RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000233084.7

DDX1-201, Transcript of DEAD-box helicase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene DDX1, Length 2,739 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX1-201ENST00000233084 GOSR2O14653 212 aa14.64□□□□□ -0.07
DDX1-201ENST00000233084 LINC01565O15544 149 aa14.64□□□□□ -0.07
DDX1-201ENST00000233084 OR2A4O95047 310 aa14.64□□□□□ -0.07
DDX1-201ENST00000233084 LATS1O95835 1130 aa14.64□□□□□ -0.07
DDX1-201ENST00000233084 CEBPBP17676 345 aa14.64□□□□□ -0.07
DDX1-201ENST00000233084 GSTM3P21266 225 aa14.64□□□□□ -0.07
DDX1-201ENST00000233084 DDX6P26196 483 aaKnown RBP eCLIP14.64□□□□□ -0.07
DDX1-201ENST00000233084 STARP49675 285 aa14.64□□□□□ -0.07
DDX1-201ENST00000233084 SHC2P98077 582 aa14.64□□□□□ -0.07
DDX1-201ENST00000233084 ACSM3Q53FZ2 586 aa14.64□□□□□ -0.07
DDX1-201ENST00000233084 TCEAL5Q5H9L2 206 aa14.64□□□□□ -0.07
DDX1-201ENST00000233084 DCAF12L2Q5VW00 463 aa14.64□□□□□ -0.07
DDX1-201ENST00000233084 PRAMEF13Q5VWM6 474 aa14.64□□□□□ -0.07
DDX1-201ENST00000233084 PLBD1Q6P4A8 553 aa14.64□□□□□ -0.07
DDX1-201ENST00000233084 APCDD1Q8J025 514 aa14.64□□□□□ -0.07
DDX1-201ENST00000233084 ACBD7Q8N6N7 88 aa14.64□□□□□ -0.07
DDX1-201ENST00000233084 THEM6Q8WUY1 208 aa14.64□□□□□ -0.07
DDX1-201ENST00000233084 OR2A7Q96R45 310 aa14.64□□□□□ -0.07
DDX1-201ENST00000233084 ZNF576Q9H609 170 aa14.64□□□□□ -0.07
DDX1-201ENST00000233084 TRIM36Q9NQ86 728 aa14.64□□□□□ -0.07
DDX1-201ENST00000233084 HINT3Q9NQE9 182 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
DDX1-201ENST00000233084 STOX2Q9P2F5 926 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
DDX1-201ENST00000233084 BRWD1Q9NSI6 2320 aa14.63□□□□□ -0.07
DDX1-201ENST00000233084 J3QLW9 94 aa14.63□□□□□ -0.07
DDX1-201ENST00000233084 LEFTY2O00292 366 aa14.63□□□□□ -0.07
DDX1-201ENST00000233084 B4GALT2O60909 372 aa14.63□□□□□ -0.07
DDX1-201ENST00000233084 KLHL18O94889 574 aa14.63□□□□□ -0.07
DDX1-201ENST00000233084 H2AFB1P0C5Y9 115 aa14.63□□□□□ -0.07
DDX1-201ENST00000233084 NR2F1P10589 423 aa14.63□□□□□ -0.07
DDX1-201ENST00000233084 ZNF19P17023 458 aa14.63□□□□□ -0.07
DDX1-201ENST00000233084 PRR5P85299 388 aa14.63□□□□□ -0.07
DDX1-201ENST00000233084 SORDQ00796 357 aa14.63□□□□□ -0.07
DDX1-201ENST00000233084 PDE7AQ13946 482 aa14.63□□□□□ -0.07
DDX1-201ENST00000233084 COL19A1Q14993 1142 aa14.63□□□□□ -0.07
DDX1-201ENST00000233084 PIP5KL1Q5T9C9 394 aa14.63□□□□□ -0.07
DDX1-201ENST00000233084 ZDHHC20Q5W0Z9 365 aa14.63□□□□□ -0.07
DDX1-201ENST00000233084 LILRB2Q8N423 598 aa14.63□□□□□ -0.07
DDX1-201ENST00000233084 LILRA3Q8N6C8 439 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
DDX1-201ENST00000233084 LGALS14Q8TCE9 139 aa14.63□□□□□ -0.07
DDX1-201ENST00000233084 ING5Q8WYH8 240 aa14.63□□□□□ -0.07
DDX1-201ENST00000233084 A4GALTQ9NPC4 353 aa14.63□□□□□ -0.07
DDX1-201ENST00000233084 SH2B3Q9UQQ2 575 aa14.63□□□□□ -0.07
DDX1-201ENST00000233084 EXOGQ9Y2C4 368 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
DDX1-201ENST00000233084 PRAMEF27A3QJZ7 478 aa14.63□□□□□ -0.07
DDX1-201ENST00000233084 TMEM200CA6NKL6 621 aa14.63□□□□□ -0.07
DDX1-201ENST00000233084 CPSF4LA6NMK7 179 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
DDX1-201ENST00000233084 AKR7A3O95154 331 aa14.63□□□□□ -0.07
DDX1-201ENST00000233084 HTR1FP30939 366 aa14.63□□□□□ -0.07
DDX1-201ENST00000233084 RPL3P39023 403 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
DDX1-201ENST00000233084 SLBPQ14493 270 aaKnown RBP eCLIP14.63□□□□□ -0.07
DDX1-201ENST00000233084 FAM69AQ5T7M9 428 aa14.63□□□□□ -0.07
DDX1-201ENST00000233084 ZNF626Q68DY1 528 aa14.63□□□□□ -0.07
DDX1-201ENST00000233084 C11orf88Q6PI97 169 aa14.63□□□□□ -0.07
DDX1-201ENST00000233084 CMTM4Q8IZR5 234 aa14.63□□□□□ -0.07
DDX1-201ENST00000233084 OR6V1Q8N148 313 aa14.63□□□□□ -0.07
DDX1-201ENST00000233084 FAM98AQ8NCA5 519 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
DDX1-201ENST00000233084 TIMP4Q99727 224 aa14.63□□□□□ -0.07
DDX1-201ENST00000233084 GPN1Q9HCN4 374 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
DDX1-201ENST00000233084 DOCK8Q8NF50 2099 aa14.63□□□□□ -0.07
DDX1-201ENST00000233084 ANTXRLA6NF34 631 aa14.62□□□□□ -0.07
DDX1-201ENST00000233084 CPN1P15169 458 aa14.62□□□□□ -0.07
DDX1-201ENST00000233084 DCTDP32321 178 aa14.62□□□□□ -0.07
DDX1-201ENST00000233084 RFC3P40938 356 aa14.62□□□□□ -0.07
DDX1-201ENST00000233084 TAS2R41P59536 307 aa14.62□□□□□ -0.07
DDX1-201ENST00000233084 UBE2IP63279 158 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
DDX1-201ENST00000233084 CDKN3Q16667 212 aa14.62□□□□□ -0.07
DDX1-201ENST00000233084 ZC3H14Q6PJT7 736 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
DDX1-201ENST00000233084 TBC1D19Q8N5T2 526 aa14.62□□□□□ -0.07
DDX1-201ENST00000233084 PNPLA2Q96AD5 504 aa14.62□□□□□ -0.07
DDX1-201ENST00000233084 ORAI1Q96D31 301 aa14.62□□□□□ -0.07
DDX1-201ENST00000233084 DERL3Q96Q80 235 aa14.62□□□□□ -0.07
DDX1-201ENST00000233084 PLXND1Q9Y4D7 1925 aa14.62□□□□□ -0.07
DDX1-201ENST00000233084 CRYBA1P05813 215 aa14.62□□□□□ -0.07
DDX1-201ENST00000233084 GALP22466 123 aa14.62□□□□□ -0.07
DDX1-201ENST00000233084 CTSOP43234 321 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
DDX1-201ENST00000233084 SNRPEP62304 92 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
DDX1-201ENST00000233084 CNTN1Q12860 1018 aa14.62□□□□□ -0.07
DDX1-201ENST00000233084 COL9A2Q14055 689 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
DDX1-201ENST00000233084 RPE65Q16518 533 aa14.62□□□□□ -0.07
DDX1-201ENST00000233084 MANEAQ5SRI9 462 aa14.62□□□□□ -0.07
DDX1-201ENST00000233084 TMEM184AQ6ZMB5 413 aa14.62□□□□□ -0.07
DDX1-201ENST00000233084 TPRA1Q86W33 373 aa14.62□□□□□ -0.07
DDX1-201ENST00000233084 OR14A16Q8NHC5 309 aa14.62□□□□□ -0.07
DDX1-201ENST00000233084 NEURL3Q96EH8 262 aa14.62□□□□□ -0.07
DDX1-201ENST00000233084 MS4A4EQ96PG1 132 aa14.62□□□□□ -0.07
DDX1-201ENST00000233084 DZANK1Q9NVP4 752 aa14.62□□□□□ -0.07
DDX1-201ENST00000233084 MRPS23Q9Y3D9 190 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
DDX1-201ENST00000233084 HMSDA8MTL9 139 aa14.61□□□□□ -0.07
DDX1-201ENST00000233084 RTCAO00442 366 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
DDX1-201ENST00000233084 ZNF197O14709 1029 aa14.61□□□□□ -0.07
DDX1-201ENST00000233084 EPPINO95925 133 aa14.61□□□□□ -0.07
DDX1-201ENST00000233084 RLN1P04808 185 aa14.61□□□□□ -0.07
DDX1-201ENST00000233084 EPXP11678 715 aa14.61□□□□□ -0.07
DDX1-201ENST00000233084 ADH7P40394 386 aa14.61□□□□□ -0.07
DDX1-201ENST00000233084 ZNF783Q6ZMS7 281 aa14.61□□□□□ -0.07
DDX1-201ENST00000233084 ZNF740Q8NDX6 193 aa14.61□□□□□ -0.07
DDX1-201ENST00000233084 GLYATL2Q8WU03 294 aa14.61□□□□□ -0.07
DDX1-201ENST00000233084 LRIG1Q96JA1 1093 aa14.61□□□□□ -0.07
DDX1-201ENST00000233084 SPHK1Q9NYA1 384 aa14.61□□□□□ -0.07
DDX1-201ENST00000233084 TAS2R5Q9NYW4 299 aa14.61□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.6 ms