RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000639895.1

SPIN3-231, Transcript of spindlin family member 3, human

TSL 5

Gene SPIN3, Length 4,234 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SPIN3-231	ENST00000639895	MEMO1	Q9Y316	297 aa		10.62	□□□□□ -0.71
SPIN3-231	ENST00000639895	FCF1	Q9Y324	198 aa	Known RBP	10.62	□□□□□ -0.71
SPIN3-231	ENST00000639895	SBF2	Q86WG5	1849 aa		10.62	□□□□□ -0.71
SPIN3-231	ENST00000639895		A0A0D9SEW6	157 aa		10.62	□□□□□ -0.71
SPIN3-231	ENST00000639895	WASH3P	C4AMC7	463 aa		10.62	□□□□□ -0.71
SPIN3-231	ENST00000639895	SERPINA5	P05154	406 aa		10.62	□□□□□ -0.71
SPIN3-231	ENST00000639895	IQCF3	P0C7M6	154 aa		10.62	□□□□□ -0.71
SPIN3-231	ENST00000639895	CXCL2	P19875	107 aa		10.62	□□□□□ -0.71
SPIN3-231	ENST00000639895	ST8SIA6	P61647	398 aa		10.62	□□□□□ -0.71
SPIN3-231	ENST00000639895	RAB41	Q5JT25	222 aa		10.62	□□□□□ -0.71
SPIN3-231	ENST00000639895	MARCH8	Q5T0T0	291 aa		10.62	□□□□□ -0.71
SPIN3-231	ENST00000639895	PTOV1	Q86YD1	416 aa		10.62	□□□□□ -0.71
SPIN3-231	ENST00000639895	ADAMTSL1	Q8N6G6	1762 aa		10.62	□□□□□ -0.71
SPIN3-231	ENST00000639895	ABHD4	Q8TB40	342 aa		10.62	□□□□□ -0.71
SPIN3-231	ENST00000639895	FOXRED1	Q96CU9	486 aa	Predicted RBP	10.62	□□□□□ -0.71
SPIN3-231	ENST00000639895	TMEM41A	Q96HV5	264 aa		10.62	□□□□□ -0.71
SPIN3-231	ENST00000639895	TRMT61B	Q9BVS5	477 aa	Known RBP	10.62	□□□□□ -0.71
SPIN3-231	ENST00000639895	COMMD4	Q9H0A8	199 aa		10.62	□□□□□ -0.71
SPIN3-231	ENST00000639895	FAM86C1	Q9NVL1	165 aa		10.62	□□□□□ -0.71
SPIN3-231	ENST00000639895	ASB6	Q9NWX5	421 aa		10.62	□□□□□ -0.71
SPIN3-231	ENST00000639895	FAM96B	Q9Y3D0	163 aa		10.62	□□□□□ -0.71
SPIN3-231	ENST00000639895	C7orf66	A4D0T2	115 aa		10.62	□□□□□ -0.71
SPIN3-231	ENST00000639895	ZNF705F	A8MVS1	300 aa	Predicted RBP	10.62	□□□□□ -0.71
SPIN3-231	ENST00000639895	ZNF705D	P0CH99	300 aa	Predicted RBP	10.62	□□□□□ -0.71
SPIN3-231	ENST00000639895	ZNF705B	P0CI00	300 aa	Predicted RBP	10.62	□□□□□ -0.71
SPIN3-231	ENST00000639895	GPR143	P51810	404 aa		10.62	□□□□□ -0.71
SPIN3-231	ENST00000639895	OR2W3	Q7Z3T1	314 aa		10.62	□□□□□ -0.71
SPIN3-231	ENST00000639895	C6orf120	Q7Z4R8	191 aa		10.62	□□□□□ -0.71
SPIN3-231	ENST00000639895	GPR142	Q7Z601	462 aa		10.62	□□□□□ -0.71
SPIN3-231	ENST00000639895	OR2AK2	Q8NG84	335 aa		10.62	□□□□□ -0.71
SPIN3-231	ENST00000639895	HUS1B	Q8NHY5	278 aa		10.62	□□□□□ -0.71
SPIN3-231	ENST00000639895	GHSR	Q92847	366 aa		10.62	□□□□□ -0.71
SPIN3-231	ENST00000639895	RGMA	Q96B86	450 aa		10.62	□□□□□ -0.71
SPIN3-231	ENST00000639895	MCHR1	Q99705	422 aa		10.62	□□□□□ -0.71
SPIN3-231	ENST00000639895	EDEM2	Q9BV94	578 aa		10.62	□□□□□ -0.71
SPIN3-231	ENST00000639895	RIOK2	Q9BVS4	552 aa	Known RBP	10.62	□□□□□ -0.71
SPIN3-231	ENST00000639895	ZNF275	Q9NSD4	429 aa	Predicted RBP	10.62	□□□□□ -0.71
SPIN3-231	ENST00000639895	ZNF831	Q5JPB2	1677 aa		10.61	□□□□□ -0.71
SPIN3-231	ENST00000639895	IGSF6	O95976	241 aa		10.61	□□□□□ -0.71
SPIN3-231	ENST00000639895	PGAM2	P15259	253 aa		10.61	□□□□□ -0.71
SPIN3-231	ENST00000639895	MELK	Q14680	651 aa		10.61	□□□□□ -0.71
SPIN3-231	ENST00000639895	RPE65	Q16518	533 aa		10.61	□□□□□ -0.71
SPIN3-231	ENST00000639895	PLA1A	Q53H76	456 aa		10.61	□□□□□ -0.71
SPIN3-231	ENST00000639895	FCRLB	Q6BAA4	426 aa		10.61	□□□□□ -0.71
SPIN3-231	ENST00000639895	ARMC6	Q6NXE6	501 aa		10.61	□□□□□ -0.71
SPIN3-231	ENST00000639895	CALHM3	Q86XJ0	350 aa		10.61	□□□□□ -0.71
SPIN3-231	ENST00000639895	NRM	Q8IXM6	262 aa		10.61	□□□□□ -0.71
SPIN3-231	ENST00000639895	KDM8	Q8N371	416 aa		10.61	□□□□□ -0.71
SPIN3-231	ENST00000639895	ZNF383	Q8NA42	475 aa		10.61	□□□□□ -0.71
SPIN3-231	ENST00000639895	NLGN2	Q8NFZ4	835 aa		10.61	□□□□□ -0.71
SPIN3-231	ENST00000639895	TERB2	Q8NHR7	220 aa		10.61	□□□□□ -0.71
SPIN3-231	ENST00000639895	HAVCR2	Q8TDQ0	301 aa		10.61	□□□□□ -0.71
SPIN3-231	ENST00000639895	HGD	Q93099	445 aa		10.61	□□□□□ -0.71
SPIN3-231	ENST00000639895	PEX11G	Q96HA9	241 aa		10.61	□□□□□ -0.71
SPIN3-231	ENST00000639895	PARP12	Q9H0J9	701 aa	Known RBP	10.61	□□□□□ -0.71
SPIN3-231	ENST00000639895	MAGEH1	Q9H213	219 aa		10.61	□□□□□ -0.71
SPIN3-231	ENST00000639895	KIF13B	Q9NQT8	1826 aa		10.61	□□□□□ -0.71
SPIN3-231	ENST00000639895	PQLC2L	A1A4F0	135 aa		10.61	□□□□□ -0.71
SPIN3-231	ENST00000639895	CARNS1	A5YM72	827 aa		10.61	□□□□□ -0.71
SPIN3-231	ENST00000639895	CA12	O43570	354 aa		10.61	□□□□□ -0.71
SPIN3-231	ENST00000639895	CLDN7	O95471	211 aa		10.61	□□□□□ -0.71
SPIN3-231	ENST00000639895	ADH1C	P00326	375 aa		10.61	□□□□□ -0.71
SPIN3-231	ENST00000639895	IFNA2	P01563	188 aa		10.61	□□□□□ -0.71
SPIN3-231	ENST00000639895	CCR4	P51679	360 aa		10.61	□□□□□ -0.71
SPIN3-231	ENST00000639895	TAF10	Q12962	218 aa		10.61	□□□□□ -0.71
SPIN3-231	ENST00000639895	TANGO2	Q6ICL3	276 aa		10.61	□□□□□ -0.71
SPIN3-231	ENST00000639895	AGTRAP	Q6RW13	159 aa		10.61	□□□□□ -0.71
SPIN3-231	ENST00000639895	MED20	Q9H944	212 aa		10.61	□□□□□ -0.71
SPIN3-231	ENST00000639895	KLK11	Q9UBX7	282 aa		10.61	□□□□□ -0.71
SPIN3-231	ENST00000639895	CYP8B1	Q9UNU6	501 aa		10.61	□□□□□ -0.71
SPIN3-231	ENST00000639895	SLC22A31	A6NKX4	558 aa		10.61	□□□□□ -0.71
SPIN3-231	ENST00000639895	EIF1AY	O14602	144 aa	Known RBP	10.61	□□□□□ -0.71
SPIN3-231	ENST00000639895	AKR7A3	O95154	331 aa		10.61	□□□□□ -0.71
SPIN3-231	ENST00000639895	RCBTB2	O95199	551 aa		10.61	□□□□□ -0.71
SPIN3-231	ENST00000639895	DBI	P07108	87 aa	Known RBP	10.61	□□□□□ -0.71
SPIN3-231	ENST00000639895	UQCRC2	P22695	453 aa		10.61	□□□□□ -0.71
SPIN3-231	ENST00000639895	ABCD3	P28288	659 aa		10.61	□□□□□ -0.71
SPIN3-231	ENST00000639895	GRPR	P30550	384 aa		10.61	□□□□□ -0.71
SPIN3-231	ENST00000639895	EIF1AX	P47813	144 aa	Known RBP	10.61	□□□□□ -0.71
SPIN3-231	ENST00000639895	SKP2	Q13309	424 aa		10.61	□□□□□ -0.71
SPIN3-231	ENST00000639895	SERINC3	Q13530	473 aa		10.61	□□□□□ -0.71
SPIN3-231	ENST00000639895	MS4A13	Q5J8X5	152 aa		10.61	□□□□□ -0.71
SPIN3-231	ENST00000639895	LRRC73	Q5JTD7	316 aa		10.61	□□□□□ -0.71
SPIN3-231	ENST00000639895	LRRC56	Q8IYG6	542 aa	Predicted RBP	10.61	□□□□□ -0.71
SPIN3-231	ENST00000639895	UMODL1-AS1	Q8N2C9	162 aa		10.61	□□□□□ -0.71
SPIN3-231	ENST00000639895	ISOC2	Q96AB3	205 aa		10.61	□□□□□ -0.71
SPIN3-231	ENST00000639895	RRNAD1	Q96FB5	475 aa	Known RBP	10.61	□□□□□ -0.71
SPIN3-231	ENST00000639895	ZNF354B	Q96LW1	612 aa		10.61	□□□□□ -0.71
SPIN3-231	ENST00000639895	TRIM2	Q9C040	744 aa		10.61	□□□□□ -0.71
SPIN3-231	ENST00000639895	DNASE2	O00115	360 aa	Predicted RBP	10.6	□□□□□ -0.71
SPIN3-231	ENST00000639895	GYPB	P06028	91 aa		10.6	□□□□□ -0.71
SPIN3-231	ENST00000639895	AKAIN1	P0CW23	69 aa		10.6	□□□□□ -0.71
SPIN3-231	ENST00000639895	NFYB	P25208	207 aa		10.6	□□□□□ -0.71
SPIN3-231	ENST00000639895	ELAVL4	P26378	380 aa	Known RBP	10.6	□□□□□ -0.71
SPIN3-231	ENST00000639895	ATP5C1	P36542	298 aa	Known RBP	10.6	□□□□□ -0.71
SPIN3-231	ENST00000639895	ALDH3B1	P43353	468 aa		10.6	□□□□□ -0.71
SPIN3-231	ENST00000639895	SGCA	Q16586	387 aa		10.6	□□□□□ -0.71
SPIN3-231	ENST00000639895	RNASE10	Q5GAN6	216 aa	Known RBP	10.6	□□□□□ -0.71
SPIN3-231	ENST00000639895	C9orf131	Q5VYM1	1079 aa		10.6	□□□□□ -0.71
SPIN3-231	ENST00000639895	RPTN	Q6XPR3	784 aa		10.6	□□□□□ -0.71

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