RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000367576.5

LTV1-201, Transcript of LTV1 ribosome biogenesis factor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LTV1, Length 1,847 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTV1-201ENST00000367576 HES7Q9BYE0 225 aa16.16■□□□□ 0.18
LTV1-201ENST00000367576 DPH1Q9BZG8 443 aa16.16■□□□□ 0.18
LTV1-201ENST00000367576 Q9H521 79 aa16.16■□□□□ 0.18
LTV1-201ENST00000367576 MEPEQ9NQ76 525 aaPredicted RBP16.16■□□□□ 0.18
LTV1-201ENST00000367576 IGKV1D-42A0A075B6H8 117 aa16.15■□□□□ 0.18
LTV1-201ENST00000367576 A0A087WUJ7 227 aa16.15■□□□□ 0.18
LTV1-201ENST00000367576 MAKP20794 623 aa16.15■□□□□ 0.18
LTV1-201ENST00000367576 POU1F1P28069 291 aa16.15■□□□□ 0.18
LTV1-201ENST00000367576 IFNGR2P38484 337 aa16.15■□□□□ 0.18
LTV1-201ENST00000367576 ZNF41P51814 821 aaPredicted RBP16.15■□□□□ 0.18
LTV1-201ENST00000367576 SUMO3P55854 103 aaPredicted RBP16.15■□□□□ 0.18
LTV1-201ENST00000367576 FOXF1Q12946 379 aa16.15■□□□□ 0.18
LTV1-201ENST00000367576 SLC36A3Q495N2 470 aa16.15■□□□□ 0.18
LTV1-201ENST00000367576 SWT1Q5T5J6 900 aaKnown RBP16.15■□□□□ 0.18
LTV1-201ENST00000367576 C1orf94Q6P1W5 598 aa16.15■□□□□ 0.18
LTV1-201ENST00000367576 TMEM81Q6P7N7 255 aa16.15■□□□□ 0.18
LTV1-201ENST00000367576 GNPDA2Q8TDQ7 276 aa16.15■□□□□ 0.18
LTV1-201ENST00000367576 DEPPQ9NTK1 212 aa16.15■□□□□ 0.18
LTV1-201ENST00000367576 MED17Q9NVC6 651 aa16.15■□□□□ 0.18
LTV1-201ENST00000367576 OSGIN1Q9UJX0 560 aa16.15■□□□□ 0.18
LTV1-201ENST00000367576 PCDHGB5Q9Y5G0 923 aa16.15■□□□□ 0.18
LTV1-201ENST00000367576 CPAMD8Q8IZJ3 1885 aa16.15■□□□□ 0.18
LTV1-201ENST00000367576 IGLV3-32A0A0A0MS00 114 aa16.15■□□□□ 0.18
LTV1-201ENST00000367576 ENO4A6NNW6 628 aa16.15■□□□□ 0.18
LTV1-201ENST00000367576 NEURL1O76050 574 aa16.15■□□□□ 0.18
LTV1-201ENST00000367576 PLA2G5P39877 138 aa16.15■□□□□ 0.18
LTV1-201ENST00000367576 CRYZQ08257 329 aaKnown RBP16.15■□□□□ 0.18
LTV1-201ENST00000367576 LINC00114Q6XXX2 140 aa16.15■□□□□ 0.18
LTV1-201ENST00000367576 PLCZ1Q86YW0 608 aa16.15■□□□□ 0.18
LTV1-201ENST00000367576 CHERPQ8IWX8 916 aaKnown RBP16.15■□□□□ 0.18
LTV1-201ENST00000367576 FDCSPQ8NFU4 85 aa16.15■□□□□ 0.18
LTV1-201ENST00000367576 OR5M1Q8NGP8 315 aa16.15■□□□□ 0.18
LTV1-201ENST00000367576 SLC39A7Q92504 469 aa16.15■□□□□ 0.18
LTV1-201ENST00000367576 HS6ST2Q96MM7 605 aa16.15■□□□□ 0.18
LTV1-201ENST00000367576 ZNF426Q9BUY5 554 aa16.15■□□□□ 0.18
LTV1-201ENST00000367576 ADAM19Q9H013 955 aa16.15■□□□□ 0.18
LTV1-201ENST00000367576 CCDC86Q9H6F5 360 aaKnown RBP16.15■□□□□ 0.18
LTV1-201ENST00000367576 TIMMDC1Q9NPL8 285 aa16.15■□□□□ 0.18
LTV1-201ENST00000367576 KLHL1Q9NR64 748 aa16.15■□□□□ 0.18
LTV1-201ENST00000367576 REV1Q9UBZ9 1251 aa16.15■□□□□ 0.18
LTV1-201ENST00000367576 LRCH1Q9Y2L9 728 aa16.15■□□□□ 0.18
LTV1-201ENST00000367576 LRRN3E7EW58 273 aa16.14■□□□□ 0.17
LTV1-201ENST00000367576 CDC42EP2O14613 210 aa16.14■□□□□ 0.17
LTV1-201ENST00000367576 BCKDKO14874 412 aa16.14■□□□□ 0.17
LTV1-201ENST00000367576 SNPHO15079 494 aa16.14■□□□□ 0.17
LTV1-201ENST00000367576 SLC25A12O75746 678 aa16.14■□□□□ 0.17
LTV1-201ENST00000367576 PNMTP11086 282 aa16.14■□□□□ 0.17
LTV1-201ENST00000367576 PRKCAP17252 672 aa16.14■□□□□ 0.17
LTV1-201ENST00000367576 CXCR1P25024 350 aa16.14■□□□□ 0.17
LTV1-201ENST00000367576 MSX1P28360 303 aa16.14■□□□□ 0.17
LTV1-201ENST00000367576 EIF2S3P41091 472 aaKnown RBP16.14■□□□□ 0.17
LTV1-201ENST00000367576 RBM34P42696 430 aaKnown RBP16.14■□□□□ 0.17
LTV1-201ENST00000367576 FOXK1P85037 733 aa16.14■□□□□ 0.17
LTV1-201ENST00000367576 NPRL3Q12980 569 aa16.14■□□□□ 0.17
LTV1-201ENST00000367576 SPACA3Q8IXA5 215 aa16.14■□□□□ 0.17
LTV1-201ENST00000367576 FADS6Q8N9I5 356 aa16.14■□□□□ 0.17
LTV1-201ENST00000367576 OR1J4Q8NGS1 313 aa16.14■□□□□ 0.17
LTV1-201ENST00000367576 BPIFA2Q96DR5 249 aa16.14■□□□□ 0.17
LTV1-201ENST00000367576 FRMD6Q96NE9 622 aa16.14■□□□□ 0.17
LTV1-201ENST00000367576 GNRHR2Q96P88 292 aa16.14■□□□□ 0.17
LTV1-201ENST00000367576 GABARAPL3Q9BY60 117 aa16.14■□□□□ 0.17
LTV1-201ENST00000367576 ZNF552Q9H707 407 aaPredicted RBP16.14■□□□□ 0.17
LTV1-201ENST00000367576 KRCC1Q9NPI7 259 aaPredicted RBP16.14■□□□□ 0.17
LTV1-201ENST00000367576 MED13Q9UHV7 2174 aa16.13■□□□□ 0.17
LTV1-201ENST00000367576 TMED7-TICAM2A0A0A6YYA0 188 aa16.13■□□□□ 0.17
LTV1-201ENST00000367576 PINLYPA6NC86 204 aa16.13■□□□□ 0.17
LTV1-201ENST00000367576 H3BN98 237 aa16.13■□□□□ 0.17
LTV1-201ENST00000367576 POLR2HP52434 150 aaKnown RBP16.13■□□□□ 0.17
LTV1-201ENST00000367576 TPD52P55327 224 aaPredicted RBP16.13■□□□□ 0.17
LTV1-201ENST00000367576 SOX8P57073 446 aa16.13■□□□□ 0.17
LTV1-201ENST00000367576 PRKCDQ05655 676 aa16.13■□□□□ 0.17
LTV1-201ENST00000367576 MFAP5Q13361 173 aa16.13■□□□□ 0.17
LTV1-201ENST00000367576 MED21Q13503 144 aa16.13■□□□□ 0.17
LTV1-201ENST00000367576 CRTC2Q53ET0 693 aaPredicted RBP16.13■□□□□ 0.17
LTV1-201ENST00000367576 TMEM236Q5W0B7 351 aa16.13■□□□□ 0.17
LTV1-201ENST00000367576 CCDC81Q6ZN84 652 aa16.13■□□□□ 0.17
LTV1-201ENST00000367576 GRINAQ7Z429 371 aa16.13■□□□□ 0.17
LTV1-201ENST00000367576 KIF18BQ86Y91 864 aa16.13■□□□□ 0.17
LTV1-201ENST00000367576 OR13C2Q8NGS9 318 aa16.13■□□□□ 0.17
LTV1-201ENST00000367576 TMEM234Q8WY98 164 aa16.13■□□□□ 0.17
LTV1-201ENST00000367576 C1GALT1C1Q96EU7 318 aa16.13■□□□□ 0.17
LTV1-201ENST00000367576 EGLN3Q9H6Z9 239 aa16.13■□□□□ 0.17
LTV1-201ENST00000367576 TMED7Q9Y3B3 224 aa16.13■□□□□ 0.17
LTV1-201ENST00000367576 KCNMB2Q9Y691 235 aa16.13■□□□□ 0.17
LTV1-201ENST00000367576 LOC100130705A0A1B0GUX0 176 aa16.12■□□□□ 0.17
LTV1-201ENST00000367576 TMEM72A0PK05 275 aa16.12■□□□□ 0.17
LTV1-201ENST00000367576 ANKRD33BA6NCL7 494 aa16.12■□□□□ 0.17
LTV1-201ENST00000367576 FAM47E-STBD1D6RA91 191 aa16.12■□□□□ 0.17
LTV1-201ENST00000367576 KLF4O43474 513 aa16.12■□□□□ 0.17
LTV1-201ENST00000367576 DENRO43583 198 aaKnown RBP16.12■□□□□ 0.17
LTV1-201ENST00000367576 SUSD5O60279 629 aa16.12■□□□□ 0.17
LTV1-201ENST00000367576 TP53P04637 393 aaPredicted RBP16.12■□□□□ 0.17
LTV1-201ENST00000367576 SAGP10523 405 aaPredicted RBP16.12■□□□□ 0.17
LTV1-201ENST00000367576 OSMP13725 252 aa16.12■□□□□ 0.17
LTV1-201ENST00000367576 CHMP24386 653 aa16.12■□□□□ 0.17
LTV1-201ENST00000367576 FPR3P25089 353 aa16.12■□□□□ 0.17
LTV1-201ENST00000367576 TSPAN31Q12999 210 aa16.12■□□□□ 0.17
LTV1-201ENST00000367576 PLPPR5Q32ZL2 321 aa16.12■□□□□ 0.17
LTV1-201ENST00000367576 RNF113BQ8IZP6 322 aaKnown RBP16.12■□□□□ 0.17
LTV1-201ENST00000367576 C10orf53Q8N6V4 93 aa16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.4 ms