RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462494.5

ACTB-207, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 5

Gene ACTB, Length 2,245 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-207ENST00000462494 LANCL1O43813 399 aa15.62■□□□□ 0.09
ACTB-207ENST00000462494 NKX2-2O95096 273 aa15.62■□□□□ 0.09
ACTB-207ENST00000462494 PAHP00439 452 aa15.62■□□□□ 0.09
ACTB-207ENST00000462494 TNFP01375 233 aa15.62■□□□□ 0.09
ACTB-207ENST00000462494 FAM157BP0CG42 384 aa15.62■□□□□ 0.09
ACTB-207ENST00000462494 ATXN8OSP0DMR3 200 aa15.62■□□□□ 0.09
ACTB-207ENST00000462494 CLDN20P56880 219 aa15.62■□□□□ 0.09
ACTB-207ENST00000462494 PSG6Q00889 435 aa15.62■□□□□ 0.09
ACTB-207ENST00000462494 FAAH2Q6GMR7 532 aa15.62■□□□□ 0.09
ACTB-207ENST00000462494 TRILQ7L0X0 811 aa15.62■□□□□ 0.09
ACTB-207ENST00000462494 RFLNBQ8N5W9 214 aa15.62■□□□□ 0.09
ACTB-207ENST00000462494 FAM98AQ8NCA5 519 aaKnown RBP15.62■□□□□ 0.09
ACTB-207ENST00000462494 OR52E2Q8NGJ4 325 aa15.62■□□□□ 0.09
ACTB-207ENST00000462494 OR51L1Q8NGJ5 315 aa15.62■□□□□ 0.09
ACTB-207ENST00000462494 RPLP0P6Q8NHW5 317 aa15.62■□□□□ 0.09
ACTB-207ENST00000462494 SLC37A2Q8TED4 501 aa15.62■□□□□ 0.09
ACTB-207ENST00000462494 ZMYND19Q96E35 227 aaPredicted RBP15.62■□□□□ 0.09
ACTB-207ENST00000462494 ERMAPQ96PL5 475 aaPredicted RBP15.62■□□□□ 0.09
ACTB-207ENST00000462494 TWSG1Q9GZX9 223 aa15.62■□□□□ 0.09
ACTB-207ENST00000462494 ERVMER34-1Q9H9K5 563 aa15.62■□□□□ 0.09
ACTB-207ENST00000462494 CYSLTR2Q9NS75 346 aa15.62■□□□□ 0.09
ACTB-207ENST00000462494 POT1Q9NUX5 634 aa15.62■□□□□ 0.09
ACTB-207ENST00000462494 CLEC4AQ9UMR7 237 aa15.62■□□□□ 0.09
ACTB-207ENST00000462494 TCRBV21S2A2A0A5A6 115 aa15.62■□□□□ 0.09
ACTB-207ENST00000462494 IGKV1D-16P01601 117 aa15.62■□□□□ 0.09
ACTB-207ENST00000462494 PEPDP12955 493 aa15.62■□□□□ 0.09
ACTB-207ENST00000462494 SLC2A5P22732 501 aa15.62■□□□□ 0.09
ACTB-207ENST00000462494 SLC6A6P31641 620 aa15.62■□□□□ 0.09
ACTB-207ENST00000462494 RAB38P57729 211 aa15.62■□□□□ 0.09
ACTB-207ENST00000462494 ZNHIT3Q15649 155 aaPredicted RBP15.62■□□□□ 0.09
ACTB-207ENST00000462494 GHDCQ8N2G8 530 aa15.62■□□□□ 0.09
ACTB-207ENST00000462494 SDR9C7Q8NEX9 313 aa15.62■□□□□ 0.09
ACTB-207ENST00000462494 OR4K13Q8NH42 304 aa15.62■□□□□ 0.09
ACTB-207ENST00000462494 THAP7Q9BT49 309 aaPredicted RBP15.62■□□□□ 0.09
ACTB-207ENST00000462494 MCCC2Q9HCC0 563 aa15.62■□□□□ 0.09
ACTB-207ENST00000462494 FAM60AQ9NP50 221 aa15.62■□□□□ 0.09
ACTB-207ENST00000462494 DNAJB12Q9NXW2 375 aaKnown RBP15.62■□□□□ 0.09
ACTB-207ENST00000462494 HRKO00198 91 aa15.61■□□□□ 0.09
ACTB-207ENST00000462494 ORC5O43913 435 aa15.61■□□□□ 0.09
ACTB-207ENST00000462494 IFNGP01579 166 aa15.61■□□□□ 0.09
ACTB-207ENST00000462494 SLC35E2P0CK97 266 aa15.61■□□□□ 0.09
ACTB-207ENST00000462494 THBS2P35442 1172 aa15.61■□□□□ 0.09
ACTB-207ENST00000462494 ACAA2P42765 397 aaKnown RBP15.61■□□□□ 0.09
ACTB-207ENST00000462494 TAS2R43P59537 309 aa15.61■□□□□ 0.09
ACTB-207ENST00000462494 YPEL5P62699 121 aa15.61■□□□□ 0.09
ACTB-207ENST00000462494 DLX2Q07687 328 aaPredicted RBP15.61■□□□□ 0.09
ACTB-207ENST00000462494 NNATQ16517 81 aa15.61■□□□□ 0.09
ACTB-207ENST00000462494 SLC25A35Q3KQZ1 300 aa15.61■□□□□ 0.09
ACTB-207ENST00000462494 TP53I3Q53FA7 332 aa15.61■□□□□ 0.09
ACTB-207ENST00000462494 ACSM3Q53FZ2 586 aa15.61■□□□□ 0.09
ACTB-207ENST00000462494 TAF8Q7Z7C8 310 aa15.61■□□□□ 0.09
ACTB-207ENST00000462494 OOSP2Q86WS3 158 aa15.61■□□□□ 0.09
ACTB-207ENST00000462494 SLC22A18ASQ8N1D0 253 aa15.61■□□□□ 0.09
ACTB-207ENST00000462494 LILRB4Q8NHJ6 448 aa15.61■□□□□ 0.09
ACTB-207ENST00000462494 TRMT10AQ8TBZ6 339 aaKnown RBP15.61■□□□□ 0.09
ACTB-207ENST00000462494 GHSRQ92847 366 aa15.61■□□□□ 0.09
ACTB-207ENST00000462494 GDF15Q99988 308 aa15.61■□□□□ 0.09
ACTB-207ENST00000462494 FOLH1BQ9HBA9 442 aa15.61■□□□□ 0.09
ACTB-207ENST00000462494 POLE3Q9NRF9 147 aa15.61■□□□□ 0.09
ACTB-207ENST00000462494 PITPNBP48739 271 aa15.6■□□□□ 0.09
ACTB-207ENST00000462494 C1orf61Q13536 156 aa15.6■□□□□ 0.09
ACTB-207ENST00000462494 FAM53BQ14153 422 aa15.6■□□□□ 0.09
ACTB-207ENST00000462494 TRAM1Q15629 374 aa15.6■□□□□ 0.09
ACTB-207ENST00000462494 MANEAQ5SRI9 462 aa15.6■□□□□ 0.09
ACTB-207ENST00000462494 TMEM184AQ6ZMB5 413 aa15.6■□□□□ 0.09
ACTB-207ENST00000462494 HMGB4Q8WW32 186 aa15.6■□□□□ 0.09
ACTB-207ENST00000462494 RFT1Q96AA3 541 aa15.6■□□□□ 0.09
ACTB-207ENST00000462494 UBL7Q96S82 380 aaPredicted RBP15.6■□□□□ 0.09
ACTB-207ENST00000462494 MARVELD1Q9BSK0 173 aa15.6■□□□□ 0.09
ACTB-207ENST00000462494 HCN3Q9P1Z3 774 aa15.6■□□□□ 0.09
ACTB-207ENST00000462494 RPS6KB2Q9UBS0 482 aa15.6■□□□□ 0.09
ACTB-207ENST00000462494 PIAS3Q9Y6X2 628 aa15.6■□□□□ 0.09
ACTB-207ENST00000462494 SLC9B1P1A6NJY1 282 aa15.6■□□□□ 0.09
ACTB-207ENST00000462494 INMT-MINDY4F8WBC2 141 aa15.6■□□□□ 0.09
ACTB-207ENST00000462494 EEF1E1O43324 174 aaKnown RBP15.6■□□□□ 0.09
ACTB-207ENST00000462494 TFPIP10646 304 aa15.6■□□□□ 0.09
ACTB-207ENST00000462494 ARSBP15848 533 aa15.6■□□□□ 0.09
ACTB-207ENST00000462494 ST6GAL1P15907 406 aa15.6■□□□□ 0.09
ACTB-207ENST00000462494 HIST1H1CP16403 213 aaKnown RBP15.6■□□□□ 0.09
ACTB-207ENST00000462494 AGFG1P52594 562 aaKnown RBP15.6■□□□□ 0.09
ACTB-207ENST00000462494 UBE2IP63279 158 aaKnown RBP15.6■□□□□ 0.09
ACTB-207ENST00000462494 STX4Q12846 297 aa15.6■□□□□ 0.09
ACTB-207ENST00000462494 GPR176Q14439 515 aa15.6■□□□□ 0.09
ACTB-207ENST00000462494 NDUFAF6Q330K2 333 aa15.6■□□□□ 0.09
ACTB-207ENST00000462494 Q5BKY6 102 aa15.6■□□□□ 0.09
ACTB-207ENST00000462494 ARHGAP11AQ6P4F7 1023 aa15.6■□□□□ 0.09
ACTB-207ENST00000462494 KRT74Q7RTS7 529 aa15.6■□□□□ 0.09
ACTB-207ENST00000462494 GPR135Q8IZ08 494 aa15.6■□□□□ 0.09
ACTB-207ENST00000462494 GPBAR1Q8TDU6 330 aa15.6■□□□□ 0.09
ACTB-207ENST00000462494 PMM1Q92871 262 aa15.6■□□□□ 0.09
ACTB-207ENST00000462494 RIT1Q92963 219 aa15.6■□□□□ 0.09
ACTB-207ENST00000462494 RBM18Q96H35 190 aaKnown RBP15.6■□□□□ 0.09
ACTB-207ENST00000462494 PGLYRP3Q96LB9 341 aa15.6■□□□□ 0.09
ACTB-207ENST00000462494 TRIM2Q9C040 744 aa15.6■□□□□ 0.09
ACTB-207ENST00000462494 SYNDIG1Q9H7V2 258 aa15.6■□□□□ 0.09
ACTB-207ENST00000462494 MCUBQ9NWR8 336 aa15.6■□□□□ 0.09
ACTB-207ENST00000462494 BAIAP2Q9UQB8 552 aa15.6■□□□□ 0.09
ACTB-207ENST00000462494 DTX4Q9Y2E6 619 aa15.6■□□□□ 0.09
ACTB-207ENST00000462494 NOX1Q9Y5S8 564 aa15.6■□□□□ 0.09
ACTB-207ENST00000462494 A0A0C4DFX4 3053 aa15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 89.1 ms