RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486357.1

APOBEC3G-206, Transcript of apolipoprotein B mRNA editing enzyme catalytic subunit 3G, humanhuman

TSL 4

Gene APOBEC3G, Length 543 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3G-206ENST00000486357 NR2F6P10588 404 aa6.37□□□□□ -1.39
APOBEC3G-206ENST00000486357 POU2F1P14859 743 aa6.37□□□□□ -1.39
APOBEC3G-206ENST00000486357 CPN1P15169 458 aa6.37□□□□□ -1.39
APOBEC3G-206ENST00000486357 ATP6V1B1P15313 513 aa6.37□□□□□ -1.39
APOBEC3G-206ENST00000486357 TCEA1P23193 301 aaKnown RBP6.37□□□□□ -1.39
APOBEC3G-206ENST00000486357 CPT2P23786 658 aa6.37□□□□□ -1.39
APOBEC3G-206ENST00000486357 BUD31P41223 144 aaPredicted RBP6.37□□□□□ -1.39
APOBEC3G-206ENST00000486357 CASP3P42574 277 aa6.37□□□□□ -1.39
APOBEC3G-206ENST00000486357 STARP49675 285 aa6.37□□□□□ -1.39
APOBEC3G-206ENST00000486357 SLC12A2P55011 1212 aa6.37□□□□□ -1.39
APOBEC3G-206ENST00000486357 F2RL1P55085 397 aa6.37□□□□□ -1.39
APOBEC3G-206ENST00000486357 RPS13P62277 151 aaKnown RBP6.37□□□□□ -1.39
APOBEC3G-206ENST00000486357 CDKL1Q00532 357 aa6.37□□□□□ -1.39
APOBEC3G-206ENST00000486357 CHIT1Q13231 466 aa6.37□□□□□ -1.39
APOBEC3G-206ENST00000486357 TNK1Q13470 666 aa6.37□□□□□ -1.39
APOBEC3G-206ENST00000486357 DDX39BQ13838 428 aaKnown RBP6.37□□□□□ -1.39
APOBEC3G-206ENST00000486357 DOC2AQ14183 400 aa6.37□□□□□ -1.39
APOBEC3G-206ENST00000486357 FGFBP1Q14512 234 aa6.37□□□□□ -1.39
APOBEC3G-206ENST00000486357 EBPQ15125 230 aaKnown RBP6.37□□□□□ -1.39
APOBEC3G-206ENST00000486357 TSNQ15631 228 aaKnown RBP6.37□□□□□ -1.39
APOBEC3G-206ENST00000486357 PDK4Q16654 411 aa6.37□□□□□ -1.39
APOBEC3G-206ENST00000486357 PPP1R3AQ16821 1122 aa6.37□□□□□ -1.39
APOBEC3G-206ENST00000486357 ERCC6LQ2NKX8 1250 aa6.37□□□□□ -1.39
APOBEC3G-206ENST00000486357 TMEM35AQ53FP2 167 aa6.37□□□□□ -1.39
APOBEC3G-206ENST00000486357 NHSL2Q5HYW2 709 aa6.37□□□□□ -1.39
APOBEC3G-206ENST00000486357 C6orf163Q5TEZ5 329 aa6.37□□□□□ -1.39
APOBEC3G-206ENST00000486357 C18orf63Q68DL7 685 aa6.37□□□□□ -1.39
APOBEC3G-206ENST00000486357 TIGD3Q6B0B8 471 aa6.37□□□□□ -1.39
APOBEC3G-206ENST00000486357 CFAP77Q6ZQR2 320 aa6.37□□□□□ -1.39
APOBEC3G-206ENST00000486357 ZNF550Q7Z398 422 aa6.37□□□□□ -1.39
APOBEC3G-206ENST00000486357 GPR180Q86V85 440 aa6.37□□□□□ -1.39
APOBEC3G-206ENST00000486357 ST13P4Q8IZP2 240 aaPredicted RBP6.37□□□□□ -1.39
APOBEC3G-206ENST00000486357 NAT8LQ8N9F0 302 aa6.37□□□□□ -1.39
APOBEC3G-206ENST00000486357 ANKRD7Q92527 254 aa6.37□□□□□ -1.39
APOBEC3G-206ENST00000486357 RHBDF1Q96CC6 855 aa6.37□□□□□ -1.39
APOBEC3G-206ENST00000486357 NTNG2Q96CW9 530 aa6.37□□□□□ -1.39
APOBEC3G-206ENST00000486357 TMCO6Q96DC7 493 aa6.37□□□□□ -1.39
APOBEC3G-206ENST00000486357 PGM2Q96G03 612 aa6.37□□□□□ -1.39
APOBEC3G-206ENST00000486357 PIGQQ9BRB3 760 aa6.37□□□□□ -1.39
APOBEC3G-206ENST00000486357 SLC39A3Q9BRY0 314 aa6.37□□□□□ -1.39
APOBEC3G-206ENST00000486357 EFCAB11Q9BUY7 163 aa6.37□□□□□ -1.39
APOBEC3G-206ENST00000486357 UBQLN3Q9H347 655 aa6.37□□□□□ -1.39
APOBEC3G-206ENST00000486357 EHD1Q9H4M9 534 aa6.37□□□□□ -1.39
APOBEC3G-206ENST00000486357 WDR41Q9HAD4 459 aa6.37□□□□□ -1.39
APOBEC3G-206ENST00000486357 SLC6A13Q9NSD5 602 aa6.37□□□□□ -1.39
APOBEC3G-206ENST00000486357 SERTAD4Q9NUC0 356 aa6.37□□□□□ -1.39
APOBEC3G-206ENST00000486357 MS4A12Q9NXJ0 267 aa6.37□□□□□ -1.39
APOBEC3G-206ENST00000486357 CD274Q9NZQ7 290 aa6.37□□□□□ -1.39
APOBEC3G-206ENST00000486357 KLRF1Q9NZS2 232 aa6.37□□□□□ -1.39
APOBEC3G-206ENST00000486357 PHF11Q9UIL8 331 aa6.37□□□□□ -1.39
APOBEC3G-206ENST00000486357 WIF1Q9Y5W5 379 aa6.37□□□□□ -1.39
APOBEC3G-206ENST00000486357 DNHD1Q96M86 4753 aa6.37□□□□□ -1.39
APOBEC3G-206ENST00000486357 KIAA1549Q9HCM3 1950 aa6.37□□□□□ -1.39
APOBEC3G-206ENST00000486357 A0A1W2PNV4 684 aa6.36□□□□□ -1.39
APOBEC3G-206ENST00000486357 C16orf97H3BN30 126 aa6.36□□□□□ -1.39
APOBEC3G-206ENST00000486357 PLOD2O00469 737 aa6.36□□□□□ -1.39
APOBEC3G-206ENST00000486357 STK16O75716 305 aa6.36□□□□□ -1.39
APOBEC3G-206ENST00000486357 GPR75O95800 540 aa6.36□□□□□ -1.39
APOBEC3G-206ENST00000486357 BAG2O95816 211 aa6.36□□□□□ -1.39
APOBEC3G-206ENST00000486357 FCGR2AP12318 317 aa6.36□□□□□ -1.39
APOBEC3G-206ENST00000486357 CRYGSP22914 178 aa6.36□□□□□ -1.39
APOBEC3G-206ENST00000486357 POU1F1P28069 291 aa6.36□□□□□ -1.39
APOBEC3G-206ENST00000486357 PTPN6P29350 595 aa6.36□□□□□ -1.39
APOBEC3G-206ENST00000486357 CDAP32320 146 aa6.36□□□□□ -1.39
APOBEC3G-206ENST00000486357 CD79BP40259 229 aa6.36□□□□□ -1.39
APOBEC3G-206ENST00000486357 MAGEA3P43357 314 aa6.36□□□□□ -1.39
APOBEC3G-206ENST00000486357 SLC6A12P48065 614 aa6.36□□□□□ -1.39
APOBEC3G-206ENST00000486357 CLK1P49759 484 aaKnown RBP6.36□□□□□ -1.39
APOBEC3G-206ENST00000486357 CAMPP49913 170 aa6.36□□□□□ -1.39
APOBEC3G-206ENST00000486357 SIRPAP78324 504 aa6.36□□□□□ -1.39
APOBEC3G-206ENST00000486357 IGLV3-21P80748 117 aaPredicted RBP6.36□□□□□ -1.39
APOBEC3G-206ENST00000486357 TNFRSF17Q02223 184 aa6.36□□□□□ -1.39
APOBEC3G-206ENST00000486357 PPP1R7Q15435 360 aa6.36□□□□□ -1.39
APOBEC3G-206ENST00000486357 TGFBIQ15582 683 aa6.36□□□□□ -1.39
APOBEC3G-206ENST00000486357 NNATQ16517 81 aa6.36□□□□□ -1.39
APOBEC3G-206ENST00000486357 CXorf66Q5JRM2 361 aaPredicted RBP6.36□□□□□ -1.39
APOBEC3G-206ENST00000486357 KRBOX4Q5JUW0 171 aa6.36□□□□□ -1.39
APOBEC3G-206ENST00000486357 FNDC7Q5VTL7 733 aa6.36□□□□□ -1.39
APOBEC3G-206ENST00000486357 OR4C11Q6IEV9 310 aa6.36□□□□□ -1.39
APOBEC3G-206ENST00000486357 HEPHL1Q6MZM0 1159 aa6.36□□□□□ -1.39
APOBEC3G-206ENST00000486357 MED27Q6P2C8 311 aa6.36□□□□□ -1.39
APOBEC3G-206ENST00000486357 TTC27Q6P3X3 843 aa6.36□□□□□ -1.39
APOBEC3G-206ENST00000486357 AAGABQ6PD74 315 aa6.36□□□□□ -1.39
APOBEC3G-206ENST00000486357 TRAT1Q6PIZ9 186 aa6.36□□□□□ -1.39
APOBEC3G-206ENST00000486357 CCDC137Q6PK04 289 aaKnown RBP6.36□□□□□ -1.39
APOBEC3G-206ENST00000486357 ZNF551Q7Z340 670 aaPredicted RBP6.36□□□□□ -1.39
APOBEC3G-206ENST00000486357 GPAT4Q86UL3 456 aa6.36□□□□□ -1.39
APOBEC3G-206ENST00000486357 IFNEQ86WN2 208 aa6.36□□□□□ -1.39
APOBEC3G-206ENST00000486357 GPSM1Q86YR5 675 aa6.36□□□□□ -1.39
APOBEC3G-206ENST00000486357 CNTN4Q8IWV2 1026 aa6.36□□□□□ -1.39
APOBEC3G-206ENST00000486357 CNPY4Q8N129 248 aa6.36□□□□□ -1.39
APOBEC3G-206ENST00000486357 TCAIMQ8N3R3 496 aa6.36□□□□□ -1.39
APOBEC3G-206ENST00000486357 SPATA6LQ8N4H0 392 aa6.36□□□□□ -1.39
APOBEC3G-206ENST00000486357 SPC24Q8NBT2 197 aa6.36□□□□□ -1.39
APOBEC3G-206ENST00000486357 DNAAF1Q8NEP3 725 aa6.36□□□□□ -1.39
APOBEC3G-206ENST00000486357 EXT2Q93063 718 aa6.36□□□□□ -1.39
APOBEC3G-206ENST00000486357 UBE2E3Q969T4 207 aa6.36□□□□□ -1.39
APOBEC3G-206ENST00000486357 CMTM7Q96FZ5 175 aa6.36□□□□□ -1.39
APOBEC3G-206ENST00000486357 SFXN2Q96NB2 322 aa6.36□□□□□ -1.39
APOBEC3G-206ENST00000486357 ZNF347Q96SE7 839 aa6.36□□□□□ -1.39
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.2 ms