RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428064.5

LIMS1-208, Transcript of LIM zinc finger domain containing 1, humanhuman

TSL 2

Gene LIMS1, Length 637 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIMS1-208ENST00000428064 ETFDHQ16134 617 aa18.59■□□□□ 0.57
LIMS1-208ENST00000428064 MAPK14Q16539 360 aa18.59■□□□□ 0.57
LIMS1-208ENST00000428064 TNFAIP8L3Q5GJ75 292 aa18.59■□□□□ 0.57
LIMS1-208ENST00000428064 OGFOD2Q6N063 350 aa18.59■□□□□ 0.57
LIMS1-208ENST00000428064 ZNF619Q8N2I2 560 aa18.59■□□□□ 0.57
LIMS1-208ENST00000428064 PPP1R36Q96LQ0 422 aa18.59■□□□□ 0.57
LIMS1-208ENST00000428064 CCDC106Q9BWC9 280 aa18.59■□□□□ 0.57
LIMS1-208ENST00000428064 FREM1Q5H8C1 2179 aa18.59■□□□□ 0.57
LIMS1-208ENST00000428064 E9PBE3 544 aa18.58■□□□□ 0.56
LIMS1-208ENST00000428064 SMAD7O15105 426 aaKnown RBP18.58■□□□□ 0.56
LIMS1-208ENST00000428064 CYP7B1O75881 506 aa18.58■□□□□ 0.56
LIMS1-208ENST00000428064 DANCRP0C864 163 aa18.58■□□□□ 0.56
LIMS1-208ENST00000428064 LBPP18428 481 aa18.58■□□□□ 0.56
LIMS1-208ENST00000428064 KHKP50053 298 aa18.58■□□□□ 0.56
LIMS1-208ENST00000428064 ATP5J2P56134 94 aa18.58■□□□□ 0.56
LIMS1-208ENST00000428064 TXNL4AP83876 142 aaKnown RBP18.58■□□□□ 0.56
LIMS1-208ENST00000428064 MERTKQ12866 999 aa18.58■□□□□ 0.56
LIMS1-208ENST00000428064 ZNF672Q499Z4 452 aaPredicted RBP18.58■□□□□ 0.56
LIMS1-208ENST00000428064 FRRS1Q6ZNA5 592 aa18.58■□□□□ 0.56
LIMS1-208ENST00000428064 P2RY8Q86VZ1 359 aa18.58■□□□□ 0.56
LIMS1-208ENST00000428064 ANKRD46Q86W74 232 aa18.58■□□□□ 0.56
LIMS1-208ENST00000428064 XAGE5Q8WWM1 108 aa18.58■□□□□ 0.56
LIMS1-208ENST00000428064 ROPN1LQ96C74 230 aa18.58■□□□□ 0.56
LIMS1-208ENST00000428064 ZNF300Q96RE9 604 aaPredicted RBP18.58■□□□□ 0.56
LIMS1-208ENST00000428064 MEAF6Q9HAF1 191 aa18.58■□□□□ 0.56
LIMS1-208ENST00000428064 CHRNA9Q9UGM1 479 aa18.58■□□□□ 0.56
LIMS1-208ENST00000428064 PRSS50Q9UI38 385 aa18.58■□□□□ 0.56
LIMS1-208ENST00000428064 LAMP3Q9UQV4 416 aa18.58■□□□□ 0.56
LIMS1-208ENST00000428064 ROS1P08922 2347 aa18.58■□□□□ 0.56
LIMS1-208ENST00000428064 SULT2B1O00204 365 aa18.57■□□□□ 0.56
LIMS1-208ENST00000428064 PMS2P2O95744 297 aa18.57■□□□□ 0.56
LIMS1-208ENST00000428064 FESP07332 822 aa18.57■□□□□ 0.56
LIMS1-208ENST00000428064 CLK1P49759 484 aaKnown RBP18.57■□□□□ 0.56
LIMS1-208ENST00000428064 CAPRIN1Q14444 709 aaKnown RBP18.57■□□□□ 0.56
LIMS1-208ENST00000428064 SPANXN4Q5MJ08 99 aa18.57■□□□□ 0.56
LIMS1-208ENST00000428064 TIMM23BQ5SRD1 257 aa18.57■□□□□ 0.56
LIMS1-208ENST00000428064 TNFAIP8L2Q6P589 184 aaPredicted RBP18.57■□□□□ 0.56
LIMS1-208ENST00000428064 OLIG3Q7RTU3 272 aa18.57■□□□□ 0.56
LIMS1-208ENST00000428064 GRINAQ7Z429 371 aa18.57■□□□□ 0.56
LIMS1-208ENST00000428064 GALNT5Q7Z7M9 940 aa18.57■□□□□ 0.56
LIMS1-208ENST00000428064 MTDHQ86UE4 582 aaKnown RBP18.57■□□□□ 0.56
LIMS1-208ENST00000428064 CCDC115Q96NT0 180 aa18.57■□□□□ 0.56
LIMS1-208ENST00000428064 EMC3Q9P0I2 261 aa18.57■□□□□ 0.56
LIMS1-208ENST00000428064 MARCOQ9UEW3 520 aaPredicted RBP18.57■□□□□ 0.56
LIMS1-208ENST00000428064 BTNL2Q9UIR0 455 aa18.57■□□□□ 0.56
LIMS1-208ENST00000428064 HDGFL3Q9Y3E1 203 aa18.57■□□□□ 0.56
LIMS1-208ENST00000428064 GOLGA8QA0A0J9YX86 632 aa18.56■□□□□ 0.56
LIMS1-208ENST00000428064 GOLGA8OA6NCC3 632 aa18.56■□□□□ 0.56
LIMS1-208ENST00000428064 GOLGA8NF8WBI6 632 aa18.56■□□□□ 0.56
LIMS1-208ENST00000428064 CLOCKO15516 846 aa18.56■□□□□ 0.56
LIMS1-208ENST00000428064 PGM3O95394 542 aa18.56■□□□□ 0.56
LIMS1-208ENST00000428064 CPSF4O95639 269 aaKnown RBP18.56■□□□□ 0.56
LIMS1-208ENST00000428064 THBS1P07996 1170 aa18.56■□□□□ 0.56
LIMS1-208ENST00000428064 CASP9P55211 416 aa18.56■□□□□ 0.56
LIMS1-208ENST00000428064 PLAURQ03405 335 aa18.56■□□□□ 0.56
LIMS1-208ENST00000428064 BSPH1Q075Z2 132 aa18.56■□□□□ 0.56
LIMS1-208ENST00000428064 PPA1Q15181 289 aa18.56■□□□□ 0.56
LIMS1-208ENST00000428064 ALKBH2Q6NS38 261 aa18.56■□□□□ 0.56
LIMS1-208ENST00000428064 CMIPQ8IY22 773 aa18.56■□□□□ 0.56
LIMS1-208ENST00000428064 ZNF563Q8TA94 476 aa18.56■□□□□ 0.56
LIMS1-208ENST00000428064 RAB8BQ92930 207 aa18.56■□□□□ 0.56
LIMS1-208ENST00000428064 TRMT61AQ96FX7 289 aaKnown RBP18.56■□□□□ 0.56
LIMS1-208ENST00000428064 SLC35A5Q9BS91 424 aa18.56■□□□□ 0.56
LIMS1-208ENST00000428064 NUF2Q9BZD4 464 aa18.56■□□□□ 0.56
LIMS1-208ENST00000428064 TRIM2Q9C040 744 aa18.56■□□□□ 0.56
LIMS1-208ENST00000428064 GRIP2Q9C0E4 1043 aa18.56■□□□□ 0.56
LIMS1-208ENST00000428064 CTPS2Q9NRF8 586 aa18.56■□□□□ 0.56
LIMS1-208ENST00000428064 PRR14LQ5THK1 2151 aa18.56■□□□□ 0.56
LIMS1-208ENST00000428064 PRAMEF27A3QJZ7 478 aa18.55■□□□□ 0.56
LIMS1-208ENST00000428064 ZNF716A6NP11 495 aa18.55■□□□□ 0.56
LIMS1-208ENST00000428064 HMGN4O00479 90 aa18.55■□□□□ 0.56
LIMS1-208ENST00000428064 BCAS1O75363 584 aaPredicted RBP18.55■□□□□ 0.56
LIMS1-208ENST00000428064 LYZL6O75951 148 aa18.55■□□□□ 0.56
LIMS1-208ENST00000428064 SOD3P08294 240 aa18.55■□□□□ 0.56
LIMS1-208ENST00000428064 BGNP21810 368 aa18.55■□□□□ 0.56
LIMS1-208ENST00000428064 IGHV1-2P23083 117 aa18.55■□□□□ 0.56
LIMS1-208ENST00000428064 EDNRAP25101 427 aa18.55■□□□□ 0.56
LIMS1-208ENST00000428064 S100A3P33764 101 aa18.55■□□□□ 0.56
LIMS1-208ENST00000428064 CHI3L1P36222 383 aaPredicted RBP18.55■□□□□ 0.56
LIMS1-208ENST00000428064 SLC16A1P53985 500 aa18.55■□□□□ 0.56
LIMS1-208ENST00000428064 KCNJ10P78508 379 aa18.55■□□□□ 0.56
LIMS1-208ENST00000428064 HPCAP84074 193 aa18.55■□□□□ 0.56
LIMS1-208ENST00000428064 LRRC74AQ0VAA2 488 aa18.55■□□□□ 0.56
LIMS1-208ENST00000428064 STX3Q13277 289 aa18.55■□□□□ 0.56
LIMS1-208ENST00000428064 FAM174BQ3ZCQ3 159 aa18.55■□□□□ 0.56
LIMS1-208ENST00000428064 TRIML2Q8N7C3 387 aa18.55■□□□□ 0.56
LIMS1-208ENST00000428064 SMAP2Q8WU79 429 aaPredicted RBP18.55■□□□□ 0.56
LIMS1-208ENST00000428064 ZHX1-C8orf76Q96EF9 292 aa18.55■□□□□ 0.56
LIMS1-208ENST00000428064 TRNT1Q96Q11 434 aaKnown RBP18.55■□□□□ 0.56
LIMS1-208ENST00000428064 ST6GALNAC1Q9NSC7 600 aaPredicted RBP18.55■□□□□ 0.56
LIMS1-208ENST00000428064 LIPT1Q9Y234 373 aa18.55■□□□□ 0.56
LIMS1-208ENST00000428064 DPRXA6NFQ7 191 aa18.54■□□□□ 0.56
LIMS1-208ENST00000428064 GGT1P19440 569 aa18.54■□□□□ 0.56
LIMS1-208ENST00000428064 HTR3AP46098 478 aa18.54■□□□□ 0.56
LIMS1-208ENST00000428064 ANXA11P50995 505 aaKnown RBP18.54■□□□□ 0.56
LIMS1-208ENST00000428064 MPP2Q14168 576 aa18.54■□□□□ 0.56
LIMS1-208ENST00000428064 FBXW9Q5XUX1 488 aa18.54■□□□□ 0.56
LIMS1-208ENST00000428064 CROCCP2Q86T23 111 aa18.54■□□□□ 0.56
LIMS1-208ENST00000428064 ATG4DQ86TL0 474 aaPredicted RBP18.54■□□□□ 0.56
LIMS1-208ENST00000428064 ZNF100Q8IYN0 542 aa18.54■□□□□ 0.56
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