RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000400053.8

PTPRM-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene PTPRM, Length 5,292 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-202ENST00000400053 RABEPKQ7Z6M1 372 aa8.32□□□□□ -1.08
PTPRM-202ENST00000400053 APCDD1Q8J025 514 aa8.32□□□□□ -1.08
PTPRM-202ENST00000400053 CBARPQ8N350 705 aaPredicted RBP8.32□□□□□ -1.08
PTPRM-202ENST00000400053 UBE2FQ969M7 185 aa8.32□□□□□ -1.08
PTPRM-202ENST00000400053 C3orf49Q96BT1 292 aa8.32□□□□□ -1.08
PTPRM-202ENST00000400053 TSSK2Q96PF2 358 aa8.32□□□□□ -1.08
PTPRM-202ENST00000400053 DNAJB11Q9UBS4 358 aa8.32□□□□□ -1.08
PTPRM-202ENST00000400053 SLC22A7Q9Y694 548 aa8.32□□□□□ -1.08
PTPRM-202ENST00000400053 CACNA1CQ13936 2221 aa8.32□□□□□ -1.08
PTPRM-202ENST00000400053 ANKRD30BLA7E2S9 258 aa8.32□□□□□ -1.08
PTPRM-202ENST00000400053 TMX2-CTNND1H3BSU7 103 aa8.32□□□□□ -1.08
PTPRM-202ENST00000400053 HTR3BO95264 441 aa8.32□□□□□ -1.08
PTPRM-202ENST00000400053 GAAP10253 952 aa8.32□□□□□ -1.08
PTPRM-202ENST00000400053 TACR1P25103 407 aa8.32□□□□□ -1.08
PTPRM-202ENST00000400053 APLNRP35414 380 aa8.32□□□□□ -1.08
PTPRM-202ENST00000400053 CNN3Q15417 329 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
PTPRM-202ENST00000400053 ZFAND1Q8TCF1 268 aa8.32□□□□□ -1.08
PTPRM-202ENST00000400053 GPR148Q8TDV2 347 aa8.32□□□□□ -1.08
PTPRM-202ENST00000400053 PAQR8Q8TEZ7 354 aa8.32□□□□□ -1.08
PTPRM-202ENST00000400053 MITD1Q8WV92 249 aa8.32□□□□□ -1.08
PTPRM-202ENST00000400053 UHRF2Q96PU4 802 aa8.32□□□□□ -1.08
PTPRM-202ENST00000400053 OR5M11Q96RB7 305 aa8.32□□□□□ -1.08
PTPRM-202ENST00000400053 GALNT9Q9HCQ5 603 aa8.32□□□□□ -1.08
PTPRM-202ENST00000400053 SPHK2Q9NRA0 654 aa8.32□□□□□ -1.08
PTPRM-202ENST00000400053 OSGIN1Q9UJX0 560 aa8.32□□□□□ -1.08
PTPRM-202ENST00000400053 GABARAPO95166 117 aa8.32□□□□□ -1.08
PTPRM-202ENST00000400053 HNRNPA1P09651 372 aaKnown RBP eCLIP8.32□□□□□ -1.08
PTPRM-202ENST00000400053 NFYAP23511 347 aaPredicted RBP8.32□□□□□ -1.08
PTPRM-202ENST00000400053 IDUAP35475 653 aa8.32□□□□□ -1.08
PTPRM-202ENST00000400053 GIPRP48546 466 aa8.32□□□□□ -1.08
PTPRM-202ENST00000400053 SPINT3P49223 89 aa8.32□□□□□ -1.08
PTPRM-202ENST00000400053 DAP3P51398 398 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
PTPRM-202ENST00000400053 NR0B1P51843 470 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
PTPRM-202ENST00000400053 ACY1Q03154 408 aa8.32□□□□□ -1.08
PTPRM-202ENST00000400053 SPOCK1Q08629 439 aa8.32□□□□□ -1.08
PTPRM-202ENST00000400053 RAB40BQ12829 278 aa8.32□□□□□ -1.08
PTPRM-202ENST00000400053 RAB33AQ14088 237 aa8.32□□□□□ -1.08
PTPRM-202ENST00000400053 C2orf76Q3KRA6 126 aa8.32□□□□□ -1.08
PTPRM-202ENST00000400053 TMEM244Q5VVB8 128 aa8.32□□□□□ -1.08
PTPRM-202ENST00000400053 ZNF585AQ6P3V2 769 aa8.32□□□□□ -1.08
PTPRM-202ENST00000400053 CCDC71Q8IV32 467 aaPredicted RBP8.32□□□□□ -1.08
PTPRM-202ENST00000400053 MDGA1Q8NFP4 955 aa8.32□□□□□ -1.08
PTPRM-202ENST00000400053 OR5L1Q8NGL2 311 aa8.32□□□□□ -1.08
PTPRM-202ENST00000400053 OR1J4Q8NGS1 313 aa8.32□□□□□ -1.08
PTPRM-202ENST00000400053 OLIG1Q8TAK6 271 aa8.32□□□□□ -1.08
PTPRM-202ENST00000400053 FIBINQ8TAL6 211 aa8.32□□□□□ -1.08
PTPRM-202ENST00000400053 SORBS1Q9BX66 1292 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
PTPRM-202ENST00000400053 C11orf54Q9H0W9 315 aaPredicted RBP8.32□□□□□ -1.08
PTPRM-202ENST00000400053 USP36Q9P275 1121 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
PTPRM-202ENST00000400053 LAMB2P55268 1798 aa8.32□□□□□ -1.08
PTPRM-202ENST00000400053 STRCQ7RTU9 1775 aa8.32□□□□□ -1.08
PTPRM-202ENST00000400053 SNAPINO95295 136 aa8.31□□□□□ -1.08
PTPRM-202ENST00000400053 PKLRP30613 574 aa8.31□□□□□ -1.08
PTPRM-202ENST00000400053 RACK1P63244 317 aaKnown RBP8.31□□□□□ -1.08
PTPRM-202ENST00000400053 MLLT11Q13015 90 aaPredicted RBP8.31□□□□□ -1.08
PTPRM-202ENST00000400053 SSX2Q16385 188 aa8.31□□□□□ -1.08
PTPRM-202ENST00000400053 FAM122CQ6P4D5 195 aa8.31□□□□□ -1.08
PTPRM-202ENST00000400053 TMPRSS7Q7RTY8 843 aa8.31□□□□□ -1.08
PTPRM-202ENST00000400053 FUNDC1Q8IVP5 155 aa8.31□□□□□ -1.08
PTPRM-202ENST00000400053 CMIPQ8IY22 773 aa8.31□□□□□ -1.08
PTPRM-202ENST00000400053 DIO2Q92813 273 aa8.31□□□□□ -1.08
PTPRM-202ENST00000400053 RBFOX1Q9NWB1 397 aaKnown RBP8.31□□□□□ -1.08
PTPRM-202ENST00000400053 GPR34Q9UPC5 381 aa8.31□□□□□ -1.08
PTPRM-202ENST00000400053 ANTXRLA6NF34 631 aa8.31□□□□□ -1.08
PTPRM-202ENST00000400053 PRAMEF2O60811 474 aa8.31□□□□□ -1.08
PTPRM-202ENST00000400053 ZNF780AO75290 641 aaPredicted RBP8.31□□□□□ -1.08
PTPRM-202ENST00000400053 ATXN1LP0C7T5 689 aaKnown RBP8.31□□□□□ -1.08
PTPRM-202ENST00000400053 LIPAP38571 399 aa8.31□□□□□ -1.08
PTPRM-202ENST00000400053 TSFMP43897 325 aaKnown RBP8.31□□□□□ -1.08
PTPRM-202ENST00000400053 F2RL1P55085 397 aa8.31□□□□□ -1.08
PTPRM-202ENST00000400053 CTXN1P60606 82 aa8.31□□□□□ -1.08
PTPRM-202ENST00000400053 FCN2Q15485 313 aa8.31□□□□□ -1.08
PTPRM-202ENST00000400053 CARD17Q5XLA6 110 aa8.31□□□□□ -1.08
PTPRM-202ENST00000400053 OR4C11Q6IEV9 310 aa8.31□□□□□ -1.08
PTPRM-202ENST00000400053 TBPL2Q6SJ96 375 aa8.31□□□□□ -1.08
PTPRM-202ENST00000400053 SLC46A3Q7Z3Q1 461 aa8.31□□□□□ -1.08
PTPRM-202ENST00000400053 KLHDC8AQ8IYD2 350 aa8.31□□□□□ -1.08
PTPRM-202ENST00000400053 ZFP82Q8N141 532 aa8.31□□□□□ -1.08
PTPRM-202ENST00000400053 OR2M2Q96R28 347 aa8.31□□□□□ -1.08
PTPRM-202ENST00000400053 NGBQ9NPG2 151 aa8.31□□□□□ -1.08
PTPRM-202ENST00000400053 PTTG3PQ9NZH4 202 aa8.31□□□□□ -1.08
PTPRM-202ENST00000400053 MYOTQ9UBF9 498 aa8.31□□□□□ -1.08
PTPRM-202ENST00000400053 SLC7A7Q9UM01 511 aa8.31□□□□□ -1.08
PTPRM-202ENST00000400053 LSM5Q9Y4Y9 91 aaKnown RBP8.31□□□□□ -1.08
PTPRM-202ENST00000400053 LCATP04180 440 aa8.31□□□□□ -1.08
PTPRM-202ENST00000400053 SUMF2Q8NBJ7 301 aa8.31□□□□□ -1.08
PTPRM-202ENST00000400053 ADAMTS16Q8TE57 1224 aa8.31□□□□□ -1.08
PTPRM-202ENST00000400053 FYTTD1Q96QD9 318 aaKnown RBP8.31□□□□□ -1.08
PTPRM-202ENST00000400053 CLMPQ9H6B4 373 aa8.31□□□□□ -1.08
PTPRM-202ENST00000400053 IL21RQ9HBE5 538 aa8.31□□□□□ -1.08
PTPRM-202ENST00000400053 WASH6PQ9NQA3 447 aa8.31□□□□□ -1.08
PTPRM-202ENST00000400053 RNF186Q9NXI6 227 aa8.31□□□□□ -1.08
PTPRM-202ENST00000400053 LUZP4Q9P127 313 aa8.31□□□□□ -1.08
PTPRM-202ENST00000400053 PCDHB10Q9UN67 800 aa8.31□□□□□ -1.08
PTPRM-202ENST00000400053 SLC6A5Q9Y345 797 aa8.31□□□□□ -1.08
PTPRM-202ENST00000400053 MROH6A6NGR9 719 aa8.31□□□□□ -1.08
PTPRM-202ENST00000400053 P2RX6O15547 441 aa8.31□□□□□ -1.08
PTPRM-202ENST00000400053 SNRNP70P08621 437 aaKnown RBP8.31□□□□□ -1.08
PTPRM-202ENST00000400053 ARSBP15848 533 aa8.31□□□□□ -1.08
PTPRM-202ENST00000400053 M6PRP20645 277 aa8.31□□□□□ -1.08
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