RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516272.1

RNU6-277P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 277, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-277P, Length 106 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-277P-201ENST00000516272 SPIBQ01892 262 aa0.94□□□□□ -2.26
RNU6-277P-201ENST00000516272 PPP1R8Q12972 351 aaKnown RBP0.94□□□□□ -2.26
RNU6-277P-201ENST00000516272 TFDP1Q14186 410 aa0.94□□□□□ -2.26
RNU6-277P-201ENST00000516272 SLMAPQ14BN4 828 aa0.94□□□□□ -2.26
RNU6-277P-201ENST00000516272 RSPO1Q2MKA7 263 aaPredicted RBP0.94□□□□□ -2.26
RNU6-277P-201ENST00000516272 TMEM52BQ4KMG9 183 aa0.94□□□□□ -2.26
RNU6-277P-201ENST00000516272 AARDQ4LEZ3 155 aa0.94□□□□□ -2.26
RNU6-277P-201ENST00000516272 BOLA3Q53S33 107 aa0.94□□□□□ -2.26
RNU6-277P-201ENST00000516272 C1orf100Q5SVJ3 147 aa0.94□□□□□ -2.26
RNU6-277P-201ENST00000516272 ZNF620Q6ZNG0 422 aa0.94□□□□□ -2.26
RNU6-277P-201ENST00000516272 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa0.94□□□□□ -2.26
RNU6-277P-201ENST00000516272 PAQR9Q6ZVX9 377 aa0.94□□□□□ -2.26
RNU6-277P-201ENST00000516272 SERPINA12Q8IW75 414 aa0.94□□□□□ -2.26
RNU6-277P-201ENST00000516272 LEMD2Q8NC56 503 aa0.94□□□□□ -2.26
RNU6-277P-201ENST00000516272 OR6C4Q8NGE1 309 aa0.94□□□□□ -2.26
RNU6-277P-201ENST00000516272 PAQR8Q8TEZ7 354 aa0.94□□□□□ -2.26
RNU6-277P-201ENST00000516272 ZFP90Q8TF47 636 aa0.94□□□□□ -2.26
RNU6-277P-201ENST00000516272 CELF6Q96J87 481 aaKnown RBP0.94□□□□□ -2.26
RNU6-277P-201ENST00000516272 OR5B2Q96R09 309 aa0.94□□□□□ -2.26
RNU6-277P-201ENST00000516272 KLHDC3Q9BQ90 382 aa0.94□□□□□ -2.26
RNU6-277P-201ENST00000516272 HEBP2Q9Y5Z4 205 aa0.94□□□□□ -2.26
RNU6-277P-201ENST00000516272 HSFX4A0A1B0GTS1 333 aaPredicted RBP0.93□□□□□ -2.26
RNU6-277P-201ENST00000516272 HSFX3A0A1B0GWH4 333 aaPredicted RBP0.93□□□□□ -2.26
RNU6-277P-201ENST00000516272 TMEM89A2RUT3 159 aa0.93□□□□□ -2.26
RNU6-277P-201ENST00000516272 OR6C65A6NJZ3 312 aa0.93□□□□□ -2.26
RNU6-277P-201ENST00000516272 C16orf90A8MZG2 172 aa0.93□□□□□ -2.26
RNU6-277P-201ENST00000516272 E9PBE3 544 aa0.93□□□□□ -2.26
RNU6-277P-201ENST00000516272 H3BTX0 84 aa0.93□□□□□ -2.26
RNU6-277P-201ENST00000516272 ZBTB14O43829 449 aa0.93□□□□□ -2.26
RNU6-277P-201ENST00000516272 CD5LO43866 347 aa0.93□□□□□ -2.26
RNU6-277P-201ENST00000516272 P0C880 135 aa0.93□□□□□ -2.26
RNU6-277P-201ENST00000516272 XRCC1P18887 633 aaPredicted RBP0.93□□□□□ -2.26
RNU6-277P-201ENST00000516272 CNN1P51911 297 aaKnown RBP0.93□□□□□ -2.26
RNU6-277P-201ENST00000516272 RGS1Q08116 209 aa0.93□□□□□ -2.26
RNU6-277P-201ENST00000516272 RCN2Q14257 317 aa0.93□□□□□ -2.26
RNU6-277P-201ENST00000516272 ARL6IP1Q15041 203 aa0.93□□□□□ -2.26
RNU6-277P-201ENST00000516272 TYSND1Q2T9J0 566 aa0.93□□□□□ -2.26
RNU6-277P-201ENST00000516272 RFX4Q33E94 735 aa0.93□□□□□ -2.26
RNU6-277P-201ENST00000516272 RGP1Q92546 391 aaPredicted RBP0.93□□□□□ -2.26
RNU6-277P-201ENST00000516272 ALDH8A1Q9H2A2 487 aaPredicted RBP0.93□□□□□ -2.26
RNU6-277P-201ENST00000516272 CLMPQ9H6B4 373 aa0.93□□□□□ -2.26
RNU6-277P-201ENST00000516272 HOMER3Q9NSC5 361 aa0.93□□□□□ -2.26
RNU6-277P-201ENST00000516272 C1orf123Q9NWV4 160 aa0.93□□□□□ -2.26
RNU6-277P-201ENST00000516272 ZNF490Q9ULM2 529 aaPredicted RBP0.93□□□□□ -2.26
RNU6-277P-201ENST00000516272 H3BMQ9 156 aa0.92□□□□□ -2.26
RNU6-277P-201ENST00000516272 J3QKU1 62 aa0.92□□□□□ -2.26
RNU6-277P-201ENST00000516272 K7EM74 188 aa0.92□□□□□ -2.26
RNU6-277P-201ENST00000516272 KIF2AO00139 706 aaPredicted RBP0.92□□□□□ -2.26
RNU6-277P-201ENST00000516272 ZNF263O14978 683 aa0.92□□□□□ -2.26
RNU6-277P-201ENST00000516272 ASMTP46597 345 aa0.92□□□□□ -2.26
RNU6-277P-201ENST00000516272 SLC6A8P48029 635 aa0.92□□□□□ -2.26
RNU6-277P-201ENST00000516272 PSMD8P48556 350 aa0.92□□□□□ -2.26
RNU6-277P-201ENST00000516272 KLK7P49862 253 aa0.92□□□□□ -2.26
RNU6-277P-201ENST00000516272 KPNA2P52292 529 aaKnown RBP0.92□□□□□ -2.26
RNU6-277P-201ENST00000516272 SMARCB1Q12824 385 aa0.92□□□□□ -2.26
RNU6-277P-201ENST00000516272 NDUFA9Q16795 377 aa0.92□□□□□ -2.26
RNU6-277P-201ENST00000516272 ZSWIM7Q19AV6 140 aa0.92□□□□□ -2.26
RNU6-277P-201ENST00000516272 HFEQ30201 348 aa0.92□□□□□ -2.26
RNU6-277P-201ENST00000516272 LRRC10Q5BKY1 277 aa0.92□□□□□ -2.26
RNU6-277P-201ENST00000516272 HECTD3Q5T447 861 aa0.92□□□□□ -2.26
RNU6-277P-201ENST00000516272 CTRB2Q6GPI1 263 aa0.92□□□□□ -2.26
RNU6-277P-201ENST00000516272 TMIGD1Q6UXZ0 262 aa0.92□□□□□ -2.26
RNU6-277P-201ENST00000516272 LINC00336Q6ZUF6 198 aa0.92□□□□□ -2.26
RNU6-277P-201ENST00000516272 ACOT7LQ6ZUV0 252 aa0.92□□□□□ -2.26
RNU6-277P-201ENST00000516272 UNC45BQ8IWX7 931 aa0.92□□□□□ -2.26
RNU6-277P-201ENST00000516272 OSR2Q8N2R0 312 aa0.92□□□□□ -2.26
RNU6-277P-201ENST00000516272 CCDC89Q8N998 374 aa0.92□□□□□ -2.26
RNU6-277P-201ENST00000516272 LPCAT1Q8NF37 534 aa0.92□□□□□ -2.26
RNU6-277P-201ENST00000516272 OR5W2Q8NH69 310 aa0.92□□□□□ -2.26
RNU6-277P-201ENST00000516272 OR9G1Q8NH87 305 aa0.92□□□□□ -2.26
RNU6-277P-201ENST00000516272 BRSK1Q8TDC3 778 aa0.92□□□□□ -2.26
RNU6-277P-201ENST00000516272 HIST1H4GQ99525 98 aa0.92□□□□□ -2.26
RNU6-277P-201ENST00000516272 KLF6Q99612 283 aaPredicted RBP0.92□□□□□ -2.26
RNU6-277P-201ENST00000516272 SLC25A51Q9H1U9 297 aa0.92□□□□□ -2.26
RNU6-277P-201ENST00000516272 VCPKMTQ9H867 229 aa0.92□□□□□ -2.26
RNU6-277P-201ENST00000516272 COPS7BQ9H9Q2 264 aaPredicted RBP0.92□□□□□ -2.26
RNU6-277P-201ENST00000516272 GPN2Q9H9Y4 310 aaPredicted RBP0.92□□□□□ -2.26
RNU6-277P-201ENST00000516272 NOX3Q9HBY0 568 aa0.92□□□□□ -2.26
RNU6-277P-201ENST00000516272 B3GNT2Q9NY97 397 aa0.92□□□□□ -2.26
RNU6-277P-201ENST00000516272 MRPS33Q9Y291 106 aaKnown RBP0.92□□□□□ -2.26
RNU6-277P-201ENST00000516272 SEC16AO15027 2179 aa0.91□□□□□ -2.26
RNU6-277P-201ENST00000516272 KMT2BQ9UMN6 2715 aaPredicted RBP0.91□□□□□ -2.26
RNU6-277P-201ENST00000516272 A6NIZ1 184 aa0.91□□□□□ -2.26
RNU6-277P-201ENST00000516272 HCRTR1O43613 425 aa0.91□□□□□ -2.26
RNU6-277P-201ENST00000516272 SRP72O76094 671 aaKnown RBP0.91□□□□□ -2.26
RNU6-277P-201ENST00000516272 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP0.91□□□□□ -2.26
RNU6-277P-201ENST00000516272 TLX1NBP0CAT3 122 aa0.91□□□□□ -2.26
RNU6-277P-201ENST00000516272 RBMY1CP0DJD4 496 aa0.91□□□□□ -2.26
RNU6-277P-201ENST00000516272 ANXA3P12429 323 aa0.91□□□□□ -2.26
RNU6-277P-201ENST00000516272 TDGF1P13385 188 aa0.91□□□□□ -2.26
RNU6-277P-201ENST00000516272 TDGF1P3P51864 188 aa0.91□□□□□ -2.26
RNU6-277P-201ENST00000516272 BIDP55957 195 aa0.91□□□□□ -2.26
RNU6-277P-201ENST00000516272 RAP1BP61224 184 aa0.91□□□□□ -2.26
RNU6-277P-201ENST00000516272 OSTNP61366 133 aa0.91□□□□□ -2.26
RNU6-277P-201ENST00000516272 SNTB2Q13425 540 aaKnown RBP0.91□□□□□ -2.26
RNU6-277P-201ENST00000516272 SLC39A12Q504Y0 691 aa0.91□□□□□ -2.26
RNU6-277P-201ENST00000516272 PCGF5Q86SE9 256 aa0.91□□□□□ -2.26
RNU6-277P-201ENST00000516272 VPS36Q86VN1 386 aa0.91□□□□□ -2.26
RNU6-277P-201ENST00000516272 OR8H3Q8N146 312 aa0.91□□□□□ -2.26
RNU6-277P-201ENST00000516272 MCOLN3Q8TDD5 553 aa0.91□□□□□ -2.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.4 ms