RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516098.1

RNU6-240P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 240, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-240P, Length 97 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-240P-201ENST00000516098 ARL6IP1Q15041 203 aa-0.05□□□□□ -2.42
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RNU6-240P-201ENST00000516098 ANKRD20A2Q5SQ80 823 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-240P-201ENST00000516098 ANKRD20A1Q5TYW2 823 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-240P-201ENST00000516098 ANKRD20A3Q5VUR7 823 aa-0.05□□□□□ -2.42
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RNU6-240P-201ENST00000516098 HERVK_113P63132 956 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-240P-201ENST00000516098 ERVK-8P63133 956 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-240P-201ENST00000516098 DEFB103AP81534 67 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-240P-201ENST00000516098 GALK2Q01415 458 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-240P-201ENST00000516098 SRYQ05066 204 aa-0.07□□□□□ -2.42
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