RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000338546.9

HPS1-202, Transcript of HPS1, biogenesis of lysosomal organelles complex 3 subunit 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HPS1, Length 1,580 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS1-202ENST00000338546 ELOA3Q8NG57 546 aa14.87□□□□□ -0.03
HPS1-202ENST00000338546 STRADBQ9C0K7 418 aa14.87□□□□□ -0.03
HPS1-202ENST00000338546 CMC2Q9NRP2 79 aa14.87□□□□□ -0.03
HPS1-202ENST00000338546 SLC39A1Q9NY26 324 aa14.87□□□□□ -0.03
HPS1-202ENST00000338546 H2AFY2Q9P0M6 372 aaPredicted RBP14.87□□□□□ -0.03
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HPS1-202ENST00000338546 A0A1W2PPW3 197 aa14.86□□□□□ -0.03
HPS1-202ENST00000338546 CDC14CA4D256 554 aa14.86□□□□□ -0.03
HPS1-202ENST00000338546 CDC40O60508 579 aaKnown RBP eCLIP14.86□□□□□ -0.03
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HPS1-202ENST00000338546 BCL10O95999 233 aa14.86□□□□□ -0.03
HPS1-202ENST00000338546 ZNF806P0C7X5 589 aa14.86□□□□□ -0.03
HPS1-202ENST00000338546 CCL4P13236 92 aa14.86□□□□□ -0.03
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HPS1-202ENST00000338546 EVI2BP34910 448 aa14.86□□□□□ -0.03
HPS1-202ENST00000338546 TGFBR2P37173 567 aa14.86□□□□□ -0.03
HPS1-202ENST00000338546 GAS1P54826 345 aa14.86□□□□□ -0.03
HPS1-202ENST00000338546 CDH11P55287 796 aa14.86□□□□□ -0.03
HPS1-202ENST00000338546 KHDRBS1Q07666 443 aaKnown RBP eCLIP14.86□□□□□ -0.03
HPS1-202ENST00000338546 ISXQ2M1V0 245 aa14.86□□□□□ -0.03
HPS1-202ENST00000338546 LCN10Q6JVE6 187 aa14.86□□□□□ -0.03
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HPS1-202ENST00000338546 SLC46A3Q7Z3Q1 461 aa14.86□□□□□ -0.03
HPS1-202ENST00000338546 HEATR5AQ86XA9 2040 aa14.86□□□□□ -0.03
HPS1-202ENST00000338546 NANOGP1Q8N7R0 232 aa14.86□□□□□ -0.03
HPS1-202ENST00000338546 OR52I1Q8NGK6 324 aa14.86□□□□□ -0.03
HPS1-202ENST00000338546 OR13C2Q8NGS9 318 aa14.86□□□□□ -0.03
HPS1-202ENST00000338546 OR5W2Q8NH69 310 aa14.86□□□□□ -0.03
HPS1-202ENST00000338546 TTC9Q92623 222 aa14.86□□□□□ -0.03
HPS1-202ENST00000338546 ATOH1Q92858 354 aaPredicted RBP14.86□□□□□ -0.03
HPS1-202ENST00000338546 TMCO6Q96DC7 493 aa14.86□□□□□ -0.03
HPS1-202ENST00000338546 LGALS12Q96DT0 336 aa14.86□□□□□ -0.03
HPS1-202ENST00000338546 ARSGQ96EG1 525 aa14.86□□□□□ -0.03
HPS1-202ENST00000338546 IFT27Q9BW83 186 aa14.86□□□□□ -0.03
HPS1-202ENST00000338546 JAM3Q9BX67 310 aa14.86□□□□□ -0.03
HPS1-202ENST00000338546 CHCHD3Q9NX63 227 aaKnown RBP14.86□□□□□ -0.03
HPS1-202ENST00000338546 EXOSC1Q9Y3B2 195 aaKnown RBP14.86□□□□□ -0.03
HPS1-202ENST00000338546 ZNF337Q9Y3M9 751 aa14.86□□□□□ -0.03
HPS1-202ENST00000338546 OR7A10O76100 309 aa14.85□□□□□ -0.03
HPS1-202ENST00000338546 IGHEP01854 428 aa14.85□□□□□ -0.03
HPS1-202ENST00000338546 PEPDP12955 493 aa14.85□□□□□ -0.03
HPS1-202ENST00000338546 CD59P13987 128 aa14.85□□□□□ -0.03
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HPS1-202ENST00000338546 ZNF117Q03924 483 aa14.85□□□□□ -0.03
HPS1-202ENST00000338546 FHL1Q13642 323 aa14.85□□□□□ -0.03
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HPS1-202ENST00000338546 ARMCX4Q5H9R4 360 aa14.85□□□□□ -0.03
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HPS1-202ENST00000338546 ARHGAP11AQ6P4F7 1023 aa14.85□□□□□ -0.03
HPS1-202ENST00000338546 C19orf48Q6RUI8 117 aa14.85□□□□□ -0.03
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HPS1-202ENST00000338546 SLC15A4Q8N697 577 aa14.85□□□□□ -0.03
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HPS1-202ENST00000338546 RNF138Q8WVD3 245 aa14.85□□□□□ -0.03
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HPS1-202ENST00000338546 RNFT2Q96EX2 444 aa14.85□□□□□ -0.03
HPS1-202ENST00000338546 MGLLQ99685 303 aa14.85□□□□□ -0.03
HPS1-202ENST00000338546 ISYNA1Q9NPH2 558 aa14.85□□□□□ -0.03
HPS1-202ENST00000338546 EXOGQ9Y2C4 368 aaKnown RBP14.85□□□□□ -0.03
HPS1-202ENST00000338546 LSM2Q9Y333 95 aaKnown RBP14.85□□□□□ -0.03
HPS1-202ENST00000338546 TMEM129A0AVI4 362 aa14.85□□□□□ -0.03
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HPS1-202ENST00000338546 HCRTR2O43614 444 aa14.85□□□□□ -0.03
HPS1-202ENST00000338546 IDH3BO43837 385 aa14.85□□□□□ -0.03
HPS1-202ENST00000338546 CH25HO95992 272 aa14.85□□□□□ -0.03
HPS1-202ENST00000338546 IFNGP01579 166 aa14.85□□□□□ -0.03
HPS1-202ENST00000338546 SCG5P05408 212 aa14.85□□□□□ -0.03
HPS1-202ENST00000338546 ZNF28P17035 718 aa14.85□□□□□ -0.03
HPS1-202ENST00000338546 HK1P19367 917 aa14.85□□□□□ -0.03
HPS1-202ENST00000338546 FUT1P19526 365 aa14.85□□□□□ -0.03
HPS1-202ENST00000338546 LIPAP38571 399 aa14.85□□□□□ -0.03
HPS1-202ENST00000338546 TMED10P49755 219 aaKnown RBP14.85□□□□□ -0.03
HPS1-202ENST00000338546 RGS6P49758 472 aa14.85□□□□□ -0.03
HPS1-202ENST00000338546 P2RX1P51575 399 aa14.85□□□□□ -0.03
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HPS1-202ENST00000338546 SUMO3P55854 103 aaPredicted RBP14.85□□□□□ -0.03
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HPS1-202ENST00000338546 TIMM50Q3ZCQ8 353 aa14.85□□□□□ -0.03
HPS1-202ENST00000338546 FAM198BQ6UWH4 519 aa14.85□□□□□ -0.03
HPS1-202ENST00000338546 DPY19L2P2Q6ZN68 376 aa14.85□□□□□ -0.03
HPS1-202ENST00000338546 CXXC5Q7LFL8 322 aaKnown RBP14.85□□□□□ -0.03
HPS1-202ENST00000338546 BCDIN3DQ7Z5W3 292 aaKnown RBP14.85□□□□□ -0.03
HPS1-202ENST00000338546 MARCH3Q86UD3 253 aa14.85□□□□□ -0.03
HPS1-202ENST00000338546 ZNF563Q8TA94 476 aa14.85□□□□□ -0.03
HPS1-202ENST00000338546 TNFRSF13CQ96RJ3 184 aa14.85□□□□□ -0.03
HPS1-202ENST00000338546 CDC6Q99741 560 aa14.85□□□□□ -0.03
HPS1-202ENST00000338546 DCUN1D5Q9BTE7 237 aa14.85□□□□□ -0.03
HPS1-202ENST00000338546 ULBP3Q9BZM4 244 aa14.85□□□□□ -0.03
HPS1-202ENST00000338546 MCCC2Q9HCC0 563 aa14.85□□□□□ -0.03
HPS1-202ENST00000338546 GPR52Q9Y2T5 361 aa14.85□□□□□ -0.03
HPS1-202ENST00000338546 KMT2EQ8IZD2 1858 aa14.85□□□□□ -0.03
HPS1-202ENST00000338546 COL27A1Q8IZC6 1860 aaPredicted RBP14.84□□□□□ -0.03
HPS1-202ENST00000338546 IGKV1D-42A0A075B6H8 117 aa14.84□□□□□ -0.03
HPS1-202ENST00000338546 TRBV11-1A0A0K0K1C0 115 aa14.84□□□□□ -0.03
HPS1-202ENST00000338546 A0A1W2PQ72 361 aa14.84□□□□□ -0.03
HPS1-202ENST00000338546 RIIAD1A6NNX1 92 aa14.84□□□□□ -0.03
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