RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000384139.1

RNU6-187P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 187, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-187P, Length 106 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-187P-201ENST00000384139 KLHL4Q9C0H6 718 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-187P-201ENST00000384139 RABEP2Q9H5N1 569 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-187P-201ENST00000384139 FAM124BQ9H5Z6 455 aaPredicted RBP0.05□□□□□ -2.4
RNU6-187P-201ENST00000384139 CLMPQ9H6B4 373 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-187P-201ENST00000384139 SMYD3Q9H7B4 428 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-187P-201ENST00000384139 ZNF442Q9H7R0 627 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-187P-201ENST00000384139 IL26Q9NPH9 171 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-187P-201ENST00000384139 TECRQ9NZ01 308 aaKnown RBP0.05□□□□□ -2.4
RNU6-187P-201ENST00000384139 AIPL1Q9NZN9 384 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-187P-201ENST00000384139 CGNQ9P2M7 1197 aaKnown RBP0.05□□□□□ -2.4
RNU6-187P-201ENST00000384139 ANKMY1Q9P2S6 941 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-187P-201ENST00000384139 CD84Q9UIB8 345 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-187P-201ENST00000384139 DDX19BQ9UMR2 479 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-187P-201ENST00000384139 DIMT1Q9UNQ2 313 aaKnown RBP0.05□□□□□ -2.4
RNU6-187P-201ENST00000384139 COPS3Q9UNS2 423 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-187P-201ENST00000384139 TRAF3IP3Q9Y228 551 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-187P-201ENST00000384139 KLHDC2Q9Y2U9 406 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-187P-201ENST00000384139 YARS2Q9Y2Z4 477 aaKnown RBP0.05□□□□□ -2.4
RNU6-187P-201ENST00000384139 EXOSC1Q9Y3B2 195 aaKnown RBP0.05□□□□□ -2.4
RNU6-187P-201ENST00000384139 HYOU1Q9Y4L1 999 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-187P-201ENST00000384139 GMPPBQ9Y5P6 360 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-187P-201ENST00000384139 HEBP2Q9Y5Z4 205 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-187P-201ENST00000384139 FAM169AQ9Y6X4 670 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-187P-201ENST00000384139 V9GY05 133 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-187P-201ENST00000384139 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP0.05□□□□□ -2.4
RNU6-187P-201ENST00000384139 SH3TC1Q8TE82 1336 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-187P-201ENST00000384139 PASKQ96RG2 1323 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-187P-201ENST00000384139 IGKV1D-37A0A075B6S9 117 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-187P-201ENST00000384139 IGHV3OR16-8A0A075B7F1 116 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-187P-201ENST00000384139 A0A087X0K7 114 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-187P-201ENST00000384139 IGHV5-10-1A0A0J9YXX1 117 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-187P-201ENST00000384139 A0A0U1RQG5 324 aaPredicted RBP0.04□□□□□ -2.4
RNU6-187P-201ENST00000384139 A0A1B0GVI7 797 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-187P-201ENST00000384139 SAGE2PA6NJ88 616 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-187P-201ENST00000384139 SIGLEC16A6NMB1 481 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-187P-201ENST00000384139 C12orf71A8MTZ7 269 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-187P-201ENST00000384139 A8MUU9 505 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-187P-201ENST00000384139 H3BTX0 84 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-187P-201ENST00000384139 H7C417 338 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-187P-201ENST00000384139 SGK1O00141 431 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-187P-201ENST00000384139 RASGRF2O14827 1237 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-187P-201ENST00000384139 POLR1CO15160 346 aaPredicted RBP0.04□□□□□ -2.4
RNU6-187P-201ENST00000384139 TBX19O60806 448 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-187P-201ENST00000384139 PTP4A3O75365 173 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-187P-201ENST00000384139 GMNNO75496 209 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-187P-201ENST00000384139 SCRG1O75711 98 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-187P-201ENST00000384139 EIF3JO75822 258 aaKnown RBP0.04□□□□□ -2.4
RNU6-187P-201ENST00000384139 BEST1O76090 585 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-187P-201ENST00000384139 GLSO94925 669 aaPredicted RBP0.04□□□□□ -2.4
RNU6-187P-201ENST00000384139 KLHL2O95198 593 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-187P-201ENST00000384139 STARD3NLO95772 234 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-187P-201ENST00000384139 CCNE2O96020 404 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-187P-201ENST00000384139 CALCAP01258 141 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-187P-201ENST00000384139 HLA-DQA1P01909 254 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-187P-201ENST00000384139 BGLAPP02818 100 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-187P-201ENST00000384139 HLA-DPB1P04440 258 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-187P-201ENST00000384139 KLK3P07288 261 aaPredicted RBP0.04□□□□□ -2.4
RNU6-187P-201ENST00000384139 CHTF8P0CG12 524 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-187P-201ENST00000384139 CLUP10909 449 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-187P-201ENST00000384139 CSRP1P21291 193 aaKnown RBP0.04□□□□□ -2.4
RNU6-187P-201ENST00000384139 TBXA2RP21731 343 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-187P-201ENST00000384139 PAICSP22234 425 aaKnown RBP0.04□□□□□ -2.4
RNU6-187P-201ENST00000384139 AQP1P29972 269 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-187P-201ENST00000384139 MC5RP33032 325 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-187P-201ENST00000384139 FUSP35637 526 aaKnown RBP eCLIP0.04□□□□□ -2.4
RNU6-187P-201ENST00000384139 OPRD1P41143 372 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-187P-201ENST00000384139 OPRK1P41145 380 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-187P-201ENST00000384139 PRKCIP41743 596 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-187P-201ENST00000384139 GALR1P47211 349 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-187P-201ENST00000384139 CXCL12P48061 93 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-187P-201ENST00000384139 GDI2P50395 445 aaKnown RBP0.04□□□□□ -2.4
RNU6-187P-201ENST00000384139 ATP1B3P54709 279 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-187P-201ENST00000384139 CASP9P55211 416 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-187P-201ENST00000384139 HAND2P61296 217 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-187P-201ENST00000384139 ESRRGP62508 458 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-187P-201ENST00000384139 RPS4XP62701 263 aaKnown RBP0.04□□□□□ -2.4
RNU6-187P-201ENST00000384139 ASIC1P78348 528 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-187P-201ENST00000384139 SLC7A9P82251 487 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-187P-201ENST00000384139 CCZ1BP86790 482 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-187P-201ENST00000384139 CCZ1P86791 482 aaPredicted RBP0.04□□□□□ -2.4
RNU6-187P-201ENST00000384139 SPIBQ01892 262 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-187P-201ENST00000384139 ZNF616Q08AN1 781 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-187P-201ENST00000384139 ASPHQ12797 758 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-187P-201ENST00000384139 CDC20Q12834 499 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-187P-201ENST00000384139 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP0.04□□□□□ -2.4
RNU6-187P-201ENST00000384139 CYTH1Q15438 398 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-187P-201ENST00000384139 STXBP2Q15833 593 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-187P-201ENST00000384139 ATP6AP1Q15904 470 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-187P-201ENST00000384139 ZBED5Q49AG3 693 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-187P-201ENST00000384139 ANKRD20A4Q4UJ75 823 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-187P-201ENST00000384139 BMP2KLQ5H9B9 411 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-187P-201ENST00000384139 ANKRD20A2Q5SQ80 823 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-187P-201ENST00000384139 C1orf100Q5SVJ3 147 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-187P-201ENST00000384139 THEM4Q5T1C6 240 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-187P-201ENST00000384139 CFAP58Q5T655 872 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-187P-201ENST00000384139 N4BP2L1Q5TBK1 243 aaPredicted RBP0.04□□□□□ -2.4
RNU6-187P-201ENST00000384139 ANKRD20A1Q5TYW2 823 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-187P-201ENST00000384139 ANKRD20A3Q5VUR7 823 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-187P-201ENST00000384139 LIPKQ5VXJ0 399 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-187P-201ENST00000384139 KCTD11Q693B1 232 aa0.04□□□□□ -2.4
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.9 ms