RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000331163.10

PDGFB-201, Transcript of platelet derived growth factor subunit B, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PDGFB, Length 3,497 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFB-201ENST00000331163 HPRP00739 348 aa14.62□□□□□ -0.07
PDGFB-201ENST00000331163 PSG6Q00889 435 aa14.62□□□□□ -0.07
PDGFB-201ENST00000331163 FRRS1Q6ZNA5 592 aa14.62□□□□□ -0.07
PDGFB-201ENST00000331163 CAMKMTQ7Z624 323 aa14.62□□□□□ -0.07
PDGFB-201ENST00000331163 COMTD1Q86VU5 262 aa14.62□□□□□ -0.07
PDGFB-201ENST00000331163 SLC34A3Q8N130 599 aa14.62□□□□□ -0.07
PDGFB-201ENST00000331163 ZNF527Q8NB42 609 aa14.62□□□□□ -0.07
PDGFB-201ENST00000331163 FCRL1Q96LA6 429 aa14.62□□□□□ -0.07
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PDGFB-201ENST00000331163 UCK2Q9BZX2 261 aa14.62□□□□□ -0.07
PDGFB-201ENST00000331163 SP140LQ9H930 580 aa14.62□□□□□ -0.07
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PDGFB-201ENST00000331163 PFN4Q8NHR9 129 aa14.61□□□□□ -0.07
PDGFB-201ENST00000331163 TMEM38AQ9H6F2 299 aa14.61□□□□□ -0.07
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PDGFB-201ENST00000331163 SEC23BQ15437 767 aa14.61□□□□□ -0.07
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PDGFB-201ENST00000331163 IER2Q9BTL4 223 aa14.61□□□□□ -0.07
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PDGFB-201ENST00000331163 SLC35F4A4IF30 521 aa14.61□□□□□ -0.07
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PDGFB-201ENST00000331163 ARMCX4Q5H9R4 360 aa14.61□□□□□ -0.07
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PDGFB-201ENST00000331163 ZNF544Q6NX49 715 aa14.6□□□□□ -0.07
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PDGFB-201ENST00000331163 ELMOD2Q8IZ81 293 aa14.59□□□□□ -0.07
PDGFB-201ENST00000331163 GOT1L1Q8NHS2 421 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
PDGFB-201ENST00000331163 SFXN5Q8TD22 340 aa14.59□□□□□ -0.07
PDGFB-201ENST00000331163 SMIM10Q96HG1 83 aa14.59□□□□□ -0.07
PDGFB-201ENST00000331163 RDH12Q96NR8 316 aa14.59□□□□□ -0.07
PDGFB-201ENST00000331163 OR11A1Q9GZK7 315 aa14.59□□□□□ -0.07
PDGFB-201ENST00000331163 ABCB9Q9NP78 766 aa14.59□□□□□ -0.07
PDGFB-201ENST00000331163 ACER3Q9NUN7 267 aa14.59□□□□□ -0.07
PDGFB-201ENST00000331163 PRELID1Q9Y255 219 aa14.59□□□□□ -0.07
PDGFB-201ENST00000331163 EFCAB10A6NFE3 127 aa14.59□□□□□ -0.07
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