RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000426282.6

NUP50-AS1-201, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene NUP50-AS1, Length 2,076 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CSTF1Q05048 431 aaKnown RBP17.19■□□□□ 0.34
NUP50-AS1-201ENST00000426282 OR7G1Q8NGA0 311 aa17.19■□□□□ 0.34
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PTPMT1Q8WUK0 201 aaPredicted RBP17.19■□□□□ 0.34
NUP50-AS1-201ENST00000426282 EFHD2Q96C19 240 aaPredicted RBP17.19■□□□□ 0.34
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TBX5Q99593 518 aa17.19■□□□□ 0.34
NUP50-AS1-201ENST00000426282 HDHD5Q9BXW7 423 aa17.19■□□□□ 0.34
NUP50-AS1-201ENST00000426282 MN1Q10571 1320 aaPredicted RBP17.19■□□□□ 0.34
NUP50-AS1-201ENST00000426282 LAMA1P25391 3075 aa17.19■□□□□ 0.34
NUP50-AS1-201ENST00000426282 IGHV1OR21-1A0A087WYE8 117 aa17.19■□□□□ 0.34
NUP50-AS1-201ENST00000426282 DAPL1A0PJW8 107 aa17.19■□□□□ 0.34
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TMEM150CB9EJG8 249 aa17.19■□□□□ 0.34
NUP50-AS1-201ENST00000426282 GABRPO00591 440 aa17.19■□□□□ 0.34
NUP50-AS1-201ENST00000426282 REM1O75628 298 aa17.19■□□□□ 0.34
NUP50-AS1-201ENST00000426282 DLGAP3O95886 979 aa17.19■□□□□ 0.34
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CLUP10909 449 aa17.19■□□□□ 0.34
NUP50-AS1-201ENST00000426282 HK1P19367 917 aa17.19■□□□□ 0.34
NUP50-AS1-201ENST00000426282 DEFA1P59665 94 aa17.19■□□□□ 0.34
NUP50-AS1-201ENST00000426282 DEFA3P59666 94 aa17.19■□□□□ 0.34
NUP50-AS1-201ENST00000426282 HSD11B2P80365 405 aa17.19■□□□□ 0.34
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ZNF79Q15937 498 aa17.19■□□□□ 0.34
NUP50-AS1-201ENST00000426282 KLHL26Q53HC5 615 aa17.19■□□□□ 0.34
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ARHGAP11AQ6P4F7 1023 aa17.19■□□□□ 0.34
NUP50-AS1-201ENST00000426282 MED25Q71SY5 747 aa17.19■□□□□ 0.34
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SIX5Q8N196 739 aa17.19■□□□□ 0.34
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SPEM1Q8N4L4 309 aa17.19■□□□□ 0.34
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ZNF321PQ8N8H1 164 aa17.19■□□□□ 0.34
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CYB561A3Q8NBI2 242 aa17.19■□□□□ 0.34
NUP50-AS1-201ENST00000426282 OR10H4Q8NGA5 316 aa17.19■□□□□ 0.34
NUP50-AS1-201ENST00000426282 DNAJA4Q8WW22 397 aaPredicted RBP17.19■□□□□ 0.34
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SHDQ96IW2 340 aa17.19■□□□□ 0.34
NUP50-AS1-201ENST00000426282 YIPF2Q9BWQ6 316 aa17.19■□□□□ 0.34
NUP50-AS1-201ENST00000426282 MIXL1Q9H2W2 232 aa17.19■□□□□ 0.34
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ABCB9Q9NP78 766 aa17.19■□□□□ 0.34
NUP50-AS1-201ENST00000426282 MKKSQ9NPJ1 570 aaPredicted RBP17.19■□□□□ 0.34
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ASB6Q9NWX5 421 aa17.19■□□□□ 0.34
NUP50-AS1-201ENST00000426282 WNT16Q9UBV4 365 aa17.19■□□□□ 0.34
NUP50-AS1-201ENST00000426282 A0A087WUJ7 227 aa17.18■□□□□ 0.34
NUP50-AS1-201ENST00000426282 GAAP10253 952 aa17.18■□□□□ 0.34
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ALAS2P22557 587 aa17.18■□□□□ 0.34
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SLC37A1P57057 533 aa17.18■□□□□ 0.34
NUP50-AS1-201ENST00000426282 KRR1Q13601 381 aaKnown RBP17.18■□□□□ 0.34
NUP50-AS1-201ENST00000426282 GALEQ14376 348 aa17.18■□□□□ 0.34
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PTCRAQ6ISU1 281 aaPredicted RBP17.18■□□□□ 0.34
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ZDHHC19Q8WVZ1 309 aaPredicted RBP17.18■□□□□ 0.34
NUP50-AS1-201ENST00000426282 INPP5EQ9NRR6 644 aa17.18■□□□□ 0.34
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PNO1Q9NRX1 252 aaKnown RBP17.18■□□□□ 0.34
NUP50-AS1-201ENST00000426282 BABAM2Q9NXR7 383 aa17.18■□□□□ 0.34
NUP50-AS1-201ENST00000426282 FBXL4Q9UKA2 621 aa17.18■□□□□ 0.34
NUP50-AS1-201ENST00000426282 MMACHCQ9Y4U1 282 aa17.18■□□□□ 0.34
NUP50-AS1-201ENST00000426282 EML5Q05BV3 1969 aa17.18■□□□□ 0.34
NUP50-AS1-201ENST00000426282 A0A1W2PQL4 384 aaPredicted RBP17.17■□□□□ 0.34
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CASKO14936 926 aa17.17■□□□□ 0.34
NUP50-AS1-201ENST00000426282 POLR1CO15160 346 aaPredicted RBP17.17■□□□□ 0.34
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ATP6V1G1O75348 118 aa17.17■□□□□ 0.34
NUP50-AS1-201ENST00000426282 IFNGP01579 166 aa17.17■□□□□ 0.34
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SBK2P0C263 348 aa17.17■□□□□ 0.34
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SPNP16150 400 aa17.17■□□□□ 0.34
NUP50-AS1-201ENST00000426282 INSL4Q14641 139 aa17.17■□□□□ 0.34
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ZMAT1Q5H9K5 638 aa17.17■□□□□ 0.34
NUP50-AS1-201ENST00000426282 MARCH9Q86YJ5 346 aa17.17■□□□□ 0.34
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CAMKK1Q8N5S9 505 aa17.17■□□□□ 0.34
NUP50-AS1-201ENST00000426282 FAM71CQ8NEG0 241 aa17.17■□□□□ 0.34
NUP50-AS1-201ENST00000426282 AP3S1Q92572 193 aa17.17■□□□□ 0.34
NUP50-AS1-201ENST00000426282 HPS1Q92902 700 aa17.17■□□□□ 0.34
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CLIP3Q96DZ5 547 aa17.17■□□□□ 0.34
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SGTBQ96EQ0 304 aa17.17■□□□□ 0.34
NUP50-AS1-201ENST00000426282 MVB12AQ96EY5 273 aa17.17■□□□□ 0.34
NUP50-AS1-201ENST00000426282 OR1F2PQ96R84 312 aa17.17■□□□□ 0.34
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ADGRL4Q9HBW9 690 aa17.17■□□□□ 0.34
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ENAMQ9NRM1 1142 aa17.17■□□□□ 0.34
NUP50-AS1-201ENST00000426282 DHCR7Q9UBM7 475 aaKnown RBP17.17■□□□□ 0.34
NUP50-AS1-201ENST00000426282 MUTYHQ9UIF7 546 aa17.17■□□□□ 0.34
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SERTAD3Q9UJW9 196 aa17.17■□□□□ 0.34
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PAIP2BQ9ULR5 123 aaKnown RBP17.17■□□□□ 0.34
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ICAM5Q9UMF0 924 aa17.17■□□□□ 0.34
NUP50-AS1-201ENST00000426282 NUDT21O43809 227 aaKnown RBP17.17■□□□□ 0.34
NUP50-AS1-201ENST00000426282 NDUFB2O95178 105 aa17.17■□□□□ 0.34
NUP50-AS1-201ENST00000426282 MRPL3P09001 348 aaKnown RBP17.17■□□□□ 0.34
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ARL4DP49703 201 aa17.17■□□□□ 0.34
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CAV3P56539 151 aa17.17■□□□□ 0.34
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CFHR1Q03591 330 aa17.17■□□□□ 0.34
NUP50-AS1-201ENST00000426282 GPR50Q13585 617 aa17.17■□□□□ 0.34
NUP50-AS1-201ENST00000426282 DDI2Q5TDH0 399 aa17.17■□□□□ 0.34
NUP50-AS1-201ENST00000426282 OR8H2Q8N162 312 aa17.17■□□□□ 0.34
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CARFQ8N187 725 aa17.17■□□□□ 0.34
NUP50-AS1-201ENST00000426282 NEIL3Q8TAT5 605 aa17.17■□□□□ 0.34
NUP50-AS1-201ENST00000426282 HLA-CQ95604 372 aa17.17■□□□□ 0.34
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TSLPQ969D9 159 aa17.17■□□□□ 0.34
NUP50-AS1-201ENST00000426282 C3orf49Q96BT1 292 aa17.17■□□□□ 0.34
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ART5Q96L15 291 aa17.17■□□□□ 0.34
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ERMAPQ96PL5 475 aaPredicted RBP17.17■□□□□ 0.34
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CHRNA9Q9UGM1 479 aa17.17■□□□□ 0.34
NUP50-AS1-201ENST00000426282 POLHQ9Y253 713 aa17.17■□□□□ 0.34
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SIRT4Q9Y6E7 314 aaPredicted RBP17.17■□□□□ 0.34
NUP50-AS1-201ENST00000426282 IGKV3D-11A0A0A0MRZ8 115 aa17.16■□□□□ 0.34
NUP50-AS1-201ENST00000426282 LRRN3E7EW58 273 aa17.16■□□□□ 0.34
NUP50-AS1-201ENST00000426282 RNF13O43567 381 aa17.16■□□□□ 0.34
NUP50-AS1-201ENST00000426282 GYPBP06028 91 aa17.16■□□□□ 0.34
NUP50-AS1-201ENST00000426282 GALP22466 123 aa17.16■□□□□ 0.34
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PPICP45877 212 aa17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44.4 ms