RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516614.1

RNU6-229P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 229, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-229P, Length 102 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-229P-201ENST00000516614 SF3A3Q12874 501 aaKnown RBP eCLIP0.45□□□□□ -2.34
RNU6-229P-201ENST00000516614 EPS8Q12929 822 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-229P-201ENST00000516614 FOXF1Q12946 379 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-229P-201ENST00000516614 BNIP2Q12982 314 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-229P-201ENST00000516614 HSPB3Q12988 150 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-229P-201ENST00000516614 ECH1Q13011 328 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-229P-201ENST00000516614 DYNC1I2Q13409 638 aaKnown RBP0.45□□□□□ -2.34
RNU6-229P-201ENST00000516614 CUL4AQ13619 759 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-229P-201ENST00000516614 ITGA9Q13797 1035 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-229P-201ENST00000516614 DPYSQ14117 519 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-229P-201ENST00000516614 DAG1Q14118 895 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-229P-201ENST00000516614 CSHL1Q14406 222 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-229P-201ENST00000516614 RBM39Q14498 530 aaKnown RBP0.45□□□□□ -2.34
RNU6-229P-201ENST00000516614 HNF4GQ14541 408 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-229P-201ENST00000516614 PRPSAP1Q14558 356 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-229P-201ENST00000516614 GRM3Q14832 879 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-229P-201ENST00000516614 KIR2DS3Q14952 304 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-229P-201ENST00000516614 P2RY6Q15077 328 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-229P-201ENST00000516614 KRT31Q15323 416 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-229P-201ENST00000516614 RPS6KA1Q15418 735 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-229P-201ENST00000516614 SLC9A3R2Q15599 337 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-229P-201ENST00000516614 OR8B8Q15620 311 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-229P-201ENST00000516614 SLC1A5Q15758 541 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-229P-201ENST00000516614 TOMM34Q15785 309 aaPredicted RBP0.45□□□□□ -2.34
RNU6-229P-201ENST00000516614 NPTX1Q15818 432 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-229P-201ENST00000516614 CCNG2Q16589 344 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-229P-201ENST00000516614 HADHQ16836 314 aaKnown RBP0.45□□□□□ -2.34
RNU6-229P-201ENST00000516614 LTC4SQ16873 150 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-229P-201ENST00000516614 SLC5A12Q1EHB4 618 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-229P-201ENST00000516614 C2orf68Q2NKX9 166 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-229P-201ENST00000516614 SMU1Q2TAY7 513 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-229P-201ENST00000516614 TRMT5Q32P41 509 aaKnown RBP0.45□□□□□ -2.34
RNU6-229P-201ENST00000516614 GFOD2Q3B7J2 385 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-229P-201ENST00000516614 GRAMD1BQ3KR37 738 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-229P-201ENST00000516614 TMEM176BQ3YBM2 270 aaPredicted RBP0.45□□□□□ -2.34
RNU6-229P-201ENST00000516614 ANKRD20A4Q4UJ75 823 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-229P-201ENST00000516614 ATP6AP1LQ52LC2 224 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-229P-201ENST00000516614 INO80DQ53TQ3 878 aaPredicted RBP0.45□□□□□ -2.34
RNU6-229P-201ENST00000516614 TTMPQ5BVD1 217 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-229P-201ENST00000516614 EEF1AKMT2Q5JPI9 291 aaKnown RBP0.45□□□□□ -2.34
RNU6-229P-201ENST00000516614 TCTE1Q5JU00 501 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-229P-201ENST00000516614 PCID2Q5JVF3 399 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-229P-201ENST00000516614 CTSL3PQ5NE16 218 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-229P-201ENST00000516614 ANKRD20A2Q5SQ80 823 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-229P-201ENST00000516614 CEP85LQ5SZL2 805 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-229P-201ENST00000516614 NCMAPQ5T1S8 102 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-229P-201ENST00000516614 RBM20Q5T481 1227 aaKnown RBP0.45□□□□□ -2.34
RNU6-229P-201ENST00000516614 CCNJQ5T5M9 372 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-229P-201ENST00000516614 RIPPLY2Q5TAB7 128 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-229P-201ENST00000516614 NDUFAF5Q5TEU4 345 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-229P-201ENST00000516614 ZNF658Q5TYW1 1059 aaPredicted RBP0.45□□□□□ -2.34
RNU6-229P-201ENST00000516614 ANKRD20A1Q5TYW2 823 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-229P-201ENST00000516614 MANEALQ5VSG8 457 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-229P-201ENST00000516614 GFI1BQ5VTD9 330 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-229P-201ENST00000516614 EEF1A1P5Q5VTE0 462 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-229P-201ENST00000516614 KLHDC7AQ5VTJ3 777 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-229P-201ENST00000516614 ANKRD20A3Q5VUR7 823 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-229P-201ENST00000516614 NSUN5P2Q63ZY6 315 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-229P-201ENST00000516614 ARL6IP4Q66PJ3 421 aaKnown RBP0.45□□□□□ -2.34
RNU6-229P-201ENST00000516614 NCBP2-AS2Q69YL0 99 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-229P-201ENST00000516614 HBMQ6B0K9 141 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-229P-201ENST00000516614 PLAG1Q6DJT9 500 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-229P-201ENST00000516614 TTC19Q6DKK2 380 aaPredicted RBP0.45□□□□□ -2.34
RNU6-229P-201ENST00000516614 ZNF470Q6ECI4 717 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-229P-201ENST00000516614 DHRS7BQ6IAN0 325 aaPredicted RBP0.45□□□□□ -2.34
RNU6-229P-201ENST00000516614 SLC35E4Q6ICL7 350 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-229P-201ENST00000516614 ZNF770Q6IQ21 691 aaPredicted RBP0.45□□□□□ -2.34
RNU6-229P-201ENST00000516614 ANKRD26P1Q6NSI1 321 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-229P-201ENST00000516614 UGT3A1Q6NUS8 523 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-229P-201ENST00000516614 RPUSD3Q6P087 351 aaKnown RBP0.45□□□□□ -2.34
RNU6-229P-201ENST00000516614 CDC73Q6P1J9 531 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-229P-201ENST00000516614 PRMT9Q6P2P2 845 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-229P-201ENST00000516614 NIPAL3Q6P499 406 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-229P-201ENST00000516614 ZNF549Q6P9A3 640 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-229P-201ENST00000516614 TRIM40Q6P9F5 258 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-229P-201ENST00000516614 TMEM154Q6P9G4 183 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-229P-201ENST00000516614 AAGABQ6PD74 315 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-229P-201ENST00000516614 C16orf87Q6PH81 154 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-229P-201ENST00000516614 KLHL17Q6TDP4 642 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-229P-201ENST00000516614 OPN5Q6U736 354 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-229P-201ENST00000516614 CYP20A1Q6UW02 462 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-229P-201ENST00000516614 TMEM205Q6UW68 189 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-229P-201ENST00000516614 IGFL2Q6UWQ7 119 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-229P-201ENST00000516614 TMEM107Q6UX40 140 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-229P-201ENST00000516614 C16orf89Q6UX73 402 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-229P-201ENST00000516614 LYPD2Q6UXB3 125 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-229P-201ENST00000516614 MFSD7Q6UXD7 560 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-229P-201ENST00000516614 LRIG3Q6UXM1 1119 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-229P-201ENST00000516614 STAC2Q6ZMT1 411 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-229P-201ENST00000516614 Q6ZWC4 215 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-229P-201ENST00000516614 IKBIPQ70UQ0 350 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-229P-201ENST00000516614 ZNF767PQ75MW2 155 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-229P-201ENST00000516614 RNF44Q7L0R7 432 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-229P-201ENST00000516614 EIF3MQ7L2H7 374 aaKnown RBP0.45□□□□□ -2.34
RNU6-229P-201ENST00000516614 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP0.45□□□□□ -2.34
RNU6-229P-201ENST00000516614 FCRLAQ7L513 359 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-229P-201ENST00000516614 KRT74Q7RTS7 529 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-229P-201ENST00000516614 ZNF571Q7Z3V5 609 aaPredicted RBP0.45□□□□□ -2.34
RNU6-229P-201ENST00000516614 VN1R4Q7Z5H5 301 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-229P-201ENST00000516614 SNX20Q7Z614 316 aa0.45□□□□□ -2.34
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.1 ms