RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000628078.2

TCF4-262, Transcript of transcription factor 4, human

TSL 5

Gene TCF4, Length 1,277 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TCF4-262	ENST00000628078	HOXD1	Q9GZZ0	328 aa		11.94	□□□□□ -0.5
TCF4-262	ENST00000628078	ALG2	Q9H553	416 aa		11.94	□□□□□ -0.5
TCF4-262	ENST00000628078	NPAP1	Q9NZP6	1156 aa		11.94	□□□□□ -0.5
TCF4-262	ENST00000628078	B3GALT5	Q9Y2C3	310 aa		11.94	□□□□□ -0.5
TCF4-262	ENST00000628078	TMED5	Q9Y3A6	229 aa		11.94	□□□□□ -0.5
TCF4-262	ENST00000628078	ABCA1	O95477	2261 aa		11.93	□□□□□ -0.5
TCF4-262	ENST00000628078	SHISA9	B4DS77	424 aa		11.93	□□□□□ -0.5
TCF4-262	ENST00000628078	NPIPB9	F8W1W9	429 aa		11.93	□□□□□ -0.5
TCF4-262	ENST00000628078	RAD51D	O75771	328 aa		11.93	□□□□□ -0.5
TCF4-262	ENST00000628078	HSPA4L	O95757	839 aa		11.93	□□□□□ -0.5
TCF4-262	ENST00000628078	FES	P07332	822 aa		11.93	□□□□□ -0.5
TCF4-262	ENST00000628078	FGF4	P08620	206 aa		11.93	□□□□□ -0.5
TCF4-262	ENST00000628078	UBTFL6	P0CB48	400 aa	Predicted RBP	11.93	□□□□□ -0.5
TCF4-262	ENST00000628078	TFPI	P10646	304 aa		11.93	□□□□□ -0.5
TCF4-262	ENST00000628078	UBL4A	P11441	157 aa		11.93	□□□□□ -0.5
TCF4-262	ENST00000628078	MATN1	P21941	496 aa		11.93	□□□□□ -0.5
TCF4-262	ENST00000628078	ARRB2	P32121	409 aa		11.93	□□□□□ -0.5
TCF4-262	ENST00000628078	ZNF83	P51522	516 aa		11.93	□□□□□ -0.5
TCF4-262	ENST00000628078	FOXG1	P55316	489 aa	Predicted RBP	11.93	□□□□□ -0.5
TCF4-262	ENST00000628078	SESN3	P58005	492 aa		11.93	□□□□□ -0.5
TCF4-262	ENST00000628078	RAC3	P60763	192 aa		11.93	□□□□□ -0.5
TCF4-262	ENST00000628078	HBA1	P69905	142 aa		11.93	□□□□□ -0.5
TCF4-262	ENST00000628078	SPOCK1	Q08629	439 aa		11.93	□□□□□ -0.5
TCF4-262	ENST00000628078	MERTK	Q12866	999 aa		11.93	□□□□□ -0.5
TCF4-262	ENST00000628078	SELENBP1	Q13228	472 aa		11.93	□□□□□ -0.5
TCF4-262	ENST00000628078	LSM12	Q3MHD2	195 aa	Known RBP	11.93	□□□□□ -0.5
TCF4-262	ENST00000628078	C6orf136	Q5SQH8	315 aa		11.93	□□□□□ -0.5
TCF4-262	ENST00000628078		Q6ZT83	130 aa		11.93	□□□□□ -0.5
TCF4-262	ENST00000628078	SLC43A2	Q8N370	569 aa		11.93	□□□□□ -0.5
TCF4-262	ENST00000628078	FNDC5	Q8NAU1	212 aa		11.93	□□□□□ -0.5
TCF4-262	ENST00000628078	OR56A1	Q8NGH5	318 aa		11.93	□□□□□ -0.5
TCF4-262	ENST00000628078	KIF18A	Q8NI77	898 aa		11.93	□□□□□ -0.5
TCF4-262	ENST00000628078	MUCL1	Q96DR8	90 aa		11.93	□□□□□ -0.5
TCF4-262	ENST00000628078	MRGPRX4	Q96LA9	322 aa		11.93	□□□□□ -0.5
TCF4-262	ENST00000628078	PPP3R2	Q96LZ3	170 aa		11.93	□□□□□ -0.5
TCF4-262	ENST00000628078	TRAF4	Q9BUZ4	470 aa	Predicted RBP	11.93	□□□□□ -0.5
TCF4-262	ENST00000628078	POTEKP	Q9BYX7	375 aa		11.93	□□□□□ -0.5
TCF4-262	ENST00000628078	SERHL2	Q9H4I8	314 aa		11.93	□□□□□ -0.5
TCF4-262	ENST00000628078	KLHL9	Q9P2J3	617 aa		11.93	□□□□□ -0.5
TCF4-262	ENST00000628078	ZDHHC2	Q9UIJ5	367 aa		11.93	□□□□□ -0.5
TCF4-262	ENST00000628078	FBN3	Q75N90	2809 aa		11.92	□□□□□ -0.5
TCF4-262	ENST00000628078	IGHV4-30-2	A0A087WSY4	118 aa		11.92	□□□□□ -0.5
TCF4-262	ENST00000628078	FAM234B	A2RU67	622 aa		11.92	□□□□□ -0.5
TCF4-262	ENST00000628078	SERINC4	A6NH21	518 aa		11.92	□□□□□ -0.5
TCF4-262	ENST00000628078	SULT2B1	O00204	365 aa		11.92	□□□□□ -0.5
TCF4-262	ENST00000628078	CD5L	O43866	347 aa		11.92	□□□□□ -0.5
TCF4-262	ENST00000628078	CYTIP	O60759	359 aa		11.92	□□□□□ -0.5
TCF4-262	ENST00000628078	TMCC2	O75069	709 aa		11.92	□□□□□ -0.5
TCF4-262	ENST00000628078	BCAS1	O75363	584 aa	Predicted RBP	11.92	□□□□□ -0.5
TCF4-262	ENST00000628078	MAPK1	P28482	360 aa		11.92	□□□□□ -0.5
TCF4-262	ENST00000628078	RYK	P34925	604 aa		11.92	□□□□□ -0.5
TCF4-262	ENST00000628078	DIO1	P49895	249 aa		11.92	□□□□□ -0.5
TCF4-262	ENST00000628078	CDH11	P55287	796 aa		11.92	□□□□□ -0.5
TCF4-262	ENST00000628078	SUMO3	P55854	103 aa	Predicted RBP	11.92	□□□□□ -0.5
TCF4-262	ENST00000628078	IRX1	P78414	480 aa	Predicted RBP	11.92	□□□□□ -0.5
TCF4-262	ENST00000628078	CBFB	Q13951	182 aa		11.92	□□□□□ -0.5
TCF4-262	ENST00000628078	ATP6AP1L	Q52LC2	224 aa		11.92	□□□□□ -0.5
TCF4-262	ENST00000628078	C9orf135	Q5VTT2	229 aa		11.92	□□□□□ -0.5
TCF4-262	ENST00000628078	C6orf120	Q7Z4R8	191 aa		11.92	□□□□□ -0.5
TCF4-262	ENST00000628078	TUBGCP3	Q96CW5	907 aa		11.92	□□□□□ -0.5
TCF4-262	ENST00000628078	COQ8B	Q96D53	544 aa		11.92	□□□□□ -0.5
TCF4-262	ENST00000628078	TRMO	Q9BU70	441 aa		11.92	□□□□□ -0.5
TCF4-262	ENST00000628078	DUSP26	Q9BV47	211 aa		11.92	□□□□□ -0.5
TCF4-262	ENST00000628078	CACNG6	Q9BXT2	260 aa		11.92	□□□□□ -0.5
TCF4-262	ENST00000628078	BCO1	Q9HAY6	547 aa		11.92	□□□□□ -0.5
TCF4-262	ENST00000628078	MID2	Q9UJV3	735 aa		11.92	□□□□□ -0.5
TCF4-262	ENST00000628078	POU2F3	Q9UKI9	436 aa		11.92	□□□□□ -0.5
TCF4-262	ENST00000628078	ACTL7B	Q9Y614	415 aa		11.92	□□□□□ -0.5
TCF4-262	ENST00000628078	COL6A5	A8TX70	2615 aa		11.91	□□□□□ -0.5
TCF4-262	ENST00000628078	CIB4	A0PJX0	185 aa		11.91	□□□□□ -0.5
TCF4-262	ENST00000628078	CCT8L1P	A6NM43	557 aa		11.91	□□□□□ -0.5
TCF4-262	ENST00000628078		E7EQL1	145 aa		11.91	□□□□□ -0.5
TCF4-262	ENST00000628078	KIF2A	O00139	706 aa	Predicted RBP	11.91	□□□□□ -0.5
TCF4-262	ENST00000628078	NPHS1	O60500	1241 aa		11.91	□□□□□ -0.5
TCF4-262	ENST00000628078	EIF4E2	O60573	245 aa	Known RBP	11.91	□□□□□ -0.5
TCF4-262	ENST00000628078	UGT2B17	O75795	530 aa		11.91	□□□□□ -0.5
TCF4-262	ENST00000628078	CPSF4	O95639	269 aa	Known RBP	11.91	□□□□□ -0.5
TCF4-262	ENST00000628078	CSTA	P01040	98 aa		11.91	□□□□□ -0.5
TCF4-262	ENST00000628078	C1QC	P02747	245 aa		11.91	□□□□□ -0.5
TCF4-262	ENST00000628078	G6PD	P11413	515 aa		11.91	□□□□□ -0.5
TCF4-262	ENST00000628078	CREB1	P16220	341 aa		11.91	□□□□□ -0.5
TCF4-262	ENST00000628078	GGT1	P19440	569 aa		11.91	□□□□□ -0.5
TCF4-262	ENST00000628078	NTF4	P34130	210 aa		11.91	□□□□□ -0.5
TCF4-262	ENST00000628078	RPL3	P39023	403 aa	Known RBP	11.91	□□□□□ -0.5
TCF4-262	ENST00000628078	MAPK14	Q16539	360 aa		11.91	□□□□□ -0.5
TCF4-262	ENST00000628078	SLC25A53	Q5H9E4	307 aa		11.91	□□□□□ -0.5
TCF4-262	ENST00000628078	OR4F3	Q6IEY1	312 aa		11.91	□□□□□ -0.5
TCF4-262	ENST00000628078	SLC22A25	Q6T423	547 aa		11.91	□□□□□ -0.5
TCF4-262	ENST00000628078	RNF165	Q6ZSG1	346 aa		11.91	□□□□□ -0.5
TCF4-262	ENST00000628078	GALNT5	Q7Z7M9	940 aa		11.91	□□□□□ -0.5
TCF4-262	ENST00000628078	TDRP	Q86YL5	185 aa		11.91	□□□□□ -0.5
TCF4-262	ENST00000628078	HIPK1	Q86Z02	1210 aa		11.91	□□□□□ -0.5
TCF4-262	ENST00000628078	CCDC103	Q8IW40	242 aa		11.91	□□□□□ -0.5
TCF4-262	ENST00000628078	PHC2	Q8IXK0	858 aa		11.91	□□□□□ -0.5
TCF4-262	ENST00000628078	ZNF433	Q8N7K0	673 aa	Predicted RBP	11.91	□□□□□ -0.5
TCF4-262	ENST00000628078	RAB8B	Q92930	207 aa		11.91	□□□□□ -0.5
TCF4-262	ENST00000628078	APOPT1	Q96IL0	206 aa		11.91	□□□□□ -0.5
TCF4-262	ENST00000628078	PRPF18	Q99633	342 aa	Known RBP	11.91	□□□□□ -0.5
TCF4-262	ENST00000628078	RHNO1	Q9BSD3	238 aa		11.91	□□□□□ -0.5
TCF4-262	ENST00000628078	LAT2	Q9GZY6	243 aa		11.91	□□□□□ -0.5

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