RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000493967.1

PATJ-211, Transcript of PATJ, crumbs cell polarity complex component, humanhuman

TSL 2

Gene PATJ, Length 574 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PATJ-211ENST00000493967 DNAJA3Q96EY1 480 aa6.71□□□□□ -1.34
PATJ-211ENST00000493967 GMPPAQ96IJ6 420 aaPredicted RBP6.71□□□□□ -1.34
PATJ-211ENST00000493967 OR5B2Q96R09 309 aa6.71□□□□□ -1.34
PATJ-211ENST00000493967 RABEP2Q9H5N1 569 aa6.71□□□□□ -1.34
PATJ-211ENST00000493967 IKZF5Q9H5V7 419 aa6.71□□□□□ -1.34
PATJ-211ENST00000493967 SLC24A3Q9HC58 644 aa6.71□□□□□ -1.34
PATJ-211ENST00000493967 A4GALTQ9NPC4 353 aa6.71□□□□□ -1.34
PATJ-211ENST00000493967 TIGARQ9NQ88 270 aa6.71□□□□□ -1.34
PATJ-211ENST00000493967 EXOSC3Q9NQT5 275 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.34
PATJ-211ENST00000493967 CTPS2Q9NRF8 586 aa6.71□□□□□ -1.34
PATJ-211ENST00000493967 ACER3Q9NUN7 267 aa6.71□□□□□ -1.34
PATJ-211ENST00000493967 TMEM45AQ9NWC5 275 aa6.71□□□□□ -1.34
PATJ-211ENST00000493967 NIPSNAP3AQ9UFN0 247 aaPredicted RBP6.71□□□□□ -1.34
PATJ-211ENST00000493967 PROCRQ9UNN8 238 aa6.71□□□□□ -1.34
PATJ-211ENST00000493967 TRIM33Q9UPN9 1127 aa6.71□□□□□ -1.34
PATJ-211ENST00000493967 EMC9Q9Y3B6 208 aa6.71□□□□□ -1.34
PATJ-211ENST00000493967 OTOGQ6ZRI0 2925 aa6.71□□□□□ -1.34
PATJ-211ENST00000493967 A0A0G2JPF8 293 aa6.7□□□□□ -1.34
PATJ-211ENST00000493967 CDHR4A6H8M9 788 aa6.7□□□□□ -1.34
PATJ-211ENST00000493967 TMEM247A6NEH6 219 aa6.7□□□□□ -1.34
PATJ-211ENST00000493967 CFAP73A6NFT4 308 aa6.7□□□□□ -1.34
PATJ-211ENST00000493967 HNRNPCL2B2RXH8 293 aa6.7□□□□□ -1.34
PATJ-211ENST00000493967 HNRNPCL3B7ZW38 293 aa6.7□□□□□ -1.34
PATJ-211ENST00000493967 ANGPT2O15123 496 aa6.7□□□□□ -1.34
PATJ-211ENST00000493967 HNRNPCL1O60812 293 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
PATJ-211ENST00000493967 CTAG2O75638 210 aa6.7□□□□□ -1.34
PATJ-211ENST00000493967 GKN3PP0CG01 181 aa6.7□□□□□ -1.34
PATJ-211ENST00000493967 HNRNPCL4P0DMR1 293 aa6.7□□□□□ -1.34
PATJ-211ENST00000493967 TROVE2P10155 538 aaKnown RBP eCLIP6.7□□□□□ -1.34
PATJ-211ENST00000493967 TFPIP10646 304 aa6.7□□□□□ -1.34
PATJ-211ENST00000493967 CD8BP10966 210 aa6.7□□□□□ -1.34
PATJ-211ENST00000493967 EPXP11678 715 aa6.7□□□□□ -1.34
PATJ-211ENST00000493967 BMP2P12643 396 aa6.7□□□□□ -1.34
PATJ-211ENST00000493967 TACR3P29371 465 aa6.7□□□□□ -1.34
PATJ-211ENST00000493967 AGTR1P30556 359 aa6.7□□□□□ -1.34
PATJ-211ENST00000493967 CD79BP40259 229 aa6.7□□□□□ -1.34
PATJ-211ENST00000493967 PEX19P40855 299 aa6.7□□□□□ -1.34
PATJ-211ENST00000493967 KCNJ5P48544 419 aa6.7□□□□□ -1.34
PATJ-211ENST00000493967 ARFIP2P53365 341 aa6.7□□□□□ -1.34
PATJ-211ENST00000493967 RAC3P60763 192 aa6.7□□□□□ -1.34
PATJ-211ENST00000493967 SORDQ00796 357 aa6.7□□□□□ -1.34
PATJ-211ENST00000493967 EPS8Q12929 822 aa6.7□□□□□ -1.34
PATJ-211ENST00000493967 FADDQ13158 208 aa6.7□□□□□ -1.34
PATJ-211ENST00000493967 EXOC3L2Q2M3D2 409 aa6.7□□□□□ -1.34
PATJ-211ENST00000493967 LIN52Q52LA3 116 aa6.7□□□□□ -1.34
PATJ-211ENST00000493967 SYT14P1Q58G82 188 aa6.7□□□□□ -1.34
PATJ-211ENST00000493967 GCNT6Q5T4J0 391 aa6.7□□□□□ -1.34
PATJ-211ENST00000493967 DLEU7Q6UYE1 221 aa6.7□□□□□ -1.34
PATJ-211ENST00000493967 FCRLAQ7L513 359 aa6.7□□□□□ -1.34
PATJ-211ENST00000493967 GRINAQ7Z429 371 aa6.7□□□□□ -1.34
PATJ-211ENST00000493967 DHDDSQ86SQ9 333 aa6.7□□□□□ -1.34
PATJ-211ENST00000493967 RETREG3Q86VR2 466 aa6.7□□□□□ -1.34
PATJ-211ENST00000493967 ADGRG3Q86Y34 549 aa6.7□□□□□ -1.34
PATJ-211ENST00000493967 TUSC5Q8IXB3 177 aa6.7□□□□□ -1.34
PATJ-211ENST00000493967 OR6K3Q8NGY3 331 aa6.7□□□□□ -1.34
PATJ-211ENST00000493967 NFKBIDQ8NI38 313 aa6.7□□□□□ -1.34
PATJ-211ENST00000493967 RNF128Q8TEB7 428 aa6.7□□□□□ -1.34
PATJ-211ENST00000493967 FAM222BQ8WU58 562 aa6.7□□□□□ -1.34
PATJ-211ENST00000493967 NRGNQ92686 78 aa6.7□□□□□ -1.34
PATJ-211ENST00000493967 PMM1Q92871 262 aa6.7□□□□□ -1.34
PATJ-211ENST00000493967 CPNE4Q96A23 557 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
PATJ-211ENST00000493967 REXO5Q96IC2 774 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
PATJ-211ENST00000493967 CPPED1Q9BRF8 314 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
PATJ-211ENST00000493967 GPATCH1Q9BRR8 931 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
PATJ-211ENST00000493967 CCDC106Q9BWC9 280 aa6.7□□□□□ -1.34
PATJ-211ENST00000493967 OR11A1Q9GZK7 315 aa6.7□□□□□ -1.34
PATJ-211ENST00000493967 RAD21L1Q9H4I0 556 aa6.7□□□□□ -1.34
PATJ-211ENST00000493967 C12orf49Q9H741 205 aa6.7□□□□□ -1.34
PATJ-211ENST00000493967 BCL2L10Q9HD36 194 aa6.7□□□□□ -1.34
PATJ-211ENST00000493967 MED4Q9NPJ6 270 aa6.7□□□□□ -1.34
PATJ-211ENST00000493967 SERINC1Q9NRX5 453 aa6.7□□□□□ -1.34
PATJ-211ENST00000493967 THUMPD1Q9NXG2 353 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
PATJ-211ENST00000493967 CALML5Q9NZT1 146 aa6.7□□□□□ -1.34
PATJ-211ENST00000493967 CHRNA9Q9UGM1 479 aa6.7□□□□□ -1.34
PATJ-211ENST00000493967 LEF1Q9UJU2 399 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
PATJ-211ENST00000493967 ZNF443Q9Y2A4 671 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
PATJ-211ENST00000493967 NDUFAF1Q9Y375 327 aa6.7□□□□□ -1.34
PATJ-211ENST00000493967 CHST2Q9Y4C5 530 aa6.7□□□□□ -1.34
PATJ-211ENST00000493967 SETD2Q9BYW2 2564 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
PATJ-211ENST00000493967 TMED7-TICAM2A0A0A6YYA0 188 aa6.69□□□□□ -1.34
PATJ-211ENST00000493967 TMEM72A0PK05 275 aa6.69□□□□□ -1.34
PATJ-211ENST00000493967 SH3D21A4FU49 640 aa6.69□□□□□ -1.34
PATJ-211ENST00000493967 A6NNC1 897 aa6.69□□□□□ -1.34
PATJ-211ENST00000493967 C5orf58C9J3I9 102 aa6.69□□□□□ -1.34
PATJ-211ENST00000493967 SULT2B1O00204 365 aa6.69□□□□□ -1.34
PATJ-211ENST00000493967 SMAD9O15198 467 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
PATJ-211ENST00000493967 FRS3O43559 492 aa6.69□□□□□ -1.34
PATJ-211ENST00000493967 PRKD3O94806 890 aa6.69□□□□□ -1.34
PATJ-211ENST00000493967 PGM3O95394 542 aa6.69□□□□□ -1.34
PATJ-211ENST00000493967 FESP07332 822 aa6.69□□□□□ -1.34
PATJ-211ENST00000493967 THBS1P07996 1170 aa6.69□□□□□ -1.34
PATJ-211ENST00000493967 PABPC4LP0CB38 370 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
PATJ-211ENST00000493967 ARAFP10398 606 aa6.69□□□□□ -1.34
PATJ-211ENST00000493967 PRG2P13727 222 aa6.69□□□□□ -1.34
PATJ-211ENST00000493967 POU2F1P14859 743 aa6.69□□□□□ -1.34
PATJ-211ENST00000493967 UQCRBP14927 111 aa6.69□□□□□ -1.34
PATJ-211ENST00000493967 GPX2P18283 190 aa6.69□□□□□ -1.34
PATJ-211ENST00000493967 PPIBP23284 216 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
PATJ-211ENST00000493967 MDH1P40925 334 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
PATJ-211ENST00000493967 APOBEC1P41238 236 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
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