RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516162.1

RNU6-1333P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1333, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1333P, Length 93 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1333P-201ENST00000516162 KCNK10P57789 538 aa-0.86□□□□□ -2.55
RNU6-1333P-201ENST00000516162 AKAP17AQ02040 695 aaKnown RBP-0.86□□□□□ -2.55
RNU6-1333P-201ENST00000516162 BIRC2Q13490 618 aa-0.86□□□□□ -2.55
RNU6-1333P-201ENST00000516162 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP-0.86□□□□□ -2.55
RNU6-1333P-201ENST00000516162 MARCH8Q5T0T0 291 aa-0.86□□□□□ -2.55
RNU6-1333P-201ENST00000516162 CCDC30Q5VVM6 783 aa-0.86□□□□□ -2.55
RNU6-1333P-201ENST00000516162 CST9LP1Q5W188 147 aa-0.86□□□□□ -2.55
RNU6-1333P-201ENST00000516162 CDC42EP5Q6NZY7 148 aa-0.86□□□□□ -2.55
RNU6-1333P-201ENST00000516162 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa-0.86□□□□□ -2.55
RNU6-1333P-201ENST00000516162 ENOSF1Q7L5Y1 443 aa-0.86□□□□□ -2.55
RNU6-1333P-201ENST00000516162 TCF24Q7RTU0 167 aa-0.86□□□□□ -2.55
RNU6-1333P-201ENST00000516162 DNAJB7Q7Z6W7 309 aaPredicted RBP-0.86□□□□□ -2.55
RNU6-1333P-201ENST00000516162 RANBP3LQ86VV4 465 aaPredicted RBP-0.86□□□□□ -2.55
RNU6-1333P-201ENST00000516162 GID4Q8IVV7 300 aa-0.86□□□□□ -2.55
RNU6-1333P-201ENST00000516162 SMAP1Q8IYB5 467 aaPredicted RBP-0.86□□□□□ -2.55
RNU6-1333P-201ENST00000516162 CHCHD4Q8N4Q1 142 aa-0.86□□□□□ -2.55
RNU6-1333P-201ENST00000516162 OCC1Q8TAD7 63 aa-0.86□□□□□ -2.55
RNU6-1333P-201ENST00000516162 PEX13Q92968 403 aa-0.86□□□□□ -2.55
RNU6-1333P-201ENST00000516162 TIGD1Q96MW7 591 aa-0.86□□□□□ -2.55
RNU6-1333P-201ENST00000516162 DHX35Q9H5Z1 703 aaKnown RBP-0.86□□□□□ -2.55
RNU6-1333P-201ENST00000516162 ZDHHC6Q9H6R6 413 aa-0.86□□□□□ -2.55
RNU6-1333P-201ENST00000516162 APPL1Q9UKG1 709 aa-0.86□□□□□ -2.55
RNU6-1333P-201ENST00000516162 TMEM5Q9Y2B1 443 aa-0.86□□□□□ -2.55
RNU6-1333P-201ENST00000516162 HEBP2Q9Y5Z4 205 aa-0.86□□□□□ -2.55
RNU6-1333P-201ENST00000516162 IGF2RP11717 2491 aa-0.87□□□□□ -2.55
RNU6-1333P-201ENST00000516162 IGHV3OR16-13A0A075B7E8 117 aa-0.87□□□□□ -2.55
RNU6-1333P-201ENST00000516162 A0A087X0K7 114 aa-0.87□□□□□ -2.55
RNU6-1333P-201ENST00000516162 IGKV1-8A0A0C4DH67 115 aa-0.87□□□□□ -2.55
RNU6-1333P-201ENST00000516162 A0A0G2JRQ6 117 aa-0.87□□□□□ -2.55
RNU6-1333P-201ENST00000516162 C4orf51C9J302 202 aa-0.87□□□□□ -2.55
RNU6-1333P-201ENST00000516162 KBTBD13C9JR72 458 aa-0.87□□□□□ -2.55
RNU6-1333P-201ENST00000516162 E9PBE3 544 aa-0.87□□□□□ -2.55
RNU6-1333P-201ENST00000516162 REC8O95072 547 aa-0.87□□□□□ -2.55
RNU6-1333P-201ENST00000516162 GSTA1P08263 222 aa-0.87□□□□□ -2.55
RNU6-1333P-201ENST00000516162 IGHV1-8P0DP01 117 aa-0.87□□□□□ -2.55
RNU6-1333P-201ENST00000516162 MSR1P21757 451 aa-0.87□□□□□ -2.55
RNU6-1333P-201ENST00000516162 APLNRP35414 380 aa-0.87□□□□□ -2.55
RNU6-1333P-201ENST00000516162 SLC11A1P49279 550 aa-0.87□□□□□ -2.55
RNU6-1333P-201ENST00000516162 RAP1AP62834 184 aa-0.87□□□□□ -2.55
RNU6-1333P-201ENST00000516162 CTAG1AP78358 180 aa-0.87□□□□□ -2.55
RNU6-1333P-201ENST00000516162 LOXL1Q08397 574 aaPredicted RBP-0.87□□□□□ -2.55
RNU6-1333P-201ENST00000516162 SLC10A7Q0GE19 358 aa-0.87□□□□□ -2.55
RNU6-1333P-201ENST00000516162 HSP90AB4PQ58FF6 505 aa-0.87□□□□□ -2.55
RNU6-1333P-201ENST00000516162 LRRC10Q5BKY1 277 aa-0.87□□□□□ -2.55
RNU6-1333P-201ENST00000516162 C1orf100Q5SVJ3 147 aa-0.87□□□□□ -2.55
RNU6-1333P-201ENST00000516162 N4BP2L1Q5TBK1 243 aaPredicted RBP-0.87□□□□□ -2.55
RNU6-1333P-201ENST00000516162 STAC2Q6ZMT1 411 aa-0.87□□□□□ -2.55
RNU6-1333P-201ENST00000516162 IFNEQ86WN2 208 aa-0.87□□□□□ -2.55
RNU6-1333P-201ENST00000516162 ZCCHC24Q8N2G6 241 aaKnown RBP-0.87□□□□□ -2.55
RNU6-1333P-201ENST00000516162 BPIFB2Q8N4F0 458 aa-0.87□□□□□ -2.55
RNU6-1333P-201ENST00000516162 ACBD4Q8NC06 268 aa-0.87□□□□□ -2.55
RNU6-1333P-201ENST00000516162 CCDC54Q8NEL0 328 aa-0.87□□□□□ -2.55
RNU6-1333P-201ENST00000516162 CMTM2Q8TAZ6 248 aa-0.87□□□□□ -2.55
RNU6-1333P-201ENST00000516162 SLC5A11Q8WWX8 675 aa-0.87□□□□□ -2.55
RNU6-1333P-201ENST00000516162 ARPC1AQ92747 370 aa-0.87□□□□□ -2.55
RNU6-1333P-201ENST00000516162 NARS2Q96I59 477 aaKnown RBP-0.87□□□□□ -2.55
RNU6-1333P-201ENST00000516162 MCHR1Q99705 422 aa-0.87□□□□□ -2.55
RNU6-1333P-201ENST00000516162 GPATCH2LQ9NWQ4 482 aa-0.87□□□□□ -2.55
RNU6-1333P-201ENST00000516162 TREM2Q9NZC2 230 aa-0.87□□□□□ -2.55
RNU6-1333P-201ENST00000516162 PCYOX1Q9UHG3 505 aa-0.87□□□□□ -2.55
RNU6-1333P-201ENST00000516162 KIF25Q9UIL4 384 aa-0.87□□□□□ -2.55
RNU6-1333P-201ENST00000516162 USP16Q9Y5T5 823 aa-0.87□□□□□ -2.55
RNU6-1333P-201ENST00000516162 LRP1BQ9NZR2 4599 aa-0.87□□□□□ -2.55
RNU6-1333P-201ENST00000516162 BDP1A6H8Y1 2624 aa-0.87□□□□□ -2.55
RNU6-1333P-201ENST00000516162 FAM86B1E9PN63 330 aa-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-1333P-201ENST00000516162 INS-IGF2F8WCM5 200 aa-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-1333P-201ENST00000516162 HAS3O00219 553 aa-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-1333P-201ENST00000516162 DIAPH2O60879 1101 aa-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-1333P-201ENST00000516162 GLCEO94923 617 aa-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-1333P-201ENST00000516162 FAM86B2P0C5J1 330 aa-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-1333P-201ENST00000516162 DCKP27707 260 aa-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-1333P-201ENST00000516162 ADSSP30520 456 aa-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-1333P-201ENST00000516162 CALCRP30988 508 aa-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-1333P-201ENST00000516162 EPHX2P34913 555 aa-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-1333P-201ENST00000516162 OPRK1P41145 380 aa-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-1333P-201ENST00000516162 SLC39A12Q504Y0 691 aa-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-1333P-201ENST00000516162 ATF7IP2Q5U623 682 aa-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-1333P-201ENST00000516162 ADNP2Q6IQ32 1131 aa-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-1333P-201ENST00000516162 BIVMQ86UB2 503 aa-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-1333P-201ENST00000516162 NRMQ8IXM6 262 aa-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-1333P-201ENST00000516162 LRRC75AQ8NAA5 344 aa-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-1333P-201ENST00000516162 POMGNT2Q8NAT1 580 aa-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-1333P-201ENST00000516162 OR6C4Q8NGE1 309 aa-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-1333P-201ENST00000516162 FAM110BQ8TC76 370 aa-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-1333P-201ENST00000516162 FANK1Q8TC84 345 aa-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-1333P-201ENST00000516162 CD300LFQ8TDQ1 290 aa-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-1333P-201ENST00000516162 TRUB1Q8WWH5 349 aaKnown RBP-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-1333P-201ENST00000516162 ACCSQ96QU6 501 aa-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-1333P-201ENST00000516162 ROGDIQ9GZN7 287 aa-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-1333P-201ENST00000516162 DNTTIP1Q9H147 329 aa-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-1333P-201ENST00000516162 C10orf95Q9H7T3 257 aa-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-1333P-201ENST00000516162 HMG20AQ9NP66 347 aa-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-1333P-201ENST00000516162 DCAF13Q9NV06 445 aaKnown RBP-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-1333P-201ENST00000516162 GPR132Q9UNW8 380 aa-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-1333P-201ENST00000516162 EPPK1P58107 5090 aaKnown RBP-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-1333P-201ENST00000516162 ABCA2Q9BZC7 2435 aa-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-1333P-201ENST00000516162 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-1333P-201ENST00000516162 SETD2Q9BYW2 2564 aaPredicted RBP-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-1333P-201ENST00000516162 IGLV10-54A0A075B6I4 117 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-1333P-201ENST00000516162 A0A087WV48 116 aa-0.89□□□□□ -2.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.1 ms