RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000264389.6

COPS4-201, Transcript of COP9 signalosome subunit 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene COPS4, Length 1,744 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS4-201ENST00000264389 CLN6Q9NWW5 311 aa7.58□□□□□ -1.2
COPS4-201ENST00000264389 TVP23BQ9NYZ1 205 aa7.58□□□□□ -1.2
COPS4-201ENST00000264389 FBXL4Q9UKA2 621 aa7.58□□□□□ -1.2
COPS4-201ENST00000264389 SMIM31A0A1B0GVY4 71 aa7.58□□□□□ -1.2
COPS4-201ENST00000264389 C17orf51A8MQB3 221 aa7.58□□□□□ -1.2
COPS4-201ENST00000264389 PTGES3LE9PB15 166 aa7.58□□□□□ -1.2
COPS4-201ENST00000264389 CDC40O60508 579 aaKnown RBP eCLIP7.58□□□□□ -1.2
COPS4-201ENST00000264389 HCN1O60741 890 aa7.58□□□□□ -1.2
COPS4-201ENST00000264389 BMP7P18075 431 aa7.58□□□□□ -1.2
COPS4-201ENST00000264389 FUT1P19526 365 aa7.58□□□□□ -1.2
COPS4-201ENST00000264389 CSRP1P21291 193 aaKnown RBP7.58□□□□□ -1.2
COPS4-201ENST00000264389 SOX3P41225 446 aa7.58□□□□□ -1.2
COPS4-201ENST00000264389 GIPRP48546 466 aa7.58□□□□□ -1.2
COPS4-201ENST00000264389 PCYT1AP49585 367 aa7.58□□□□□ -1.2
COPS4-201ENST00000264389 NUDT6P53370 316 aa7.58□□□□□ -1.2
COPS4-201ENST00000264389 CSNK2BP67870 215 aa7.58□□□□□ -1.2
COPS4-201ENST00000264389 SLC35A2P78381 396 aa7.58□□□□□ -1.2
COPS4-201ENST00000264389 CDK5Q00535 292 aa7.58□□□□□ -1.2
COPS4-201ENST00000264389 NEDD8Q15843 81 aa7.58□□□□□ -1.2
COPS4-201ENST00000264389 COL28A1Q2UY09 1125 aa7.58□□□□□ -1.2
COPS4-201ENST00000264389 PGGHGQ32M88 737 aa7.58□□□□□ -1.2
COPS4-201ENST00000264389 SLC30A6Q6NXT4 461 aa7.58□□□□□ -1.2
COPS4-201ENST00000264389 LYPD8Q6UX82 237 aa7.58□□□□□ -1.2
COPS4-201ENST00000264389 LINC00114Q6XXX2 140 aa7.58□□□□□ -1.2
COPS4-201ENST00000264389 KCTD8Q6ZWB6 473 aa7.58□□□□□ -1.2
COPS4-201ENST00000264389 TMPRSS11FQ6ZWK6 438 aa7.58□□□□□ -1.2
COPS4-201ENST00000264389 AHSA2Q719I0 299 aa7.58□□□□□ -1.2
COPS4-201ENST00000264389 ATG4DQ86TL0 474 aaPredicted RBP7.58□□□□□ -1.2
COPS4-201ENST00000264389 TMPRSS12Q86WS5 348 aa7.58□□□□□ -1.2
COPS4-201ENST00000264389 TCEANCQ8N8B7 351 aa7.58□□□□□ -1.2
COPS4-201ENST00000264389 OR2T33Q8NG76 320 aa7.58□□□□□ -1.2
COPS4-201ENST00000264389 OR10G3Q8NGC4 313 aa7.58□□□□□ -1.2
COPS4-201ENST00000264389 OR8J1Q8NGP2 316 aa7.58□□□□□ -1.2
COPS4-201ENST00000264389 OR13C2Q8NGS9 318 aa7.58□□□□□ -1.2
COPS4-201ENST00000264389 OR5W2Q8NH69 310 aa7.58□□□□□ -1.2
COPS4-201ENST00000264389 TRUB1Q8WWH5 349 aaKnown RBP7.58□□□□□ -1.2
COPS4-201ENST00000264389 ASB15Q8WXK1 588 aa7.58□□□□□ -1.2
COPS4-201ENST00000264389 SGCDQ92629 289 aa7.58□□□□□ -1.2
COPS4-201ENST00000264389 SGTBQ96EQ0 304 aa7.58□□□□□ -1.2
COPS4-201ENST00000264389 PLEKHA8Q96JA3 519 aa7.58□□□□□ -1.2
COPS4-201ENST00000264389 Q96MT0 163 aa7.58□□□□□ -1.2
COPS4-201ENST00000264389 IL4I1Q96RQ9 567 aa7.58□□□□□ -1.2
COPS4-201ENST00000264389 GPR87Q9BY21 358 aa7.58□□□□□ -1.2
COPS4-201ENST00000264389 POLDIP3Q9BY77 421 aaKnown RBP7.58□□□□□ -1.2
COPS4-201ENST00000264389 KRTAP3-3Q9BYR6 98 aa7.58□□□□□ -1.2
COPS4-201ENST00000264389 KRTAP3-2Q9BYR7 98 aa7.58□□□□□ -1.2
COPS4-201ENST00000264389 SLC19A3Q9BZV2 496 aa7.58□□□□□ -1.2
COPS4-201ENST00000264389 FAM192AQ9GZU8 254 aa7.58□□□□□ -1.2
COPS4-201ENST00000264389 C12orf10Q9HB07 376 aa7.58□□□□□ -1.2
COPS4-201ENST00000264389 GALNT9Q9HCQ5 603 aa7.58□□□□□ -1.2
COPS4-201ENST00000264389 PAK1IP1Q9NWT1 392 aaPredicted RBP7.58□□□□□ -1.2
COPS4-201ENST00000264389 TAS2R10Q9NYW0 307 aa7.58□□□□□ -1.2
COPS4-201ENST00000264389 IL20Q9NYY1 176 aa7.58□□□□□ -1.2
COPS4-201ENST00000264389 PPP4R1LQ9P1A2 415 aa7.58□□□□□ -1.2
COPS4-201ENST00000264389 ICAM5Q9UMF0 924 aa7.58□□□□□ -1.2
COPS4-201ENST00000264389 KIAA1549Q9HCM3 1950 aa7.57□□□□□ -1.2
COPS4-201ENST00000264389 TRAV27A0A087WT01 109 aa7.57□□□□□ -1.2
COPS4-201ENST00000264389 SH3D21A4FU49 640 aa7.57□□□□□ -1.2
COPS4-201ENST00000264389 ANKUB1A6NFN9 424 aa7.57□□□□□ -1.2
COPS4-201ENST00000264389 TP53I11O14683 189 aa7.57□□□□□ -1.2
COPS4-201ENST00000264389 RGS10O43665 173 aa7.57□□□□□ -1.2
COPS4-201ENST00000264389 PRKYO43930 277 aa7.57□□□□□ -1.2
COPS4-201ENST00000264389 RCBTB2O95199 551 aa7.57□□□□□ -1.2
COPS4-201ENST00000264389 HTR1AP08908 422 aa7.57□□□□□ -1.2
COPS4-201ENST00000264389 GP1BBP13224 206 aa7.57□□□□□ -1.2
COPS4-201ENST00000264389 ICAM2P13598 275 aa7.57□□□□□ -1.2
COPS4-201ENST00000264389 MST1P26927 711 aa7.57□□□□□ -1.2
COPS4-201ENST00000264389 TACR3P29371 465 aa7.57□□□□□ -1.2
COPS4-201ENST00000264389 RBMS1P29558 406 aaKnown RBP7.57□□□□□ -1.2
COPS4-201ENST00000264389 SLC1A3P43003 542 aa7.57□□□□□ -1.2
COPS4-201ENST00000264389 ALDH3B2P48448 385 aa7.57□□□□□ -1.2
COPS4-201ENST00000264389 SSR4P51571 173 aa7.57□□□□□ -1.2
COPS4-201ENST00000264389 SUMO3P55854 103 aaPredicted RBP7.57□□□□□ -1.2
COPS4-201ENST00000264389 SNRPGP62308 76 aaKnown RBP7.57□□□□□ -1.2
COPS4-201ENST00000264389 C17orf67Q0P5P2 114 aa7.57□□□□□ -1.2
COPS4-201ENST00000264389 IL10RAQ13651 578 aa7.57□□□□□ -1.2
COPS4-201ENST00000264389 QPRTQ15274 297 aa7.57□□□□□ -1.2
COPS4-201ENST00000264389 SNAPC1Q16533 368 aa7.57□□□□□ -1.2
COPS4-201ENST00000264389 OPN5Q6U736 354 aa7.57□□□□□ -1.2
COPS4-201ENST00000264389 GPR141Q7Z602 305 aa7.57□□□□□ -1.2
COPS4-201ENST00000264389 MRGPREQ86SM8 312 aa7.57□□□□□ -1.2
COPS4-201ENST00000264389 DND1Q8IYX4 353 aaKnown RBP7.57□□□□□ -1.2
COPS4-201ENST00000264389 CACTIN-AS1Q8N1I8 211 aa7.57□□□□□ -1.2
COPS4-201ENST00000264389 CYP4Z2PQ8N1L4 340 aa7.57□□□□□ -1.2
COPS4-201ENST00000264389 IL22RA1Q8N6P7 574 aa7.57□□□□□ -1.2
COPS4-201ENST00000264389 OR4Q3Q8NH05 313 aa7.57□□□□□ -1.2
COPS4-201ENST00000264389 BRIX1Q8TDN6 353 aaKnown RBP7.57□□□□□ -1.2
COPS4-201ENST00000264389 NACC2Q96BF6 587 aa7.57□□□□□ -1.2
COPS4-201ENST00000264389 SAMD8Q96LT4 415 aa7.57□□□□□ -1.2
COPS4-201ENST00000264389 RHNO1Q9BSD3 238 aa7.57□□□□□ -1.2
COPS4-201ENST00000264389 COPS4Q9BT78 406 aa7.57□□□□□ -1.2
COPS4-201ENST00000264389 TMEM43Q9BTV4 400 aa7.57□□□□□ -1.2
COPS4-201ENST00000264389 SDHAF3Q9NRP4 125 aa7.57□□□□□ -1.2
COPS4-201ENST00000264389 PLCXD1Q9NUJ7 323 aa7.57□□□□□ -1.2
COPS4-201ENST00000264389 P4HTMQ9NXG6 502 aa7.57□□□□□ -1.2
COPS4-201ENST00000264389 DNAJC27Q9NZQ0 273 aa7.57□□□□□ -1.2
COPS4-201ENST00000264389 NDUFA13Q9P0J0 144 aa7.57□□□□□ -1.2
COPS4-201ENST00000264389 IL20RAQ9UHF4 553 aa7.57□□□□□ -1.2
COPS4-201ENST00000264389 YARS2Q9Y2Z4 477 aaKnown RBP7.57□□□□□ -1.2
COPS4-201ENST00000264389 WIF1Q9Y5W5 379 aa7.57□□□□□ -1.2
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 53.4 ms