RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000311008.15

SPNS1-201, Transcript of sphingolipid transporter 1 (putative), humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SPNS1, Length 2,208 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS1-201ENST00000311008 SHISA5Q8N114 240 aa18.03■□□□□ 0.48
SPNS1-201ENST00000311008 ABHD4Q8TB40 342 aa18.03■□□□□ 0.48
SPNS1-201ENST00000311008 PTCHD1Q96NR3 888 aa18.03■□□□□ 0.48
SPNS1-201ENST00000311008 ERVMER34-1Q9H9K5 563 aa18.03■□□□□ 0.48
SPNS1-201ENST00000311008 Q9N2J8 555 aa18.03■□□□□ 0.48
SPNS1-201ENST00000311008 MKKSQ9NPJ1 570 aaPredicted RBP18.03■□□□□ 0.48
SPNS1-201ENST00000311008 B3GAT2Q9NPZ5 323 aa18.03■□□□□ 0.48
SPNS1-201ENST00000311008 FAM240BA0A1B0GVZ2 78 aa18.02■□□□□ 0.48
SPNS1-201ENST00000311008 EFCAB7A8K855 629 aa18.02■□□□□ 0.48
SPNS1-201ENST00000311008 J3QLW9 94 aa18.02■□□□□ 0.48
SPNS1-201ENST00000311008 CLDN4O14493 209 aa18.02■□□□□ 0.48
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SPNS1-201ENST00000311008 ZNF19P17023 458 aa18.02■□□□□ 0.48
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SPNS1-201ENST00000311008 PPP1CAP62136 330 aa18.02■□□□□ 0.48
SPNS1-201ENST00000311008 IGLV3-21P80748 117 aaPredicted RBP18.02■□□□□ 0.48
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SPNS1-201ENST00000311008 EXTL2Q9UBQ6 330 aa18.02■□□□□ 0.48
SPNS1-201ENST00000311008 CD207Q9UJ71 328 aa18.02■□□□□ 0.48
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SPNS1-201ENST00000311008 CEACAM19Q7Z692 300 aa18.02■□□□□ 0.47
SPNS1-201ENST00000311008 ZDHHC1Q8WTX9 485 aa18.02■□□□□ 0.47
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SPNS1-201ENST00000311008 I3L1I5 382 aaPredicted RBP18■□□□□ 0.47
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SPNS1-201ENST00000311008 OR12D2P58182 307 aa18■□□□□ 0.47
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SPNS1-201ENST00000311008 COL13A1Q5TAT6 717 aaPredicted RBP18■□□□□ 0.47
SPNS1-201ENST00000311008 HACD4Q5VWC8 232 aa18■□□□□ 0.47
SPNS1-201ENST00000311008 TIGD3Q6B0B8 471 aa18■□□□□ 0.47
SPNS1-201ENST00000311008 ZNF761Q86XN6 746 aaPredicted RBP18■□□□□ 0.47
SPNS1-201ENST00000311008 ZNF440Q8IYI8 595 aa18■□□□□ 0.47
SPNS1-201ENST00000311008 UBE2J2Q8N2K1 259 aa18■□□□□ 0.47
SPNS1-201ENST00000311008 CADM2Q8N3J6 435 aa18■□□□□ 0.47
SPNS1-201ENST00000311008 FAM98AQ8NCA5 519 aaKnown RBP18■□□□□ 0.47
SPNS1-201ENST00000311008 NLGN4YQ8NFZ3 816 aaPredicted RBP18■□□□□ 0.47
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