RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000397396.5

TSPAN4-202, Transcript of tetraspanin 4, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene TSPAN4, Length 1,332 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN4-202ENST00000397396 PLGLB1Q02325 96 aa21.39■■□□□ 1.01
TSPAN4-202ENST00000397396 FOXO1Q12778 655 aa21.39■■□□□ 1.01
TSPAN4-202ENST00000397396 MERTKQ12866 999 aa21.39■■□□□ 1.01
TSPAN4-202ENST00000397396 INPP5JQ15735 1006 aaPredicted RBP21.39■■□□□ 1.01
TSPAN4-202ENST00000397396 TOMM34Q15785 309 aaPredicted RBP21.39■■□□□ 1.01
TSPAN4-202ENST00000397396 HYAL4Q2M3T9 481 aa21.39■■□□□ 1.01
TSPAN4-202ENST00000397396 ZNF800Q2TB10 664 aaPredicted RBP eCLIP21.39■■□□□ 1.01
TSPAN4-202ENST00000397396 PODNL1Q6PEZ8 512 aa21.39■■□□□ 1.01
TSPAN4-202ENST00000397396 C5orf46Q6UWT4 87 aa21.39■■□□□ 1.01
TSPAN4-202ENST00000397396 OR10G2Q8NGC3 310 aa21.39■■□□□ 1.01
TSPAN4-202ENST00000397396 TMEM239Q8WW34 195 aa21.39■■□□□ 1.01
TSPAN4-202ENST00000397396 EXTL1Q92935 676 aa21.39■■□□□ 1.01
TSPAN4-202ENST00000397396 GNRHR2Q96P88 292 aa21.39■■□□□ 1.01
TSPAN4-202ENST00000397396 PRSS27Q9BQR3 290 aa21.39■■□□□ 1.01
TSPAN4-202ENST00000397396 FUZQ9BT04 418 aa21.39■■□□□ 1.01
TSPAN4-202ENST00000397396 ZNF426Q9BUY5 554 aa21.39■■□□□ 1.01
TSPAN4-202ENST00000397396 KLHL4Q9C0H6 718 aa21.39■■□□□ 1.01
TSPAN4-202ENST00000397396 ADNPQ9H2P0 1102 aa21.39■■□□□ 1.01
TSPAN4-202ENST00000397396 SERINC1Q9NRX5 453 aa21.39■■□□□ 1.01
TSPAN4-202ENST00000397396 QPCTLQ9NXS2 382 aa21.39■■□□□ 1.01
TSPAN4-202ENST00000397396 KIF17Q9P2E2 1029 aa21.39■■□□□ 1.01
TSPAN4-202ENST00000397396 OR10H3O60404 316 aa21.38■■□□□ 1.01
TSPAN4-202ENST00000397396 LYPD3O95274 346 aa21.38■■□□□ 1.01
TSPAN4-202ENST00000397396 HPRP00739 348 aa21.38■■□□□ 1.01
TSPAN4-202ENST00000397396 HK1P19367 917 aa21.38■■□□□ 1.01
TSPAN4-202ENST00000397396 MST1P26927 711 aa21.38■■□□□ 1.01
TSPAN4-202ENST00000397396 ELK4P28324 431 aa21.38■■□□□ 1.01
TSPAN4-202ENST00000397396 VHLP40337 213 aa21.38■■□□□ 1.01
TSPAN4-202ENST00000397396 FOXK2Q01167 660 aa21.38■■□□□ 1.01
TSPAN4-202ENST00000397396 ZNF169Q14929 603 aaPredicted RBP21.38■■□□□ 1.01
TSPAN4-202ENST00000397396 ARSKQ6UWY0 536 aa21.38■■□□□ 1.01
TSPAN4-202ENST00000397396 MBOAT2Q6ZWT7 520 aa21.38■■□□□ 1.01
TSPAN4-202ENST00000397396 SLC22A16Q86VW1 577 aa21.38■■□□□ 1.01
TSPAN4-202ENST00000397396 EPHX4Q8IUS5 362 aa21.38■■□□□ 1.01
TSPAN4-202ENST00000397396 NKAIN4Q8IVV8 208 aa21.38■■□□□ 1.01
TSPAN4-202ENST00000397396 ZFP62Q8NB50 900 aaPredicted RBP21.38■■□□□ 1.01
TSPAN4-202ENST00000397396 OR4K5Q8NGD3 323 aa21.38■■□□□ 1.01
TSPAN4-202ENST00000397396 PIGXQ8TBF5 258 aa21.38■■□□□ 1.01
TSPAN4-202ENST00000397396 ARHGAP9Q9BRR9 750 aa21.38■■□□□ 1.01
TSPAN4-202ENST00000397396 TMEM43Q9BTV4 400 aa21.38■■□□□ 1.01
TSPAN4-202ENST00000397396 HES7Q9BYE0 225 aa21.38■■□□□ 1.01
TSPAN4-202ENST00000397396 ZNF556Q9HAH1 456 aa21.38■■□□□ 1.01
TSPAN4-202ENST00000397396 OSGIN1Q9UJX0 560 aa21.38■■□□□ 1.01
TSPAN4-202ENST00000397396 MGAT4BQ9UQ53 548 aa21.38■■□□□ 1.01
TSPAN4-202ENST00000397396 TMEM5Q9Y2B1 443 aa21.38■■□□□ 1.01
TSPAN4-202ENST00000397396 MED31Q9Y3C7 131 aa21.38■■□□□ 1.01
TSPAN4-202ENST00000397396 HRH3Q9Y5N1 445 aa21.38■■□□□ 1.01
TSPAN4-202ENST00000397396 HEATR5AQ86XA9 2040 aa21.38■■□□□ 1.01
TSPAN4-202ENST00000397396 A0A087WUU8 490 aa21.37■■□□□ 1.01
TSPAN4-202ENST00000397396 B4DXG7 233 aa21.37■■□□□ 1.01
TSPAN4-202ENST00000397396 RASAL1O95294 804 aa21.37■■□□□ 1.01
TSPAN4-202ENST00000397396 IGF2P01344 180 aa21.37■■□□□ 1.01
TSPAN4-202ENST00000397396 GDF1P27539 372 aa21.37■■□□□ 1.01
TSPAN4-202ENST00000397396 FOXF1Q12946 379 aa21.37■■□□□ 1.01
TSPAN4-202ENST00000397396 PPP1R8Q12972 351 aaKnown RBP21.37■■□□□ 1.01
TSPAN4-202ENST00000397396 KCNAB2Q13303 367 aa21.37■■□□□ 1.01
TSPAN4-202ENST00000397396 INAQ16352 499 aa21.37■■□□□ 1.01
TSPAN4-202ENST00000397396 LPCAT4Q643R3 524 aa21.37■■□□□ 1.01
TSPAN4-202ENST00000397396 LINC00114Q6XXX2 140 aa21.37■■□□□ 1.01
TSPAN4-202ENST00000397396 TMEM179BQ7Z7N9 219 aa21.37■■□□□ 1.01
TSPAN4-202ENST00000397396 CDK20Q8IZL9 346 aa21.37■■□□□ 1.01
TSPAN4-202ENST00000397396 GTPBP8Q8N3Z3 284 aaPredicted RBP21.37■■□□□ 1.01
TSPAN4-202ENST00000397396 TMEM255BQ8WV15 326 aa21.37■■□□□ 1.01
TSPAN4-202ENST00000397396 ABHD17AQ96GS6 310 aa21.37■■□□□ 1.01
TSPAN4-202ENST00000397396 PIGQQ9BRB3 760 aa21.37■■□□□ 1.01
TSPAN4-202ENST00000397396 TTTY12Q9BZ98 90 aa21.37■■□□□ 1.01
TSPAN4-202ENST00000397396 UBQLN3Q9H347 655 aa21.37■■□□□ 1.01
TSPAN4-202ENST00000397396 ZNF703Q9H7S9 590 aaPredicted RBP21.37■■□□□ 1.01
TSPAN4-202ENST00000397396 USE1Q9NZ43 259 aa21.37■■□□□ 1.01
TSPAN4-202ENST00000397396 ASPMQ8IZT6 3477 aa21.37■■□□□ 1.01
TSPAN4-202ENST00000397396 TMED7-TICAM2A0A0A6YYA0 188 aa21.36■■□□□ 1.01
TSPAN4-202ENST00000397396 NTN1O95631 604 aa21.36■■□□□ 1.01
TSPAN4-202ENST00000397396 ADAP00813 363 aa21.36■■□□□ 1.01
TSPAN4-202ENST00000397396 ALDH3A2P51648 485 aa21.36■■□□□ 1.01
TSPAN4-202ENST00000397396 DAG1Q14118 895 aa21.36■■□□□ 1.01
TSPAN4-202ENST00000397396 LRRC36Q1X8D7 754 aa21.36■■□□□ 1.01
TSPAN4-202ENST00000397396 OTUD3Q5T2D3 398 aaPredicted RBP21.36■■□□□ 1.01
TSPAN4-202ENST00000397396 PPP4R4Q6NUP7 873 aa21.36■■□□□ 1.01
TSPAN4-202ENST00000397396 Q6ZS92 163 aa21.36■■□□□ 1.01
TSPAN4-202ENST00000397396 CBR4Q8N4T8 237 aa21.36■■□□□ 1.01
TSPAN4-202ENST00000397396 ATG16L2Q8NAA4 619 aa21.36■■□□□ 1.01
TSPAN4-202ENST00000397396 SLC25A43Q8WUT9 341 aaPredicted RBP21.36■■□□□ 1.01
TSPAN4-202ENST00000397396 OR2B2Q9GZK3 357 aa21.36■■□□□ 1.01
TSPAN4-202ENST00000397396 CHRNA9Q9UGM1 479 aa21.36■■□□□ 1.01
TSPAN4-202ENST00000397396 ENOPH1Q9UHY7 261 aa21.36■■□□□ 1.01
TSPAN4-202ENST00000397396 TMED7Q9Y3B3 224 aa21.36■■□□□ 1.01
TSPAN4-202ENST00000397396 ORC6Q9Y5N6 252 aa21.36■■□□□ 1.01
TSPAN4-202ENST00000397396 IGF2RP11717 2491 aa21.36■■□□□ 1.01
TSPAN4-202ENST00000397396 PINLYPA6NC86 204 aa21.35■■□□□ 1.01
TSPAN4-202ENST00000397396 LINC01387J3KSC0 135 aa21.35■■□□□ 1.01
TSPAN4-202ENST00000397396 ZNF208O43345 1280 aa21.35■■□□□ 1.01
TSPAN4-202ENST00000397396 GLSO94925 669 aaPredicted RBP21.35■■□□□ 1.01
TSPAN4-202ENST00000397396 UGT2B15P54855 530 aa21.35■■□□□ 1.01
TSPAN4-202ENST00000397396 FOXD4Q12950 439 aaPredicted RBP21.35■■□□□ 1.01
TSPAN4-202ENST00000397396 SELENBP1Q13228 472 aa21.35■■□□□ 1.01
TSPAN4-202ENST00000397396 TOMM20Q15388 145 aa21.35■■□□□ 1.01
TSPAN4-202ENST00000397396 RFX4Q33E94 735 aa21.35■■□□□ 1.01
TSPAN4-202ENST00000397396 C3orf33Q6P1S2 294 aa21.35■■□□□ 1.01
TSPAN4-202ENST00000397396 C9orf43Q8TAL5 461 aaPredicted RBP21.35■■□□□ 1.01
TSPAN4-202ENST00000397396 STK35Q8TDR2 534 aa21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 48.1 ms