RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429595.1

PTPRK-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRK, Length 558 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-211ENST00000429595 C10orf90Q96M02 699 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRK-211ENST00000429595 LRGUKQ96M69 825 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRK-211ENST00000429595 TRIB3Q96RU7 358 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRK-211ENST00000429595 SH3GL3Q99963 347 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRK-211ENST00000429595 OSBPL11Q9BXB4 747 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRK-211ENST00000429595 DERL2Q9GZP9 239 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRK-211ENST00000429595 CAB39LQ9H9S4 337 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRK-211ENST00000429595 WDR41Q9HAD4 459 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRK-211ENST00000429595 SH2D2AQ9NP31 389 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRK-211ENST00000429595 TRIM36Q9NQ86 728 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRK-211ENST00000429595 SDR39U1Q9NRG7 319 aaPredicted RBP5.55□□□□□ -1.52
PTPRK-211ENST00000429595 PAPOLBQ9NRJ5 636 aaKnown RBP5.55□□□□□ -1.52
PTPRK-211ENST00000429595 NLE1Q9NVX2 485 aaPredicted RBP5.55□□□□□ -1.52
PTPRK-211ENST00000429595 HPF1Q9NWY4 346 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRK-211ENST00000429595 KLHL42Q9P2K6 505 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRK-211ENST00000429595 ABCD2Q9UBJ2 740 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRK-211ENST00000429595 CRLS1Q9UJA2 301 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRK-211ENST00000429595 RIMS3Q9UJD0 308 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRK-211ENST00000429595 FBXW2Q9UKT8 454 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRK-211ENST00000429595 AP3M1Q9Y2T2 418 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRK-211ENST00000429595 WBP11Q9Y2W2 641 aaKnown RBP5.55□□□□□ -1.52
PTPRK-211ENST00000429595 C15orf38-AP3S2A0A0A6YYH1 394 aa5.54□□□□□ -1.52
PTPRK-211ENST00000429595 TMEM89A2RUT3 159 aa5.54□□□□□ -1.52
PTPRK-211ENST00000429595 PINLYPA6NC86 204 aa5.54□□□□□ -1.52
PTPRK-211ENST00000429595 FAM157AC9JC47 383 aa5.54□□□□□ -1.52
PTPRK-211ENST00000429595 E9PBE3 544 aa5.54□□□□□ -1.52
PTPRK-211ENST00000429595 G3V3Y1 287 aa5.54□□□□□ -1.52
PTPRK-211ENST00000429595 H0YGG7 62 aa5.54□□□□□ -1.52
PTPRK-211ENST00000429595 TRIM77I1YAP6 450 aa5.54□□□□□ -1.52
PTPRK-211ENST00000429595 AIM2O14862 343 aa5.54□□□□□ -1.52
PTPRK-211ENST00000429595 STX7O15400 261 aaKnown RBP5.54□□□□□ -1.52
PTPRK-211ENST00000429595 PHGDHO43175 533 aaKnown RBP5.54□□□□□ -1.52
PTPRK-211ENST00000429595 B4GALT2O60909 372 aa5.54□□□□□ -1.52
PTPRK-211ENST00000429595 CTSVO60911 334 aa5.54□□□□□ -1.52
PTPRK-211ENST00000429595 TNFAIP8O95379 198 aa5.54□□□□□ -1.52
PTPRK-211ENST00000429595 NDST3O95803 873 aa5.54□□□□□ -1.52
PTPRK-211ENST00000429595 P04436 131 aa5.54□□□□□ -1.52
PTPRK-211ENST00000429595 RPN2P04844 631 aa5.54□□□□□ -1.52
PTPRK-211ENST00000429595 CHRNGP07510 517 aa5.54□□□□□ -1.52
PTPRK-211ENST00000429595 ATP1B2P14415 290 aaPredicted RBP5.54□□□□□ -1.52
PTPRK-211ENST00000429595 IDO1P14902 403 aa5.54□□□□□ -1.52
PTPRK-211ENST00000429595 CD1DP15813 335 aa5.54□□□□□ -1.52
PTPRK-211ENST00000429595 GPX3P22352 226 aa5.54□□□□□ -1.52
PTPRK-211ENST00000429595 DPP4P27487 766 aa5.54□□□□□ -1.52
PTPRK-211ENST00000429595 PEBP1P30086 187 aaKnown RBP5.54□□□□□ -1.52
PTPRK-211ENST00000429595 CDKN2AP42771 156 aaKnown RBP5.54□□□□□ -1.52
PTPRK-211ENST00000429595 XCR1P46094 333 aa5.54□□□□□ -1.52
PTPRK-211ENST00000429595 PRLHRP49683 370 aa5.54□□□□□ -1.52
PTPRK-211ENST00000429595 DSCR9P59020 149 aa5.54□□□□□ -1.52
PTPRK-211ENST00000429595 ARF3P61204 181 aaPredicted RBP5.54□□□□□ -1.52
PTPRK-211ENST00000429595 EEF1A1P68104 462 aaKnown RBP5.54□□□□□ -1.52
PTPRK-211ENST00000429595 LOXL1Q08397 574 aaPredicted RBP5.54□□□□□ -1.52
PTPRK-211ENST00000429595 RCAN2Q14206 197 aa5.54□□□□□ -1.52
PTPRK-211ENST00000429595 FLOT2Q14254 428 aa5.54□□□□□ -1.52
PTPRK-211ENST00000429595 POU6F1Q14863 301 aa5.54□□□□□ -1.52
PTPRK-211ENST00000429595 ABRAXAS2Q15018 415 aa5.54□□□□□ -1.52
PTPRK-211ENST00000429595 PDK3Q15120 406 aa5.54□□□□□ -1.52
PTPRK-211ENST00000429595 TAF1AQ15573 450 aaPredicted RBP5.54□□□□□ -1.52
PTPRK-211ENST00000429595 UNC50Q53HI1 259 aa5.54□□□□□ -1.52
PTPRK-211ENST00000429595 SIRPB2Q5JXA9 342 aa5.54□□□□□ -1.52
PTPRK-211ENST00000429595 CDKL4Q5MAI5 379 aa5.54□□□□□ -1.52
PTPRK-211ENST00000429595 INTS11Q5TA45 600 aaKnown RBP5.54□□□□□ -1.52
PTPRK-211ENST00000429595 EEF1A1P5Q5VTE0 462 aa5.54□□□□□ -1.52
PTPRK-211ENST00000429595 ZNF470Q6ECI4 717 aa5.54□□□□□ -1.52
PTPRK-211ENST00000429595 IL20RBQ6UXL0 311 aa5.54□□□□□ -1.52
PTPRK-211ENST00000429595 ZNF704Q6ZNC4 412 aaPredicted RBP5.54□□□□□ -1.52
PTPRK-211ENST00000429595 DENND6AQ8IWF6 608 aa5.54□□□□□ -1.52
PTPRK-211ENST00000429595 GPALPP1Q8IXQ4 340 aa5.54□□□□□ -1.52
PTPRK-211ENST00000429595 RAB42Q8N4Z0 105 aa5.54□□□□□ -1.52
PTPRK-211ENST00000429595 OR51Q1Q8NH59 317 aa5.54□□□□□ -1.52
PTPRK-211ENST00000429595 OR5K2Q8NHB8 316 aa5.54□□□□□ -1.52
PTPRK-211ENST00000429595 CDKN2AIPNLQ96HQ2 116 aa5.54□□□□□ -1.52
PTPRK-211ENST00000429595 COPS8Q99627 209 aa5.54□□□□□ -1.52
PTPRK-211ENST00000429595 MRPS26Q9BYN8 205 aaKnown RBP5.54□□□□□ -1.52
PTPRK-211ENST00000429595 NUF2Q9BZD4 464 aa5.54□□□□□ -1.52
PTPRK-211ENST00000429595 TRIM15Q9C019 465 aa5.54□□□□□ -1.52
PTPRK-211ENST00000429595 PIGMQ9H3S5 423 aa5.54□□□□□ -1.52
PTPRK-211ENST00000429595 WDR55Q9H6Y2 383 aaPredicted RBP5.54□□□□□ -1.52
PTPRK-211ENST00000429595 SPAG4Q9NPE6 437 aa5.54□□□□□ -1.52
PTPRK-211ENST00000429595 SEMA4BQ9NPR2 832 aaPredicted RBP5.54□□□□□ -1.52
PTPRK-211ENST00000429595 SLC52A3Q9NQ40 469 aa5.54□□□□□ -1.52
PTPRK-211ENST00000429595 DEPPQ9NTK1 212 aa5.54□□□□□ -1.52
PTPRK-211ENST00000429595 SMOXQ9NWM0 555 aa5.54□□□□□ -1.52
PTPRK-211ENST00000429595 GID8Q9NWU2 228 aa5.54□□□□□ -1.52
PTPRK-211ENST00000429595 CPSF2Q9P2I0 782 aaKnown RBP5.54□□□□□ -1.52
PTPRK-211ENST00000429595 CAMK2AQ9UQM7 478 aa5.54□□□□□ -1.52
PTPRK-211ENST00000429595 LIPT1Q9Y234 373 aa5.54□□□□□ -1.52
PTPRK-211ENST00000429595 DTNAQ9Y4J8 743 aa5.54□□□□□ -1.52
PTPRK-211ENST00000429595 AP4S1Q9Y587 144 aa5.54□□□□□ -1.52
PTPRK-211ENST00000429595 CR1P17927 2039 aa5.53□□□□□ -1.52
PTPRK-211ENST00000429595 OR2W5A6NFC9 320 aa5.53□□□□□ -1.52
PTPRK-211ENST00000429595 ARHGEF33A8MVX0 844 aa5.53□□□□□ -1.52
PTPRK-211ENST00000429595 H0YIG0 161 aa5.53□□□□□ -1.52
PTPRK-211ENST00000429595 HS3ST1O14792 307 aa5.53□□□□□ -1.52
PTPRK-211ENST00000429595 AZIN1O14977 448 aa5.53□□□□□ -1.52
PTPRK-211ENST00000429595 KERAO60938 352 aa5.53□□□□□ -1.52
PTPRK-211ENST00000429595 GLSO94925 669 aaPredicted RBP5.53□□□□□ -1.52
PTPRK-211ENST00000429595 STAMBPO95630 424 aa5.53□□□□□ -1.52
PTPRK-211ENST00000429595 GPIP06744 558 aa5.53□□□□□ -1.52
PTPRK-211ENST00000429595 FCGR1AP12314 374 aa5.53□□□□□ -1.52
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.9 ms