RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000008088.8

Ttc9b-201, Transcript of Tetratricopeptide repeat protein 9B, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Ttc9b, Length 2,052 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 CpoxP36552 443 aa18.29■□□□□ 0.52
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Etv1P41164 477 aa18.29■□□□□ 0.52
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Ccbe1Q3MI99 408 aa18.29■□□□□ 0.52
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 CtrcQ3SYP2 268 aa18.29■□□□□ 0.52
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Fam196aQ3USH1 422 aa18.29■□□□□ 0.52
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Xkr7Q5GH64 580 aa18.29■□□□□ 0.52
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Rims3Q80U57 307 aa18.29■□□□□ 0.52
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Supv3l1Q80YD1 779 aaKnown RBP18.29■□□□□ 0.52
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Txnl4bQ8BUH1 149 aa18.29■□□□□ 0.52
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Unc5dQ8K1S2 956 aa18.29■□□□□ 0.52
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Imp3Q921Y2 184 aaKnown RBP18.29■□□□□ 0.52
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Etv5Q9CXC9 510 aa18.29■□□□□ 0.52
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Adck1Q9D0L4 525 aa18.29■□□□□ 0.52
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Clec3aQ9EPW4 196 aa18.29■□□□□ 0.52
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Pole3Q9JKP7 145 aa18.29■□□□□ 0.52
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Actr10Q9QZB7 417 aa18.29■□□□□ 0.52
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Olfr1338A2ACY7 313 aa18.29■□□□□ 0.52
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Gm436B1AVU6 407 aa18.29■□□□□ 0.52
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Olfr287E9PZS7 322 aa18.29■□□□□ 0.52
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Cyp4a10O88833 509 aa18.29■□□□□ 0.52
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Ubl4aP21126 157 aaKnown RBP18.29■□□□□ 0.52
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Hsd3b2P26149 373 aa18.29■□□□□ 0.52
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Sox1P53783 391 aa18.29■□□□□ 0.52
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Slc9a3r1P70441 355 aa18.29■□□□□ 0.52
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Tmprss11cQ1JRP2 431 aa18.29■□□□□ 0.52
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Hddc2Q3SXD3 199 aa18.29■□□□□ 0.52
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Gm1604bQ3TRG0 118 aa18.29■□□□□ 0.52
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Adam26bQ6IMH6 699 aa18.29■□□□□ 0.52
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 RgmaQ6PCX7 454 aa18.29■□□□□ 0.52
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Clec7aQ6QLQ4 244 aa18.29■□□□□ 0.52
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Fbxo34Q80XI1 695 aa18.29■□□□□ 0.52
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Mgat4bQ812F8 548 aa18.29■□□□□ 0.52
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Fbxo46Q8BG80 603 aa18.29■□□□□ 0.52
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Slc35d3Q8BGF8 422 aa18.29■□□□□ 0.52
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Cdk5rap1Q8BTW8 588 aa18.29■□□□□ 0.52
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Timmdc1Q8BUY5 285 aa18.29■□□□□ 0.52
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Ankmy1Q8C0W1 906 aa18.29■□□□□ 0.52
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Zfp119bQ8K0G9 543 aa18.29■□□□□ 0.52
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Ahsa2Q8N9S3 331 aa18.29■□□□□ 0.52
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Med9Q8VCS6 142 aa18.29■□□□□ 0.52
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 As3mtQ91WU5 376 aa18.29■□□□□ 0.52
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Mrgprb3Q91ZC1 312 aa18.29■□□□□ 0.52
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Fastkd2Q922E6 689 aaKnown RBP18.29■□□□□ 0.52
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Batf3Q9D275 118 aa18.29■□□□□ 0.52
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 NfkbiaQ9Z1E3 314 aa18.29■□□□□ 0.52
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Zfp54E9PW05 585 aa18.28■□□□□ 0.52
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Olfr543E9PWI5 336 aa18.28■□□□□ 0.52
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Zfp945E9PYM8 794 aa18.28■□□□□ 0.52
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Zfp870J3QMA4 560 aa18.28■□□□□ 0.52
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Efna1P52793 205 aa18.28■□□□□ 0.52
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Scn1bP97952 218 aa18.28■□□□□ 0.52
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Myl12bQ3THE2 172 aaKnown RBP18.28■□□□□ 0.52
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Olfr146Q60884 306 aa18.28■□□□□ 0.52
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Surf4Q64310 269 aa18.28■□□□□ 0.52
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 AY358078Q6UY53 465 aa18.28■□□□□ 0.52
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Serpina3fQ80X76 445 aa18.28■□□□□ 0.52
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Spag1Q80ZX8 901 aa18.28■□□□□ 0.52
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Flrt3Q8BGT1 649 aa18.28■□□□□ 0.52
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Olfr692Q8VF03 329 aa18.28■□□□□ 0.52
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 SostQ99P68 211 aa18.28■□□□□ 0.52
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 P2ry12Q9CPV9 347 aa18.28■□□□□ 0.52
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Mrpl54Q9CPW3 135 aa18.28■□□□□ 0.52
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Tmem269Q9D4Y8 254 aa18.28■□□□□ 0.52
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Brca2P97929 3329 aa18.28■□□□□ 0.52
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Slc25a43A2A3V2 341 aa18.27■□□□□ 0.52
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Amd2D3Z6H8 334 aa18.27■□□□□ 0.52
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2610021A01RikE9Q0Q3 834 aa18.27■□□□□ 0.52
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Vmn1r175K7N6T9 304 aa18.27■□□□□ 0.52
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Cep76Q0VEJ0 659 aa18.27■□□□□ 0.52
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 CfiQ61129 603 aa18.27■□□□□ 0.52
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Zfp933Q6PEE4 468 aa18.27■□□□□ 0.52
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Tas2r117Q7M715 330 aa18.27■□□□□ 0.52
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Olfr1065Q7TR70 313 aa18.27■□□□□ 0.52
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Ptbp3Q8BHD7 523 aaKnown RBP18.27■□□□□ 0.52
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Q8C784 167 aa18.27■□□□□ 0.52
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Lin28aQ8K3Y3 209 aaKnown RBP18.27■□□□□ 0.52
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Vmn1r83Q8R287 306 aa18.27■□□□□ 0.52
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Asb6Q91ZU1 418 aa18.27■□□□□ 0.52
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Zbtb8aQ9CWH1 434 aa18.27■□□□□ 0.52
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Hmg20aQ9DC33 346 aa18.27■□□□□ 0.52
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Nectin3Q9JLB9 549 aa18.27■□□□□ 0.52
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Fbxo8Q9QZN3 319 aa18.27■□□□□ 0.52
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Efemp2Q9WVJ9 443 aa18.27■□□□□ 0.52
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Golga4Q91VW5 2238 aa18.27■□□□□ 0.52
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2010106E10RikA2ANY3 279 aa18.27■□□□□ 0.51
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Zfp40B1B1D3 796 aa18.27■□□□□ 0.51
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Gm21820J3KMU2 361 aa18.27■□□□□ 0.51
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Zfp994J3QM38 661 aa18.27■□□□□ 0.51
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 CmahQ61419 577 aa18.27■□□□□ 0.51
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Klhl6Q6V595 619 aa18.27■□□□□ 0.51
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Olfr645Q7TRQ1 315 aa18.27■□□□□ 0.51
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Lhfpl6Q8BM86 200 aa18.27■□□□□ 0.51
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Fem1abQ8C0T1 654 aa18.27■□□□□ 0.51
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Q8R3Y5 413 aa18.27■□□□□ 0.51
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Rhbdl1Q8VC82 373 aa18.27■□□□□ 0.51
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 SgtbQ8VD33 304 aa18.27■□□□□ 0.51
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Abhd17aQ99JW1 310 aa18.27■□□□□ 0.51
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Chmp1b1Q99LU0 199 aa18.27■□□□□ 0.51
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Cd302Q9DCG2 228 aa18.27■□□□□ 0.51
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Vmn1r40Q9EQ46 310 aa18.27■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 36.5 ms