RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000348564.10

PTPRC-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRC, Length 4,626 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-201ENST00000348564 SRD5A2P31213 254 aa4.05□□□□□ -1.76
PTPRC-201ENST00000348564 CDH12P55289 794 aa4.05□□□□□ -1.76
PTPRC-201ENST00000348564 RPS23P62266 143 aaKnown RBP4.05□□□□□ -1.76
PTPRC-201ENST00000348564 SPNS3Q6ZMD2 512 aa4.05□□□□□ -1.76
PTPRC-201ENST00000348564 OR9I1Q8NGQ6 314 aa4.05□□□□□ -1.76
PTPRC-201ENST00000348564 NT5CQ8TCD5 201 aa4.05□□□□□ -1.76
PTPRC-201ENST00000348564 FAM131CQ96AQ9 280 aa4.05□□□□□ -1.76
PTPRC-201ENST00000348564 ARSGQ96EG1 525 aa4.05□□□□□ -1.76
PTPRC-201ENST00000348564 WBP1Q96G27 269 aa4.05□□□□□ -1.76
PTPRC-201ENST00000348564 OR7D2Q96RA2 312 aa4.05□□□□□ -1.76
PTPRC-201ENST00000348564 GAL3ST1Q99999 423 aa4.05□□□□□ -1.76
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PTPRC-201ENST00000348564 PNPLA3Q9NST1 481 aa4.05□□□□□ -1.76
PTPRC-201ENST00000348564 GPC6Q9Y625 555 aaPredicted RBP4.05□□□□□ -1.76
PTPRC-201ENST00000348564 F5H5K5 113 aa4.05□□□□□ -1.76
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PTPRC-201ENST00000348564 SDHDO14521 159 aa4.05□□□□□ -1.76
PTPRC-201ENST00000348564 CASQ2O14958 399 aaPredicted RBP4.05□□□□□ -1.76
PTPRC-201ENST00000348564 ATP5HO75947 161 aa4.05□□□□□ -1.76
PTPRC-201ENST00000348564 AKR7A3O95154 331 aa4.05□□□□□ -1.76
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PTPRC-201ENST00000348564 TACR1P25103 407 aa4.05□□□□□ -1.76
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PTPRC-201ENST00000348564 GRB7Q14451 532 aa4.05□□□□□ -1.76
PTPRC-201ENST00000348564 IFI44LQ53G44 452 aa4.05□□□□□ -1.76
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PTPRC-201ENST00000348564 METTL21CQ5VZV1 264 aa4.05□□□□□ -1.76
PTPRC-201ENST00000348564 KANK2Q63ZY3 851 aa4.05□□□□□ -1.76
PTPRC-201ENST00000348564 HIST2H2BCQ6DN03 193 aa4.05□□□□□ -1.76
PTPRC-201ENST00000348564 TYW3Q6IPR3 259 aaKnown RBP4.05□□□□□ -1.76
PTPRC-201ENST00000348564 C3orf33Q6P1S2 294 aa4.05□□□□□ -1.76
PTPRC-201ENST00000348564 CDH24Q86UP0 819 aa4.05□□□□□ -1.76
PTPRC-201ENST00000348564 APLFQ8IW19 511 aaPredicted RBP4.05□□□□□ -1.76
PTPRC-201ENST00000348564 LRRC18Q8N456 261 aa4.05□□□□□ -1.76
PTPRC-201ENST00000348564 OR1J2Q8NGS2 313 aa4.05□□□□□ -1.76
PTPRC-201ENST00000348564 BBS10Q8TAM1 723 aa4.05□□□□□ -1.76
PTPRC-201ENST00000348564 SLC25A43Q8WUT9 341 aaPredicted RBP4.05□□□□□ -1.76
PTPRC-201ENST00000348564 RCN3Q96D15 328 aa4.05□□□□□ -1.76
PTPRC-201ENST00000348564 SGTBQ96EQ0 304 aa4.05□□□□□ -1.76
PTPRC-201ENST00000348564 TMEM19Q96HH6 336 aa4.05□□□□□ -1.76
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PTPRC-201ENST00000348564 B3GNT4Q9C0J1 378 aa4.05□□□□□ -1.76
PTPRC-201ENST00000348564 BHLHE41Q9C0J9 482 aaPredicted RBP4.05□□□□□ -1.76
PTPRC-201ENST00000348564 ZNF700Q9H0M5 742 aa4.05□□□□□ -1.76
PTPRC-201ENST00000348564 QRSL1Q9H0R6 528 aaKnown RBP4.05□□□□□ -1.76
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PTPRC-201ENST00000348564 IGHV3-64DA0A0J9YX35 117 aa4.05□□□□□ -1.76
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PTPRC-201ENST00000348564 PTDSS1P48651 473 aaKnown RBP4.05□□□□□ -1.76
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PTPRC-201ENST00000348564 TRAF3Q13114 568 aa4.05□□□□□ -1.76
PTPRC-201ENST00000348564 METTL2BQ6P1Q9 378 aaKnown RBP4.05□□□□□ -1.76
PTPRC-201ENST00000348564 MRPL21Q7Z2W9 205 aaKnown RBP4.05□□□□□ -1.76
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PTPRC-201ENST00000348564 LACC1Q8IV20 430 aa4.05□□□□□ -1.76
PTPRC-201ENST00000348564 ZNF555Q8NEP9 628 aa4.05□□□□□ -1.76
PTPRC-201ENST00000348564 OR10D3Q8NH80 312 aa4.05□□□□□ -1.76
PTPRC-201ENST00000348564 NUDT8Q8WV74 236 aa4.05□□□□□ -1.76
PTPRC-201ENST00000348564 SARGQ9BW04 601 aa4.05□□□□□ -1.76
PTPRC-201ENST00000348564 OR11A1Q9GZK7 315 aa4.05□□□□□ -1.76
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PTPRC-201ENST00000348564 DDX31Q9H8H2 851 aaKnown RBP4.05□□□□□ -1.76
PTPRC-201ENST00000348564 EXOSC4Q9NPD3 245 aaKnown RBP4.05□□□□□ -1.76
PTPRC-201ENST00000348564 SAR1AQ9NR31 198 aa4.05□□□□□ -1.76
PTPRC-201ENST00000348564 ARL8BQ9NVJ2 186 aa4.05□□□□□ -1.76
PTPRC-201ENST00000348564 DNAJC27Q9NZQ0 273 aa4.05□□□□□ -1.76
PTPRC-201ENST00000348564 EYSQ5T1H1 3165 aa4.05□□□□□ -1.76
PTPRC-201ENST00000348564 hCG_2039718K7EN88 272 aa4.04□□□□□ -1.76
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PTPRC-201ENST00000348564 NAGAP17050 411 aa4.04□□□□□ -1.76
PTPRC-201ENST00000348564 MSX2P35548 267 aaPredicted RBP4.04□□□□□ -1.76
PTPRC-201ENST00000348564 SLC6A12P48065 614 aa4.04□□□□□ -1.76
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PTPRC-201ENST00000348564 WNT3P56703 355 aa4.04□□□□□ -1.76
PTPRC-201ENST00000348564 KLF10Q13118 480 aa4.04□□□□□ -1.76
PTPRC-201ENST00000348564 SELENBP1Q13228 472 aa4.04□□□□□ -1.76
PTPRC-201ENST00000348564 SQSTM1Q13501 440 aa4.04□□□□□ -1.76
PTPRC-201ENST00000348564 TIGD6Q17RP2 521 aa4.04□□□□□ -1.76
PTPRC-201ENST00000348564 GLYATQ6IB77 296 aa4.04□□□□□ -1.76
PTPRC-201ENST00000348564 ARSKQ6UWY0 536 aa4.04□□□□□ -1.76
PTPRC-201ENST00000348564 ESPNLQ6ZVH7 1005 aa4.04□□□□□ -1.76
PTPRC-201ENST00000348564 TIGD4Q8IY51 512 aa4.04□□□□□ -1.76
PTPRC-201ENST00000348564 CACTIN-AS1Q8N1I8 211 aa4.04□□□□□ -1.76
PTPRC-201ENST00000348564 AMER3Q8N944 861 aa4.04□□□□□ -1.76
PTPRC-201ENST00000348564 L3MBTL4Q8NA19 623 aa4.04□□□□□ -1.76
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