RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000468468.5

TSPAN4-211, Transcript of tetraspanin 4, humanhuman

TSL 2

Gene TSPAN4, Length 2,777 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN4-211ENST00000468468 BMP8AQ7Z5Y6 402 aa14.6□□□□□ -0.07
TSPAN4-211ENST00000468468 COX18Q8N8Q8 333 aa14.6□□□□□ -0.07
TSPAN4-211ENST00000468468 CYB561A3Q8NBI2 242 aa14.6□□□□□ -0.07
TSPAN4-211ENST00000468468 OR51A7Q8NH64 312 aa14.6□□□□□ -0.07
TSPAN4-211ENST00000468468 SRMSQ9H3Y6 488 aa14.6□□□□□ -0.07
TSPAN4-211ENST00000468468 MED31Q9Y3C7 131 aa14.6□□□□□ -0.07
TSPAN4-211ENST00000468468 A0A0G2JK05 382 aa14.6□□□□□ -0.07
TSPAN4-211ENST00000468468 CDHR4A6H8M9 788 aa14.6□□□□□ -0.07
TSPAN4-211ENST00000468468 LRRC72A6NJI9 287 aa14.6□□□□□ -0.07
TSPAN4-211ENST00000468468 PCP4L1A6NKN8 68 aa14.6□□□□□ -0.07
TSPAN4-211ENST00000468468 HOXB2P14652 356 aa14.6□□□□□ -0.07
TSPAN4-211ENST00000468468 IL9P15248 144 aa14.6□□□□□ -0.07
TSPAN4-211ENST00000468468 HK1P19367 917 aa14.6□□□□□ -0.07
TSPAN4-211ENST00000468468 ZNF85Q03923 595 aa14.6□□□□□ -0.07
TSPAN4-211ENST00000468468 NTRK2Q16620 822 aa14.6□□□□□ -0.07
TSPAN4-211ENST00000468468 AMZ1Q400G9 498 aa14.6□□□□□ -0.07
TSPAN4-211ENST00000468468 TMPRSS11FQ6ZWK6 438 aa14.6□□□□□ -0.07
TSPAN4-211ENST00000468468 TMEFF1Q8IYR6 380 aa14.6□□□□□ -0.07
TSPAN4-211ENST00000468468 OR2M4Q96R27 311 aa14.6□□□□□ -0.07
TSPAN4-211ENST00000468468 MED28Q9H204 178 aa14.6□□□□□ -0.07
TSPAN4-211ENST00000468468 FBXL4Q9UKA2 621 aa14.6□□□□□ -0.07
TSPAN4-211ENST00000468468 PRUNE2Q8WUY3 3088 aa14.59□□□□□ -0.07
TSPAN4-211ENST00000468468 TRAV6A0A075B6T7 132 aa14.59□□□□□ -0.07
TSPAN4-211ENST00000468468 PRSS38A1L453 326 aa14.59□□□□□ -0.07
TSPAN4-211ENST00000468468 RIIAD1A6NNX1 92 aa14.59□□□□□ -0.07
TSPAN4-211ENST00000468468 FZD7O75084 574 aa14.59□□□□□ -0.07
TSPAN4-211ENST00000468468 LDB3O75112 727 aa14.59□□□□□ -0.07
TSPAN4-211ENST00000468468 KLF8O95600 359 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
TSPAN4-211ENST00000468468 SMIM10L1P0DMW3 83 aa14.59□□□□□ -0.07
TSPAN4-211ENST00000468468 CTHP32929 405 aa14.59□□□□□ -0.07
TSPAN4-211ENST00000468468 CRMP1Q14194 572 aa14.59□□□□□ -0.07
TSPAN4-211ENST00000468468 FCN2Q15485 313 aa14.59□□□□□ -0.07
TSPAN4-211ENST00000468468 FHL5Q5TD97 284 aa14.59□□□□□ -0.07
TSPAN4-211ENST00000468468 CREB3L2Q70SY1 520 aa14.59□□□□□ -0.07
TSPAN4-211ENST00000468468 RD3Q7Z3Z2 195 aa14.59□□□□□ -0.07
TSPAN4-211ENST00000468468 OR4C6Q8NH72 309 aa14.59□□□□□ -0.07
TSPAN4-211ENST00000468468 SMPDL3BQ92485 455 aa14.59□□□□□ -0.07
TSPAN4-211ENST00000468468 PHF21AQ96BD5 680 aa14.59□□□□□ -0.07
TSPAN4-211ENST00000468468 SMIM10Q96HG1 83 aa14.59□□□□□ -0.07
TSPAN4-211ENST00000468468 HYLS1Q96M11 299 aa14.59□□□□□ -0.07
TSPAN4-211ENST00000468468 ADGRL4Q9HBW9 690 aa14.59□□□□□ -0.07
TSPAN4-211ENST00000468468 TMEM5Q9Y2B1 443 aa14.59□□□□□ -0.07
TSPAN4-211ENST00000468468 SLC35A3Q9Y2D2 325 aa14.59□□□□□ -0.07
TSPAN4-211ENST00000468468 CTSVO60911 334 aa14.59□□□□□ -0.07
TSPAN4-211ENST00000468468 SOX30O94993 753 aa14.59□□□□□ -0.07
TSPAN4-211ENST00000468468 DHFRP00374 187 aa14.59□□□□□ -0.07
TSPAN4-211ENST00000468468 BTCP35070 178 aa14.59□□□□□ -0.07
TSPAN4-211ENST00000468468 TAS2R43P59537 309 aa14.59□□□□□ -0.07
TSPAN4-211ENST00000468468 ACSM3Q53FZ2 586 aa14.59□□□□□ -0.07
TSPAN4-211ENST00000468468 PYHIN1Q6K0P9 492 aa14.59□□□□□ -0.07
TSPAN4-211ENST00000468468 SHISA5Q8N114 240 aa14.59□□□□□ -0.07
TSPAN4-211ENST00000468468 SLC44A3Q8N4M1 653 aa14.59□□□□□ -0.07
TSPAN4-211ENST00000468468 GRHL3Q8TE85 626 aa14.59□□□□□ -0.07
TSPAN4-211ENST00000468468 TM4SF19Q96DZ7 209 aa14.59□□□□□ -0.07
TSPAN4-211ENST00000468468 OR2A5Q96R48 311 aa14.59□□□□□ -0.07
TSPAN4-211ENST00000468468 ERVMER34-1Q9H9K5 563 aa14.59□□□□□ -0.07
TSPAN4-211ENST00000468468 MEPEQ9NQ76 525 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
TSPAN4-211ENST00000468468 CLEC4AQ9UMR7 237 aa14.59□□□□□ -0.07
TSPAN4-211ENST00000468468 CA5BQ9Y2D0 317 aa14.59□□□□□ -0.07
TSPAN4-211ENST00000468468 SLC22A7Q9Y694 548 aa14.59□□□□□ -0.07
TSPAN4-211ENST00000468468 A8MUA0 341 aa14.58□□□□□ -0.07
TSPAN4-211ENST00000468468 FABP7O15540 132 aa14.58□□□□□ -0.07
TSPAN4-211ENST00000468468 PPP1R3DO95685 299 aa14.58□□□□□ -0.07
TSPAN4-211ENST00000468468 GYPBP06028 91 aa14.58□□□□□ -0.07
TSPAN4-211ENST00000468468 NT5EP21589 574 aa14.58□□□□□ -0.07
TSPAN4-211ENST00000468468 PYCR1P32322 319 aa14.58□□□□□ -0.07
TSPAN4-211ENST00000468468 ZNF767PQ75MW2 155 aa14.58□□□□□ -0.07
TSPAN4-211ENST00000468468 OR13C5Q8NGS8 318 aa14.58□□□□□ -0.07
TSPAN4-211ENST00000468468 OR5J2Q8NH18 312 aa14.58□□□□□ -0.07
TSPAN4-211ENST00000468468 PGLYRP3Q96LB9 341 aa14.58□□□□□ -0.07
TSPAN4-211ENST00000468468 SMAD5Q99717 465 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.07
TSPAN4-211ENST00000468468 GABRG3Q99928 467 aa14.58□□□□□ -0.07
TSPAN4-211ENST00000468468 C1QTNF7Q9BXJ2 289 aa14.58□□□□□ -0.07
TSPAN4-211ENST00000468468 NUDT15Q9NV35 164 aa14.58□□□□□ -0.07
TSPAN4-211ENST00000468468 USP36Q9P275 1121 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.07
TSPAN4-211ENST00000468468 POM121BA6NF01 834 aa14.58□□□□□ -0.08
TSPAN4-211ENST00000468468 TRIM77I1YAP6 450 aa14.58□□□□□ -0.08
TSPAN4-211ENST00000468468 CHP2O43745 196 aa14.58□□□□□ -0.08
TSPAN4-211ENST00000468468 MTRF1O75570 445 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
TSPAN4-211ENST00000468468 RFPL3O75679 317 aa14.58□□□□□ -0.08
TSPAN4-211ENST00000468468 PRKACAP17612 351 aa14.58□□□□□ -0.08
TSPAN4-211ENST00000468468 RNASE12Q5GAN4 147 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
TSPAN4-211ENST00000468468 TMEM31Q5JXX7 168 aa14.58□□□□□ -0.08
TSPAN4-211ENST00000468468 PXKQ7Z7A4 578 aa14.58□□□□□ -0.08
TSPAN4-211ENST00000468468 LRRC17Q8N6Y2 441 aa14.58□□□□□ -0.08
TSPAN4-211ENST00000468468 CDRT4Q8N9R6 151 aa14.58□□□□□ -0.08
TSPAN4-211ENST00000468468 TTTY10Q9BZA0 68 aa14.58□□□□□ -0.08
TSPAN4-211ENST00000468468 SCN2AQ99250 2005 aa14.57□□□□□ -0.08
TSPAN4-211ENST00000468468 A0A1W2PRG6 482 aa14.57□□□□□ -0.08
TSPAN4-211ENST00000468468 URADA6NGE7 173 aa14.57□□□□□ -0.08
TSPAN4-211ENST00000468468 SC5DO75845 299 aa14.57□□□□□ -0.08
TSPAN4-211ENST00000468468 ZNF3P17036 446 aa14.57□□□□□ -0.08
TSPAN4-211ENST00000468468 RAB3BP20337 219 aa14.57□□□□□ -0.08
TSPAN4-211ENST00000468468 SLC2A5P22732 501 aa14.57□□□□□ -0.08
TSPAN4-211ENST00000468468 SNTA1Q13424 505 aa14.57□□□□□ -0.08
TSPAN4-211ENST00000468468 EXOSC7Q15024 291 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
TSPAN4-211ENST00000468468 TOR2AQ5JU69 321 aa14.57□□□□□ -0.08
TSPAN4-211ENST00000468468 SSX6Q7RTT6 188 aa14.57□□□□□ -0.08
TSPAN4-211ENST00000468468 GHDCQ8N2G8 530 aa14.57□□□□□ -0.08
TSPAN4-211ENST00000468468 GHSRQ92847 366 aa14.57□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.3 ms