RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000233072.9

CPS1-201, Transcript of carbamoyl-phosphate synthase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CPS1, Length 5,821 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPS1-201ENST00000233072 ZBED3Q96IU2 234 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
CPS1-201ENST00000233072 LRFN5Q96NI6 719 aa6.75□□□□□ -1.33
CPS1-201ENST00000233072 TSSK2Q96PF2 358 aa6.75□□□□□ -1.33
CPS1-201ENST00000233072 PBX4Q9BYU1 374 aa6.75□□□□□ -1.33
CPS1-201ENST00000233072 PAQR5Q9NXK6 330 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
CPS1-201ENST00000233072 LSM5Q9Y4Y9 91 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
CPS1-201ENST00000233072 B3GALT1Q9Y5Z6 326 aa6.75□□□□□ -1.33
CPS1-201ENST00000233072 HS3ST3A1Q9Y663 406 aa6.75□□□□□ -1.33
CPS1-201ENST00000233072 MYH7P12883 1935 aa6.75□□□□□ -1.33
CPS1-201ENST00000233072 A0A1W2PPK0 400 aa6.75□□□□□ -1.33
CPS1-201ENST00000233072 PLSCR5A0PG75 271 aa6.75□□□□□ -1.33
CPS1-201ENST00000233072 MITFO75030 526 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
CPS1-201ENST00000233072 IL3RAP26951 378 aa6.75□□□□□ -1.33
CPS1-201ENST00000233072 CD38P28907 300 aa6.75□□□□□ -1.33
CPS1-201ENST00000233072 EIF1P41567 113 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
CPS1-201ENST00000233072 RPS5P46782 204 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
CPS1-201ENST00000233072 SSR4P51571 173 aa6.75□□□□□ -1.33
CPS1-201ENST00000233072 GPR18Q14330 331 aa6.75□□□□□ -1.33
CPS1-201ENST00000233072 PAGE3Q5JUK9 113 aa6.75□□□□□ -1.33
CPS1-201ENST00000233072 MKXQ8IYA7 352 aa6.75□□□□□ -1.33
CPS1-201ENST00000233072 FAM83FQ8NEG4 500 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
CPS1-201ENST00000233072 OR51Q1Q8NH59 317 aa6.75□□□□□ -1.33
CPS1-201ENST00000233072 SMAP2Q8WU79 429 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
CPS1-201ENST00000233072 RSPRY1Q96DX4 576 aa6.75□□□□□ -1.33
CPS1-201ENST00000233072 HHIPL1Q96JK4 782 aa6.75□□□□□ -1.33
CPS1-201ENST00000233072 SLC6A18Q96N87 628 aa6.75□□□□□ -1.33
CPS1-201ENST00000233072 SLC46A1Q96NT5 459 aa6.75□□□□□ -1.33
CPS1-201ENST00000233072 PPA2Q9H2U2 334 aa6.75□□□□□ -1.33
CPS1-201ENST00000233072 OR52D1Q9H346 318 aa6.75□□□□□ -1.33
CPS1-201ENST00000233072 POLE4Q9NR33 117 aa6.75□□□□□ -1.33
CPS1-201ENST00000233072 OLAHQ9NV23 265 aa6.75□□□□□ -1.33
CPS1-201ENST00000233072 GFOD1Q9NXC2 390 aa6.75□□□□□ -1.33
CPS1-201ENST00000233072 PPP1R14DQ9NXH3 145 aa6.75□□□□□ -1.33
CPS1-201ENST00000233072 TAAR2Q9P1P5 351 aa6.75□□□□□ -1.33
CPS1-201ENST00000233072 TRAV36DV7A0A075B6V5 113 aa6.75□□□□□ -1.33
CPS1-201ENST00000233072 NSG1A0A0A6YYJ2 146 aa6.75□□□□□ -1.33
CPS1-201ENST00000233072 A0A0D9SG52 128 aa6.75□□□□□ -1.33
CPS1-201ENST00000233072 OR6C6A6NF89 314 aa6.75□□□□□ -1.33
CPS1-201ENST00000233072 NKX6-3A6NJ46 265 aa6.75□□□□□ -1.33
CPS1-201ENST00000233072 SYT5O00445 386 aa6.75□□□□□ -1.33
CPS1-201ENST00000233072 MPIG6BO95866 241 aa6.75□□□□□ -1.33
CPS1-201ENST00000233072 GAAP10253 952 aa6.75□□□□□ -1.33
CPS1-201ENST00000233072 GABRA5P31644 462 aa6.75□□□□□ -1.33
CPS1-201ENST00000233072 KIR2DL3P43628 341 aa6.75□□□□□ -1.33
CPS1-201ENST00000233072 HTD2P86397 168 aa6.75□□□□□ -1.33
CPS1-201ENST00000233072 ACSM3Q53FZ2 586 aa6.75□□□□□ -1.33
CPS1-201ENST00000233072 ZNF684Q5T5D7 378 aa6.75□□□□□ -1.33
CPS1-201ENST00000233072 HENMT1Q5T8I9 393 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
CPS1-201ENST00000233072 SFRP4Q6FHJ7 346 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
CPS1-201ENST00000233072 RFPL4BQ6ZWI9 263 aa6.75□□□□□ -1.33
CPS1-201ENST00000233072 MBOAT2Q6ZWT7 520 aa6.75□□□□□ -1.33
CPS1-201ENST00000233072 B3GNT8Q7Z7M8 397 aa6.75□□□□□ -1.33
CPS1-201ENST00000233072 OR4N2Q8NGD1 307 aa6.75□□□□□ -1.33
CPS1-201ENST00000233072 TFAP2CQ92754 450 aa6.75□□□□□ -1.33
CPS1-201ENST00000233072 TAAR8Q969N4 342 aa6.75□□□□□ -1.33
CPS1-201ENST00000233072 SLC41A2Q96JW4 573 aa6.75□□□□□ -1.33
CPS1-201ENST00000233072 SYT11Q9BT88 431 aa6.75□□□□□ -1.33
CPS1-201ENST00000233072 OR51J1Q9H342 316 aa6.75□□□□□ -1.33
CPS1-201ENST00000233072 OR2S2Q9NQN1 319 aa6.75□□□□□ -1.33
CPS1-201ENST00000233072 GPATCH2Q9NW75 528 aa6.75□□□□□ -1.33
CPS1-201ENST00000233072 C4orf47A7E2U8 309 aa6.75□□□□□ -1.33
CPS1-201ENST00000233072 PLATP00750 562 aa6.75□□□□□ -1.33
CPS1-201ENST00000233072 BDKRB2P30411 391 aa6.75□□□□□ -1.33
CPS1-201ENST00000233072 PRKAR1BP31321 381 aa6.75□□□□□ -1.33
CPS1-201ENST00000233072 HTR2BP41595 481 aa6.75□□□□□ -1.33
CPS1-201ENST00000233072 RNF144AP50876 292 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
CPS1-201ENST00000233072 DEFB133Q30KQ1 61 aa6.75□□□□□ -1.33
CPS1-201ENST00000233072 CFAP77Q6ZQR2 320 aa6.75□□□□□ -1.33
CPS1-201ENST00000233072 LRRTM3Q86VH5 581 aa6.75□□□□□ -1.33
CPS1-201ENST00000233072 SDR9C7Q8NEX9 313 aa6.75□□□□□ -1.33
CPS1-201ENST00000233072 OR9K2Q8NGE7 335 aa6.75□□□□□ -1.33
CPS1-201ENST00000233072 TMEM40Q8WWA1 233 aa6.75□□□□□ -1.33
CPS1-201ENST00000233072 NICN1Q9BSH3 213 aa6.75□□□□□ -1.33
CPS1-201ENST00000233072 KIR3DX1Q9H7L2 352 aa6.75□□□□□ -1.33
CPS1-201ENST00000233072 B3GAT1Q9P2W7 334 aa6.75□□□□□ -1.33
CPS1-201ENST00000233072 ACAD8Q9UKU7 415 aa6.75□□□□□ -1.33
CPS1-201ENST00000233072 HS3ST2Q9Y278 367 aa6.75□□□□□ -1.33
CPS1-201ENST00000233072 GPR52Q9Y2T5 361 aa6.75□□□□□ -1.33
CPS1-201ENST00000233072 EMC9Q9Y3B6 208 aa6.75□□□□□ -1.33
CPS1-201ENST00000233072 OR6C76A6NM76 312 aa6.75□□□□□ -1.33
CPS1-201ENST00000233072 HIDE1A8MVS5 230 aa6.75□□□□□ -1.33
CPS1-201ENST00000233072 H3BML4 177 aa6.75□□□□□ -1.33
CPS1-201ENST00000233072 GMDSO60547 372 aa6.75□□□□□ -1.33
CPS1-201ENST00000233072 EIF1BO60739 113 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
CPS1-201ENST00000233072 CA5AP35218 305 aa6.75□□□□□ -1.33
CPS1-201ENST00000233072 SNU13P55769 128 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
CPS1-201ENST00000233072 SLC36A2Q495M3 483 aa6.75□□□□□ -1.33
CPS1-201ENST00000233072 MRPL43Q8N983 215 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
CPS1-201ENST00000233072 SIMC1Q8NDZ2 872 aa6.75□□□□□ -1.33
CPS1-201ENST00000233072 OR4M1Q8NGD0 313 aa6.75□□□□□ -1.33
CPS1-201ENST00000233072 MIB2Q96AX9 1013 aa6.75□□□□□ -1.33
CPS1-201ENST00000233072 ZMYND19Q96E35 227 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
CPS1-201ENST00000233072 FAM71F1Q96KD3 344 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
CPS1-201ENST00000233072 LMF1Q96S06 567 aa6.75□□□□□ -1.33
CPS1-201ENST00000233072 PIGQQ9BRB3 760 aa6.75□□□□□ -1.33
CPS1-201ENST00000233072 CPPED1Q9BRF8 314 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
CPS1-201ENST00000233072 HIPK2Q9H2X6 1198 aa6.75□□□□□ -1.33
CPS1-201ENST00000233072 ASF1BQ9NVP2 202 aa6.75□□□□□ -1.33
CPS1-201ENST00000233072 BABAM2Q9NXR7 383 aa6.75□□□□□ -1.33
CPS1-201ENST00000233072 CNIH4Q9P003 139 aa6.75□□□□□ -1.33
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