RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439512.5

TOM1-207, Transcript of target of myb1 membrane trafficking protein, humanhuman

TSL 3

Gene TOM1, Length 800 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOM1-207ENST00000439512 MMEL1Q495T6 779 aa14.78□□□□□ -0.04
TOM1-207ENST00000439512 REEP3Q6NUK4 255 aa14.78□□□□□ -0.04
TOM1-207ENST00000439512 VWA1Q6PCB0 445 aa14.78□□□□□ -0.04
TOM1-207ENST00000439512 GRINAQ7Z429 371 aa14.78□□□□□ -0.04
TOM1-207ENST00000439512 BTLAQ7Z6A9 289 aa14.78□□□□□ -0.04
TOM1-207ENST00000439512 ZNF440Q8IYI8 595 aa14.78□□□□□ -0.04
TOM1-207ENST00000439512 C10orf82Q8WW14 230 aa14.78□□□□□ -0.04
TOM1-207ENST00000439512 REXO5Q96IC2 774 aaKnown RBP14.78□□□□□ -0.04
TOM1-207ENST00000439512 OR5B2Q96R09 309 aa14.78□□□□□ -0.04
TOM1-207ENST00000439512 CCDC106Q9BWC9 280 aa14.78□□□□□ -0.04
TOM1-207ENST00000439512 SPATA9Q9BWV2 254 aa14.78□□□□□ -0.04
TOM1-207ENST00000439512 ARMC7Q9H6L4 198 aa14.78□□□□□ -0.04
TOM1-207ENST00000439512 FOXD3Q9UJU5 478 aaPredicted RBP14.78□□□□□ -0.04
TOM1-207ENST00000439512 PACSIN3Q9UKS6 424 aa14.78□□□□□ -0.04
TOM1-207ENST00000439512 CLEC4AQ9UMR7 237 aa14.78□□□□□ -0.04
TOM1-207ENST00000439512 NOTCH2Q04721 2471 aa14.78□□□□□ -0.04
TOM1-207ENST00000439512 DCHS2Q6V1P9 2916 aa14.78□□□□□ -0.04
TOM1-207ENST00000439512 MED12LQ86YW9 2145 aa14.77□□□□□ -0.04
TOM1-207ENST00000439512 UQCRBP14927 111 aa14.77□□□□□ -0.05
TOM1-207ENST00000439512 ETS2P15036 469 aa14.77□□□□□ -0.05
TOM1-207ENST00000439512 SLC6A2P23975 617 aa14.77□□□□□ -0.05
TOM1-207ENST00000439512 CPA2P48052 419 aa14.77□□□□□ -0.05
TOM1-207ENST00000439512 GYS2P54840 703 aa14.77□□□□□ -0.05
TOM1-207ENST00000439512 MTPNP58546 118 aa14.77□□□□□ -0.05
TOM1-207ENST00000439512 EPS8Q12929 822 aa14.77□□□□□ -0.05
TOM1-207ENST00000439512 CYLC2Q14093 348 aaPredicted RBP14.77□□□□□ -0.05
TOM1-207ENST00000439512 SCARB2Q14108 478 aa14.77□□□□□ -0.05
TOM1-207ENST00000439512 ADRM1Q16186 407 aa14.77□□□□□ -0.05
TOM1-207ENST00000439512 ZSWIM7Q19AV6 140 aa14.77□□□□□ -0.05
TOM1-207ENST00000439512 GTF2IRD2BQ6EKJ0 949 aa14.77□□□□□ -0.05
TOM1-207ENST00000439512 C3orf33Q6P1S2 294 aa14.77□□□□□ -0.05
TOM1-207ENST00000439512 GTF2IRD2Q86UP8 949 aa14.77□□□□□ -0.05
TOM1-207ENST00000439512 ADGRG3Q86Y34 549 aa14.77□□□□□ -0.05
TOM1-207ENST00000439512 ELAC2Q9BQ52 826 aaKnown RBP14.77□□□□□ -0.05
TOM1-207ENST00000439512 RBM24Q9BX46 236 aaKnown RBP14.77□□□□□ -0.05
TOM1-207ENST00000439512 SRXN1Q9BYN0 137 aa14.77□□□□□ -0.05
TOM1-207ENST00000439512 TMEM38AQ9H6F2 299 aa14.77□□□□□ -0.05
TOM1-207ENST00000439512 COQ10BQ9H8M1 238 aa14.77□□□□□ -0.05
TOM1-207ENST00000439512 CHST2Q9Y4C5 530 aa14.77□□□□□ -0.05
TOM1-207ENST00000439512 CAPN7Q9Y6W3 813 aa14.77□□□□□ -0.05
TOM1-207ENST00000439512 APCP25054 2843 aa14.77□□□□□ -0.05
TOM1-207ENST00000439512 TMED7-TICAM2A0A0A6YYA0 188 aa14.76□□□□□ -0.05
TOM1-207ENST00000439512 A8MXE2 369 aa14.76□□□□□ -0.05
TOM1-207ENST00000439512 MSTNO14793 375 aa14.76□□□□□ -0.05
TOM1-207ENST00000439512 PABPC4LP0CB38 370 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
TOM1-207ENST00000439512 PRG2P13727 222 aa14.76□□□□□ -0.05
TOM1-207ENST00000439512 TACR3P29371 465 aa14.76□□□□□ -0.05
TOM1-207ENST00000439512 ADSLP30566 484 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
TOM1-207ENST00000439512 ACAA2P42765 397 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
TOM1-207ENST00000439512 SLC1A3P43003 542 aa14.76□□□□□ -0.05
TOM1-207ENST00000439512 KIR2DL3P43628 341 aa14.76□□□□□ -0.05
TOM1-207ENST00000439512 HTR3AP46098 478 aa14.76□□□□□ -0.05
TOM1-207ENST00000439512 CTBP2P56545 445 aa14.76□□□□□ -0.05
TOM1-207ENST00000439512 MYBPHQ13203 477 aa14.76□□□□□ -0.05
TOM1-207ENST00000439512 MAPRE2Q15555 327 aa14.76□□□□□ -0.05
TOM1-207ENST00000439512 CYP51A1Q16850 503 aa14.76□□□□□ -0.05
TOM1-207ENST00000439512 RNF220Q5VTB9 566 aa14.76□□□□□ -0.05
TOM1-207ENST00000439512 FAM214BQ7L5A3 538 aa14.76□□□□□ -0.05
TOM1-207ENST00000439512 ZNF550Q7Z398 422 aa14.76□□□□□ -0.05
TOM1-207ENST00000439512 GDF7Q7Z4P5 450 aa14.76□□□□□ -0.05
TOM1-207ENST00000439512 SNX32Q86XE0 403 aa14.76□□□□□ -0.05
TOM1-207ENST00000439512 KRT73Q86Y46 540 aa14.76□□□□□ -0.05
TOM1-207ENST00000439512 KIF18BQ86Y91 864 aa14.76□□□□□ -0.05
TOM1-207ENST00000439512 CADM2Q8N3J6 435 aa14.76□□□□□ -0.05
TOM1-207ENST00000439512 CPNE4Q96A23 557 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
TOM1-207ENST00000439512 FAM107BQ9H098 131 aa14.76□□□□□ -0.05
TOM1-207ENST00000439512 OPN3Q9H1Y3 402 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
TOM1-207ENST00000439512 ARMCX1Q9P291 453 aa14.76□□□□□ -0.05
TOM1-207ENST00000439512 CHRNA9Q9UGM1 479 aa14.76□□□□□ -0.05
TOM1-207ENST00000439512 TMED7Q9Y3B3 224 aa14.76□□□□□ -0.05
TOM1-207ENST00000439512 SPIN1Q9Y657 262 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
TOM1-207ENST00000439512 TEX15Q9BXT5 2789 aa14.76□□□□□ -0.05
TOM1-207ENST00000439512 FAAHO00519 579 aa14.75□□□□□ -0.05
TOM1-207ENST00000439512 DYNC1I1O14576 645 aa14.75□□□□□ -0.05
TOM1-207ENST00000439512 MRASO14807 208 aa14.75□□□□□ -0.05
TOM1-207ENST00000439512 ENPP1P22413 925 aa14.75□□□□□ -0.05
TOM1-207ENST00000439512 AQP1P29972 269 aa14.75□□□□□ -0.05
TOM1-207ENST00000439512 SSTR2P30874 369 aa14.75□□□□□ -0.05
TOM1-207ENST00000439512 POLR2HP52434 150 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
TOM1-207ENST00000439512 RAC3P60763 192 aa14.75□□□□□ -0.05
TOM1-207ENST00000439512 COPZ1P61923 177 aa14.75□□□□□ -0.05
TOM1-207ENST00000439512 TLE4Q04727 773 aa14.75□□□□□ -0.05
TOM1-207ENST00000439512 ZNF239Q16600 458 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
TOM1-207ENST00000439512 TRMT5Q32P41 509 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
TOM1-207ENST00000439512 SYT14P1Q58G82 188 aa14.75□□□□□ -0.05
TOM1-207ENST00000439512 NANOGP8Q6NSW7 305 aa14.75□□□□□ -0.05
TOM1-207ENST00000439512 TMPPEQ6ZT21 453 aa14.75□□□□□ -0.05
TOM1-207ENST00000439512 LSRQ86X29 649 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
TOM1-207ENST00000439512 PTOV1Q86YD1 416 aa14.75□□□□□ -0.05
TOM1-207ENST00000439512 ZNF610Q8N9Z0 462 aa14.75□□□□□ -0.05
TOM1-207ENST00000439512 C11orf65Q8NCR3 313 aa14.75□□□□□ -0.05
TOM1-207ENST00000439512 SLC25A43Q8WUT9 341 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
TOM1-207ENST00000439512 LRRC58Q96CX6 371 aa14.75□□□□□ -0.05
TOM1-207ENST00000439512 DNAJA3Q96EY1 480 aa14.75□□□□□ -0.05
TOM1-207ENST00000439512 GMPPAQ96IJ6 420 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
TOM1-207ENST00000439512 ZNF559Q9BR84 538 aa14.75□□□□□ -0.05
TOM1-207ENST00000439512 SLC39A3Q9BRY0 314 aa14.75□□□□□ -0.05
TOM1-207ENST00000439512 SPATA5L1Q9BVQ7 753 aa14.75□□□□□ -0.05
TOM1-207ENST00000439512 RSPO3Q9BXY4 272 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
TOM1-207ENST00000439512 OR11A1Q9GZK7 315 aa14.75□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 85.9 ms