RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000519076.5

TRPS1-208, Transcript of transcriptional repressor GATA binding 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene TRPS1, Length 3,329 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPS1-208ENST00000519076 DSG2Q14126 1118 aa7.31□□□□□ -1.24
TRPS1-208ENST00000519076 AGERQ15109 404 aa7.31□□□□□ -1.24
TRPS1-208ENST00000519076 SNAPC1Q16533 368 aa7.31□□□□□ -1.24
TRPS1-208ENST00000519076 NDUFA9Q16795 377 aa7.31□□□□□ -1.24
TRPS1-208ENST00000519076 CDC73Q6P1J9 531 aa7.31□□□□□ -1.24
TRPS1-208ENST00000519076 SLC48A1Q6P1K1 146 aa7.31□□□□□ -1.24
TRPS1-208ENST00000519076 SLC27A4Q6P1M0 643 aa7.31□□□□□ -1.24
TRPS1-208ENST00000519076 OR1M1Q8NGA1 313 aa7.31□□□□□ -1.24
TRPS1-208ENST00000519076 OR5M11Q96RB7 305 aa7.31□□□□□ -1.24
TRPS1-208ENST00000519076 NIPSNAP1Q9BPW8 284 aa7.31□□□□□ -1.24
TRPS1-208ENST00000519076 NT5DC2Q9H857 520 aa7.31□□□□□ -1.24
TRPS1-208ENST00000519076 CCNB1IP1Q9NPC3 277 aa7.31□□□□□ -1.24
TRPS1-208ENST00000519076 PRMT8Q9NR22 394 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
TRPS1-208ENST00000519076 CALML5Q9NZT1 146 aa7.31□□□□□ -1.24
TRPS1-208ENST00000519076 ZNF639Q9UID6 485 aa7.31□□□□□ -1.24
TRPS1-208ENST00000519076 KLHL21Q9UJP4 597 aa7.31□□□□□ -1.24
TRPS1-208ENST00000519076 ENTPD2Q9Y5L3 495 aa7.31□□□□□ -1.24
TRPS1-208ENST00000519076 HS3ST3A1Q9Y663 406 aa7.31□□□□□ -1.24
TRPS1-208ENST00000519076 XIRP2A4UGR9 3374 aa7.31□□□□□ -1.24
TRPS1-208ENST00000519076 FAM186AA6NE01 2351 aa7.31□□□□□ -1.24
TRPS1-208ENST00000519076 MDC1Q14676 2089 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
TRPS1-208ENST00000519076 KIF26AQ9ULI4 1882 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
TRPS1-208ENST00000519076 A0A0J9YY10 115 aa7.31□□□□□ -1.24
TRPS1-208ENST00000519076 LOC105378220A0A1B0GUY1 285 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
TRPS1-208ENST00000519076 MEIOCA2RUB1 952 aa7.31□□□□□ -1.24
TRPS1-208ENST00000519076 HMGN4O00479 90 aa7.31□□□□□ -1.24
TRPS1-208ENST00000519076 GMFGO60234 142 aa7.31□□□□□ -1.24
TRPS1-208ENST00000519076 CH25HO95992 272 aa7.31□□□□□ -1.24
TRPS1-208ENST00000519076 QDPRP09417 244 aa7.31□□□□□ -1.24
TRPS1-208ENST00000519076 LAP3P28838 519 aa7.31□□□□□ -1.24
TRPS1-208ENST00000519076 GALNSP34059 522 aa7.31□□□□□ -1.24
TRPS1-208ENST00000519076 VEGFCP49767 419 aa7.31□□□□□ -1.24
TRPS1-208ENST00000519076 RPS7P62081 194 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
TRPS1-208ENST00000519076 PPP1CAP62136 330 aa7.31□□□□□ -1.24
TRPS1-208ENST00000519076 TRA2BP62995 288 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
TRPS1-208ENST00000519076 MICAQ29983 383 aa7.31□□□□□ -1.24
TRPS1-208ENST00000519076 PRSS53Q2L4Q9 553 aa7.31□□□□□ -1.24
TRPS1-208ENST00000519076 SLC25A25Q6KCM7 469 aa7.31□□□□□ -1.24
TRPS1-208ENST00000519076 FAM111BQ6SJ93 734 aa7.31□□□□□ -1.24
TRPS1-208ENST00000519076 TEX261Q6UWH6 196 aa7.31□□□□□ -1.24
TRPS1-208ENST00000519076 UBE3DQ7Z6J8 389 aa7.31□□□□□ -1.24
TRPS1-208ENST00000519076 FJX1Q86VR8 437 aa7.31□□□□□ -1.24
TRPS1-208ENST00000519076 SLC34A3Q8N130 599 aa7.31□□□□□ -1.24
TRPS1-208ENST00000519076 SLC16A11Q8NCK7 471 aa7.31□□□□□ -1.24
TRPS1-208ENST00000519076 OR52E4Q8NGH9 312 aa7.31□□□□□ -1.24
TRPS1-208ENST00000519076 OR9Q1Q8NGQ5 310 aa7.31□□□□□ -1.24
TRPS1-208ENST00000519076 CREB3L4Q8TEY5 395 aa7.31□□□□□ -1.24
TRPS1-208ENST00000519076 MBOAT4Q96T53 435 aa7.31□□□□□ -1.24
TRPS1-208ENST00000519076 GAREM1Q9H706 876 aa7.31□□□□□ -1.24
TRPS1-208ENST00000519076 PRDM7Q9NQW5 492 aa7.31□□□□□ -1.24
TRPS1-208ENST00000519076 RDH8Q9NYR8 311 aa7.31□□□□□ -1.24
TRPS1-208ENST00000519076 U3KQ87 197 aa7.31□□□□□ -1.24
TRPS1-208ENST00000519076 GPR179Q6PRD1 2367 aa7.31□□□□□ -1.24
TRPS1-208ENST00000519076 NPIPA5A0A0B4J1W7 369 aa7.3□□□□□ -1.24
TRPS1-208ENST00000519076 SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 76 aa7.3□□□□□ -1.24
TRPS1-208ENST00000519076 A0A1W2PPC4 97 aa7.3□□□□□ -1.24
TRPS1-208ENST00000519076 ZNF99A8MXY4 864 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
TRPS1-208ENST00000519076 HSBP1L1C9JCN9 74 aa7.3□□□□□ -1.24
TRPS1-208ENST00000519076 NPIPA7E9PJI5 369 aa7.3□□□□□ -1.24
TRPS1-208ENST00000519076 TCAPO15273 167 aa7.3□□□□□ -1.24
TRPS1-208ENST00000519076 MT-ND2P03891 347 aa7.3□□□□□ -1.24
TRPS1-208ENST00000519076 DCNP07585 359 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
TRPS1-208ENST00000519076 NPIPA8P0DM63 369 aa7.3□□□□□ -1.24
TRPS1-208ENST00000519076 ST6GAL1P15907 406 aa7.3□□□□□ -1.24
TRPS1-208ENST00000519076 SLC1A3P43003 542 aa7.3□□□□□ -1.24
TRPS1-208ENST00000519076 MAN2A2P49641 1150 aa7.3□□□□□ -1.24
TRPS1-208ENST00000519076 PER3P56645 1201 aa7.3□□□□□ -1.24
TRPS1-208ENST00000519076 SNRPD2P62316 118 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
TRPS1-208ENST00000519076 EXOSC7Q15024 291 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
TRPS1-208ENST00000519076 ZNF691Q5VV52 312 aa7.3□□□□□ -1.24
TRPS1-208ENST00000519076 ETV3LQ6ZN32 361 aa7.3□□□□□ -1.24
TRPS1-208ENST00000519076 C10orf53Q8N6V4 93 aa7.3□□□□□ -1.24
TRPS1-208ENST00000519076 ZNF321PQ8N8H1 164 aa7.3□□□□□ -1.24
TRPS1-208ENST00000519076 SUN3Q8TAQ9 357 aa7.3□□□□□ -1.24
TRPS1-208ENST00000519076 SFT2D1Q8WV19 159 aa7.3□□□□□ -1.24
TRPS1-208ENST00000519076 TMCO6Q96DC7 493 aa7.3□□□□□ -1.24
TRPS1-208ENST00000519076 EPYCQ99645 322 aa7.3□□□□□ -1.24
TRPS1-208ENST00000519076 MAP3K3Q99759 626 aa7.3□□□□□ -1.24
TRPS1-208ENST00000519076 CCDC86Q9H6F5 360 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
TRPS1-208ENST00000519076 C19orf12Q9NSK7 152 aa7.3□□□□□ -1.24
TRPS1-208ENST00000519076 WSB2Q9NYS7 404 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
TRPS1-208ENST00000519076 DNAJC27Q9NZQ0 273 aa7.3□□□□□ -1.24
TRPS1-208ENST00000519076 EPHA6Q9UF33 1036 aa7.3□□□□□ -1.24
TRPS1-208ENST00000519076 PADI2Q9Y2J8 665 aa7.3□□□□□ -1.24
TRPS1-208ENST00000519076 PLXNB3Q9ULL4 1909 aa7.3□□□□□ -1.24
TRPS1-208ENST00000519076 A0A0A6YYD5 115 aa7.3□□□□□ -1.24
TRPS1-208ENST00000519076 TRBV4-1A0A0J9YWV2 114 aa7.3□□□□□ -1.24
TRPS1-208ENST00000519076 CPED1A4D0V7 1026 aa7.3□□□□□ -1.24
TRPS1-208ENST00000519076 TMEM127O75204 238 aa7.3□□□□□ -1.24
TRPS1-208ENST00000519076 EIF3GO75821 320 aaKnown RBP eCLIP7.3□□□□□ -1.24
TRPS1-208ENST00000519076 GP1BAP07359 652 aa7.3□□□□□ -1.24
TRPS1-208ENST00000519076 CKMT1AP12532 417 aa7.3□□□□□ -1.24
TRPS1-208ENST00000519076 PEBP1P30086 187 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
TRPS1-208ENST00000519076 GABRA3P34903 492 aa7.3□□□□□ -1.24
TRPS1-208ENST00000519076 GLO1Q04760 184 aa7.3□□□□□ -1.24
TRPS1-208ENST00000519076 IL18R1Q13478 541 aa7.3□□□□□ -1.24
TRPS1-208ENST00000519076 SEC23BQ15437 767 aa7.3□□□□□ -1.24
TRPS1-208ENST00000519076 CTU2Q2VPK5 515 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
TRPS1-208ENST00000519076 ZNF658BQ4V348 819 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
TRPS1-208ENST00000519076 KDM4DQ6B0I6 523 aa7.3□□□□□ -1.24
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