RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000320580.8

PACS1-201, Transcript of phosphofurin acidic cluster sorting protein 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PACS1, Length 4,392 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACS1-201ENST00000320580 CCSO14618 274 aa15.5■□□□□ 0.07
PACS1-201ENST00000320580 GPR32O75388 356 aa15.5■□□□□ 0.07
PACS1-201ENST00000320580 AK4P27144 223 aaPredicted RBP15.5■□□□□ 0.07
PACS1-201ENST00000320580 RFC3P40938 356 aa15.5■□□□□ 0.07
PACS1-201ENST00000320580 EIF1AXP47813 144 aaKnown RBP15.5■□□□□ 0.07
PACS1-201ENST00000320580 ACTA2P62736 377 aa15.5■□□□□ 0.07
PACS1-201ENST00000320580 ACTG2P63267 376 aa15.5■□□□□ 0.07
PACS1-201ENST00000320580 KIAA0141Q14154 515 aaPredicted RBP15.5■□□□□ 0.07
PACS1-201ENST00000320580 MPEG1Q2M385 716 aa15.5■□□□□ 0.07
PACS1-201ENST00000320580 LINC00303Q3SY05 128 aa15.5■□□□□ 0.07
PACS1-201ENST00000320580 TTLL10Q6ZVT0 673 aa15.5■□□□□ 0.07
PACS1-201ENST00000320580 FOXRED1Q96CU9 486 aaPredicted RBP15.5■□□□□ 0.07
PACS1-201ENST00000320580 IER2Q9BTL4 223 aa15.5■□□□□ 0.07
PACS1-201ENST00000320580 SHARPINQ9H0F6 387 aa15.5■□□□□ 0.07
PACS1-201ENST00000320580 RSPH9Q9H1X1 276 aaPredicted RBP15.5■□□□□ 0.07
PACS1-201ENST00000320580 SUV39H2Q9H5I1 410 aa15.5■□□□□ 0.07
PACS1-201ENST00000320580 TMEM82A0PJX8 343 aa15.5■□□□□ 0.07
PACS1-201ENST00000320580 H7C1Q1 480 aa15.5■□□□□ 0.07
PACS1-201ENST00000320580 CACNB4O00305 520 aaPredicted RBP15.5■□□□□ 0.07
PACS1-201ENST00000320580 SLC16A5O15375 505 aa15.5■□□□□ 0.07
PACS1-201ENST00000320580 TSPAN6O43657 245 aa15.5■□□□□ 0.07
PACS1-201ENST00000320580 PGAM2P15259 253 aa15.5■□□□□ 0.07
PACS1-201ENST00000320580 PTAFRP25105 342 aa15.5■□□□□ 0.07
PACS1-201ENST00000320580 MPIP34949 423 aa15.5■□□□□ 0.07
PACS1-201ENST00000320580 TMCO2Q7Z6W1 182 aaPredicted RBP15.5■□□□□ 0.07
PACS1-201ENST00000320580 OR6T1Q8NGN1 323 aa15.5■□□□□ 0.07
PACS1-201ENST00000320580 OR13C5Q8NGS8 318 aa15.5■□□□□ 0.07
PACS1-201ENST00000320580 OR14A16Q8NHC5 309 aa15.5■□□□□ 0.07
PACS1-201ENST00000320580 CD99L2Q8TCZ2 262 aa15.5■□□□□ 0.07
PACS1-201ENST00000320580 UBTD2Q8WUN7 234 aa15.5■□□□□ 0.07
PACS1-201ENST00000320580 DVL3Q92997 716 aaPredicted RBP15.5■□□□□ 0.07
PACS1-201ENST00000320580 HGDQ93099 445 aa15.5■□□□□ 0.07
PACS1-201ENST00000320580 NEIL2Q969S2 332 aa15.5■□□□□ 0.07
PACS1-201ENST00000320580 RAB3CQ96E17 227 aa15.5■□□□□ 0.07
PACS1-201ENST00000320580 PHB2Q99623 299 aa15.5■□□□□ 0.07
PACS1-201ENST00000320580 KCNJ16Q9NPI9 418 aa15.5■□□□□ 0.07
PACS1-201ENST00000320580 TAS2R5Q9NYW4 299 aa15.5■□□□□ 0.07
PACS1-201ENST00000320580 ZC3H12DA2A288 527 aaKnown RBP15.5■□□□□ 0.07
PACS1-201ENST00000320580 NEDD8-MDP1E9PL57 170 aa15.5■□□□□ 0.07
PACS1-201ENST00000320580 GABARAPH6UMI1 98 aa15.5■□□□□ 0.07
PACS1-201ENST00000320580 SYT5O00445 386 aa15.5■□□□□ 0.07
PACS1-201ENST00000320580 MGMTP16455 207 aa15.5■□□□□ 0.07
PACS1-201ENST00000320580 TLX1P31314 330 aaPredicted RBP15.5■□□□□ 0.07
PACS1-201ENST00000320580 SLC6A6P31641 620 aa15.5■□□□□ 0.07
PACS1-201ENST00000320580 AGFG1P52594 562 aaKnown RBP15.5■□□□□ 0.07
PACS1-201ENST00000320580 TDGQ13569 410 aa15.5■□□□□ 0.07
PACS1-201ENST00000320580 OR52E2Q8NGJ4 325 aa15.5■□□□□ 0.07
PACS1-201ENST00000320580 OR56A3Q8NH54 315 aa15.5■□□□□ 0.07
PACS1-201ENST00000320580 SLC41A3Q96GZ6 507 aa15.5■□□□□ 0.07
PACS1-201ENST00000320580 RNF32Q9H0A6 362 aa15.5■□□□□ 0.07
PACS1-201ENST00000320580 ISG20L2Q9H9L3 353 aaKnown RBP15.5■□□□□ 0.07
PACS1-201ENST00000320580 ZNF208O43345 1280 aa15.5■□□□□ 0.07
PACS1-201ENST00000320580 IGFBP6P24592 240 aaPredicted RBP15.5■□□□□ 0.07
PACS1-201ENST00000320580 HTR1FP30939 366 aa15.5■□□□□ 0.07
PACS1-201ENST00000320580 DCTDP32321 178 aa15.5■□□□□ 0.07
PACS1-201ENST00000320580 GNALP38405 381 aa15.5■□□□□ 0.07
PACS1-201ENST00000320580 LIM2P55344 173 aa15.5■□□□□ 0.07
PACS1-201ENST00000320580 RPE65Q16518 533 aa15.5■□□□□ 0.07
PACS1-201ENST00000320580 PDZD11Q5EBL8 140 aa15.5■□□□□ 0.07
PACS1-201ENST00000320580 HENMT1Q5T8I9 393 aaKnown RBP15.5■□□□□ 0.07
PACS1-201ENST00000320580 TMED6Q8WW62 240 aa15.5■□□□□ 0.07
PACS1-201ENST00000320580 OR52D1Q9H346 318 aa15.5■□□□□ 0.07
PACS1-201ENST00000320580 CXorf36Q9H7Y0 433 aa15.5■□□□□ 0.07
PACS1-201ENST00000320580 PLAGL1Q9UM63 463 aa15.5■□□□□ 0.07
PACS1-201ENST00000320580 FER1L6Q2WGJ9 1857 aa15.5■□□□□ 0.07
PACS1-201ENST00000320580 CDHR4A6H8M9 788 aa15.49■□□□□ 0.07
PACS1-201ENST00000320580 TVP23AA6NH52 213 aa15.49■□□□□ 0.07
PACS1-201ENST00000320580 CDC40O60508 579 aaKnown RBP eCLIP15.49■□□□□ 0.07
PACS1-201ENST00000320580 IGF2P01344 180 aa15.49■□□□□ 0.07
PACS1-201ENST00000320580 LIMS3P0CW19 117 aa15.49■□□□□ 0.07
PACS1-201ENST00000320580 LIMS4P0CW20 117 aa15.49■□□□□ 0.07
PACS1-201ENST00000320580 ATRAIDQ6UW56 229 aa15.49■□□□□ 0.07
PACS1-201ENST00000320580 ZNF561Q8N587 486 aa15.49■□□□□ 0.07
PACS1-201ENST00000320580 THEM6Q8WUY1 208 aa15.49■□□□□ 0.07
PACS1-201ENST00000320580 ANKRD19PQ9H560 264 aa15.49■□□□□ 0.07
PACS1-201ENST00000320580 FGF20Q9NP95 211 aaPredicted RBP15.49■□□□□ 0.07
PACS1-201ENST00000320580 DUXAA6NLW8 204 aa15.49■□□□□ 0.07
PACS1-201ENST00000320580 UGDHO60701 494 aa15.49■□□□□ 0.07
PACS1-201ENST00000320580 DPM1O60762 260 aa15.49■□□□□ 0.07
PACS1-201ENST00000320580 NME2P22392 152 aa15.49■□□□□ 0.07
PACS1-201ENST00000320580 OR3A2P47893 321 aa15.49■□□□□ 0.07
PACS1-201ENST00000320580 CSNK1DP48730 415 aa15.49■□□□□ 0.07
PACS1-201ENST00000320580 RAG2P55895 527 aa15.49■□□□□ 0.07
PACS1-201ENST00000320580 TIAL1Q01085 375 aaKnown RBP eCLIP15.49■□□□□ 0.07
PACS1-201ENST00000320580 NDUFAF7Q7L592 441 aa15.49■□□□□ 0.07
PACS1-201ENST00000320580 TMEM173Q86WV6 379 aaPredicted RBP15.49■□□□□ 0.07
PACS1-201ENST00000320580 OR4C15Q8NGM1 316 aa15.49■□□□□ 0.07
PACS1-201ENST00000320580 OR5M9Q8NGP3 310 aa15.49■□□□□ 0.07
PACS1-201ENST00000320580 MS4A4AQ96JQ5 239 aa15.49■□□□□ 0.07
PACS1-201ENST00000320580 SUSD3Q96L08 255 aa15.49■□□□□ 0.07
PACS1-201ENST00000320580 CNN2Q99439 309 aaKnown RBP15.49■□□□□ 0.07
PACS1-201ENST00000320580 ENKD1Q9H0I2 346 aa15.49■□□□□ 0.07
PACS1-201ENST00000320580 DPP7Q9UHL4 492 aa15.49■□□□□ 0.07
PACS1-201ENST00000320580 ZNF223Q9UK11 482 aaPredicted RBP15.49■□□□□ 0.07
PACS1-201ENST00000320580 LOC105378220A0A1B0GUY1 285 aaPredicted RBP15.49■□□□□ 0.07
PACS1-201ENST00000320580 PSMA3P25788 255 aa15.49■□□□□ 0.07
PACS1-201ENST00000320580 PBX2P40425 430 aa15.49■□□□□ 0.07
PACS1-201ENST00000320580 MAGEB1P43366 347 aa15.49■□□□□ 0.07
PACS1-201ENST00000320580 KCNJ5P48544 419 aa15.49■□□□□ 0.07
PACS1-201ENST00000320580 IL13RA1P78552 427 aa15.49■□□□□ 0.07
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