RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000583289.5

PTPRM-215, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, human

TSL 5

Gene PTPRM, Length 792 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PTPRM-215	ENST00000583289	PLEKHG7	Q6ZR37	379 aa		4.2	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	ABHD13	Q7L211	337 aa		4.2	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	TSEN54	Q7Z6J9	526 aa	Known RBP	4.2	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	TRIM74	Q86UV6	250 aa		4.2	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	IGFN1	Q86VF2	1251 aa		4.2	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	AMIGO1	Q86WK6	493 aa		4.2	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	NRROS	Q86YC3	692 aa		4.2	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	EGFL6	Q8IUX8	553 aa		4.2	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	PEX5L	Q8IYB4	626 aa		4.2	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	CDK20	Q8IZL9	346 aa		4.2	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	TBC1D3	Q8IZP1	549 aa	Predicted RBP	4.2	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	HORMAD2	Q8N7B1	307 aa		4.2	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	CLDN22	Q8N7P3	220 aa		4.2	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	ACOT4	Q8N9L9	421 aa		4.2	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	CAMKV	Q8NCB2	501 aa		4.2	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	ZNF740	Q8NDX6	193 aa		4.2	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	B3GNT7	Q8NFL0	401 aa		4.2	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	OR2L3	Q8NG85	312 aa		4.2	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	OR4K14	Q8NGD5	310 aa		4.2	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	SETD6	Q8TBK2	473 aa		4.2	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	TEX47	Q8TBZ9	253 aa		4.2	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	NT5C	Q8TCD5	201 aa		4.2	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	ADAMTS15	Q8TE58	950 aa		4.2	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	APOBEC4	Q8WW27	367 aa	Known RBP	4.2	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	APH1B	Q8WW43	257 aa		4.2	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	LCN9	Q8WX39	176 aa		4.2	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	JPH3	Q8WXH2	748 aa	Predicted RBP	4.2	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	RSC1A1	Q92681	617 aa		4.2	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	TANK	Q92844	425 aa		4.2	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	SLC35B4	Q969S0	331 aa		4.2	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	EXOSC8	Q96B26	276 aa	Known RBP	4.2	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	EFHD2	Q96C19	240 aa	Predicted RBP	4.2	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	MS4A6E	Q96DS6	147 aa		4.2	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	CEP19	Q96LK0	163 aa		4.2	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	PRRC1	Q96M27	445 aa		4.2	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	OR2M4	Q96R27	311 aa		4.2	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	SERINC2	Q96SA4	455 aa		4.2	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	BARD1	Q99728	777 aa	Known RBP	4.2	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	GABRG3	Q99928	467 aa		4.2	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	MED18	Q9BUE0	208 aa		4.2	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	APOO	Q9BUR5	198 aa		4.2	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	CCDC32	Q9BV29	185 aa		4.2	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	ACAT2	Q9BWD1	397 aa		4.2	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	ZNF717	Q9BY31	904 aa	Predicted RBP	4.2	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	SLIRP	Q9GZT3	109 aa	Known RBP	4.2	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	DSN1	Q9H410	356 aa		4.2	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	OSGEPL1	Q9H4B0	414 aa		4.2	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	SLC25A19	Q9HC21	320 aa		4.2	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	LYRM4	Q9HD34	91 aa		4.2	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	TRPV5	Q9NQA5	729 aa		4.2	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	IMP3	Q9NV31	184 aa	Known RBP	4.2	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	TRNAU1AP	Q9NX07	287 aa	Known RBP	4.2	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	SLC23A2	Q9UGH3	650 aa		4.2	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	DAPK2	Q9UIK4	370 aa		4.2	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	SERTAD3	Q9UJW9	196 aa		4.2	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	STUB1	Q9UNE7	303 aa		4.2	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	DIMT1	Q9UNQ2	313 aa	Known RBP	4.2	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	EXOSC1	Q9Y3B2	195 aa	Known RBP	4.2	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	ASB4	Q9Y574	426 aa		4.2	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	DGKB	Q9Y6T7	804 aa		4.2	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	PTPRS	Q13332	1948 aa		4.19	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	HEATR5B	Q9P2D3	2071 aa		4.19	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289		A0A087WV62	115 aa		4.19	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289		A0A1W2PPV9	198 aa		4.19	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	TMEM129	A0AVI4	362 aa		4.19	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	HYKK	A2RU49	373 aa		4.19	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	METTL15	A6NJ78	407 aa		4.19	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	ISM1	B1AKI9	464 aa		4.19	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	ANHX	E9PGG2	379 aa		4.19	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	MYL12B	O14950	172 aa		4.19	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	ERI3	O43414	337 aa	Known RBP	4.19	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	TMPRSS11D	O60235	418 aa		4.19	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	FMO6P	O60774	539 aa		4.19	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	UPK1B	O75841	260 aa		4.19	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	OR5F1	O95221	314 aa		4.19	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	RAB36	O95755	333 aa		4.19	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	IL1A	P01583	271 aa		4.19	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	OPN1SW	P03999	348 aa		4.19	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	SERPIND1	P05546	499 aa		4.19	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	LCK	P06239	509 aa		4.19	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	STS	P08842	583 aa		4.19	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	ADORA3	P0DMS8	318 aa		4.19	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	OR12D1	P0DN82	309 aa		4.19	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	ACP2	P11117	423 aa		4.19	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	LAMP2	P13473	410 aa		4.19	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	ACP5	P13686	325 aa		4.19	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	CD53	P19397	219 aa		4.19	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	DRD1	P21728	446 aa		4.19	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	ELAVL4	P26378	380 aa	Known RBP	4.19	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	POU1F1	P28069	291 aa		4.19	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	EPHA2	P29317	976 aa		4.19	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	C21orf33	P30042	268 aa	Predicted RBP	4.19	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	GDI1	P31150	447 aa		4.19	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	TGFBR2	P37173	567 aa		4.19	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	LIPA	P38571	399 aa		4.19	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	TPTE	P56180	551 aa		4.19	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	TAS2R41	P59536	307 aa		4.19	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	HOXA4	Q00056	320 aa	Predicted RBP	4.19	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	CDK5	Q00535	292 aa		4.19	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	BNC1	Q01954	994 aa		4.19	□□□□□ -1.74

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