RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000463378.5

RBBP4-208, Transcript of RB binding protein 4, chromatin remodeling factor, human

TSL 5

Gene RBBP4, Length 882 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBBP4-208	ENST00000463378		A0A087X002	238 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RBBP4-208	ENST00000463378	OR52A4P	A6NMU1	304 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RBBP4-208	ENST00000463378	ZNF716	A6NP11	495 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RBBP4-208	ENST00000463378		H3BQF6	201 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RBBP4-208	ENST00000463378	CIAO1	O76071	339 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RBBP4-208	ENST00000463378	ZFAND5	O76080	213 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RBBP4-208	ENST00000463378	F10	P00742	488 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RBBP4-208	ENST00000463378	IGKV5-2	P06315	115 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RBBP4-208	ENST00000463378	ZNF735	P0CB33	412 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RBBP4-208	ENST00000463378	POU2F1	P14859	743 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RBBP4-208	ENST00000463378	PCMT1	P22061	227 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RBBP4-208	ENST00000463378	UGT1A4	P22310	534 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RBBP4-208	ENST00000463378	RPL4	P36578	427 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
RBBP4-208	ENST00000463378	MAGEA8	P43361	318 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RBBP4-208	ENST00000463378	POU3F4	P49335	361 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RBBP4-208	ENST00000463378	ZNF33B	Q06732	778 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RBBP4-208	ENST00000463378	RIPPLY1	Q0D2K3	151 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RBBP4-208	ENST00000463378	PLD1	Q13393	1074 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RBBP4-208	ENST00000463378	C14orf28	Q4W4Y0	310 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RBBP4-208	ENST00000463378	LGSN	Q5TDP6	509 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RBBP4-208	ENST00000463378	PRAMEF5	Q5TYX0	476 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RBBP4-208	ENST00000463378	PRAMEF6	Q5VXH4	476 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RBBP4-208	ENST00000463378	VIT	Q6UXI7	678 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RBBP4-208	ENST00000463378	KLHDC8B	Q8IXV7	354 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RBBP4-208	ENST00000463378	SLC35F6	Q8N357	371 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RBBP4-208	ENST00000463378	OTUD6B	Q8N6M0	293 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RBBP4-208	ENST00000463378	C15orf54	Q8N8G6	183 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RBBP4-208	ENST00000463378	OR9K2	Q8NGE7	335 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RBBP4-208	ENST00000463378	SLC2A14	Q8TDB8	520 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RBBP4-208	ENST00000463378	CRYGN	Q8WXF5	182 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RBBP4-208	ENST00000463378	MOCOS	Q96EN8	888 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RBBP4-208	ENST00000463378	SLC45A3	Q96JT2	553 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RBBP4-208	ENST00000463378	RBM4	Q9BWF3	364 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
RBBP4-208	ENST00000463378	TSGA10	Q9BZW7	698 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RBBP4-208	ENST00000463378	MCCC2	Q9HCC0	563 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RBBP4-208	ENST00000463378	SLC17A5	Q9NRA2	495 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RBBP4-208	ENST00000463378	RAB20	Q9NX57	234 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RBBP4-208	ENST00000463378	NUDT4	Q9NZJ9	180 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RBBP4-208	ENST00000463378	THAP10	Q9P2Z0	257 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
RBBP4-208	ENST00000463378	MLX	Q9UH92	298 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RBBP4-208	ENST00000463378	PROCR	Q9UNN8	238 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RBBP4-208	ENST00000463378	GAB2	Q9UQC2	676 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RBBP4-208	ENST00000463378	OARD1	Q9Y530	152 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RBBP4-208	ENST00000463378	SAR1B	Q9Y6B6	198 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RBBP4-208	ENST00000463378	FRMPD4	Q14CM0	1322 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RBBP4-208	ENST00000463378	SYNRG	Q9UMZ2	1314 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RBBP4-208	ENST00000463378	MRC1	P22897	1456 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RBBP4-208	ENST00000463378	ABCC6	O95255	1503 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RBBP4-208	ENST00000463378	DIP2A	Q14689	1571 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RBBP4-208	ENST00000463378	NRXN3	Q9Y4C0	1643 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RBBP4-208	ENST00000463378	GOLGA6L7	A0A1B0GV03	622 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RBBP4-208	ENST00000463378	SNTN	A6NMZ2	147 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RBBP4-208	ENST00000463378	FOXI3	A8MTJ6	420 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RBBP4-208	ENST00000463378		G3V4G9	280 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RBBP4-208	ENST00000463378	PES1	O00541	588 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RBBP4-208	ENST00000463378	ZNF264	O43296	627 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RBBP4-208	ENST00000463378	TIMM8A	O60220	97 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RBBP4-208	ENST00000463378	POP4	O95707	220 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RBBP4-208	ENST00000463378	TSPAN12	O95859	305 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RBBP4-208	ENST00000463378	SP1	P08047	785 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RBBP4-208	ENST00000463378	WNT2	P09544	360 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RBBP4-208	ENST00000463378	ALOX5	P09917	674 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RBBP4-208	ENST00000463378	CCDC130	P13994	396 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RBBP4-208	ENST00000463378	PVR	P15151	417 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RBBP4-208	ENST00000463378	CASP14	P31944	242 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RBBP4-208	ENST00000463378	TIMM10	P62072	90 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RBBP4-208	ENST00000463378	VSNL1	P62760	191 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RBBP4-208	ENST00000463378	ACY1	Q03154	408 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RBBP4-208	ENST00000463378	SIX1	Q15475	284 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RBBP4-208	ENST00000463378	SPA17	Q15506	151 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RBBP4-208	ENST00000463378	HSP90AB3P	Q58FF7	597 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RBBP4-208	ENST00000463378	HSP90AA4P	Q58FG1	418 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RBBP4-208	ENST00000463378	VWA2	Q5GFL6	755 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RBBP4-208	ENST00000463378	CCDC122	Q5T0U0	273 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RBBP4-208	ENST00000463378	FAHD2B	Q6P2I3	314 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RBBP4-208	ENST00000463378	UTS2B	Q765I0	119 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RBBP4-208	ENST00000463378	ZNF491	Q8N8L2	437 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RBBP4-208	ENST00000463378	OR8K1	Q8NGG5	319 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RBBP4-208	ENST00000463378	SSC4D	Q8WTU2	575 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RBBP4-208	ENST00000463378	FAHD2A	Q96GK7	314 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RBBP4-208	ENST00000463378	C9orf85	Q96MD7	179 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RBBP4-208	ENST00000463378	PRICKLE1	Q96MT3	831 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RBBP4-208	ENST00000463378	COPS8	Q99627	209 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RBBP4-208	ENST00000463378	CHCHD5	Q9BSY4	110 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RBBP4-208	ENST00000463378	NUP58	Q9BVL2	599 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RBBP4-208	ENST00000463378	TSSK1B	Q9BXA7	367 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RBBP4-208	ENST00000463378	FGFBP2	Q9BYJ0	223 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RBBP4-208	ENST00000463378	FAM192A	Q9GZU8	254 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RBBP4-208	ENST00000463378	LRRN3	Q9H3W5	708 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RBBP4-208	ENST00000463378	AMBN	Q9NP70	447 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RBBP4-208	ENST00000463378	ZNF221	Q9UK13	617 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RBBP4-208	ENST00000463378	ADAM28	Q9UKQ2	775 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RBBP4-208	ENST00000463378	GUCA1B	Q9UMX6	200 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RBBP4-208	ENST00000463378	NTNG1	Q9Y2I2	539 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RBBP4-208	ENST00000463378	CPD	O75976	1380 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RBBP4-208	ENST00000463378	ABCC12	Q96J65	1359 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RBBP4-208	ENST00000463378	DIP2B	Q9P265	1576 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RBBP4-208	ENST00000463378	SIPA1L2	Q9P2F8	1722 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
RBBP4-208	ENST00000463378	KDM3B	Q7LBC6	1761 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RBBP4-208	ENST00000463378	IGHV3OR16-12	A0A075B7B8	117 aa		4.86	□□□□□ -1.63

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