RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495141.5

UBE2E1-211, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 E1, humanhuman

TSL 2

Gene UBE2E1, Length 582 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2E1-211ENST00000495141 STAMBPO95630 424 aa14.66□□□□□ -0.06
UBE2E1-211ENST00000495141 PEPDP12955 493 aa14.66□□□□□ -0.06
UBE2E1-211ENST00000495141 CPN1P15169 458 aa14.66□□□□□ -0.06
UBE2E1-211ENST00000495141 HOXB6P17509 224 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
UBE2E1-211ENST00000495141 TCN1P20061 433 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
UBE2E1-211ENST00000495141 APOBEC1P41238 236 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
UBE2E1-211ENST00000495141 RNF144AP50876 292 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
UBE2E1-211ENST00000495141 SESN3P58005 492 aa14.66□□□□□ -0.06
UBE2E1-211ENST00000495141 FOXF1Q12946 379 aa14.66□□□□□ -0.06
UBE2E1-211ENST00000495141 SELENBP1Q13228 472 aa14.66□□□□□ -0.06
UBE2E1-211ENST00000495141 GLIPR1L2Q4G1C9 344 aa14.66□□□□□ -0.06
UBE2E1-211ENST00000495141 ASRGL1Q7L266 308 aa14.66□□□□□ -0.06
UBE2E1-211ENST00000495141 COMTD1Q86VU5 262 aa14.66□□□□□ -0.06
UBE2E1-211ENST00000495141 PM20D2Q8IYS1 436 aa14.66□□□□□ -0.06
UBE2E1-211ENST00000495141 FAM156AQ8NDB6 213 aa14.66□□□□□ -0.06
UBE2E1-211ENST00000495141 ZNF563Q8TA94 476 aa14.66□□□□□ -0.06
UBE2E1-211ENST00000495141 SLC25A43Q8WUT9 341 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
UBE2E1-211ENST00000495141 GEMIN6Q8WXD5 167 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
UBE2E1-211ENST00000495141 ABTB1Q969K4 478 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
UBE2E1-211ENST00000495141 CADM1Q9BY67 442 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
UBE2E1-211ENST00000495141 TRIM15Q9C019 465 aa14.66□□□□□ -0.06
UBE2E1-211ENST00000495141 PRDM14Q9GZV8 571 aa14.66□□□□□ -0.06
UBE2E1-211ENST00000495141 ADAM19Q9H013 955 aa14.66□□□□□ -0.06
UBE2E1-211ENST00000495141 EXO5Q9H790 373 aa14.66□□□□□ -0.06
UBE2E1-211ENST00000495141 PACSIN3Q9UKS6 424 aa14.66□□□□□ -0.06
UBE2E1-211ENST00000495141 SPIN1Q9Y657 262 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
UBE2E1-211ENST00000495141 CELSR1Q9NYQ6 3014 aa14.66□□□□□ -0.06
UBE2E1-211ENST00000495141 A0A1B0GTH9 108 aa14.65□□□□□ -0.06
UBE2E1-211ENST00000495141 AP3D1O14617 1153 aa14.65□□□□□ -0.06
UBE2E1-211ENST00000495141 SERPINA1P01009 418 aa14.65□□□□□ -0.06
UBE2E1-211ENST00000495141 HOXD4P09016 255 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
UBE2E1-211ENST00000495141 NCK1P16333 377 aa14.65□□□□□ -0.06
UBE2E1-211ENST00000495141 PTGS2P35354 604 aa14.65□□□□□ -0.06
UBE2E1-211ENST00000495141 PTGER4P35408 488 aa14.65□□□□□ -0.06
UBE2E1-211ENST00000495141 IDH2P48735 452 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
UBE2E1-211ENST00000495141 RAC1P63000 192 aa14.65□□□□□ -0.06
UBE2E1-211ENST00000495141 SF3B4Q15427 424 aaKnown RBP eCLIP14.65□□□□□ -0.062e-8■■■■■ 28
UBE2E1-211ENST00000495141 TOMM34Q15785 309 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
UBE2E1-211ENST00000495141 IFI44LQ53G44 452 aa14.65□□□□□ -0.06
UBE2E1-211ENST00000495141 C3orf33Q6P1S2 294 aa14.65□□□□□ -0.06
UBE2E1-211ENST00000495141 ZNF613Q6PF04 617 aa14.65□□□□□ -0.06
UBE2E1-211ENST00000495141 PLEKHM3Q6ZWE6 761 aa14.65□□□□□ -0.06
UBE2E1-211ENST00000495141 ULK2Q8IYT8 1036 aa14.65□□□□□ -0.06
UBE2E1-211ENST00000495141 FAM57AQ8TBR7 257 aa14.65□□□□□ -0.06
UBE2E1-211ENST00000495141 POC1BQ8TC44 478 aa14.65□□□□□ -0.06
UBE2E1-211ENST00000495141 DNAJA4Q8WW22 397 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
UBE2E1-211ENST00000495141 KLHDC3Q9BQ90 382 aa14.65□□□□□ -0.06
UBE2E1-211ENST00000495141 UGT2B28Q9BY64 529 aa14.65□□□□□ -0.06
UBE2E1-211ENST00000495141 SPRR3Q9UBC9 169 aa14.65□□□□□ -0.06
UBE2E1-211ENST00000495141 SLC5A6Q9Y289 635 aa14.65□□□□□ -0.06
UBE2E1-211ENST00000495141 ADGRG4Q8IZF6 3080 aa14.65□□□□□ -0.06
UBE2E1-211ENST00000495141 DOCK7Q96N67 2140 aa14.65□□□□□ -0.06
UBE2E1-211ENST00000495141 SETD2Q9BYW2 2564 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
UBE2E1-211ENST00000495141 GJE1A6NN92 205 aa14.64□□□□□ -0.07
UBE2E1-211ENST00000495141 PDE5AO76074 875 aa14.64□□□□□ -0.07
UBE2E1-211ENST00000495141 GKN3PP0CG01 181 aa14.64□□□□□ -0.07
UBE2E1-211ENST00000495141 PRG2P13727 222 aa14.64□□□□□ -0.07
UBE2E1-211ENST00000495141 ZNF708P17019 499 aa14.64□□□□□ -0.07
UBE2E1-211ENST00000495141 BMP7P18075 431 aa14.64□□□□□ -0.07
UBE2E1-211ENST00000495141 RYKP34925 604 aa14.64□□□□□ -0.07
UBE2E1-211ENST00000495141 CLK1P49759 484 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
UBE2E1-211ENST00000495141 LHX2P50458 406 aa14.64□□□□□ -0.07
UBE2E1-211ENST00000495141 POLR2HP52434 150 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
UBE2E1-211ENST00000495141 WLSQ5T9L3 541 aa14.64□□□□□ -0.07
UBE2E1-211ENST00000495141 FGD2Q7Z6J4 655 aa14.64□□□□□ -0.07
UBE2E1-211ENST00000495141 CARM1Q86X55 608 aa14.64□□□□□ -0.07
UBE2E1-211ENST00000495141 DHFR2Q86XF0 187 aa14.64□□□□□ -0.07
UBE2E1-211ENST00000495141 OR6T1Q8NGN1 323 aa14.64□□□□□ -0.07
UBE2E1-211ENST00000495141 PHF10Q8WUB8 498 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
UBE2E1-211ENST00000495141 HSH2DQ96JZ2 352 aa14.64□□□□□ -0.07
UBE2E1-211ENST00000495141 TMEM27Q9HBJ8 222 aa14.64□□□□□ -0.07
UBE2E1-211ENST00000495141 SERINC1Q9NRX5 453 aa14.64□□□□□ -0.07
UBE2E1-211ENST00000495141 RPH3AQ9Y2J0 694 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
UBE2E1-211ENST00000495141 SLC6A5Q9Y345 797 aa14.64□□□□□ -0.07
UBE2E1-211ENST00000495141 ITPR3Q14573 2671 aa14.63□□□□□ -0.07
UBE2E1-211ENST00000495141 AQP12BA6NM10 295 aa14.63□□□□□ -0.07
UBE2E1-211ENST00000495141 M0R3H8 397 aa14.63□□□□□ -0.07
UBE2E1-211ENST00000495141 ACOT8O14734 319 aa14.63□□□□□ -0.07
UBE2E1-211ENST00000495141 ZNF208O43345 1280 aa14.63□□□□□ -0.07
UBE2E1-211ENST00000495141 FRS3O43559 492 aa14.63□□□□□ -0.07
UBE2E1-211ENST00000495141 GMFGO60234 142 aa14.63□□□□□ -0.07
UBE2E1-211ENST00000495141 WDR1O75083 606 aa14.63□□□□□ -0.07
UBE2E1-211ENST00000495141 ZNF682O95780 498 aa14.63□□□□□ -0.07
UBE2E1-211ENST00000495141 IFNW1P05000 195 aa14.63□□□□□ -0.07
UBE2E1-211ENST00000495141 THRBP10828 461 aa14.63□□□□□ -0.07
UBE2E1-211ENST00000495141 GABRA1P14867 456 aa14.63□□□□□ -0.07
UBE2E1-211ENST00000495141 ABOP16442 354 aa14.63□□□□□ -0.07
UBE2E1-211ENST00000495141 MERTKQ12866 999 aa14.63□□□□□ -0.07
UBE2E1-211ENST00000495141 NPTX1Q15818 432 aa14.63□□□□□ -0.07
UBE2E1-211ENST00000495141 C5orf46Q6UWT4 87 aa14.63□□□□□ -0.07
UBE2E1-211ENST00000495141 AQP12AQ8IXF9 295 aa14.63□□□□□ -0.07
UBE2E1-211ENST00000495141 C3orf49Q96BT1 292 aa14.63□□□□□ -0.07
UBE2E1-211ENST00000495141 TPD52L3Q96J77 140 aa14.63□□□□□ -0.07
UBE2E1-211ENST00000495141 CLPTM1LQ96KA5 538 aa14.63□□□□□ -0.07
UBE2E1-211ENST00000495141 MCHR1Q99705 422 aa14.63□□□□□ -0.07
UBE2E1-211ENST00000495141 TIMP4Q99727 224 aa14.63□□□□□ -0.07
UBE2E1-211ENST00000495141 PAQR5Q9NXK6 330 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
UBE2E1-211ENST00000495141 RPS6KB2Q9UBS0 482 aa14.63□□□□□ -0.07
UBE2E1-211ENST00000495141 CHRNA9Q9UGM1 479 aa14.63□□□□□ -0.07
UBE2E1-211ENST00000495141 SH3GLB1Q9Y371 365 aa14.63□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 52 ms