RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000555894.5

TTC7B-208, Transcript of tetratricopeptide repeat domain 7B, human

TSL 3

Gene TTC7B, Length 738 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TTC7B-208	ENST00000555894	ST8SIA1	Q92185	356 aa		13.65	□□□□□ -0.22
TTC7B-208	ENST00000555894	ATP6V1G3	Q96LB4	118 aa		13.65	□□□□□ -0.22
TTC7B-208	ENST00000555894	OR52E6	Q96RD3	313 aa		13.65	□□□□□ -0.22
TTC7B-208	ENST00000555894	MANSC1	Q9H8J5	431 aa		13.65	□□□□□ -0.22
TTC7B-208	ENST00000555894	COQ10B	Q9H8M1	238 aa		13.65	□□□□□ -0.22
TTC7B-208	ENST00000555894	SLC35A3	Q9Y2D2	325 aa		13.65	□□□□□ -0.22
TTC7B-208	ENST00000555894	GPR45	Q9Y5Y3	372 aa		13.65	□□□□□ -0.22
TTC7B-208	ENST00000555894		A0A1W2PNR3	127 aa		13.64	□□□□□ -0.23
TTC7B-208	ENST00000555894	SIAH2	O43255	324 aa		13.64	□□□□□ -0.23
TTC7B-208	ENST00000555894	PRKD3	O94806	890 aa		13.64	□□□□□ -0.23
TTC7B-208	ENST00000555894	GUSB	P08236	651 aa		13.64	□□□□□ -0.23
TTC7B-208	ENST00000555894	IDO1	P14902	403 aa		13.64	□□□□□ -0.23
TTC7B-208	ENST00000555894	PPP3CB	P16298	524 aa		13.64	□□□□□ -0.23
TTC7B-208	ENST00000555894	IL12A	P29459	219 aa		13.64	□□□□□ -0.23
TTC7B-208	ENST00000555894	RIPPLY3	P57055	190 aa		13.64	□□□□□ -0.23
TTC7B-208	ENST00000555894	FUT5	Q11128	374 aa		13.64	□□□□□ -0.23
TTC7B-208	ENST00000555894	MERTK	Q12866	999 aa		13.64	□□□□□ -0.23
TTC7B-208	ENST00000555894	MAPK14	Q16539	360 aa		13.64	□□□□□ -0.23
TTC7B-208	ENST00000555894	FRRS1	Q6ZNA5	592 aa		13.64	□□□□□ -0.23
TTC7B-208	ENST00000555894	ZNF621	Q6ZSS3	439 aa		13.64	□□□□□ -0.23
TTC7B-208	ENST00000555894	GLB1L3	Q8NCI6	653 aa	Predicted RBP	13.64	□□□□□ -0.23
TTC7B-208	ENST00000555894	ZNF563	Q8TA94	476 aa		13.64	□□□□□ -0.23
TTC7B-208	ENST00000555894	ZNF524	Q96C55	264 aa		13.64	□□□□□ -0.23
TTC7B-208	ENST00000555894	OR5B2	Q96R09	309 aa		13.64	□□□□□ -0.23
TTC7B-208	ENST00000555894	INPP5K	Q9BT40	448 aa		13.64	□□□□□ -0.23
TTC7B-208	ENST00000555894	QRSL1	Q9H0R6	528 aa	Known RBP	13.64	□□□□□ -0.23
TTC7B-208	ENST00000555894	SERINC1	Q9NRX5	453 aa		13.64	□□□□□ -0.23
TTC7B-208	ENST00000555894	KLHL13	Q9P2N7	655 aa		13.64	□□□□□ -0.23
TTC7B-208	ENST00000555894	HEATR5A	Q86XA9	2040 aa		13.64	□□□□□ -0.23
TTC7B-208	ENST00000555894	IGHV3-15	A0A0B4J1V0	119 aa		13.63	□□□□□ -0.23
TTC7B-208	ENST00000555894	ETV2	O00321	342 aa	Predicted RBP	13.63	□□□□□ -0.23
TTC7B-208	ENST00000555894	HMGN4	O00479	90 aa		13.63	□□□□□ -0.23
TTC7B-208	ENST00000555894	H6PD	O95479	791 aa		13.63	□□□□□ -0.23
TTC7B-208	ENST00000555894	GSN	P06396	782 aa		13.63	□□□□□ -0.23
TTC7B-208	ENST00000555894	CD53	P19397	219 aa		13.63	□□□□□ -0.23
TTC7B-208	ENST00000555894	KLK2	P20151	261 aa		13.63	□□□□□ -0.23
TTC7B-208	ENST00000555894	PGM1	P36871	562 aa		13.63	□□□□□ -0.23
TTC7B-208	ENST00000555894	CDKN2C	P42773	168 aa		13.63	□□□□□ -0.23
TTC7B-208	ENST00000555894	SESN3	P58005	492 aa		13.63	□□□□□ -0.23
TTC7B-208	ENST00000555894	RAC3	P60763	192 aa		13.63	□□□□□ -0.23
TTC7B-208	ENST00000555894	CHRNE	Q04844	493 aa		13.63	□□□□□ -0.23
TTC7B-208	ENST00000555894	PDCD4	Q53EL6	469 aa	Known RBP	13.63	□□□□□ -0.23
TTC7B-208	ENST00000555894	STAC2	Q6ZMT1	411 aa		13.63	□□□□□ -0.23
TTC7B-208	ENST00000555894	HMGN2P46	Q86SG4	172 aa		13.63	□□□□□ -0.23
TTC7B-208	ENST00000555894	TUSC5	Q8IXB3	177 aa		13.63	□□□□□ -0.23
TTC7B-208	ENST00000555894	SLC43A2	Q8N370	569 aa		13.63	□□□□□ -0.23
TTC7B-208	ENST00000555894	MARK4	Q96L34	752 aa		13.63	□□□□□ -0.23
TTC7B-208	ENST00000555894	TMUB1	Q9BVT8	246 aa		13.63	□□□□□ -0.23
TTC7B-208	ENST00000555894	SAP130	Q9H0E3	1048 aa		13.63	□□□□□ -0.23
TTC7B-208	ENST00000555894	UBTD1	Q9HAC8	227 aa		13.63	□□□□□ -0.23
TTC7B-208	ENST00000555894	GP6	Q9HCN6	339 aa		13.63	□□□□□ -0.23
TTC7B-208	ENST00000555894	ST6GALNAC1	Q9NSC7	600 aa	Predicted RBP	13.63	□□□□□ -0.23
TTC7B-208	ENST00000555894	LIPT1	Q9Y234	373 aa		13.63	□□□□□ -0.23
TTC7B-208	ENST00000555894	ACAN	P16112	2415 aa		13.62	□□□□□ -0.23
TTC7B-208	ENST00000555894	RFXANK	O14593	260 aa		13.62	□□□□□ -0.23
TTC7B-208	ENST00000555894	DNAJA2	O60884	412 aa		13.62	□□□□□ -0.23
TTC7B-208	ENST00000555894	SLC22A3	O75751	556 aa		13.62	□□□□□ -0.23
TTC7B-208	ENST00000555894	C1QC	P02747	245 aa		13.62	□□□□□ -0.23
TTC7B-208	ENST00000555894	IL6	P05231	212 aa		13.62	□□□□□ -0.23
TTC7B-208	ENST00000555894	NID1	P14543	1247 aa		13.62	□□□□□ -0.23
TTC7B-208	ENST00000555894	ENPP1	P22413	925 aa		13.62	□□□□□ -0.23
TTC7B-208	ENST00000555894	RYK	P34925	604 aa		13.62	□□□□□ -0.23
TTC7B-208	ENST00000555894	TXNL4A	P83876	142 aa	Known RBP	13.62	□□□□□ -0.23
TTC7B-208	ENST00000555894	SLC9B1	Q4ZJI4	515 aa		13.62	□□□□□ -0.23
TTC7B-208	ENST00000555894	C22orf34	Q6ZV56	151 aa		13.62	□□□□□ -0.23
TTC7B-208	ENST00000555894	PLEKHM3	Q6ZWE6	761 aa		13.62	□□□□□ -0.23
TTC7B-208	ENST00000555894	NUFIP2	Q7Z417	695 aa	Known RBP	13.62	□□□□□ -0.23
TTC7B-208	ENST00000555894	ARFGAP2	Q8N6H7	521 aa		13.62	□□□□□ -0.23
TTC7B-208	ENST00000555894	FAM71C	Q8NEG0	241 aa		13.62	□□□□□ -0.23
TTC7B-208	ENST00000555894	PIWIL2	Q8TC59	973 aa	Known RBP	13.62	□□□□□ -0.23
TTC7B-208	ENST00000555894	PNPT1	Q8TCS8	783 aa	Known RBP	13.62	□□□□□ -0.23
TTC7B-208	ENST00000555894	SLC25A43	Q8WUT9	341 aa	Predicted RBP	13.62	□□□□□ -0.23
TTC7B-208	ENST00000555894	MAEL	Q96JY0	434 aa	Known RBP	13.62	□□□□□ -0.23
TTC7B-208	ENST00000555894	TRNT1	Q96Q11	434 aa	Known RBP	13.62	□□□□□ -0.23
TTC7B-208	ENST00000555894	TACO1	Q9BSH4	297 aa	Known RBP	13.62	□□□□□ -0.23
TTC7B-208	ENST00000555894	ACTR6	Q9GZN1	396 aa		13.62	□□□□□ -0.23
TTC7B-208	ENST00000555894	ACER3	Q9NUN7	267 aa		13.62	□□□□□ -0.23
TTC7B-208	ENST00000555894	BEX4	Q9NWD9	120 aa	Predicted RBP	13.62	□□□□□ -0.23
TTC7B-208	ENST00000555894	ZNF446	Q9NWS9	450 aa		13.62	□□□□□ -0.23
TTC7B-208	ENST00000555894	KLHL9	Q9P2J3	617 aa		13.62	□□□□□ -0.23
TTC7B-208	ENST00000555894	GPR52	Q9Y2T5	361 aa		13.62	□□□□□ -0.23
TTC7B-208	ENST00000555894	SPIN1	Q9Y657	262 aa	Predicted RBP	13.62	□□□□□ -0.23
TTC7B-208	ENST00000555894	FLNA	P21333	2647 aa	Known RBP	13.62	□□□□□ -0.23
TTC7B-208	ENST00000555894	PRAMEF27	A3QJZ7	478 aa		13.61	□□□□□ -0.23
TTC7B-208	ENST00000555894	BCAS1	O75363	584 aa	Predicted RBP	13.61	□□□□□ -0.23
TTC7B-208	ENST00000555894	ANP32D	O95626	131 aa		13.61	□□□□□ -0.23
TTC7B-208	ENST00000555894	KRT75	O95678	551 aa		13.61	□□□□□ -0.23
TTC7B-208	ENST00000555894	THBD	P07204	575 aa		13.61	□□□□□ -0.23
TTC7B-208	ENST00000555894	YES1	P07947	543 aa		13.61	□□□□□ -0.23
TTC7B-208	ENST00000555894	NR2F1	P10589	423 aa		13.61	□□□□□ -0.23
TTC7B-208	ENST00000555894	TFPI	P10646	304 aa		13.61	□□□□□ -0.23
TTC7B-208	ENST00000555894	PSMB1	P20618	241 aa	Known RBP	13.61	□□□□□ -0.23
TTC7B-208	ENST00000555894	APOBEC1	P41238	236 aa	Known RBP	13.61	□□□□□ -0.23
TTC7B-208	ENST00000555894	ADAM8	P78325	824 aa		13.61	□□□□□ -0.23
TTC7B-208	ENST00000555894	KCNJ10	P78508	379 aa		13.61	□□□□□ -0.23
TTC7B-208	ENST00000555894	FOXD4	Q12950	439 aa	Predicted RBP	13.61	□□□□□ -0.23
TTC7B-208	ENST00000555894	SYPL1	Q16563	259 aa		13.61	□□□□□ -0.23
TTC7B-208	ENST00000555894	GSTA3	Q16772	222 aa		13.61	□□□□□ -0.23
TTC7B-208	ENST00000555894	SYT14P1	Q58G82	188 aa		13.61	□□□□□ -0.23
TTC7B-208	ENST00000555894	BEX5	Q5H9J7	111 aa		13.61	□□□□□ -0.23

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