RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000258962.4

SRSF1-201, Transcript of serine and arginine rich splicing factor 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SRSF1, Length 1,513 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF1-201ENST00000258962 EXOSC3Q9NQT5 275 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
SRSF1-201ENST00000258962 ZNF226Q9NYT6 803 aa15.94■□□□□ 0.14
SRSF1-201ENST00000258962 PCDHGA9Q9Y5G4 932 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
SRSF1-201ENST00000258962 ATMQ13315 3056 aa15.94■□□□□ 0.14
SRSF1-201ENST00000258962 NSG1A0A0A6YYJ2 146 aa15.94■□□□□ 0.14
SRSF1-201ENST00000258962 A0A1W2PQD3 144 aa15.94■□□□□ 0.14
SRSF1-201ENST00000258962 OR6C70A6NIJ9 312 aa15.94■□□□□ 0.14
SRSF1-201ENST00000258962 CHP2O43745 196 aa15.94■□□□□ 0.14
SRSF1-201ENST00000258962 ANGPTL1O95841 491 aa15.94■□□□□ 0.14
SRSF1-201ENST00000258962 GSTM3P21266 225 aa15.94■□□□□ 0.14
SRSF1-201ENST00000258962 POU1F1P28069 291 aa15.94■□□□□ 0.14
SRSF1-201ENST00000258962 FMO3P31513 532 aa15.94■□□□□ 0.14
SRSF1-201ENST00000258962 HLCSP50747 726 aa15.94■□□□□ 0.14
SRSF1-201ENST00000258962 CSNK2BP67870 215 aa15.94■□□□□ 0.14
SRSF1-201ENST00000258962 C19orf57Q0VDD7 668 aa15.94■□□□□ 0.14
SRSF1-201ENST00000258962 TSPAN31Q12999 210 aa15.94■□□□□ 0.14
SRSF1-201ENST00000258962 SLX4IPQ5VYV7 408 aa15.94■□□□□ 0.14
SRSF1-201ENST00000258962 CBLN3Q6UW01 205 aa15.94■□□□□ 0.14
SRSF1-201ENST00000258962 NDUFAF7Q7L592 441 aa15.94■□□□□ 0.14
SRSF1-201ENST00000258962 RRM2BQ7LG56 351 aa15.94■□□□□ 0.14
SRSF1-201ENST00000258962 GALNT16Q8N428 558 aa15.94■□□□□ 0.14
SRSF1-201ENST00000258962 TMEM239Q8WW34 195 aa15.94■□□□□ 0.14
SRSF1-201ENST00000258962 SGCDQ92629 289 aa15.94■□□□□ 0.14
SRSF1-201ENST00000258962 DSN1Q9H410 356 aa15.94■□□□□ 0.14
SRSF1-201ENST00000258962 RASSF1Q9NS23 344 aa15.94■□□□□ 0.14
SRSF1-201ENST00000258962 GPR83Q9NYM4 423 aa15.94■□□□□ 0.14
SRSF1-201ENST00000258962 NPFFR2Q9Y5X5 522 aa15.94■□□□□ 0.14
SRSF1-201ENST00000258962 ALG1L2C9J202 215 aa15.93■□□□□ 0.14
SRSF1-201ENST00000258962 M0R129 80 aa15.93■□□□□ 0.14
SRSF1-201ENST00000258962 WWP2O00308 870 aa15.93■□□□□ 0.14
SRSF1-201ENST00000258962 ADAM10O14672 748 aa15.93■□□□□ 0.14
SRSF1-201ENST00000258962 ZNF264O43296 627 aa15.93■□□□□ 0.14
SRSF1-201ENST00000258962 FADS1O60427 444 aa15.93■□□□□ 0.14
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SRSF1-201ENST00000258962 OR6B1O95007 311 aa15.93■□□□□ 0.14
SRSF1-201ENST00000258962 HPP00738 406 aa15.93■□□□□ 0.14
SRSF1-201ENST00000258962 LINGO3P0C6S8 592 aa15.93■□□□□ 0.14
SRSF1-201ENST00000258962 GABRB1P18505 474 aa15.93■□□□□ 0.14
SRSF1-201ENST00000258962 FPR3P25089 353 aa15.93■□□□□ 0.14
SRSF1-201ENST00000258962 ITGA3P26006 1051 aa15.93■□□□□ 0.14
SRSF1-201ENST00000258962 TTKP33981 857 aa15.93■□□□□ 0.14
SRSF1-201ENST00000258962 GPR4P46093 362 aa15.93■□□□□ 0.14
SRSF1-201ENST00000258962 IDH2P48735 452 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
SRSF1-201ENST00000258962 NRG3P56975 720 aa15.93■□□□□ 0.14
SRSF1-201ENST00000258962 GABARAPL2P60520 117 aa15.93■□□□□ 0.14
SRSF1-201ENST00000258962 C12orf73Q69YU5 71 aa15.93■□□□□ 0.14
SRSF1-201ENST00000258962 ASB18Q6ZVZ8 466 aa15.93■□□□□ 0.14
SRSF1-201ENST00000258962 CADM2Q8N3J6 435 aa15.93■□□□□ 0.14
SRSF1-201ENST00000258962 FDCSPQ8NFU4 85 aa15.93■□□□□ 0.14
SRSF1-201ENST00000258962 PFN4Q8NHR9 129 aa15.93■□□□□ 0.14
SRSF1-201ENST00000258962 ELP5Q8TE02 316 aa15.93■□□□□ 0.14
SRSF1-201ENST00000258962 IMMP1LQ96LU5 166 aa15.93■□□□□ 0.14
SRSF1-201ENST00000258962 KLHDC3Q9BQ90 382 aa15.93■□□□□ 0.14
SRSF1-201ENST00000258962 ZNF426Q9BUY5 554 aa15.93■□□□□ 0.14
SRSF1-201ENST00000258962 ZBTB20Q9HC78 741 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
SRSF1-201ENST00000258962 PAK1IP1Q9NWT1 392 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
SRSF1-201ENST00000258962 TP53TG5Q9Y2B4 290 aa15.93■□□□□ 0.14
SRSF1-201ENST00000258962 CARD8Q9Y2G2 431 aa15.93■□□□□ 0.14
SRSF1-201ENST00000258962 COL6A6A6NMZ7 2263 aa15.93■□□□□ 0.14
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SRSF1-201ENST00000258962 A0A1W2PQ72 361 aa15.92■□□□□ 0.14
SRSF1-201ENST00000258962 C17orf51A8MQB3 221 aa15.92■□□□□ 0.14
SRSF1-201ENST00000258962 H3BN98 237 aa15.92■□□□□ 0.14
SRSF1-201ENST00000258962 MASP2O00187 686 aa15.92■□□□□ 0.14
SRSF1-201ENST00000258962 XPNPEP2O43895 674 aa15.92■□□□□ 0.14
SRSF1-201ENST00000258962 CEACAM4O75871 244 aa15.92■□□□□ 0.14
SRSF1-201ENST00000258962 ZFAND5O76080 213 aa15.92■□□□□ 0.14
SRSF1-201ENST00000258962 CCDC159P0C7I6 412 aa15.92■□□□□ 0.14
SRSF1-201ENST00000258962 SH3BGRP55822 239 aaPredicted RBP15.92■□□□□ 0.14
SRSF1-201ENST00000258962 SOX8P57073 446 aa15.92■□□□□ 0.14
SRSF1-201ENST00000258962 SMN1Q16637 294 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
SRSF1-201ENST00000258962 ALG10BQ5I7T1 473 aa15.92■□□□□ 0.14
SRSF1-201ENST00000258962 LINC00114Q6XXX2 140 aa15.92■□□□□ 0.14
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SRSF1-201ENST00000258962 CCDC103Q8IW40 242 aa15.92■□□□□ 0.14
SRSF1-201ENST00000258962 RNF113BQ8IZP6 322 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
SRSF1-201ENST00000258962 DEPDC4Q8N2C3 294 aa15.92■□□□□ 0.14
SRSF1-201ENST00000258962 ZNF843Q8N446 348 aa15.92■□□□□ 0.14
SRSF1-201ENST00000258962 BPIFB6Q8NFQ5 453 aa15.92■□□□□ 0.14
SRSF1-201ENST00000258962 OR5L2Q8NGL0 311 aa15.92■□□□□ 0.14
SRSF1-201ENST00000258962 OR8D4Q8NGM9 314 aa15.92■□□□□ 0.14
SRSF1-201ENST00000258962 RHOXF1Q8NHV9 184 aa15.92■□□□□ 0.14
SRSF1-201ENST00000258962 RNF217Q8TC41 542 aa15.92■□□□□ 0.14
SRSF1-201ENST00000258962 DGCR14Q96DF8 476 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
SRSF1-201ENST00000258962 PLA2G12AQ9BZM1 189 aa15.92■□□□□ 0.14
SRSF1-201ENST00000258962 PCNX3Q9H6A9 2034 aa15.92■□□□□ 0.14
SRSF1-201ENST00000258962 EGLN3Q9H6Z9 239 aa15.92■□□□□ 0.14
SRSF1-201ENST00000258962 ZNF160Q9HCG1 818 aa15.92■□□□□ 0.14
SRSF1-201ENST00000258962 C20orf141Q9NUB4 165 aa15.92■□□□□ 0.14
SRSF1-201ENST00000258962 PCDHGB7Q9Y5F8 929 aa15.92■□□□□ 0.14
SRSF1-201ENST00000258962 TLN1Q9Y490 2541 aaKnown RBP15.91■□□□□ 0.14
SRSF1-201ENST00000258962 GTPBP1O00178 669 aaKnown RBP15.91■□□□□ 0.14
SRSF1-201ENST00000258962 CELA2AP08217 269 aa15.91■□□□□ 0.14
SRSF1-201ENST00000258962 HTR1AP08908 422 aa15.91■□□□□ 0.14
SRSF1-201ENST00000258962 ICAM2P13598 275 aa15.91■□□□□ 0.14
SRSF1-201ENST00000258962 MAKP20794 623 aa15.91■□□□□ 0.14
SRSF1-201ENST00000258962 EVI2BP34910 448 aa15.91■□□□□ 0.14
SRSF1-201ENST00000258962 FBXW4P57775 412 aa15.91■□□□□ 0.14
SRSF1-201ENST00000258962 CXCR4P61073 352 aa15.91■□□□□ 0.14
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