RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000525121.2

HMGB1P40-201, Transcript of high mobility group box 1 pseudogene 40, humanhuman

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Gene HMGB1P40, Length 540 nt, Biotype processed pseudogene.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGB1P40-201ENST00000525121 SLC39A3Q9BRY0 314 aa4.86□□□□□ -1.63
HMGB1P40-201ENST00000525121 CCDC106Q9BWC9 280 aa4.86□□□□□ -1.63
HMGB1P40-201ENST00000525121 TRIM8Q9BZR9 551 aa4.86□□□□□ -1.63
HMGB1P40-201ENST00000525121 TRIM2Q9C040 744 aa4.86□□□□□ -1.63
HMGB1P40-201ENST00000525121 PIGMQ9H3S5 423 aa4.86□□□□□ -1.63
HMGB1P40-201ENST00000525121 IKZF5Q9H5V7 419 aa4.86□□□□□ -1.63
HMGB1P40-201ENST00000525121 PIF1Q9H611 641 aa4.86□□□□□ -1.63
HMGB1P40-201ENST00000525121 NANOGQ9H9S0 305 aa4.86□□□□□ -1.63
HMGB1P40-201ENST00000525121 TMEM27Q9HBJ8 222 aa4.86□□□□□ -1.63
HMGB1P40-201ENST00000525121 CTPS2Q9NRF8 586 aa4.86□□□□□ -1.63
HMGB1P40-201ENST00000525121 GLRX2Q9NS18 164 aa4.86□□□□□ -1.63
HMGB1P40-201ENST00000525121 RLIMQ9NVW2 624 aa4.86□□□□□ -1.63
HMGB1P40-201ENST00000525121 Q9UFV3 132 aa4.86□□□□□ -1.63
HMGB1P40-201ENST00000525121 TESQ9UGI8 421 aaKnown RBP4.86□□□□□ -1.63
HMGB1P40-201ENST00000525121 FOXD3Q9UJU5 478 aaPredicted RBP4.86□□□□□ -1.63
HMGB1P40-201ENST00000525121 PACSIN3Q9UKS6 424 aa4.86□□□□□ -1.63
HMGB1P40-201ENST00000525121 BAG5Q9UL15 447 aa4.86□□□□□ -1.63
HMGB1P40-201ENST00000525121 SLC9A8Q9Y2E8 581 aa4.86□□□□□ -1.63
HMGB1P40-201ENST00000525121 HDGFL3Q9Y3E1 203 aa4.86□□□□□ -1.63
HMGB1P40-201ENST00000525121 EXPH5Q8NEV8 1989 aa4.85□□□□□ -1.63
HMGB1P40-201ENST00000525121 TMED7-TICAM2A0A0A6YYA0 188 aa4.85□□□□□ -1.63
HMGB1P40-201ENST00000525121 ELOVL7A1L3X0 281 aa4.85□□□□□ -1.63
HMGB1P40-201ENST00000525121 NKX2-6A6NCS4 301 aa4.85□□□□□ -1.63
HMGB1P40-201ENST00000525121 ELOA3DA6NLF2 546 aaPredicted RBP4.85□□□□□ -1.63
HMGB1P40-201ENST00000525121 H0YC42 278 aa4.85□□□□□ -1.63
HMGB1P40-201ENST00000525121 FXYD1O00168 92 aa4.85□□□□□ -1.63
HMGB1P40-201ENST00000525121 SULT2B1O00204 365 aa4.85□□□□□ -1.63
HMGB1P40-201ENST00000525121 ETV2O00321 342 aaPredicted RBP4.85□□□□□ -1.63
HMGB1P40-201ENST00000525121 SYT5O00445 386 aa4.85□□□□□ -1.63
HMGB1P40-201ENST00000525121 ZNF208O43345 1280 aa4.85□□□□□ -1.63
HMGB1P40-201ENST00000525121 HNRNPRO43390 633 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
HMGB1P40-201ENST00000525121 DNPH1O43598 174 aa4.85□□□□□ -1.63
HMGB1P40-201ENST00000525121 SMNDC1O75940 238 aaKnown RBP eCLIP4.85□□□□□ -1.63
HMGB1P40-201ENST00000525121 AHSA1O95433 338 aa4.85□□□□□ -1.63
HMGB1P40-201ENST00000525121 NTN1O95631 604 aa4.85□□□□□ -1.63
HMGB1P40-201ENST00000525121 CLDN1O95832 211 aa4.85□□□□□ -1.63
HMGB1P40-201ENST00000525121 OPN1LWP04000 364 aa4.85□□□□□ -1.63
HMGB1P40-201ENST00000525121 C8BP07358 591 aa4.85□□□□□ -1.63
HMGB1P40-201ENST00000525121 GKN3PP0CG01 181 aa4.85□□□□□ -1.63
HMGB1P40-201ENST00000525121 PNMTP11086 282 aa4.85□□□□□ -1.63
HMGB1P40-201ENST00000525121 CD1EP15812 388 aa4.85□□□□□ -1.63
HMGB1P40-201ENST00000525121 CCNA2P20248 432 aa4.85□□□□□ -1.63
HMGB1P40-201ENST00000525121 ENPP1P22413 925 aa4.85□□□□□ -1.63
HMGB1P40-201ENST00000525121 PSMA4P25789 261 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
HMGB1P40-201ENST00000525121 TACR3P29371 465 aa4.85□□□□□ -1.63
HMGB1P40-201ENST00000525121 UQCRC1P31930 480 aa4.85□□□□□ -1.63
HMGB1P40-201ENST00000525121 IFNA8P32881 189 aa4.85□□□□□ -1.63
HMGB1P40-201ENST00000525121 IDUAP35475 653 aa4.85□□□□□ -1.63
HMGB1P40-201ENST00000525121 CPOXP36551 454 aa4.85□□□□□ -1.63
HMGB1P40-201ENST00000525121 SLC7A2P52569 658 aa4.85□□□□□ -1.63
HMGB1P40-201ENST00000525121 SUCLG1P53597 346 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
HMGB1P40-201ENST00000525121 TPD52P55327 224 aaPredicted RBP4.85□□□□□ -1.63
HMGB1P40-201ENST00000525121 OR2B6P58173 313 aa4.85□□□□□ -1.63
HMGB1P40-201ENST00000525121 RAC3P60763 192 aa4.85□□□□□ -1.63
HMGB1P40-201ENST00000525121 SIRPAP78324 504 aa4.85□□□□□ -1.63
HMGB1P40-201ENST00000525121 VEZF1Q14119 521 aa4.85□□□□□ -1.63
HMGB1P40-201ENST00000525121 SELPLGQ14242 412 aa4.85□□□□□ -1.63
HMGB1P40-201ENST00000525121 MAPK11Q15759 364 aa4.85□□□□□ -1.63
HMGB1P40-201ENST00000525121 ADRM1Q16186 407 aa4.85□□□□□ -1.63
HMGB1P40-201ENST00000525121 ZNF239Q16600 458 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
HMGB1P40-201ENST00000525121 ELOA3BQ3SY89 546 aa4.85□□□□□ -1.63
HMGB1P40-201ENST00000525121 LRRC23Q53EV4 343 aaPredicted RBP4.85□□□□□ -1.63
HMGB1P40-201ENST00000525121 TMEM201Q5SNT2 666 aa4.85□□□□□ -1.63
HMGB1P40-201ENST00000525121 C5orf46Q6UWT4 87 aa4.85□□□□□ -1.63
HMGB1P40-201ENST00000525121 C16orf89Q6UX73 402 aa4.85□□□□□ -1.63
HMGB1P40-201ENST00000525121 HACD2Q6Y1H2 254 aa4.85□□□□□ -1.63
HMGB1P40-201ENST00000525121 FCRLAQ7L513 359 aa4.85□□□□□ -1.63
HMGB1P40-201ENST00000525121 PIGWQ7Z7B1 504 aa4.85□□□□□ -1.63
HMGB1P40-201ENST00000525121 ADGRE4PQ86SQ3 457 aa4.85□□□□□ -1.63
HMGB1P40-201ENST00000525121 PTOV1Q86YD1 416 aa4.85□□□□□ -1.63
HMGB1P40-201ENST00000525121 MICU2Q8IYU8 434 aa4.85□□□□□ -1.63
HMGB1P40-201ENST00000525121 SMYD1Q8NB12 490 aa4.85□□□□□ -1.63
HMGB1P40-201ENST00000525121 ELOA3Q8NG57 546 aa4.85□□□□□ -1.63
HMGB1P40-201ENST00000525121 OR52E4Q8NGH9 312 aa4.85□□□□□ -1.63
HMGB1P40-201ENST00000525121 FNDC9Q8TBE3 224 aa4.85□□□□□ -1.63
HMGB1P40-201ENST00000525121 DNAJA4Q8WW22 397 aaPredicted RBP4.85□□□□□ -1.63
HMGB1P40-201ENST00000525121 FIG4Q92562 907 aa4.85□□□□□ -1.63
HMGB1P40-201ENST00000525121 RNASE6Q93091 150 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
HMGB1P40-201ENST00000525121 GMPPAQ96IJ6 420 aaPredicted RBP4.85□□□□□ -1.63
HMGB1P40-201ENST00000525121 ZNF845Q96IR2 970 aaPredicted RBP4.85□□□□□ -1.63
HMGB1P40-201ENST00000525121 CCT8L2Q96SF2 557 aa4.85□□□□□ -1.63
HMGB1P40-201ENST00000525121 KCTD14Q9BQ13 255 aaPredicted RBP4.85□□□□□ -1.63
HMGB1P40-201ENST00000525121 ZNF559Q9BR84 538 aa4.85□□□□□ -1.63
HMGB1P40-201ENST00000525121 NAA11Q9BSU3 229 aaPredicted RBP4.85□□□□□ -1.63
HMGB1P40-201ENST00000525121 TAPBPLQ9BX59 468 aa4.85□□□□□ -1.63
HMGB1P40-201ENST00000525121 MYLK2Q9H1R3 596 aa4.85□□□□□ -1.63
HMGB1P40-201ENST00000525121 RNF122Q9H9V4 155 aa4.85□□□□□ -1.63
HMGB1P40-201ENST00000525121 GP6Q9HCN6 339 aa4.85□□□□□ -1.63
HMGB1P40-201ENST00000525121 SPAG4Q9NPE6 437 aa4.85□□□□□ -1.63
HMGB1P40-201ENST00000525121 ADPRHL2Q9NX46 363 aa4.85□□□□□ -1.63
HMGB1P40-201ENST00000525121 ADA2Q9NZK5 511 aa4.85□□□□□ -1.63
HMGB1P40-201ENST00000525121 EMC3Q9P0I2 261 aa4.85□□□□□ -1.63
HMGB1P40-201ENST00000525121 C6orf203Q9P0P8 240 aaPredicted RBP4.85□□□□□ -1.63
HMGB1P40-201ENST00000525121 KLHL9Q9P2J3 617 aa4.85□□□□□ -1.63
HMGB1P40-201ENST00000525121 TAGLN3Q9UI15 199 aa4.85□□□□□ -1.63
HMGB1P40-201ENST00000525121 PROCRQ9UNN8 238 aa4.85□□□□□ -1.63
HMGB1P40-201ENST00000525121 TMED7Q9Y3B3 224 aa4.85□□□□□ -1.63
HMGB1P40-201ENST00000525121 ESPL1Q14674 2120 aa4.85□□□□□ -1.63
HMGB1P40-201ENST00000525121 UBR5O95071 2799 aaPredicted RBP4.84□□□□□ -1.63
HMGB1P40-201ENST00000525121 FASNP49327 2511 aaKnown RBP4.84□□□□□ -1.63
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