RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000366955.7

CENPF-201, Transcript of centromere protein F, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CENPF, Length 10,307 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPF-201ENST00000366955 TMIGD3P0DMS9 266 aaPredicted RBP3.85□□□□□ -1.79
CENPF-201ENST00000366955 SLURP2P0DP57 97 aa3.85□□□□□ -1.79
CENPF-201ENST00000366955 ETS2P15036 469 aa3.85□□□□□ -1.79
CENPF-201ENST00000366955 ELAVL4P26378 380 aaKnown RBP3.85□□□□□ -1.79
CENPF-201ENST00000366955 BCL6P41182 706 aa3.85□□□□□ -1.79
CENPF-201ENST00000366955 SSTP61278 116 aa3.85□□□□□ -1.79
CENPF-201ENST00000366955 MOGSQ13724 837 aa3.85□□□□□ -1.79
CENPF-201ENST00000366955 GGTLC2Q14390 218 aa3.85□□□□□ -1.79
CENPF-201ENST00000366955 MBTPS1Q14703 1052 aa3.85□□□□□ -1.79
CENPF-201ENST00000366955 CDNFQ49AH0 187 aa3.85□□□□□ -1.79
CENPF-201ENST00000366955 ZNF836Q6ZNA1 936 aa3.85□□□□□ -1.79
CENPF-201ENST00000366955 FAM83HQ6ZRV2 1179 aaPredicted RBP3.85□□□□□ -1.79
CENPF-201ENST00000366955 RPL3LQ92901 407 aaKnown RBP3.85□□□□□ -1.79
CENPF-201ENST00000366955 UTP4Q969X6 686 aaKnown RBP3.85□□□□□ -1.79
CENPF-201ENST00000366955 SNX18Q96RF0 628 aa3.85□□□□□ -1.79
CENPF-201ENST00000366955 MYADMQ96S97 322 aa3.85□□□□□ -1.79
CENPF-201ENST00000366955 SSX3Q99909 188 aa3.85□□□□□ -1.79
CENPF-201ENST00000366955 PKP2Q99959 881 aa3.85□□□□□ -1.79
CENPF-201ENST00000366955 CHST8Q9H2A9 424 aa3.85□□□□□ -1.79
CENPF-201ENST00000366955 RANBP3Q9H6Z4 567 aaPredicted RBP3.85□□□□□ -1.79
CENPF-201ENST00000366955 VSX1Q9NZR4 365 aaPredicted RBP3.85□□□□□ -1.79
CENPF-201ENST00000366955 METRNQ9UJH8 293 aa3.85□□□□□ -1.79
CENPF-201ENST00000366955 SLC6A5Q9Y345 797 aa3.85□□□□□ -1.79
CENPF-201ENST00000366955 PRAMEF33A0A0G2JMD5 474 aa3.85□□□□□ -1.79
CENPF-201ENST00000366955 AQP7O14520 342 aa3.85□□□□□ -1.79
CENPF-201ENST00000366955 FTH1P19P0C7X4 201 aa3.85□□□□□ -1.79
CENPF-201ENST00000366955 TPMTP51580 245 aa3.85□□□□□ -1.79
CENPF-201ENST00000366955 PRSS12P56730 875 aa3.85□□□□□ -1.79
CENPF-201ENST00000366955 PPP1CAP62136 330 aa3.85□□□□□ -1.79
CENPF-201ENST00000366955 TBPL1P62380 186 aa3.85□□□□□ -1.79
CENPF-201ENST00000366955 ACTC1P68032 377 aa3.85□□□□□ -1.79
CENPF-201ENST00000366955 ACTA1P68133 377 aa3.85□□□□□ -1.79
CENPF-201ENST00000366955 GBE1Q04446 702 aa3.85□□□□□ -1.79
CENPF-201ENST00000366955 ILKQ13418 452 aa3.85□□□□□ -1.79
CENPF-201ENST00000366955 TRAM1Q15629 374 aa3.85□□□□□ -1.79
CENPF-201ENST00000366955 ASTE1Q2TB18 679 aaPredicted RBP3.85□□□□□ -1.79
CENPF-201ENST00000366955 C3orf58Q8NDZ4 430 aa3.85□□□□□ -1.79
CENPF-201ENST00000366955 TMEM104Q8NE00 496 aa3.85□□□□□ -1.79
CENPF-201ENST00000366955 LRTOMTQ8WZ04 291 aa3.85□□□□□ -1.79
CENPF-201ENST00000366955 LGALS12Q96DT0 336 aa3.85□□□□□ -1.79
CENPF-201ENST00000366955 GRAMD2BQ96HH9 432 aa3.85□□□□□ -1.79
CENPF-201ENST00000366955 TMEM246Q9BRR3 403 aa3.85□□□□□ -1.79
CENPF-201ENST00000366955 SLC22A11Q9NSA0 550 aa3.85□□□□□ -1.79
CENPF-201ENST00000366955 RNF150Q9ULK6 438 aa3.85□□□□□ -1.79
CENPF-201ENST00000366955 PIGLQ9Y2B2 252 aa3.85□□□□□ -1.79
CENPF-201ENST00000366955 ZNF831Q5JPB2 1677 aa3.85□□□□□ -1.79
CENPF-201ENST00000366955 LRP5O75197 1615 aa3.85□□□□□ -1.79
CENPF-201ENST00000366955 A0A0D9SEW6 157 aa3.85□□□□□ -1.79
CENPF-201ENST00000366955 FABP12A6NFH5 140 aa3.85□□□□□ -1.79
CENPF-201ENST00000366955 CENPBD1B2RD01 187 aa3.85□□□□□ -1.79
CENPF-201ENST00000366955 G3V3Y1 287 aa3.85□□□□□ -1.79
CENPF-201ENST00000366955 XRCC2O43543 280 aa3.85□□□□□ -1.79
CENPF-201ENST00000366955 SP9P0CG40 484 aa3.85□□□□□ -1.79
CENPF-201ENST00000366955 UBCP0CG48 685 aaKnown RBP3.85□□□□□ -1.79
CENPF-201ENST00000366955 RAP2AP10114 183 aa3.85□□□□□ -1.79
CENPF-201ENST00000366955 RAP2BP61225 183 aa3.85□□□□□ -1.79
CENPF-201ENST00000366955 RTP5Q14D33 572 aa3.85□□□□□ -1.79
CENPF-201ENST00000366955 RAD9BQ6WBX8 426 aa3.85□□□□□ -1.79
CENPF-201ENST00000366955 COMTD1Q86VU5 262 aa3.85□□□□□ -1.79
CENPF-201ENST00000366955 NPAS3Q8IXF0 933 aa3.85□□□□□ -1.79
CENPF-201ENST00000366955 PHTF2Q8N3S3 785 aa3.85□□□□□ -1.79
CENPF-201ENST00000366955 TRUB1Q8WWH5 349 aaKnown RBP3.85□□□□□ -1.79
CENPF-201ENST00000366955 FKBP10Q96AY3 582 aa3.85□□□□□ -1.79
CENPF-201ENST00000366955 MRPS24Q96EL2 167 aaKnown RBP3.85□□□□□ -1.79
CENPF-201ENST00000366955 ASB16Q96NS5 453 aa3.85□□□□□ -1.79
CENPF-201ENST00000366955 PIP5K1AQ99755 562 aa3.85□□□□□ -1.79
CENPF-201ENST00000366955 LHPPQ9H008 270 aa3.85□□□□□ -1.79
CENPF-201ENST00000366955 TSPAN10Q9H1Z9 355 aaPredicted RBP3.85□□□□□ -1.79
CENPF-201ENST00000366955 SMOC1Q9H4F8 434 aa3.85□□□□□ -1.79
CENPF-201ENST00000366955 MYOZ1Q9NP98 299 aaPredicted RBP3.85□□□□□ -1.79
CENPF-201ENST00000366955 UBQLN4Q9NRR5 601 aa3.85□□□□□ -1.79
CENPF-201ENST00000366955 ZFP57Q9NU63 452 aa3.85□□□□□ -1.79
CENPF-201ENST00000366955 SLC17A6Q9P2U8 582 aa3.85□□□□□ -1.79
CENPF-201ENST00000366955 AMMECR1Q9Y4X0 333 aaPredicted RBP3.85□□□□□ -1.79
CENPF-201ENST00000366955 NUP98P52948 1817 aa3.85□□□□□ -1.79
CENPF-201ENST00000366955 NUMA1Q14980 2115 aa3.85□□□□□ -1.79
CENPF-201ENST00000366955 TRBV23-1A0A0A0MS06 115 aa3.85□□□□□ -1.79
CENPF-201ENST00000366955 OR6C65A6NJZ3 312 aa3.85□□□□□ -1.79
CENPF-201ENST00000366955 HSPB6O14558 160 aa3.85□□□□□ -1.79
CENPF-201ENST00000366955 SUSD5O60279 629 aa3.85□□□□□ -1.79
CENPF-201ENST00000366955 SNNO75324 88 aaPredicted RBP3.85□□□□□ -1.79
CENPF-201ENST00000366955 FKBP2P26885 142 aaKnown RBP3.85□□□□□ -1.79
CENPF-201ENST00000366955 PPT1P50897 306 aa3.85□□□□□ -1.79
CENPF-201ENST00000366955 CCL7P80098 99 aa3.85□□□□□ -1.79
CENPF-201ENST00000366955 MADCAM1Q13477 382 aa3.85□□□□□ -1.79
CENPF-201ENST00000366955 SSPNQ14714 243 aa3.85□□□□□ -1.79
CENPF-201ENST00000366955 CSNK2A3Q8NEV1 391 aa3.85□□□□□ -1.79
CENPF-201ENST00000366955 OR51A7Q8NH64 312 aa3.85□□□□□ -1.79
CENPF-201ENST00000366955 WDR20Q8TBZ3 569 aa3.85□□□□□ -1.79
CENPF-201ENST00000366955 MAL2Q969L2 176 aa3.85□□□□□ -1.79
CENPF-201ENST00000366955 MS4A4AQ96JQ5 239 aa3.85□□□□□ -1.79
CENPF-201ENST00000366955 CCDC74BQ96LY2 380 aa3.85□□□□□ -1.79
CENPF-201ENST00000366955 DDX31Q9H8H2 851 aaKnown RBP3.85□□□□□ -1.79
CENPF-201ENST00000366955 SIRT5Q9NXA8 310 aa3.85□□□□□ -1.79
CENPF-201ENST00000366955 ETAA1Q9NY74 926 aa3.85□□□□□ -1.79
CENPF-201ENST00000366955 COMMD3Q9UBI1 195 aa3.85□□□□□ -1.79
CENPF-201ENST00000366955 DHCR7Q9UBM7 475 aaKnown RBP3.85□□□□□ -1.79
CENPF-201ENST00000366955 SLC23A2Q9UGH3 650 aa3.85□□□□□ -1.79
CENPF-201ENST00000366955 CHRNA9Q9UGM1 479 aa3.85□□□□□ -1.79
CENPF-201ENST00000366955 TRAF3IP2O43734 574 aaPredicted RBP3.85□□□□□ -1.79
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.2 ms