RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590874.5

CAPNS1-211, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 926 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-211ENST00000590874 UBL4AP11441 157 aa22.64■■□□□ 1.21
CAPNS1-211ENST00000590874 DDX5P17844 614 aaKnown RBP22.64■■□□□ 1.21
CAPNS1-211ENST00000590874 GGT1P19440 569 aa22.64■■□□□ 1.21
CAPNS1-211ENST00000590874 IRX1P78414 480 aaPredicted RBP22.64■■□□□ 1.21
CAPNS1-211ENST00000590874 NRF1Q16656 503 aa22.64■■□□□ 1.21
CAPNS1-211ENST00000590874 UGT3A2Q3SY77 523 aa22.64■■□□□ 1.21
CAPNS1-211ENST00000590874 SPDYE7PQ495Y7 208 aa22.64■■□□□ 1.21
CAPNS1-211ENST00000590874 C3orf33Q6P1S2 294 aa22.64■■□□□ 1.21
CAPNS1-211ENST00000590874 RHNO1Q9BSD3 238 aa22.64■■□□□ 1.21
CAPNS1-211ENST00000590874 TRMOQ9BU70 441 aa22.64■■□□□ 1.21
CAPNS1-211ENST00000590874 GOLGA8QA0A0J9YX86 632 aa22.63■■□□□ 1.21
CAPNS1-211ENST00000590874 GOLGA8OA6NCC3 632 aa22.63■■□□□ 1.21
CAPNS1-211ENST00000590874 SMIM23A6NLE4 172 aa22.63■■□□□ 1.21
CAPNS1-211ENST00000590874 ZNF724A8MTY0 619 aa22.63■■□□□ 1.21
CAPNS1-211ENST00000590874 GOLGA8NF8WBI6 632 aa22.63■■□□□ 1.21
CAPNS1-211ENST00000590874 PGM3O95394 542 aa22.63■■□□□ 1.21
CAPNS1-211ENST00000590874 NUDT6P53370 316 aa22.63■■□□□ 1.21
CAPNS1-211ENST00000590874 CBFBQ13951 182 aa22.63■■□□□ 1.21
CAPNS1-211ENST00000590874 PTGR1Q14914 329 aa22.63■■□□□ 1.21
CAPNS1-211ENST00000590874 TIGD2Q4W5G0 525 aa22.63■■□□□ 1.21
CAPNS1-211ENST00000590874 PDZK1Q5T2W1 519 aa22.63■■□□□ 1.21
CAPNS1-211ENST00000590874 C6orf52Q5T4I8 152 aa22.63■■□□□ 1.21
CAPNS1-211ENST00000590874 AGAP6Q5VW22 663 aa22.63■■□□□ 1.21
CAPNS1-211ENST00000590874 C11orf71Q6IPW1 123 aa22.63■■□□□ 1.21
CAPNS1-211ENST00000590874 C4orf33Q8N1A6 199 aa22.63■■□□□ 1.21
CAPNS1-211ENST00000590874 OR10H5Q8NGA6 315 aa22.63■■□□□ 1.21
CAPNS1-211ENST00000590874 OR5D16Q8NGK9 328 aa22.63■■□□□ 1.21
CAPNS1-211ENST00000590874 OR7D2Q96RA2 312 aa22.63■■□□□ 1.21
CAPNS1-211ENST00000590874 CACNG6Q9BXT2 260 aa22.63■■□□□ 1.21
CAPNS1-211ENST00000590874 OR5H1A6NKK0 313 aa22.62■■□□□ 1.21
CAPNS1-211ENST00000590874 TMEM114B3SHH9 223 aa22.62■■□□□ 1.21
CAPNS1-211ENST00000590874 EIF4E2O60573 245 aaKnown RBP22.62■■□□□ 1.21
CAPNS1-211ENST00000590874 KRT16P08779 473 aa22.62■■□□□ 1.21
CAPNS1-211ENST00000590874 KRT4P19013 534 aa22.62■■□□□ 1.21
CAPNS1-211ENST00000590874 RPL3P39023 403 aaKnown RBP22.62■■□□□ 1.21
CAPNS1-211ENST00000590874 SPOCK1Q08629 439 aa22.62■■□□□ 1.21
CAPNS1-211ENST00000590874 ZNF100Q8IYN0 542 aa22.62■■□□□ 1.21
CAPNS1-211ENST00000590874 PIAS4Q8N2W9 510 aaPredicted RBP22.62■■□□□ 1.21
CAPNS1-211ENST00000590874 ZNF433Q8N7K0 673 aaPredicted RBP22.62■■□□□ 1.21
CAPNS1-211ENST00000590874 OR5AK3PQ8NH89 298 aa22.62■■□□□ 1.21
CAPNS1-211ENST00000590874 TMEM158Q8WZ71 300 aa22.62■■□□□ 1.21
CAPNS1-211ENST00000590874 CENPVL1A0A0U1RR11 272 aa22.61■■□□□ 1.21
CAPNS1-211ENST00000590874 FAM234BA2RU67 622 aa22.61■■□□□ 1.21
CAPNS1-211ENST00000590874 E7EQL1 145 aa22.61■■□□□ 1.21
CAPNS1-211ENST00000590874 TRIM13O60858 407 aa22.61■■□□□ 1.21
CAPNS1-211ENST00000590874 PEX11AO75192 247 aa22.61■■□□□ 1.21
CAPNS1-211ENST00000590874 RAD51DO75771 328 aa22.61■■□□□ 1.21
CAPNS1-211ENST00000590874 IGHV3-9P01782 118 aa22.61■■□□□ 1.21
CAPNS1-211ENST00000590874 FGF4P08620 206 aa22.61■■□□□ 1.21
CAPNS1-211ENST00000590874 DIO1P49895 249 aa22.61■■□□□ 1.21
CAPNS1-211ENST00000590874 SKP2Q13309 424 aa22.61■■□□□ 1.21
CAPNS1-211ENST00000590874 ARL13AQ5H913 290 aaPredicted RBP22.61■■□□□ 1.21
CAPNS1-211ENST00000590874 GALNT5Q7Z7M9 940 aa22.61■■□□□ 1.21
CAPNS1-211ENST00000590874 P2RY8Q86VZ1 359 aa22.61■■□□□ 1.21
CAPNS1-211ENST00000590874 SFXN5Q8TD22 340 aa22.61■■□□□ 1.21
CAPNS1-211ENST00000590874 HTRA1Q92743 480 aa22.61■■□□□ 1.21
CAPNS1-211ENST00000590874 ADAD1Q96M93 576 aaKnown RBP22.61■■□□□ 1.21
CAPNS1-211ENST00000590874 SDF2Q99470 211 aa22.61■■□□□ 1.21
CAPNS1-211ENST00000590874 C1orf50Q9BV19 199 aa22.61■■□□□ 1.21
CAPNS1-211ENST00000590874 THUMPD3Q9BV44 507 aaKnown RBP22.61■■□□□ 1.21
CAPNS1-211ENST00000590874 KCNE5Q9UJ90 142 aa22.61■■□□□ 1.21
CAPNS1-211ENST00000590874 MID2Q9UJV3 735 aa22.61■■□□□ 1.21
CAPNS1-211ENST00000590874 TRAF6Q9Y4K3 522 aa22.61■■□□□ 1.21
CAPNS1-211ENST00000590874 CADP27708 2225 aa22.6■■□□□ 1.21
CAPNS1-211ENST00000590874 SERINC4A6NH21 518 aa22.6■■□□□ 1.21
CAPNS1-211ENST00000590874 PHF1O43189 567 aaPredicted RBP22.6■■□□□ 1.21
CAPNS1-211ENST00000590874 DNAJA2O60884 412 aa22.6■■□□□ 1.21
CAPNS1-211ENST00000590874 MAPK1P28482 360 aa22.6■■□□□ 1.21
CAPNS1-211ENST00000590874 TTKP33981 857 aa22.6■■□□□ 1.21
CAPNS1-211ENST00000590874 RPS26P62854 115 aaKnown RBP22.6■■□□□ 1.21
CAPNS1-211ENST00000590874 TMEM249Q2WGJ8 235 aa22.6■■□□□ 1.21
CAPNS1-211ENST00000590874 XKR7Q5GH72 579 aa22.6■■□□□ 1.21
CAPNS1-211ENST00000590874 ABLIM2Q6H8Q1 611 aa22.6■■□□□ 1.21
CAPNS1-211ENST00000590874 B3GLCTQ6Y288 498 aa22.6■■□□□ 1.21
CAPNS1-211ENST00000590874 SSX8Q7RTT4 187 aa22.6■■□□□ 1.21
CAPNS1-211ENST00000590874 OLIG3Q7RTU3 272 aa22.6■■□□□ 1.21
CAPNS1-211ENST00000590874 KRTCAP2Q8N6L1 136 aa22.6■■□□□ 1.21
CAPNS1-211ENST00000590874 OR52N5Q8NH56 324 aa22.6■■□□□ 1.21
CAPNS1-211ENST00000590874 AGR3Q8TD06 166 aa22.6■■□□□ 1.21
CAPNS1-211ENST00000590874 EPS8L3Q8TE67 593 aaKnown RBP22.6■■□□□ 1.21
CAPNS1-211ENST00000590874 COQ8BQ96D53 544 aa22.6■■□□□ 1.21
CAPNS1-211ENST00000590874 RADILQ96JH8 1075 aa22.6■■□□□ 1.21
CAPNS1-211ENST00000590874 PPP3R2Q96LZ3 170 aa22.6■■□□□ 1.21
CAPNS1-211ENST00000590874 RHOXF2Q9BQY4 288 aa22.6■■□□□ 1.21
CAPNS1-211ENST00000590874 SERHL2Q9H4I8 314 aa22.6■■□□□ 1.21
CAPNS1-211ENST00000590874 CYP7B1O75881 506 aa22.59■■□□□ 1.21
CAPNS1-211ENST00000590874 FAM157CP0CG43 387 aa22.59■■□□□ 1.21
CAPNS1-211ENST00000590874 SESN3P58005 492 aa22.59■■□□□ 1.21
CAPNS1-211ENST00000590874 LSM12Q3MHD2 195 aaKnown RBP22.59■■□□□ 1.21
CAPNS1-211ENST00000590874 CLEC2AQ6UVW9 174 aa22.59■■□□□ 1.21
CAPNS1-211ENST00000590874 TMPPEQ6ZT21 453 aa22.59■■□□□ 1.21
CAPNS1-211ENST00000590874 C3orf30Q96M34 536 aa22.59■■□□□ 1.21
CAPNS1-211ENST00000590874 NMUR2Q9GZQ4 415 aa22.59■■□□□ 1.21
CAPNS1-211ENST00000590874 LAT2Q9GZY6 243 aa22.59■■□□□ 1.21
CAPNS1-211ENST00000590874 CBLN4Q9NTU7 201 aa22.59■■□□□ 1.21
CAPNS1-211ENST00000590874 ATAD3AQ9NVI7 634 aa22.59■■□□□ 1.21
CAPNS1-211ENST00000590874 IGKV3D-15A0A087WSY6 115 aa22.58■■□□□ 1.21
CAPNS1-211ENST00000590874 A0A1W2PR80 420 aa22.58■■□□□ 1.21
CAPNS1-211ENST00000590874 ALDH3A1P30838 453 aa22.58■■□□□ 1.21
CAPNS1-211ENST00000590874 ZNF83P51522 516 aa22.58■■□□□ 1.21
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