RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428445.1

VARS-216, Transcript of valyl-tRNA synthetase, humanhuman

TSL 5

Gene VARS, Length 863 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VARS-216ENST00000428445 UBTFL6P0CB48 400 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
VARS-216ENST00000428445 COX5AP20674 150 aa14.58□□□□□ -0.08
VARS-216ENST00000428445 MATN1P21941 496 aa14.58□□□□□ -0.08
VARS-216ENST00000428445 SOAT1P35610 550 aa14.58□□□□□ -0.08
VARS-216ENST00000428445 NUDT6P53370 316 aa14.58□□□□□ -0.08
VARS-216ENST00000428445 SRSF2Q01130 221 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
VARS-216ENST00000428445 MERTKQ12866 999 aa14.58□□□□□ -0.08
VARS-216ENST00000428445 SKP2Q13309 424 aa14.58□□□□□ -0.08
VARS-216ENST00000428445 MAPK14Q16539 360 aa14.58□□□□□ -0.08
VARS-216ENST00000428445 CHRFAM7AQ494W8 412 aa14.58□□□□□ -0.08
VARS-216ENST00000428445 C6orf136Q5SQH8 315 aa14.58□□□□□ -0.08
VARS-216ENST00000428445 TIMM23BQ5SRD1 257 aa14.58□□□□□ -0.08
VARS-216ENST00000428445 C11orf71Q6IPW1 123 aa14.58□□□□□ -0.08
VARS-216ENST00000428445 BHLHB9Q6PI77 547 aa14.58□□□□□ -0.08
VARS-216ENST00000428445 GALNT5Q7Z7M9 940 aa14.58□□□□□ -0.08
VARS-216ENST00000428445 CLECL1Q8IZS7 167 aa14.58□□□□□ -0.08
VARS-216ENST00000428445 UBE2J2Q8N2K1 259 aa14.58□□□□□ -0.08
VARS-216ENST00000428445 RIBC1Q8N443 379 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
VARS-216ENST00000428445 OR10H5Q8NGA6 315 aa14.58□□□□□ -0.08
VARS-216ENST00000428445 COQ8BQ96D53 544 aa14.58□□□□□ -0.08
VARS-216ENST00000428445 LAT2Q9GZY6 243 aa14.58□□□□□ -0.08
VARS-216ENST00000428445 L2HGDHQ9H9P8 463 aa14.58□□□□□ -0.08
VARS-216ENST00000428445 ZDHHC2Q9UIJ5 367 aa14.58□□□□□ -0.08
VARS-216ENST00000428445 TLDC2A0PJX2 215 aa14.57□□□□□ -0.08
VARS-216ENST00000428445 OR5H1A6NKK0 313 aa14.57□□□□□ -0.08
VARS-216ENST00000428445 ZNF724A8MTY0 619 aa14.57□□□□□ -0.08
VARS-216ENST00000428445 SULT2B1O00204 365 aa14.57□□□□□ -0.08
VARS-216ENST00000428445 SPAG7O75391 227 aa14.57□□□□□ -0.08
VARS-216ENST00000428445 UGT2B17O75795 530 aa14.57□□□□□ -0.08
VARS-216ENST00000428445 LY6HO94772 140 aa14.57□□□□□ -0.08
VARS-216ENST00000428445 C1QCP02747 245 aa14.57□□□□□ -0.08
VARS-216ENST00000428445 TFPIP10646 304 aa14.57□□□□□ -0.08
VARS-216ENST00000428445 CCNA2P20248 432 aa14.57□□□□□ -0.08
VARS-216ENST00000428445 TTKP33981 857 aa14.57□□□□□ -0.08
VARS-216ENST00000428445 PGS1Q32NB8 556 aa14.57□□□□□ -0.08
VARS-216ENST00000428445 XKR7Q5GH72 579 aa14.57□□□□□ -0.08
VARS-216ENST00000428445 C6orf52Q5T4I8 152 aa14.57□□□□□ -0.08
VARS-216ENST00000428445 C9orf135Q5VTT2 229 aa14.57□□□□□ -0.08
VARS-216ENST00000428445 AGAP6Q5VW22 663 aa14.57□□□□□ -0.08
VARS-216ENST00000428445 C3orf33Q6P1S2 294 aa14.57□□□□□ -0.08
VARS-216ENST00000428445 SLC22A25Q6T423 547 aa14.57□□□□□ -0.08
VARS-216ENST00000428445 TMPPEQ6ZT21 453 aa14.57□□□□□ -0.08
VARS-216ENST00000428445 C6orf120Q7Z4R8 191 aa14.57□□□□□ -0.08
VARS-216ENST00000428445 CCDC103Q8IW40 242 aa14.57□□□□□ -0.08
VARS-216ENST00000428445 ZNF525Q8N782 197 aa14.57□□□□□ -0.08
VARS-216ENST00000428445 ARL5BQ96KC2 179 aa14.57□□□□□ -0.08
VARS-216ENST00000428445 MANSC1Q9H8J5 431 aa14.57□□□□□ -0.08
VARS-216ENST00000428445 CIB4A0PJX0 185 aa14.56□□□□□ -0.08
VARS-216ENST00000428445 DUXAA6NLW8 204 aa14.56□□□□□ -0.08
VARS-216ENST00000428445 CCT8L1PA6NM43 557 aa14.56□□□□□ -0.08
VARS-216ENST00000428445 M0R1B8 84 aa14.56□□□□□ -0.08
VARS-216ENST00000428445 ETV2O00321 342 aaPredicted RBP14.56□□□□□ -0.08
VARS-216ENST00000428445 PHF1O43189 567 aaPredicted RBP14.56□□□□□ -0.08
VARS-216ENST00000428445 CSTAP01040 98 aa14.56□□□□□ -0.08
VARS-216ENST00000428445 IFNA2P01563 188 aa14.56□□□□□ -0.08
VARS-216ENST00000428445 G6PDP11413 515 aa14.56□□□□□ -0.08
VARS-216ENST00000428445 PRPS1L1P21108 318 aa14.56□□□□□ -0.08
VARS-216ENST00000428445 RYKP34925 604 aa14.56□□□□□ -0.08
VARS-216ENST00000428445 TMEM249Q2WGJ8 235 aa14.56□□□□□ -0.08
VARS-216ENST00000428445 ATP6AP1LQ52LC2 224 aa14.56□□□□□ -0.08
VARS-216ENST00000428445 FBXW9Q5XUX1 488 aa14.56□□□□□ -0.08
VARS-216ENST00000428445 RIMKLAQ8IXN7 391 aa14.56□□□□□ -0.08
VARS-216ENST00000428445 FNDC5Q8NAU1 212 aa14.56□□□□□ -0.08
VARS-216ENST00000428445 OR52E4Q8NGH9 312 aa14.56□□□□□ -0.08
VARS-216ENST00000428445 SFXN5Q8TD22 340 aa14.56□□□□□ -0.08
VARS-216ENST00000428445 ZG16BQ96DA0 208 aa14.56□□□□□ -0.08
VARS-216ENST00000428445 DUSP26Q9BV47 211 aa14.56□□□□□ -0.08
VARS-216ENST00000428445 OR11A1Q9GZK7 315 aa14.56□□□□□ -0.08
VARS-216ENST00000428445 BARX1Q9HBU1 254 aaPredicted RBP14.56□□□□□ -0.08
VARS-216ENST00000428445 CTPS2Q9NRF8 586 aa14.56□□□□□ -0.08
VARS-216ENST00000428445 FAIMQ9NVQ4 179 aa14.56□□□□□ -0.08
VARS-216ENST00000428445 POU2F3Q9UKI9 436 aa14.56□□□□□ -0.08
VARS-216ENST00000428445 NOSIPQ9Y314 301 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
VARS-216ENST00000428445 SLC25A15Q9Y619 301 aa14.56□□□□□ -0.08
VARS-216ENST00000428445 CLDN24A6NM45 220 aa14.55□□□□□ -0.08
VARS-216ENST00000428445 ZNF716A6NP11 495 aa14.55□□□□□ -0.08
VARS-216ENST00000428445 DNAJA2O60884 412 aa14.55□□□□□ -0.08
VARS-216ENST00000428445 CD40P25942 277 aa14.55□□□□□ -0.08
VARS-216ENST00000428445 FABP6P51161 128 aa14.55□□□□□ -0.08
VARS-216ENST00000428445 MAD2L1Q13257 205 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
VARS-216ENST00000428445 ZNF141Q15928 474 aa14.55□□□□□ -0.08
VARS-216ENST00000428445 SMU1Q2TAY7 513 aa14.55□□□□□ -0.08
VARS-216ENST00000428445 SYT14P1Q58G82 188 aa14.55□□□□□ -0.08
VARS-216ENST00000428445 AP1ARQ63HQ0 302 aa14.55□□□□□ -0.08
VARS-216ENST00000428445 ABLIM2Q6H8Q1 611 aa14.55□□□□□ -0.08
VARS-216ENST00000428445 OR4F3Q6IEY1 312 aa14.55□□□□□ -0.08
VARS-216ENST00000428445 MTDHQ86UE4 582 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
VARS-216ENST00000428445 ARIH2OSQ8N7S6 290 aa14.55□□□□□ -0.08
VARS-216ENST00000428445 OIT3Q8WWZ8 545 aa14.55□□□□□ -0.08
VARS-216ENST00000428445 RAB8BQ92930 207 aa14.55□□□□□ -0.08
VARS-216ENST00000428445 APOPT1Q96IL0 206 aa14.55□□□□□ -0.08
VARS-216ENST00000428445 PPP1R36Q96LQ0 422 aa14.55□□□□□ -0.08
VARS-216ENST00000428445 ADAD1Q96M93 576 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
VARS-216ENST00000428445 TNFRSF13CQ96RJ3 184 aa14.55□□□□□ -0.08
VARS-216ENST00000428445 DHRS9Q9BPW9 319 aa14.55□□□□□ -0.08
VARS-216ENST00000428445 ROPN1BQ9BZX4 212 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
VARS-216ENST00000428445 GRIP2Q9C0E4 1043 aa14.55□□□□□ -0.08
VARS-216ENST00000428445 BHLHE41Q9C0J9 482 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
VARS-216ENST00000428445 NMUR2Q9GZQ4 415 aa14.55□□□□□ -0.08
VARS-216ENST00000428445 OR51I1Q9H343 314 aa14.55□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.1 ms