-1	Q9UQF0	538 aa		4.26	□□□□□ -1.73
RPS13-208	ENST00000531908	NCKAP1	Q9Y2A7	1128 aa		4.26	□□□□□ -1.73
RPS13-208	ENST00000531908	DHRS7	Q9Y394	339 aa		4.26	□□□□□ -1.73
RPS13-208	ENST00000531908	WIPI2	Q9Y4P8	454 aa		4.26	□□□□□ -1.73
RPS13-208	ENST00000531908	MTCL1	Q9Y4B5	1905 aa	Known RBP	4.26	□□□□□ -1.73
RPS13-208	ENST00000531908	DENND4C	Q5VZ89	1909 aa		4.25	□□□□□ -1.73
RPS13-208	ENST00000531908		A8MT66	165 aa		4.25	□□□□□ -1.73
RPS13-208	ENST00000531908	MPTX1	A8MV57	137 aa		4.25	□□□□□ -1.73
RPS13-208	ENST00000531908	NEDD8-MDP1	E9PL57	170 aa		4.25	□□□□□ -1.73
RPS13-208	ENST00000531908		H0YHG0	523 aa		4.25	□□□□□ -1.73
RPS13-208	ENST00000531908		H3BMM5	538 aa		4.25	□□□□□ -1.73
RPS13-208	ENST00000531908	UBFD1	O14562	309 aa	Known RBP	4.25	□□□□□ -1.73
RPS13-208	ENST00000531908	PRMT5	O14744	637 aa	Predicted RBP	4.25	□□□□□ -1.73
RPS13-208	ENST00000531908	TFEC	O14948	347 aa	Predicted RBP	4.25	□□□□□ -1.73
RPS13-208	ENST00000531908	PFDN6	O15212	129 aa		4.25	□□□□□ -1.73
RPS13-208	ENST00000531908	OR1I1	O60431	355 aa		4.25	□□□□□ -1.73
RPS13-208	ENST00000531908	RAD51D	O75771	328 aa		4.25	□□□□□ -1.73
RPS13-208	ENST00000531908	SRP72	O76094	671 aa	Known RBP	4.25	□□□□□ -1.73
RPS13-208	ENST00000531908	RHOBTB1	O94844	696 aa		4.25	□□□□□ -1.73
RPS13-208	ENST00000531908	TSPAN12	O95859	305 aa		4.25	□□□□□ -1.73
RPS13-208	ENST00000531908	IGSF6	O95976	241 aa		4.25	□□□□□ -1.73
RPS13-208	ENST00000531908	SP9	P0CG40	484 aa		4.25	□□□□□ -1.73
RPS13-208	ENST00000531908	UGT1A6	P19224	532 aa		4.25	□□□□□ -1.73
RPS13-208	ENST00000531908	POLR2E	P19388	210 aa	Known RBP	4.25	□□□□□ -1.73
RPS13-208	ENST00000531908	CALB2	P22676	271 aa		4.25	□□□□□ -1.73
RPS13-208	ENST00000531908	RPS3	P23396	243 aa	Known RBP eCLIP	4.25	□□□□□ -1.73	2e-23	■■■■□ 19.6
RPS13-208	ENST00000531908	TIA1	P31483	386 aa	Known RBP eCLIP	4.25	□□□□□ -1.73	1e-7	■■■□□ 14.6
RPS13-208	ENST00000531908	CA5A	P35218	305 aa		4.25	□□□□□ -1.73
RPS13-208	ENST00000531908	UGT1A3	P35503	534 aa		4.25	□□□□□ -1.73
RPS13-208	ENST00000531908	UGT1A5	P35504	534 aa		4.25	□□□□□ -1.73
RPS13-208	ENST00000531908	STK19	P49842	368 aa	Predicted RBP	4.25	□□□□□ -1.73
RPS13-208	ENST00000531908	ATP6V0D1	P61421	351 aa		4.25	□□□□□ -1.73
RPS13-208	ENST00000531908	HERVK_113	P63132	956 aa		4.25	□□□□□ -1.73
RPS13-208	ENST00000531908	DHODH	Q02127	395 aa		4.25	□□□□□ -1.73
RPS13-208	ENST00000531908	RAD51	Q06609	339 aa		4.25	□□□□□ -1.73
RPS13-208	ENST00000531908	CHRNA6	Q15825	494 aa		4.25	□□□□□ -1.73
RPS13-208	ENST00000531908	DUSP5	Q16690	384 aa		4.25	□□□□□ -1.73
RPS13-208	ENST00000531908	MOGAT2	Q3SYC2	334 aa		4.25	□□□□□ -1.73
RPS13-208	ENST00000531908	UNC50	Q53HI1	259 aa		4.25	□□□□□ -1.73
RPS13-208	ENST00000531908	LBH	Q53QV2	105 aa	Predicted RBP	4.25	□□□□□ -1.73
RPS13-208	ENST00000531908	ZNF542P	Q5EBM4	170 aa		4.25	□□□□□ -1.73
RPS13-208	ENST00000531908	ZRANB3	Q5FWF4	1079 aa		4.25	□□□□□ -1.73
RPS13-208	ENST00000531908	FAM78A	Q5JUQ0	283 aa		4.25	□□□□□ -1.73
RPS13-208	ENST00000531908	CTSL3P	Q5NE16	218 aa		4.25	□□□□□ -1.73
RPS13-208	ENST00000531908	DDX59	Q5T1V6	619 aa	Known RBP eCLIP	4.25	□□□□□ -1.73
RPS13-208	ENST00000531908	GPRC6A	Q5T6X5	926 aa		4.25	□□□□□ -1.73
RPS13-208	ENST00000531908	C22orf39	Q6P5X5	142 aa		4.25	□□□□□ -1.73
RPS13-208	ENST00000531908	BTNL8	Q6UX41	500 aa		4.25	□□□□□ -1.73
RPS13-208	ENST00000531908	CYHR1	Q6ZMK1	362 aa		4.25	□□□□□ -1.73

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