RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000478087.5

HPS1-211, Transcript of HPS1, biogenesis of lysosomal organelles complex 3 subunit 1, humanhuman

TSL 5

Gene HPS1, Length 971 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS1-211ENST00000478087 EIF4E2O60573 245 aaKnown RBP11.6□□□□□ -0.55
HPS1-211ENST00000478087 ADAM11O75078 769 aa11.6□□□□□ -0.55
HPS1-211ENST00000478087 H6PDO95479 791 aa11.6□□□□□ -0.55
HPS1-211ENST00000478087 CSTAP01040 98 aa11.6□□□□□ -0.55
HPS1-211ENST00000478087 GUSBP08236 651 aa11.6□□□□□ -0.55
HPS1-211ENST00000478087 FCGR2AP12318 317 aa11.6□□□□□ -0.55
HPS1-211ENST00000478087 CD99P14209 185 aa11.6□□□□□ -0.55
HPS1-211ENST00000478087 CRYGSP22914 178 aa11.6□□□□□ -0.55
HPS1-211ENST00000478087 AGTR1P30556 359 aa11.6□□□□□ -0.55
HPS1-211ENST00000478087 KHKP50053 298 aa11.6□□□□□ -0.55
HPS1-211ENST00000478087 SESN3P58005 492 aa11.6□□□□□ -0.55
HPS1-211ENST00000478087 GNGT1P63211 74 aa11.6□□□□□ -0.55
HPS1-211ENST00000478087 CHRNEQ04844 493 aa11.6□□□□□ -0.55
HPS1-211ENST00000478087 FOXD4Q12950 439 aaPredicted RBP11.6□□□□□ -0.55
HPS1-211ENST00000478087 SYPL1Q16563 259 aa11.6□□□□□ -0.55
HPS1-211ENST00000478087 ZNF239Q16600 458 aaKnown RBP11.6□□□□□ -0.55
HPS1-211ENST00000478087 DEFB113Q30KQ7 82 aa11.6□□□□□ -0.55
HPS1-211ENST00000478087 TIGD2Q4W5G0 525 aa11.6□□□□□ -0.55
HPS1-211ENST00000478087 SLC25A53Q5H9E4 307 aa11.6□□□□□ -0.55
HPS1-211ENST00000478087 ATAD3BQ5T9A4 648 aa11.6□□□□□ -0.55
HPS1-211ENST00000478087 CGB2Q6NT52 195 aa11.6□□□□□ -0.55
HPS1-211ENST00000478087 FRRS1Q6ZNA5 592 aa11.6□□□□□ -0.55
HPS1-211ENST00000478087 ZNF621Q6ZSS3 439 aa11.6□□□□□ -0.55
HPS1-211ENST00000478087 SPATA21Q7Z572 469 aa11.6□□□□□ -0.55
HPS1-211ENST00000478087 TGIF2LYQ8IUE0 185 aa11.6□□□□□ -0.55
HPS1-211ENST00000478087 ANKFN1Q8N957 763 aa11.6□□□□□ -0.55
HPS1-211ENST00000478087 OR6K3Q8NGY3 331 aa11.6□□□□□ -0.55
HPS1-211ENST00000478087 PNPT1Q8TCS8 783 aaKnown RBP11.6□□□□□ -0.55
HPS1-211ENST00000478087 MBD6Q96DN6 1003 aa11.6□□□□□ -0.55
HPS1-211ENST00000478087 LAT2Q9GZY6 243 aa11.6□□□□□ -0.55
HPS1-211ENST00000478087 CCDC167Q9P0B6 97 aa11.6□□□□□ -0.55
HPS1-211ENST00000478087 LEF1Q9UJU2 399 aaPredicted RBP11.6□□□□□ -0.55
HPS1-211ENST00000478087 ING1Q9UK53 422 aaPredicted RBP11.6□□□□□ -0.55
HPS1-211ENST00000478087 CORO2BQ9UQ03 480 aa11.6□□□□□ -0.55
HPS1-211ENST00000478087 EMC9Q9Y3B6 208 aa11.6□□□□□ -0.55
HPS1-211ENST00000478087 A0A096LPI6 279 aa11.59□□□□□ -0.55
HPS1-211ENST00000478087 NR5A2O00482 541 aa11.59□□□□□ -0.55
HPS1-211ENST00000478087 KLF4O43474 513 aa11.59□□□□□ -0.55
HPS1-211ENST00000478087 KIAA0513O60268 411 aa11.59□□□□□ -0.55
HPS1-211ENST00000478087 DNAJA2O60884 412 aa11.59□□□□□ -0.55
HPS1-211ENST00000478087 PLAUP00749 431 aa11.59□□□□□ -0.55
HPS1-211ENST00000478087 EDNRAP25101 427 aa11.59□□□□□ -0.55
HPS1-211ENST00000478087 ADH6P28332 368 aa11.59□□□□□ -0.55
HPS1-211ENST00000478087 RYKP34925 604 aa11.59□□□□□ -0.55
HPS1-211ENST00000478087 PGM1P36871 562 aa11.59□□□□□ -0.55
HPS1-211ENST00000478087 PCYT1AP49585 367 aa11.59□□□□□ -0.55
HPS1-211ENST00000478087 SUMO3P55854 103 aaPredicted RBP11.59□□□□□ -0.55
HPS1-211ENST00000478087 CBFBQ13951 182 aa11.59□□□□□ -0.55
HPS1-211ENST00000478087 GPAT3Q53EU6 434 aa11.59□□□□□ -0.55
HPS1-211ENST00000478087 C6orf10Q5SRN2 563 aa11.59□□□□□ -0.55
HPS1-211ENST00000478087 ZC3HAV1Q7Z2W4 902 aaKnown RBP11.59□□□□□ -0.55
HPS1-211ENST00000478087 KRTAP1-3Q8IUG1 177 aa11.59□□□□□ -0.55
HPS1-211ENST00000478087 FUNDC1Q8IVP5 155 aa11.59□□□□□ -0.55
HPS1-211ENST00000478087 WFDC11Q8NEX6 87 aa11.59□□□□□ -0.55
HPS1-211ENST00000478087 TOR1AIP2Q8NFQ8 470 aa11.59□□□□□ -0.55
HPS1-211ENST00000478087 OR9I1Q8NGQ6 314 aa11.59□□□□□ -0.55
HPS1-211ENST00000478087 RNF128Q8TEB7 428 aa11.59□□□□□ -0.55
HPS1-211ENST00000478087 ZFP90Q8TF47 636 aa11.59□□□□□ -0.55
HPS1-211ENST00000478087 C10orf82Q8WW14 230 aa11.59□□□□□ -0.55
HPS1-211ENST00000478087 GTF2H4Q92759 462 aa11.59□□□□□ -0.55
HPS1-211ENST00000478087 PMM1Q92871 262 aa11.59□□□□□ -0.55
HPS1-211ENST00000478087 MRGPRX4Q96LA9 322 aa11.59□□□□□ -0.55
HPS1-211ENST00000478087 SAP130Q9H0E3 1048 aa11.59□□□□□ -0.55
HPS1-211ENST00000478087 GSX1Q9H4S2 264 aaPredicted RBP11.59□□□□□ -0.55
HPS1-211ENST00000478087 POLE3Q9NRF9 147 aa11.59□□□□□ -0.55
HPS1-211ENST00000478087 PAQR5Q9NXK6 330 aaPredicted RBP11.59□□□□□ -0.55
HPS1-211ENST00000478087 FAM53CQ9NYF3 392 aa11.59□□□□□ -0.55
HPS1-211ENST00000478087 LIPT1Q9Y234 373 aa11.59□□□□□ -0.55
HPS1-211ENST00000478087 WDR45Q9Y484 360 aa11.59□□□□□ -0.55
HPS1-211ENST00000478087 GMEB1Q9Y692 573 aa11.59□□□□□ -0.55
HPS1-211ENST00000478087 BBIP1A8MTZ0 92 aa11.58□□□□□ -0.56
HPS1-211ENST00000478087 ANGPT2O15123 496 aa11.58□□□□□ -0.56
HPS1-211ENST00000478087 CHRM4P08173 479 aa11.58□□□□□ -0.56
HPS1-211ENST00000478087 ELK4P28324 431 aa11.58□□□□□ -0.56
HPS1-211ENST00000478087 MERTKQ12866 999 aa11.58□□□□□ -0.56
HPS1-211ENST00000478087 FADDQ13158 208 aa11.58□□□□□ -0.56
HPS1-211ENST00000478087 FGFBP1Q14512 234 aa11.58□□□□□ -0.56
HPS1-211ENST00000478087 MAPK11Q15759 364 aa11.58□□□□□ -0.56
HPS1-211ENST00000478087 COQ5Q5HYK3 327 aa11.58□□□□□ -0.56
HPS1-211ENST00000478087 PDSS1Q5T2R2 415 aa11.58□□□□□ -0.56
HPS1-211ENST00000478087 LRIF1Q5T3J3 769 aa11.58□□□□□ -0.56
HPS1-211ENST00000478087 ALKBH2Q6NS38 261 aa11.58□□□□□ -0.56
HPS1-211ENST00000478087 FCRLAQ7L513 359 aa11.58□□□□□ -0.56
HPS1-211ENST00000478087 CXorf67Q86X51 503 aaPredicted RBP11.58□□□□□ -0.56
HPS1-211ENST00000478087 ZNF619Q8N2I2 560 aa11.58□□□□□ -0.56
HPS1-211ENST00000478087 CNOT9Q92600 299 aaKnown RBP11.58□□□□□ -0.56
HPS1-211ENST00000478087 ALPK1Q96QP1 1244 aa11.58□□□□□ -0.56
HPS1-211ENST00000478087 OR5B2Q96R09 309 aa11.58□□□□□ -0.56
HPS1-211ENST00000478087 UBTD1Q9HAC8 227 aa11.58□□□□□ -0.56
HPS1-211ENST00000478087 ZNF226Q9NYT6 803 aa11.58□□□□□ -0.56
HPS1-211ENST00000478087 NDUFAF1Q9Y375 327 aa11.58□□□□□ -0.56
HPS1-211ENST00000478087 ALPK2Q86TB3 2170 aa11.58□□□□□ -0.56
HPS1-211ENST00000478087 ZANQ9Y493 2812 aa11.58□□□□□ -0.56
HPS1-211ENST00000478087 TMEM247A6NEH6 219 aa11.57□□□□□ -0.56
HPS1-211ENST00000478087 ZNF814B7Z6K7 855 aa11.57□□□□□ -0.56
HPS1-211ENST00000478087 ETV2O00321 342 aaPredicted RBP11.57□□□□□ -0.56
HPS1-211ENST00000478087 AP3D1O14617 1153 aa11.57□□□□□ -0.56
HPS1-211ENST00000478087 SMAD9O15198 467 aaKnown RBP11.57□□□□□ -0.56
HPS1-211ENST00000478087 SNX3O60493 162 aa11.57□□□□□ -0.56
HPS1-211ENST00000478087 GCM2O75603 506 aaPredicted RBP11.57□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.2 ms