RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550996.1

CS-222, Transcript of citrate synthase, human

TSL 2

Gene CS, Length 718 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CS-222	ENST00000550996	ANP32D	O95626	131 aa		18.67	■□□□□ 0.58
CS-222	ENST00000550996	NR2F1	P10589	423 aa		18.67	■□□□□ 0.58
CS-222	ENST00000550996	CCKAR	P32238	428 aa		18.67	■□□□□ 0.58
CS-222	ENST00000550996	CPOX	P36551	454 aa		18.67	■□□□□ 0.58
CS-222	ENST00000550996	CRAT	P43155	626 aa		18.67	■□□□□ 0.58
CS-222	ENST00000550996	ANXA11	P50995	505 aa	Known RBP	18.67	■□□□□ 0.58
CS-222	ENST00000550996	CARD18	P57730	90 aa		18.67	■□□□□ 0.58
CS-222	ENST00000550996	FAM27E3	Q08E93	113 aa		18.67	■□□□□ 0.58
CS-222	ENST00000550996	ZNF239	Q16600	458 aa	Known RBP	18.67	■□□□□ 0.58
CS-222	ENST00000550996	FAM214B	Q7L5A3	538 aa		18.67	■□□□□ 0.58
CS-222	ENST00000550996	TMEM200A	Q86VY9	491 aa		18.67	■□□□□ 0.58
CS-222	ENST00000550996	ROBO4	Q8WZ75	1007 aa		18.67	■□□□□ 0.58
CS-222	ENST00000550996	ST8SIA1	Q92185	356 aa		18.67	■□□□□ 0.58
CS-222	ENST00000550996	GPATCH1	Q9BRR8	931 aa	Known RBP	18.67	■□□□□ 0.58
CS-222	ENST00000550996	ST6GALNAC1	Q9NSC7	600 aa	Predicted RBP	18.67	■□□□□ 0.58
CS-222	ENST00000550996	ACER3	Q9NUN7	267 aa		18.67	■□□□□ 0.58
CS-222	ENST00000550996	PAQR5	Q9NXK6	330 aa	Predicted RBP	18.67	■□□□□ 0.58
CS-222	ENST00000550996	DNAJB12	Q9NXW2	375 aa	Known RBP	18.67	■□□□□ 0.58
CS-222	ENST00000550996	CCDC167	Q9P0B6	97 aa		18.67	■□□□□ 0.58
CS-222	ENST00000550996	MCTS1	Q9ULC4	181 aa	Known RBP	18.67	■□□□□ 0.58
CS-222	ENST00000550996	DSPP	Q9NZW4	1301 aa		18.67	■□□□□ 0.58
CS-222	ENST00000550996		A0A1W2PNR3	127 aa		18.66	■□□□□ 0.58
CS-222	ENST00000550996		A6NNC1	897 aa		18.66	■□□□□ 0.58
CS-222	ENST00000550996	NR5A2	O00482	541 aa		18.66	■□□□□ 0.58
CS-222	ENST00000550996	AP3D1	O14617	1153 aa		18.66	■□□□□ 0.58
CS-222	ENST00000550996	SS18L1	O75177	396 aa	Predicted RBP	18.66	■□□□□ 0.58
CS-222	ENST00000550996	SYNGR4	O95473	234 aa		18.66	■□□□□ 0.58
CS-222	ENST00000550996	NUDT7	P0C024	238 aa		18.66	■□□□□ 0.58
CS-222	ENST00000550996	TFPT	P0C1Z6	253 aa		18.66	■□□□□ 0.58
CS-222	ENST00000550996	KLK2	P20151	261 aa		18.66	■□□□□ 0.58
CS-222	ENST00000550996	RYK	P34925	604 aa		18.66	■□□□□ 0.58
CS-222	ENST00000550996	MAGEA8	P43361	318 aa		18.66	■□□□□ 0.58
CS-222	ENST00000550996	ATP4B	P51164	291 aa		18.66	■□□□□ 0.58
CS-222	ENST00000550996	SELENBP1	Q13228	472 aa		18.66	■□□□□ 0.58
CS-222	ENST00000550996	PAGE3	Q5JUK9	113 aa		18.66	■□□□□ 0.58
CS-222	ENST00000550996	PLEKHM3	Q6ZWE6	761 aa		18.66	■□□□□ 0.58
CS-222	ENST00000550996	ZNF610	Q8N9Z0	462 aa		18.66	■□□□□ 0.58
CS-222	ENST00000550996	ABHD3	Q8WU67	409 aa		18.66	■□□□□ 0.58
CS-222	ENST00000550996	SLC38A5	Q8WUX1	472 aa		18.66	■□□□□ 0.58
CS-222	ENST00000550996	STON2	Q8WXE9	905 aa		18.66	■□□□□ 0.58
CS-222	ENST00000550996	SPDL1	Q96EA4	605 aa		18.66	■□□□□ 0.58
CS-222	ENST00000550996	GMPPA	Q96IJ6	420 aa	Predicted RBP	18.66	■□□□□ 0.58
CS-222	ENST00000550996	PRRG4	Q9BZD6	226 aa		18.66	■□□□□ 0.58
CS-222	ENST00000550996	ZNF385D	Q9H6B1	395 aa		18.66	■□□□□ 0.58
CS-222	ENST00000550996	MTHFD2L	Q9H903	347 aa	Predicted RBP	18.66	■□□□□ 0.58
CS-222	ENST00000550996	EXOSC3	Q9NQT5	275 aa	Known RBP	18.66	■□□□□ 0.58
CS-222	ENST00000550996	DCTN4	Q9UJW0	460 aa		18.66	■□□□□ 0.58
CS-222	ENST00000550996		A0A096LPI6	279 aa		18.65	■□□□□ 0.58
CS-222	ENST00000550996	CD8B	P10966	210 aa		18.65	■□□□□ 0.58
CS-222	ENST00000550996	EPX	P11678	715 aa		18.65	■□□□□ 0.58
CS-222	ENST00000550996	PGC	P20142	388 aa		18.65	■□□□□ 0.58
CS-222	ENST00000550996	DSTN	P60981	165 aa		18.65	■□□□□ 0.58
CS-222	ENST00000550996	MERTK	Q12866	999 aa		18.65	■□□□□ 0.58
CS-222	ENST00000550996	DAZAP2	Q15038	168 aa	Predicted RBP	18.65	■□□□□ 0.58
CS-222	ENST00000550996	AGK	Q53H12	422 aa		18.65	■□□□□ 0.58
CS-222	ENST00000550996	RPS26P11	Q5JNZ5	115 aa	Predicted RBP	18.65	■□□□□ 0.58
CS-222	ENST00000550996	LRIF1	Q5T3J3	769 aa		18.65	■□□□□ 0.58
CS-222	ENST00000550996	CDH24	Q86UP0	819 aa		18.65	■□□□□ 0.58
CS-222	ENST00000550996	C10orf111	Q8N326	155 aa		18.65	■□□□□ 0.58
CS-222	ENST00000550996	RNF128	Q8TEB7	428 aa		18.65	■□□□□ 0.58
CS-222	ENST00000550996	CCDC106	Q9BWC9	280 aa		18.65	■□□□□ 0.58
CS-222	ENST00000550996	NPHS2	Q9NP85	383 aa		18.65	■□□□□ 0.58
CS-222	ENST00000550996	RASSF1	Q9NS23	344 aa		18.65	■□□□□ 0.58
CS-222	ENST00000550996	P2RX2	Q9UBL9	471 aa		18.65	■□□□□ 0.58
CS-222	ENST00000550996	BCHE	P06276	602 aa		18.64	■□□□□ 0.57
CS-222	ENST00000550996	SQLE	Q14534	574 aa		18.64	■□□□□ 0.57
CS-222	ENST00000550996	RGN	Q15493	299 aa		18.64	■□□□□ 0.57
CS-222	ENST00000550996	PDSS1	Q5T2R2	415 aa		18.64	■□□□□ 0.57
CS-222	ENST00000550996	MRPL2	Q5T653	305 aa	Known RBP	18.64	■□□□□ 0.57
CS-222	ENST00000550996	VRK2	Q86Y07	508 aa		18.64	■□□□□ 0.57
CS-222	ENST00000550996	CMIP	Q8IY22	773 aa		18.64	■□□□□ 0.57
CS-222	ENST00000550996	ARFGAP2	Q8N6H7	521 aa		18.64	■□□□□ 0.57
CS-222	ENST00000550996	WDR60	Q8WVS4	1066 aa		18.64	■□□□□ 0.57
CS-222	ENST00000550996	TMEM19	Q96HH6	336 aa		18.64	■□□□□ 0.57
CS-222	ENST00000550996	CTPS2	Q9NRF8	586 aa		18.64	■□□□□ 0.57
CS-222	ENST00000550996	RLIM	Q9NVW2	624 aa		18.64	■□□□□ 0.57
CS-222	ENST00000550996	PROCR	Q9UNN8	238 aa		18.64	■□□□□ 0.57
CS-222	ENST00000550996	CHST2	Q9Y4C5	530 aa		18.64	■□□□□ 0.57
CS-222	ENST00000550996	HIVEP1	P15822	2718 aa		18.63	■□□□□ 0.57
CS-222	ENST00000550996	TRBV5-3	A0A0A0MS03	114 aa		18.63	■□□□□ 0.57
CS-222	ENST00000550996	IGHV3-15	A0A0B4J1V0	119 aa		18.63	■□□□□ 0.57
CS-222	ENST00000550996	GJE1	A6NN92	205 aa		18.63	■□□□□ 0.57
CS-222	ENST00000550996	CLIC1	O00299	241 aa		18.63	■□□□□ 0.57
CS-222	ENST00000550996	ENPP1	P22413	925 aa		18.63	■□□□□ 0.57
CS-222	ENST00000550996	AGTR1	P30556	359 aa		18.63	■□□□□ 0.57
CS-222	ENST00000550996	CD79B	P40259	229 aa		18.63	■□□□□ 0.57
CS-222	ENST00000550996	PCYT1A	P49585	367 aa		18.63	■□□□□ 0.57
CS-222	ENST00000550996	C3orf33	Q6P1S2	294 aa		18.63	■□□□□ 0.57
CS-222	ENST00000550996	ZNF836	Q6ZNA1	936 aa		18.63	■□□□□ 0.57
CS-222	ENST00000550996	OR6K3	Q8NGY3	331 aa		18.63	■□□□□ 0.57
CS-222	ENST00000550996	TMEM234	Q8WY98	164 aa		18.63	■□□□□ 0.57
CS-222	ENST00000550996	MAL2	Q969L2	176 aa		18.63	■□□□□ 0.57
CS-222	ENST00000550996	CPNE4	Q96A23	557 aa	Predicted RBP	18.63	■□□□□ 0.57
CS-222	ENST00000550996	RSPO3	Q9BXY4	272 aa	Predicted RBP	18.63	■□□□□ 0.57
CS-222	ENST00000550996	IKZF5	Q9H5V7	419 aa		18.63	■□□□□ 0.57
CS-222	ENST00000550996	PLSCR4	Q9NRQ2	329 aa		18.63	■□□□□ 0.57
CS-222	ENST00000550996	ING1	Q9UK53	422 aa	Predicted RBP	18.63	■□□□□ 0.57
CS-222	ENST00000550996	EMC9	Q9Y3B6	208 aa		18.63	■□□□□ 0.57
CS-222	ENST00000550996	TESMIN	Q9Y4I5	508 aa		18.63	■□□□□ 0.57
CS-222	ENST00000550996	MAP1A	P78559	2803 aa	Predicted RBP	18.62	■□□□□ 0.57

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