RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000468371.5

SHQ1-205, Transcript of SHQ1, H/ACA ribonucleoprotein assembly factor, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene SHQ1, Length 4,024 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHQ1-205ENST00000468371 OR2A25A4D2G3 310 aa5.54□□□□□ -1.52
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SHQ1-205ENST00000468371 CTSVO60911 334 aa5.54□□□□□ -1.52
SHQ1-205ENST00000468371 KDM4BO94953 1096 aa5.54□□□□□ -1.52
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SHQ1-205ENST00000468371 OR4C11Q6IEV9 310 aa5.54□□□□□ -1.52
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SHQ1-205ENST00000468371 RFPL4BQ6ZWI9 263 aa5.54□□□□□ -1.52
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SHQ1-205ENST00000468371 VWA5B2Q8N398 1253 aa5.54□□□□□ -1.52
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SHQ1-205ENST00000468371 GAL3ST1Q99999 423 aa5.54□□□□□ -1.52
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SHQ1-205ENST00000468371 TRPS1Q9UHF7 1281 aa5.54□□□□□ -1.52
SHQ1-205ENST00000468371 ZFC3H1O60293 1989 aaKnown RBP5.54□□□□□ -1.52
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SHQ1-205ENST00000468371 STX11O75558 287 aa5.53□□□□□ -1.52
SHQ1-205ENST00000468371 HTR1AP08908 422 aa5.53□□□□□ -1.52
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SHQ1-205ENST00000468371 CERS1P27544 350 aa5.53□□□□□ -1.52
SHQ1-205ENST00000468371 ERP29P30040 261 aaKnown RBP5.53□□□□□ -1.52
SHQ1-205ENST00000468371 CXCR4P61073 352 aa5.53□□□□□ -1.52
SHQ1-205ENST00000468371 SLC3A1Q07837 685 aa5.53□□□□□ -1.52
SHQ1-205ENST00000468371 SNTA1Q13424 505 aa5.53□□□□□ -1.52
SHQ1-205ENST00000468371 OR1C1Q15619 314 aa5.53□□□□□ -1.52
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